Homology swapping of intrinsic secondary structural elements between cellulosomal types I and II cohesins and their effect on dockerin binding

Pure and Applied Chemistry

Volumn 82, Issue 1, 2010, Pages 193-204

  Noach, Ilit ^a   Barak, Yoav ^a   Frolow, Felix ^b   Lamed, Raphael ^b   Bayer, Edward A ^a  

^a WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE   (Israel)

^b TEL AVIV UNIVERSITY   (Israel)

Author keywords

helix; flaps; Chimaera; Clostridium thermocellum; Enzyme linked immuno absorbent assay; Multienzyme complex; Protein protein interaction

Indexed keywords

EID: 76049118744     PISSN: 00334545     EISSN: 13653075     Source Type: Journal    
DOI: 10.1351/PAC-CON-09-02-11     Document Type: Conference Paper

References (27)

1. E. A. Bayer, L. J. W. Shimon, R. Lamed, Y. Shoham. J. Struct. Biol. 124, 221 (1998).
2. R. Lamed, E. Setter, R. Kenig, E. A. Bayer. Biotechnol. Bioeng. Symp. 13, 163 (1983).
3. R. Lamed, E. Setter, E. A. Bayer. J. Bacteriol. 156, 828 (1983).
4. E. A. Bayer, E. Morag, R. Lamed. Trends Biotechnol. 12, 379 (1994).
5. B. Lytle, C. Myers, K. Kruus, J. H. D. Wu. J. Bacteriol. 178, 1200 (1996).
6. S. Salamitou, O. Raynaud, M. Lemaire, M. Coughlan, P. Béguin, J.-P. Aubert. J. Bacteriol. 176, 2822 (1994).
7. K. Tokatlidis, P. Dhurjati, P. Béguin. Protein Eng. 6, 947 (1993).
8. K. Tokatlidis, S. Salamitou, P. Béguin, P. Dhurjati, J.-P. Aubert. FEBS Lett. 291, 185 (1991).
9. E. Leibovitz, P. Béguin. J. Bacteriol. 178, 3077 (1996).
10. E. Leibovitz, H. Ohayon, P. Gounon, P. Béguin. J. Bacteriol. 179, 2519 (1997).
11. M. Lemaire, H. Ohayon, P. Gounon, T. Fujino, P. Béguin. J. Bacteriol. 177, 2451 (1995).
12. L. J. W. Shimon, E. A. Bayer, E. Morag, R. Lamed, S. Yaron, Y. Shoham, F. Frolow. Structure 5, 381 (1997).
13. G. A. Tavares, P. Béguin, P. M. Alzari. J. Mol. Biol. 273, 701 (1997).
14. S. Spinelli, H. P. Fierobe, A. Belaich, J. P. Belaich, B. Henrissat, C. Cambillau. J. Mol. Biol. 304, 189 (2000).
15. I. Noach, F. Frolow, H. Jakoby, S. Rosenheck, L. J. W. Shimon, R. Lamed, E. A. Bayer. J. Mol. Biol. 348, 1 (2005).
16. I. Noach, R. Lamed, Q. Xu, S. Rosenheck, L. J. W. Shimon, R. Kenig, E. A. Bayer, F. Frolow. Acta Crystallogr., D 59, 1670 (2003).
17. A. L. Carvalho, V. M. Pires, T. M. Gloster, J. P. Turkenburg, J. A. Prates, L. M. Ferreira, M. J. Romao, G. J. Davies, C. M. Fontes, H. J. Gilbert. J. Mol. Biol. 349, 909 (2005).
18. D. Nakar, T. Handelsman, Y. Shoham, H.-P. Fierobe, J. P. Belaich, E. Morag, R. Lamed, E. A. Bayer. J. Biol. Chem. 279, 42881 (2004).
19. Y. Barak, T. Handelsman, D. Nakar, A. Mechaly, R. Lamed, Y. Shoham, E. A. Bayer. J. Mol. Recognit. 18, 491 (2005).
20. M. A. Larkin, G. Blackshields, N. P. Brown, R. Chenna, P. A. McGettigan, H. McWilliam, F. Valentin, I. M. Wallace, A. Wilm, R. Lopez, J. D. Thompson, T. J. Gibson, D. G. Higgins. Bioinformatics 23, 2947 (2007).
21. J. Pei, N. V. Grishin. Bioinformatics 23, 802 (2007).
22. E. Morag, A. Lapidot, D. Govorko, R. Lamed, M. Wilchek, E. A. Bayer, Y. Shoham. Appl. Environ. Microbiol. 61, 1980 (1995).
23. A. L. Carvalho, F. M. Dias, J. A. Prates, T. Nagy, H. J. Gilbert, G. J. Davies, L. M. Ferreira, M. J. Romão, C. M. Fontes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 13809 (2003).
24. A. L. Carvalho, F. M. V. Dias, T. Nagy, J. A. M. Prates, M. R. Proctor, N. Smith, E. A. Bayer, G. J. Davies, L. M. A. Ferreira, M. J. Ramão, C. M. G. A. Fontes, H. J. Gilbert. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104, 3089 (2007).
25. B. A. Pinheiro, M. R. Proctor, C. C. Martinez-Fleites, J. A. M. Prates, V. A. Money, G. J. Davies, E. A. Bayer, C. M. G. A. Fontes, H.-P. Fierobe, H. J. Gilbert. J. Biol. Chem 283, 18422 (2008).
26. J. J. Adams, G. Pal, Z. Jia, S. P. Smith. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 305 (2006).
27. E. Gasteiger, C. Hoogland, A. Gattiker, S. Duvaud, M. R. Wilkins, R. D. Appel, A. Bairoch. In The Proteomics Protocols Handbook, J. M. Walker (Ed.), pp. 571-607, Humana Press, Tolowa, NJ (2005).