메뉴 건너뛰기




Volumn 27, Issue 4, 2010, Pages 489-499

Molecular modeling of the additional inhibitor site located in secretory phospholipase a2

Author keywords

Aldehyde terpenoids; Inhibitor docking; Secretory Phospholipase A2

Indexed keywords

ALDEHYDE; ALDEHYDE OXIDASE; CALCIUM ION; DOCKING PROTEIN; PHOSPHOLIPID BINDING PROTEIN; SECRETORY PHOSPHOLIPASE A2; TERPENOID DERIVATIVE;

EID: 75149170172     PISSN: 07391102     EISSN: 15380254     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/07391102.2010.10507333     Document Type: Article
Times cited : (20)

References (52)
  • 27
    • 34247632210 scopus 로고    scopus 로고
    • (a). (b) K. Sekar, M. Yogavel, Shankar Prasad Kanaujia, Alok Sharma, D. Velmurugan, M.-J. Poi, Z. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta CrystD62, 717–724 (2006). (c) D. Velmurugan, V. Rajakannan, D. Gayathri, S. Banumathi, T. Yamane, Z. Dauter, M. Dauter, and K. Sekar. Curr Science 90, 1091–1099 (2006). (d). K. Sekar, D. Gayathri, D. Velmurugan, J. Jeyakanthan, T. Yamane, M.-J. Poi, and M.-D. Tsai. Acta Cryst D 62, 392–397 (2006). (e) K. Sekar, M. Yogavel, D. Gayathri, D. Velmurugan, R. Krishna, M.-J. Poi, Z. Dauter, M. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta Cryst F 62, 1–5 (2006). (f) K. Sekar, V. Rajakannan, D. Gayathri, D. Velmurugan, M.-J. Poi, M. Dauter, Z. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta Cryst F61, 3–7 (2005). (g) K. Sekar, V. Rajakannan, D. Velmurugan, T. Yamane, R. Thirumurugan, M. Dauter, and Z. Dauter. Acta Cryst D 60, 1586–1590 (2004). (h) K. Sekar, S. V. Mala, M. Yogavel, D. Velmurugan, M.-J. Poi, B. S. V. Nath, T. V. Gowda, A. A. J. Prakash, and M.-D. Tsai. J Mol Biol 333, 367–376 (2003). (i) V. Rajakannan, M. Yogavel, M.-J. Poi, A. A. Jeya Prakash, J. Jeyakanthan, D. Velmurugan, M.-D. Tsai, and K. Sekar. J Mol Biol 324(4), 755–762 (2002). (j) Bao-Zhu Yu, M.-J. Poi, U. A. Ramagopal, R. Jain, S. Ramakumar, Otto G. Berg, M.-D. Tsai, K. Sekar and M. K. Jain. Biochemistry 39, 12312–12323 (2000). (k) K. Sekar, R. Biswas, Y. Li., M.-D. Tsai, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D55, 443–447 (1999). (l) K. Sekar, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D55, 46–50 (1999). (m) K. Sekar, C. Sekharudu, M.-D. Tsai, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D54, 342–346 (1998). (n) K. Sekar, S. Eswaramoorthy, M. K. Jain, and M. Sundaralingam. Biochemistry 36, 14186–14191 (1997). (o) K. Sekar, Bao-Zhu Yu, Joseph Rogers, John Lutton, Xiaohong Liu, M.-D. Tsai, M. K. Jain, and M. Sundaralingam. Biochemistry 36, 3104–3114 (1997). (p) B. Huang, B. Z. Yu, J. Rogers, In.-J. L. Byeon, K. Sekar, X. Chen, M. Sundaralingam, M. K. Jain, and M.-D. Tsai. Biochemistry 35, 12164–12174 (1996)
    • Sekar, K., 2007. Curr Top in Med Chem, 7:779–785. (a). (b) K. Sekar, M. Yogavel, Shankar Prasad Kanaujia, Alok Sharma, D. Velmurugan, M.-J. Poi, Z. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta CrystD62, 717–724 (2006). (c) D. Velmurugan, V. Rajakannan, D. Gayathri, S. Banumathi, T. Yamane, Z. Dauter, M. Dauter, and K. Sekar. Curr Science 90, 1091–1099 (2006). (d). K. Sekar, D. Gayathri, D. Velmurugan, J. Jeyakanthan, T. Yamane, M.-J. Poi, and M.-D. Tsai. Acta Cryst D 62, 392–397 (2006). (e) K. Sekar, M. Yogavel, D. Gayathri, D. Velmurugan, R. Krishna, M.-J. Poi, Z. Dauter, M. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta Cryst F 62, 1–5 (2006). (f) K. Sekar, V. Rajakannan, D. Gayathri, D. Velmurugan, M.-J. Poi, M. Dauter, Z. Dauter, and M.-D. Tsai. Acta Cryst F61, 3–7 (2005). (g) K. Sekar, V. Rajakannan, D. Velmurugan, T. Yamane, R. Thirumurugan, M. Dauter, and Z. Dauter. Acta Cryst D 60, 1586–1590 (2004). (h) K. Sekar, S. V. Mala, M. Yogavel, D. Velmurugan, M.-J. Poi, B. S. V. Nath, T. V. Gowda, A. A. J. Prakash, and M.-D. Tsai. J Mol Biol 333, 367–376 (2003). (i) V. Rajakannan, M. Yogavel, M.-J. Poi, A. A. Jeya Prakash, J. Jeyakanthan, D. Velmurugan, M.-D. Tsai, and K. Sekar. J Mol Biol 324(4), 755–762 (2002). (j) Bao-Zhu Yu, M.-J. Poi, U. A. Ramagopal, R. Jain, S. Ramakumar, Otto G. Berg, M.-D. Tsai, K. Sekar and M. K. Jain. Biochemistry 39, 12312–12323 (2000). (k) K. Sekar, R. Biswas, Y. Li., M.-D. Tsai, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D55, 443–447 (1999). (l) K. Sekar, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D55, 46–50 (1999). (m) K. Sekar, C. Sekharudu, M.-D. Tsai, and M. Sundaralingam. Acta Cryst D54, 342–346 (1998). (n) K. Sekar, S. Eswaramoorthy, M. K. Jain, and M. Sundaralingam. Biochemistry 36, 14186–14191 (1997). (o) K. Sekar, Bao-Zhu Yu, Joseph Rogers, John Lutton, Xiaohong Liu, M.-D. Tsai, M. K. Jain, and M. Sundaralingam. Biochemistry 36, 3104–3114 (1997). (p) B. Huang, B. Z. Yu, J. Rogers, In.-J. L. Byeon, K. Sekar, X. Chen, M. Sundaralingam, M. K. Jain, and M.-D. Tsai. Biochemistry 35, 12164–12174 (1996)
    • (2007) Curr Top in Med Chem , vol.7 , pp. 779-785
    • Sekar, K.1
  • 29
    • 0018904327 scopus 로고
    • (a). (b) E. D. de Silva and P. J. Scheuer. Tetrahedron Lett 22, 3147–3150 (1981). (c) G. Cimino, S. de Stefano, and L. Minale. Experientia 30, 846–847 (1974). (d) G. Cimino, G. Sodano, and A. Spinella. Tetrahedron 43, 5401–5410 (1987)
    • de Silva, D. E., and Scheuer, P. J., 1980. Tetrahedron Lett, 21:1611–1614. (a). (b) E. D. de Silva and P. J. Scheuer. Tetrahedron Lett 22, 3147–3150 (1981). (c) G. Cimino, S. de Stefano, and L. Minale. Experientia 30, 846–847 (1974). (d) G. Cimino, G. Sodano, and A. Spinella. Tetrahedron 43, 5401–5410 (1987)
    • (1980) Tetrahedron Lett , vol.21 , pp. 1611-1614
    • de Silva, D.E.1    Scheuer, P.J.2
  • 30
    • 0021591782 scopus 로고
    • (a). (b) R. S. Jacobs, P. Culver, R. Langdon, T. O'Brien, and S. Wtfite. Tetrahedron 41(6), 981–984 (1985) (c) K. B. Glaser and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 35(3), 449–453 (1986). (d) C. F. Bennett, S. Mong, M. A. Clarke, L. I. Kruse, and S. T. Crooke. Biochem Pharm 36(5), 733–740 (1987)
    • de Freitas, J. C., Blankemeier, L. A., Jocobs, R. S., and Inhibitory mechanism toward bee venom PLA2;. 1984. Experientia, 40 (7):864–865. (a). (b) R. S. Jacobs, P. Culver, R. Langdon, T. O'Brien, and S. Wtfite. Tetrahedron 41(6), 981–984 (1985) (c) K. B. Glaser and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 35(3), 449–453 (1986). (d) C. F. Bennett, S. Mong, M. A. Clarke, L. I. Kruse, and S. T. Crooke. Biochem Pharm 36(5), 733–740 (1987)
    • (1984) Experientia , vol.40 , Issue.7 , pp. 864-865
    • de Freitas, J.C.1    Blankemeier, L.A.2    Jocobs, R.S.3
  • 32
    • 0023223997 scopus 로고
    • (f). (g) M. R. Keman and D. J. Faulkner. J Org Chem 53, 2773–2776 (1988). (h) K. B. Glaser, T. S. Vedvick, and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 37(19), 3639–3646 (1988). (i) M. R. Kernan, D. J. Faulkner, L. Parkanyi, J. Clardy, M. S. de Carvalho, and R. S. Jacobs. Experientia 45, 388–390 (1989). (j) K. B. Glaser, M. S. de Carvalho, R. S. Jacobs, M. R. Kernan, and D. Faulkner. J Mol Pharm 36, 782–788 (1989). (k) M. S. de Carvaiho and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 42, 1621–1626 (1991). (l) B. C. M. Potts, R. J. Capon, and D. Faulkner. J Org Chem 57, 2965–2967 (1992). (m) B. C. M. Potts, D. J. Faulkner, M. S. de Carvalho, and R. S. Jacobs. J Am Chem Soc 114, 5093–5100 (1992). (n) A. R. Ortiz, M. T. Pisabarro, and F. Gago. J Med Chem 36, 1866–1879 (1993)
    • Albizati, K. F., Holman, T., Faulkner, D. J., Glaser, K. B., and Jacobs, R. S., 1987. Experientia, 43:949–950. (f). (g) M. R. Keman and D. J. Faulkner. J Org Chem 53, 2773–2776 (1988). (h) K. B. Glaser, T. S. Vedvick, and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 37(19), 3639–3646 (1988). (i) M. R. Kernan, D. J. Faulkner, L. Parkanyi, J. Clardy, M. S. de Carvalho, and R. S. Jacobs. Experientia 45, 388–390 (1989). (j) K. B. Glaser, M. S. de Carvalho, R. S. Jacobs, M. R. Kernan, and D. Faulkner. J Mol Pharm 36, 782–788 (1989). (k) M. S. de Carvaiho and R. S. Jacobs. Biochem Pharm 42, 1621–1626 (1991). (l) B. C. M. Potts, R. J. Capon, and D. Faulkner. J Org Chem 57, 2965–2967 (1992). (m) B. C. M. Potts, D. J. Faulkner, M. S. de Carvalho, and R. S. Jacobs. J Am Chem Soc 114, 5093–5100 (1992). (n) A. R. Ortiz, M. T. Pisabarro, and F. Gago. J Med Chem 36, 1866–1879 (1993)
    • (1987) Experientia , vol.43 , pp. 949-950
    • Albizati, K.F.1    Holman, T.2    Faulkner, D.J.3    Glaser, K.B.4    Jacobs, R.S.5
  • 33
    • 0022432248 scopus 로고
    • (a). (b) R. A. Deems, D. Lombardo, B. P. Morgan, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. Biochim Blophys Acta 917, 258–268 (1987). (c) L. J. Reynolds, B. P. Morgan, G. A. Hite, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. J Am Chem Soc 110, 5172–5177 (1988). (d) L. J. Reynolds, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. J Biol Chem266, 16512–16517 (1991). (e) L. A. Plesniak, S. C. Boegeman, B. W. Segelke, and E. A. Dennis. Biochemistry 32, 5009–5016 (1993). (f) E. A. Dennis. J Biol Chem 269, 13057–13060 (1994). (g) I. D. Bianco, M. J. Kelley, R. M. Crowl, and E. A. Dennis. Biochim Biophys Acta 1250, 197–203 (1995)
    • Lombardo, D., Dennis, E. A., and Inhibitory mechanism toward cobra venom PLA2. 1985. J Biol Chem, 260:7234–7240. (a). (b) R. A. Deems, D. Lombardo, B. P. Morgan, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. Biochim Blophys Acta 917, 258–268 (1987). (c) L. J. Reynolds, B. P. Morgan, G. A. Hite, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. J Am Chem Soc 110, 5172–5177 (1988). (d) L. J. Reynolds, E. D. Mihelich, and E. A. Dennis. J Biol Chem266, 16512–16517 (1991). (e) L. A. Plesniak, S. C. Boegeman, B. W. Segelke, and E. A. Dennis. Biochemistry 32, 5009–5016 (1993). (f) E. A. Dennis. J Biol Chem 269, 13057–13060 (1994). (g) I. D. Bianco, M. J. Kelley, R. M. Crowl, and E. A. Dennis. Biochim Biophys Acta 1250, 197–203 (1995)
    • (1985) J Biol Chem , vol.260 , pp. 7234-7240
    • Lombardo, D.1    Dennis, E.A.2
  • 46
    • 84943502952 scopus 로고
    • Nosé, S., 1984. Mol Phys, 52 (2):255–268.
    • (1984) Mol Phys , vol.52 , Issue.2 , pp. 255-268
    • Nosé, S.1
  • 47
    • 0001538909 scopus 로고
    • Hoover, W. G., 1985. Phys Rev A, 31 (3):1695–1697.
    • (1985) Phys Rev A , vol.31 , Issue.3 , pp. 1695-1697
    • Hoover, W.G.1


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.