Molecular dynamics investigation of the bimolecular reaction BeH + H 2 → BeH2 + hon an ab initio potential-energy surface obtained using neural network methods with both potential and gradient accuracy determination

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 114, Issue 1, 2010, Pages 45-53

  Le, Hung M ^a   Raff, Lionel M ^a  

^a OKLAHOMA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AB INITIO; BIMOLECULAR REACTION; BOND EXTENSION; CLASSICAL REACTIONS; CLASSICAL TRAJECTORIES; CLOCK SPEED; CONFIGURATION SPACE; DATA POINTS; ENERGY ERROR; ENSEMBLE AVERAGES; FIRST EXCITED STATE; GAS-PHASE REACTIONS; GRADIENT ERRORS; GRADIENT MAGNITUDE; INTEGRATION TIME; MEAN ABSOLUTE ERROR; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; NEURAL NETWORK METHOD; QUANTUM DYNAMICS; QUANTUM REACTIONS; REACTION CROSS-SECTIONS; RELATIVE GRADIENT; RESONANCE EFFECT; SAMPLING METHOD; SAMPLING PROCESS; TOTAL ENERGY; ZERO ANGULAR MOMENTUM; ZERO-POINT VIBRATIONAL ENERGIES;

DYNAMICS; FLOW MEASUREMENT; MOLECULAR DYNAMICS; NEURAL NETWORKS; PHASE INTERFACES; POTENTIAL ENERGY; QUANTUM CHEMISTRY; REACTION KINETICS;

POTENTIAL ENERGY SURFACES;

EID: 75249087503     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp907507z     Document Type: Article

References (51)

1. Hagan, M. T.; Demuth, H. B.; Beale, M. Neural Network Design; Colorado University Bookstore: Boulder, 1996.
2. Doughan, D. I.; Raff, L. M.; Rockley, M. G.; Hagan, M. T.; Agrawal, P. M.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 054321.
3. Doughan, D. I.; Raff, L. M.; Rockley, M. G.; Hagan, M. T.; Agrawal, P. M.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2006, 125, 079901.
4. Malshe, M.; Raff, L. M.; Rockley, M. G.; Agrawal, P. M.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2007, 127, 134105.
5. Le, H. M.; Raff, L. M. J. Chem. Phys. 2008, 128, 194310.
6. Agrawal, P. M.; Malshe, M.; Narulkar, R.; Raff, L. M.; Hagan, M. T.; Bukkapatnum, S.; Komanduri, R. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 869.
7. Pukrittayakamee, A.; Malshe, M.; Hagan, M. T.; Raff, L. M.; Narulkar, R.; Bukkapatnum, S.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2009, 130, 134101.
8. Pukrittayakamee, A.; Hagan, M. T.; Raff, L. M.; Bukkapatnam, S.; Komanduri, R. Intell. Eng. Syst. Artif. Neural Networks 2007, 17 (ANNIE2007).
9. Blank, T. B.; Brown, S. D. Anal. Chem. Acta 1993, 277, 273.
10. Blank, T. B.; Brown, S. D.; Calhoun, S. W.; Doren, D. J. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4129.
11. Hobday, S.; Smith, R.; BelBruno, J. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res., Sect. B 1999, 153, 247.
12. Tafeit, E.; Estelberger, W.; Horejsi, R.; Moeller, R.; Oettl, K.; Vrecko, K.; Reibnegger, G. J. Mol. Graphics 1996, 14, 12.
13. Gassner, H.; Probst, M.; Lauenstein, A.; Hermansson, K. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4596.
14. Brown, D. R.; Gibbs, M. N.; Clary, D. C. J. Chem. Phys. 1996, 105, 7597.
15. Manzhos, S.; Wang, X.; Dawes, R.; Carrington, T., Jr. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 5295.
16. Manzhos, S.; Carrington, T. J., Jr. J. Chem. Phys. 2006, 125, 194105.
17. Manzhos, S.; Carrington, T. J., Jr. J. Chem. Phys. 2006, 125, 084109.
18. Manzhos, S.; Carrington, T. J., Jr. J. Chem. Phys. 2008, 129, 224104.
19. Lorenz, S.; Gross, A.; Scheffier, M. Chem. Phys. Lett. 2004, 395, 210.
20. Raff, L. M.; Malshe, M.; Hagan, M. T.; Doughan, D. I.; Rockley, M. G.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2005, 122, 084104.
21. Le, H. M.; Huynh, S.; Raff, L. M. J. Chem. Phys. 2009, 131, 014107.
22. Prudente, F. V.; Acioli, P. H.; Neto, J. J. S. J. Chem. Phys. 1998. 109, 8801.
23. Agrawal, P. M.; Raff, L. M.; Hagan, M. T.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 134306.
24. Malshe, M.; Narulkar, R.; Raff, L. M.; Hagan, M. T.; Bukkapatnam, S.; Agrawal, P. M.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2009, 130, 184102.
25. Malshe, M.; Narulkar, R.; Raff, L. M.; Hagan, M. T.; Bukkapatnam, S.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2008, 129, 044111.
26. Agrawal, P. M.; Samadh, A. N. A.; Raff, L. M.; Hagan, M. T.; Bukkapatnam, S.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2005, 123,1.
27. Bukkapatanam, S.; Malshe, M.; Agrawal, P. M.; Raff, L. M.; Komanduri, R. Phys. Rev.B 2006, 74, 224102.
28. Malshe, M.; Pukrittayakamee, A.; Hagan, M. T.; Raff, L. M.; Bukkapatnum, S.; Komanduri, R. J. Chem. Phys. 2009, 131, 124127.
29. (a) Collins, M. A.; Bettens, R. P. A. Phys. Chem. Chem. Phys.
30. 1999, 1, 939.
31. b) Collins, M. A.; Zhang, D. H. J. Chem. Phys. 1999, 111, 9924.
32. c) Bettens, R. P. A.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 1999, 111, 816.
33. Thompson, K. C.; Collins, M. A. Faraday Trans. 1997, 93, 871.
34. Ischtwan, J.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 1994, 100, 8080.
35. Head-Gordon, M.; Pople, J. A.; Frisch, M. J. Chem. Phys. Lett. 1988, 153, 503.
36. Frisch, M. J.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 275.
37. Frisch, M. J.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 281.
38. Head-Gordon, M.; Head-Gordon, T. Chem. Phys. Lett. 1994, 220, 122.
39. Saebo, S.; Almlof, J. Chem. Phys. Lett. 1989, 154, 83.
40. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; et al. Gaussian 98, Revision A.1; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2001.
41. Zhang, D. H.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 1994, 101, 1146.
42. Zhang, D. H.; Light, J. C.; Lee, S. Y. J. Chem. Phys. 1998, 109, 79.
43. Zhang, D. H.; Lee, S. Y. J. Chem. Phys. 1998, 110, 4435.
44. Hornik, M.; Stinchcombe, M.; White, H. Neural Networks 1989, 2, 359.
45. Lawrence, S.; Giles, C. L. Int. Jt. Conf. Neural Networks 2000, 1, 1114.
46. Collins, M. A. Theor. Chem. Acc. 2002, 108, 313.
47. Rahaman, A.; Raff, L. M. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 2156.
48. Guan, Y.; Thompson, D. L. Chem. Phys. 1989, 139, 147.
49. Raff, L. M.; Thompson, D. L. Theory of Chemical Reaction Dynamics; Baer, M., Ed.; CRC: Boca Raton, FL, 1985; Vol. 3, p 1.
50. Raff, L. M.; Porter, R. N.; Thompson, D. L.; Sims, L. B. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 3208.
51. Raff, L. M.; Sims, L. B.; Thompson, D. L.; Porter, R. N. J. Chem. Phys. 1970, 53, 1606.