Unraveling the potential of intrinsically disordered proteins as drug targets: Application to Mycobacterium tuberculosis

Molecular BioSystems

Volumn 5, Issue 12, 2009, Pages 1752-1757

  Anurag, Meenakshi ^a   Dash, Debasis ^a  

^a CSIR INSTITUTE OF GENOMICS AND INTEGRATIVE BIOLOGY   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; FTSW PROTEIN, BACTERIA; GLMU PROTEIN, MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; GUANINE NUCLEOTIDE BINDING PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN; MULTIENZYME COMPLEX; OBG GTP BINDING PROTEIN, BACTERIA; OBG GTP-BINDING PROTEIN, BACTERIA; PROTEOME; TUBERCULOSTATIC AGENT;

ARTICLE; BIOLOGY; COMPUTER SIMULATION; DRUG DELIVERY SYSTEM; DRUG EFFECT; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETICS; METABOLISM; METHODOLOGY; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; PROTEIN ANALYSIS;

ANTITUBERCULAR AGENTS; BACTERIAL PROTEINS; COMPUTATIONAL BIOLOGY; COMPUTER SIMULATION; DRUG DELIVERY SYSTEMS; GENE EXPRESSION REGULATION, BACTERIAL; GTP-BINDING PROTEINS; MEMBRANE PROTEINS; MULTIENZYME COMPLEXES; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; PROTEIN INTERACTION MAPPING; PROTEOME;

EUKARYOTA; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; PROKARYOTA;

EID: 72949092693     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b905518p     Document Type: Article

References (40)

1. WHO, Global tuberculosis control-surveillance, planning, financing, 2008, http://www.who.int/tb/publications/global-report/2008/en
2. A. C. Murillo H. Y. Li T. Alber E. N. Baker J. M. Berger L. T. Cherney M. M. Cherney Y. S. Cho D. Eisenberg C. R. Garen C. W. Goulding L. W. Hung T. R. Ioerger W. R. Jacobs M. N. James C. Kim I. Krieger J. S. Lott R. Sankaranarayanan B. W. Segelke T. C. Terwilliger F. Wang S. Wang J. C. Sacchettini Infect. Disord. Drug Targets 2007 7 127 139
3. S. T. Cole R. Brosch J. Parkhill T. Garnier C. Churcher D. Harris S. V. Gordon K. Eiglmeier S. Gas C. E. Barry III F. Tekaia K. Badcock D. Basham D. Brown T. Chillingworth R. Connor R. Davies K. Devlin T. Feltwell S. Gentles N. Hamlin S. Holroyd T. Hornsby K. Jagels A. Krogh J. McLean S. Moule L. Murphy K. Oliver J. Osborne M. A. Quail M. A. Rajandream J. Rogers S. Rutter K. Seeger J. Skelton R. Squares S. Squares J. E. Sulston K. Taylor S. Whitehead B. G. Barrell Nature 1998 393 537 544
4. P. Tompa Trends Biochem. Sci. 2002 27 527 533
5. A. K. Dunker C. J. Brown J. D. Lawson L. M. Iakoucheva Z. Obradovic Biochemistry 2002 41 6573 6582
6. Y. Cheng T. LeGall C. J. Oldfield J. P. Mueller Y. Y. Van P. Romero M. S. Cortese V. N. Uversky A. K. Dunker Trends Biotechnol. 2006 24 435 442
7. N. Issaeva A. Friedler P. Bozko K. G. Wiman A. R. Fersht G. Selivanova Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 13303 13307
8. J. J. Ward J. S. Sodhi L. J. McGuffin B. F. Buxton D. T. Jones J. Mol. Biol. 2003 337 635 645
9. Z. Dosztanyi V. Csizmok P. Tompa I. Simon J. Mol. Biol. 2005 347 827 839
10. Z. Dosztanyi V. Csizmok P. Tompa I. Simon Bioinformatics 2005 21 3433 3434
11. J. Cheng M. Sweredoski P. Baldi Data Mining and Knowledge Discovery 2005 11 213 222
12. C. M. Sassetti D. H. Boyd E. J. Rubin Mol. Microbiol. 2003 48 77 84
13. H. Hegyi E. Schad P. Tompa BMC Struct. Biol. 2007 7 65
14. C. Haynes C. J. Oldfield F. Ji N. Klitgord M. E. Cusick P. Radivojac V. N. Uversky M. Vidal L. M. Iakoucheva PLoS Comput. Biol. 2006 2 e100
15. G. P. Singh M. Ganapathi D. Dash Proteins 2007 66 761 765
16. A. J. Steyn D. M. Collins M. K. Hondalus W. R. Jacobs Jr R. P. Kawakami B. R. Bloom Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 3147 3152
17. C. Mani N. Selvakumar S. Narayanan P. R. Narayanan J. Clin. Microbiol. 2001 39 2987 2990
18. S. Hasan S. Daugelat P. S. Rao M. Schreiber PLoS Comput. Biol. 2006 2 e61
19. P. Datta A. Dasgupta A. K. Singh P. Mukherjee M. Kundu J. Basu Mol. Microbiol. 2006 62 1655 1673
20. P. Datta A. Dasgupta S. Bhakta J. Basu J. Biol. Chem. 2002 277 24983 24987
21. F. Gueiros-Filho, Cell Division, in Bacillus: Cellular and Molecular Biology, ed., P. Graumann, Horizon Scientific Press/Caister Academic Press, Norwich, UK, 2007
22. A. M. Gehring W. J. Lees D. J. Mindiola C. T. Walsh E. D. Brown Biochemistry 1996 35 579 585
23. L. R. Olsen S. L. Roderick Biochemistry 2001 40 1913 1921
24. W. Zhang V. C. Jones M. S. Scherman S. Mahapatra D. Crick S. Bhamidi Y. Xin M. R. McNeil Y. Ma Int. J. Biochem. Cell Biol. 2008 40 2560 2571
25. J. Buglino V. Shen P. Hakimian C. D. Lima Structure 2002 10 1581 1592
26. Y. I. Wolf L. Aravind N. V. Grishin E. V. Koonin Genome Res. 1999 9 689 710
27. J. M. Scott W. G. Haldenwang J. Bacteriol. 1999 181 4653 4660
28. E. Gasteiger A. Gattiker C. Hoogland I. Ivanyi R. D. Appel A. Bairoch Nucleic Acids Res. 2003 31 3784 3788
29. M. Cokol R. Nair B. Rost EMBO Rep. 2000 1 411 415
30. R. Zhang H. Y. Ou C. T. Zhang Nucleic Acids Res. 2004 32 D271 D272
31. R. Zhang Y. Lin Nucleic Acids Res. 2009 37 D455 D458
32. L. J. Jensen M. Kuhn M. Stark S. Chaffron C. Creevey J. Muller T. Doerks P. Julien A. Roth M. Simonovic P. Bork M. C. von Nucleic Acids Res. 2009 37 D412 D416
33. B. Snel G. Lehmann P. Bork M. A. Huynen Nucleic Acids Res. 2000 28 3442 3444
34. M. C. von Huynen D. Jaeggi S. Schmidt P. Bork B. Snel Nucleic Acids Res. 2003 31 258 261
35. M. C. von L. J. Jensen B. Snel S. D. Hooper M. Krupp M. Foglierini N. Jouffre M. A. Huynen P. Bork Nucleic Acids Res. 2005 33 D433 D437
36. M. C. von L. J. Jensen M. Kuhn S. Chaffron T. Doerks B. Kruger B. Snel P. Bork Nucleic Acids Res. 2007 35 D358 D362
37. M. Kuhn M. C. von M. Campillos L. J. Jensen P. Bork Nucleic Acids Res. 2008 36 D684 D688
38. K. R. Sakharkar, M. K. Sakharkar and V. T. K. Chow, Biocomputational Strategies for Microbial Drug Target Identification, in New Antibiotic Targets, ed., W. S. Champney, Humana Press, Totowa, New Jersey, 2008, pp. 1-9
39. S. F. Altschul W. Gish W. Miller E. W. Myers D. J. Lipman J. Mol. Biol. 1990 215 403 410
40. W. Li A. Godzik Bioinformatics 2006 22 1658 1659