Relevance of low molecular weight compounds produced by fungi and involved in wood biodegradation;RELEVÂNCIA de COMPOSTOS de BAIXA MASSA MOLAR PRODUZIDOS POR FUNGOS e ENVOLVIDOS NA BIODEGRADAÇÃO da MADEIRA

Quimica Nova

Volumn 32, Issue 6, 2009, Pages 1586-1595

  Arantes, Valdeir ^a   Milagres, Adriane M F ^b  

^a UNIVERSITY OF BRITISH COLUMBIA   (Canada)

^b UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

Author keywords

Enzymes; Low molecular weight compounds; Wood biodegradation

Indexed keywords

EID: 70349929030     PISSN: 01004042     EISSN: 16787064     Source Type: Journal    
DOI: 10.1590/s0100-40422009000600043     Document Type: Article

References (150)

1. Pointing, S. B.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 57, 20.
2. Archibald, F. S.; Paice, M. G.; Jurasek, L.; Enzyme Microb. Technol. 1990,12, 846.
3. Duran, N.; Esposito, E.; Appl. Catal. B 2000, 28, 83.
4. Andersson, B. E.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996, 46, 647.
5. Allard, A. -S.; Neilson, A. H.; Int. Biodeterior. Biodegrad. 1997, 39, 253.
6. Hatakka, A.; Maijala, P.; Mettälä, A.; Hakala, T; Hauhio, L.; Ellmén, J.; Prog. Biotechnol. 2002, 21, 81.
7. Ferraz, A.; Guerra, A.; Mendonça, R.; Masarin, F.; Vicentim, M. P.; Aguiar, A.; Pavan, P. G; Enzyme Microb. Technol. 2008, 43, 178.
8. Milagres, A. M. F; Arantes, V; Medeiros, C. L.; Machuca, A.; Enzyme Microb. Technol. 2002, 30, 562.
9. Bajpai, P.; Crit. Rev. Biotechnol. 2004, 24, 1.
10. Moreira, M. T.; Feijoo, G.; Sierra-Alvarez, R.; Field, J. A.; Bioresour. Technol. 1999, 70, 255.
11. Blanchette, R. A.; Krueger, E. W; Haight, J. E.; Akhtar, M.; Akin, D. E.; J. Biotechnol. 1997, 53, 203.
12. Goodell, B.; Jellison, J.; Liu, J.; Daniel, G.; Paszczynski, A.; Fekete, F; Krishnamurthy, S.; Jun, L.; Xu, G.; J. Biotechnol. 1997, 53, 133.
13. Fengel, D.; Wegener, G.; Wood: Chemsitry, ultrastructure, reactions, Walter de Gruyter: Berlin, 1989.
14. Blanchette, R. A. Em The structural conservation of panel paintings: proceedings of a symposium at the J. Paul Getty Museum; Dardes, K.; Rothe, A., eds.; Getty Conservation Institute: Los Angeles, 1998.
15. Blanchette, R. A.; Int. Biodeterior. Biodegrad. 2000, 46, 189.
16. Schwarze, F. W. M. R.; Fungal Biology Rev. 2007, 21, 133.
17. Gilbertson, R. L.; Mycologia 1980, 72, 1.
18. Worrall, J. J.; Anagnost, S. E.; Zabel, R. A.; Mycologia 1997, 89, 199.
19. Daniel, G. Em Wood Deterioration and Preservation -Advances in our Changing World; Goodell, B.; Nicholas, D. D.; Schultz, T. P., eds.; ACS Symp. Ser 845, American Chemical Society: Washington, 2003.
20. Blanchette, R. A.; Ann. Rev. Phytopathol 1991, 29, 381.
21. Eriksson, K. E. L.; Blanchette, R. A.; Ander, P.; Biodegradation of lignin. Microbial and enzymatic degradation of wood and wood components, Springer-Verlag: Berlin, 1990.
22. Rayner, A. D. M.; Boddy, L.; Fungal Decomposition of Wood: its Biology and Ecology, John Wiley: Chichester, 1988.
23. Ander, P.; Stoytschev, I.; Eriksson, K. E.; Cellul Chem. Technol. 1988, 22, 255.
24. Enoki, A.; Tanaka, H.; Fuse, G.; Holzforchung 1988, 42, 85.
25. Blanchette, R. A; Obst, J. R.; Timell, T. E.; Holzforschung 1994, 48, 34.
26. Machuca, M.; Ferraz, A.; Enzyme Microbial Technol. 2001, 29, 386.
27. Highley, T. L.; Murmanis, L. L.; Palmer, J. G.; Holzforschung 1985, 39, 73.
28. Xu, G.; Goodell, B.; J. Biotechnol. 2001, 27, 43.
29. Kirk, T. K.; Cullen, D.; Environmentally friendly technologies for the pulp and paper industry, New York, John Wiley and Sons: New York, 1998.
30. Cullen, D.; Kersten, P. J.; The Mycota III Biochemistry and Molecular Biology, Springer-Verlag: Berlin, 2004.
31. Enoki, A.; Itajura, S.; Tanaka, H.; J. Biotechnol. 1997, 53, 265.
32. Henriksson, G.; Johansson, G.; Pettersson, G.; J. Biotechnol. 2000, 78, 93.
33. Vries, R. P.; Visser, J.; Microbiol. Mol Biol. Rev. 2001, 65, 497.
34. Kuhad, R. C.; Singh, A. W; Eriksson, K. E. L.; Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology, Springer-Verlag Heidelberg: New York, vol.57, 1997.
35. Martinez, A.; Enzyme Microb. Technol. 2002, 30, 425.
36. Kersten, P. J.; Kirk, T. K.; J. Bacterial. 1987, 169, 2195.
37. Hu, G.; Zhang, W.; Lu, X.; Gao, P.; Sci. China: Ser. C Life Sci 2006, 49, 1.
38. Srebotnik, E.; Boisson, J. -N.; Enzyme Microb. Technol. 2005, 36, 785.
39. Messner, K.; Srebotnik, E.; FEMS Microbiol. Rev. 1994, 13, 351.
40. Poulos, T. L.; Edwards, S. L.; Wariishi, H.; J. Biolog. Chem. 1993, 268, 4429.
41. Harvey, P. J.; Schoemaker, H. E.; Palmer, J. M.; FEBS Lett. 1986, 195, 242.
42. ten Have, R.; Teunissen, P. J. M.; Chem. Rev. 2001, 101, 3397.
43. Bourbonnais, R.; Paice, M. G.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 1992, 36, 823.
44. Potthast, A.; Rosenau, T; Chen, G L.; Gratzl, J. S. J.; Org. Chem. 1995, 60, 4320.
45. Banci, L.; Ciofi-baffoni, S.; Tien, M.; Biochem. 1999, 38, 3205.
46. Cantarella, G.; Galli, G.; Gentili, C.; J. Mol Catal. B 2003, 22, 135.
47. Eggert, C.; Temp, U.; Dean, J. F; Eriksson, K. -E. L.; FEBS Lett. 1996, 391, 144.
48. Li, K.; Horanyi, P.; Collins, R.; Phillips, R. S.; Eriksson, K. -E. L.; Enzyme Microb. Technol. 2001, 28, 301.
49. Camarero, S.; Ibarra, D.; Martinez, A. T.; Romero, J.; Gutierrez, A; Del Rio, J. C.; Enzyme Microb. Technol. 2007, 40, 1264.
50. Shimada, M.; Fumiakin, M.; Kirk, T. K.; Higuchi, T.; Arch. Microbiol 1981, 129, 321.
51. Zapanta, L. S.; Tien, M.; J. Biotechnol. 1997, 53, 93.
52. Jong, E.; Field, J. A.; Bont, J. A. M.; FEMS Microbiol. Rev. 1994, 13, 153.
53. Gilardi, G.; Harvey, P. J.; Cass, A. E. G.; Palmer, J. M.; Biochim. Biophys. Acta 1990, 1041, 129.
54. Khindaria, A.; Grover, T. A.; Aust, S. D.; Biochem. 1995, 34, 6020.
55. Baciocchi, E.; Bietti, M.; Steenken, S.; J. Phys. Chem. A. 1998, 102, 7337.
56. Baciocchi, E.; Bietti, M.; Gerini, M. F; Lanzalunga, O.; Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002, 293, 832.
57. Candeias, L. P.; Harvey, P. J.; J. Biol. Chem. 1995, 270, 16745.
58. Khindaria, A.; Yamazaki, I.; Aust, S. D.; Biochem. 1996, 35, 6418.
59. Khindaria, A.; Yamazaki, L; Aust, S. D.; Biochem. 1995, 34, 16860.
60. Popp, J. L.; Kalyanaraman, B.; Kirk, T. K.; Biochem. 1990, 29, 10475.
61. de Jong, E.; Field, J.; Annu. Rev. Microbiol. 1997, 51, 375.
62. Teunissen, P. J. M.; Field, J. A.; Appl. Env. Microbiol. 1998, 64, 830.
63. Teunissen, P. J.; Sheng, D.; Reddy, G. V.; Moenne-Loccoz, P.; Field, J. A.; Gold, M. H.; Arch. Biochem. Biophys. 1998, 360, 233.
64. Arantes, V; Tese de Doutorado, Universidade de São Paulo, Brasil, 2008.
65. Hammel, K. E.; Kapich, A. N.; Jensen Jr., K. A.; Ryan, Z. C.; Enzyme Microb. Technol. 2002, 30, 445.
66. Hofrichter, M.; Enzyme Microb. Technol. 2002, 30, 454.
67. Jensen Jr. K. A.; Bao, W.; Kawai, S.; Srebotnik, E.; Hammel, K. E.; Appl. Environ. Microbiol. 1996, 62, 3679.
68. Kapich, A. N.; Jensen, K. A.; Hammel, K. E.; FEBS Lett. 1999, 461, 115.
69. Srebotniki, E.; Jensen Jr., K. E.; Kawai, S.; Hammel, K. E.; Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 4435.
70. Watanabe, T.; Katayama, S.; Enoki, M.; Honda, Y. H.; Kuwahara, M.; Eur. J. Biochem. 2000, 267, 4222.
71. Lima, E. S.; Abdalla, D. S. P.; Rev. Bras. Cien. Farm. 2001, 37, 293.
72. Braughler, J. M.; Duncan, L. A.; Chase, R. L.; J. Biol. Chem 1986, 261, 10282.
73. Kapich, A. N.; Galkin, S.; Hatakka, A.; Biocat. Biotransform. 2007, 25, 350.
74. Hofrichter, M.; Vares, T.; Kalsi, M.; Galkin, S.; Scheibner, K.; Fritsche, W.; Hatakka, A.; Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 1864.
75. Urzúa, U.; Kersten, P. L.; Vicuna, R.; Appl. Environ. Microbiol. 1998, 64, 68.
76. Lequart, C.; Kurek, B.; Debeire, P.; Monties, B.; J. Agrie. Food Chem. 1998, 46, 3868.
77. Meyer-Pinson, V.; Ruel, K.; Gaudard, F.; Valtat, G.; Petit-Conil, M.; Kurek, B.; C. R. Biol. 2004, 327, 917.
78. Jellison, J.; Connolly, J.; Goodell, B.; Doyle, B.; Illman, B.; Fekete, F; Ostrofsky, A.; Inter. Biodeter. Biodegr. 1997, 39, 165.
79. th Brazilian symposium on the chemistry of lignins and other wood components, Belo Horizonte, Brasil, 2001.
80. Schmidt, C. J.; Whitten, B. K.; Nicholas, D. D.; Am. Wood Preserv. Assoc. 1981, 77, 157.
81. Arantes, V.; Qian, Y.; Milagres, A. M. F.; Jellison, J.; Goodell, B.; Inter. Biodeter. Biodegr. 2009, no prelo.
82. Halliwell, G.; Biochem. J. 1965, 95, 35.
83. Koenigs, J. W.; Wood Fibre 1974, 6, 66.
84. Koenigs, J. W.; Biotechnol. Bioeng. Symp. 1975, 5, 151.
85. Koenigs, J. W.; Mater. Org. 1972, 7, 133.
86. Koenigs, J. W.; Phytopathology 1972, 62, 100.
87. Koenigs, J. W.; Arch. Microbiol. 1974, 99, 129.
88. Highley, T. L.; Mater. Org. 1977, 12, 25.
89. Kirk, T. K.; Ibach, M. D.; Mozuch, A. H. C.; Highley, T. L.; Holzforschung 1991, 45, 239.
90. Cohen, R.; Jensen, K. A.; Houtman, C. J.; Hammel, K. E.; FEBS Lett. 2002, 531, 483.
91. Kramer, C.; Kreisel, G.; Fahr, K.; Kassbohrer, J.; Schlosser, D.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004, 64, 387.
92. Newcombe, D.; Paszczynski, A.; Gajewska, W.; Kroger, M.; Feis, G.; Crawford, R.; Enzyme Microb. Technol. 2002, 30, 506.
93. Schlosser, D.; Fahr, K.; Karl, W.; Wetzstein, H.; Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 2479.
94. Wetzstein, H. -G.; Schmeer, N.; Karl, W; Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 4272.
95. Ek, M.; Gierer, J.; Jansbo. K.; Holzforschung 1989, 43, 391.
96. Gierer J.; Holzforschung 1990, 44, 387.
97. Tatsumi, K.; Terashima, N.; Mokuzai Gakkaishi 1985, 31, 316.
98. Filley, T. R.; Hatcher, P. G.; Shortle, W. C.; Praseuth, R. T; Org. Geochem. 2000, 31, 181.
99. Enoki, A.; Tanaka, H.; Fuse, G.; Wood Sci. Technol. 1989, 23, 1.
100. Enoki, A.; Hirano, T; Tanaka, H.; Mater. Org. 1992, 27, 247.
101. Hirano, T.; Enoki, A.; Tanaka, H.; J. Wood Sci. 2000, 46, 45.
102. Hirano, T.; Tanaka, H.; Enoki, A.; Mokuzai Gakkaishi 1995, 41, 334.
103. Tanaka, H.; Fuse, G.; Enoki, A.; Mokuzai Gakkaishi 1991, 37, 986.
104. Tanaka, H.; Itakura, S.; Hirano, T.; Enoki, A.; Holzforschung 1996, 50, 541.
105. Tanaka, H.; Itakura, S.; Enoki, A.; J. Biotechnol. 1999, 75, 57.
106. Wang, W; Gao, P.; Biodegrad 2002, 13, 383.
107. Wang, W; Gao, P. J.; J. Biotechnol. 2003, 101, 119.
108. Wang, W; Huagn, F; Lu, X. M.; Gao, P. J.; Biotechnol. J. 2006, 1, 447.
109. Wang, W; Liu, J. C.; Gao, P. J.; Chin. Chem. Lett. 2002, 13, 113.
110. Yang, W.; Liu, J.; Wang, W.; Zhang, Y.; Gao, P.; Biotechnol. Lett. 2004, 26, 1799.
111. Machuca, A. ; Aoyama, H. ; Durán, N. ; Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 256, 20.
112. Fekete, F. A.; Chandhoke, V; Jellison, J.; Appl. Environ. Microbiol. 1989, 55, 2720.
113. Chandhoke, V; Goodell, B.; Jellison, J.; Fekete, F. A.; FEMS Microbiol. Lett. 1992, 90, 263.
114. Jellison, J.; Chandhoke, V; Goodell, B.; Fekete, F. A.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 1991, 35, 805.
115. Paszczynski, A.; Crawford, R.; Funk, D.; Goodell, B.; Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 674.
116. Cohen, R.; Suzuki, M. R.; Hammel, K. E.; Appl. Environ. Microbiol. 2004, 70, 324.
117. Kerem, Z.; Bao, W; Hammel, K. E.; Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 10373.
118. Kerem, Z.; Jensen, K. A.; Hammel, K. E.; FEBS Lett. 1999, 446, 49.
119. Jensen Jr., K. A.; Ryan, Z. C.; Wymelenberg, A. V; Cullen, D.; Hammel, K. E.; Appl. Environ. Microbiol. 2002, 68, 2699.
120. Jensen, K. A.; Houtman, C. J.; Ryan, Z. C.; Hammel, K. E.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 67, 2705.
121. Suzuki, M. R.; Hunt, G G.; Houtman, C. J.; Dalebroux, Z. D.; Hammel, K. E.; Environ. Microbiol. 2006, 8, 2214.
122. Qi, W; Jellison, J.; Inter. Biodeter. Biodegrad. 2004, 54, 53.
123. Shimokawa, T.; Nakamura, M.; Hayashi, N.; Ishihara, M.; Holzforschung 2004, 58, 305.
124. Arantes, V; Milagres, A. M. F.; Process Biochem. 2006, 41, 887.
125. Arantes, V.; Milagres, A. M. F.; Can. J. Microbiol. 2007, 53, 1323.
126. Arantes, V.; Milagres, A. M. F.; J. Appl. Microbiol. 2008, 104, 185.
127. Arantes, V.; Milagres, A. M. F.; Enzyme Microb. Technol. 2007, 42, 17.
128. Watanabe, T.; Teranishi, H.; Honda, Y.; Kuwahara, M.; Biochem. Biophys. Res. Commun. 2002, 297, 918.
129. Filley, T. R.; Cody, G. D.; Goodell, B.; Jellison, J.; Noser, C.; Ostrofsky, A.; Org. Geochem. 2002, 33, 111.
130. Goodell, B.; Daniel, G.; Jellison, J.; Qian, Y; Holzforschung 2006, 60, 630.
131. Hyde, S. M.; Wood, P. M.; Microbiology 1997, 143, 259.
132. Arantes, V.; Baldochi, C.; Milagres, A. M. F.; Chemosphere 2006, 63, 1764.
133. Pracht, J.; Boenigk, J.; Isenbeck-Schroter, M.; Keppler, F.; Scholer, H. F.; Chemosphere 2001, 44, 613.
134. Hamilton, G. A.; Hanafin, J. W; Friedman, J.; J. Am. Chem. Soc. 1966, 88, 5269.
135. Arantes, V.; Milagres, A. M. F.; J. Hazard. Mater. 2007, 141, 273.
136. Arantes, V.; Milagres, A. M. F.; Water Sci. Technol. 2007, 55, 1.
137. Aguiar, A.; Ferraz, A.; Chemosphere 2007, 66, 947.
138. Arantes, V.; Milagres, A. M. F; J. Chem. Technol. Biotechnol. 2006, 30, 562.
139. Bourbonnais, R.; Leech, D.; Paice, M. G.; Biochim. Biophys. Acta 1998, 1379, 381.
140. Call, H. P.; Mucke, I.; J. Biotechnol. 1997, 53, 163.
141. Crestini, C. L.; Argyropoulos, D. S.; Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 2161.
142. Sealey, J.; Ragauskas, A. J.; Enzyme Microb. Technol. 1998, 23, 422.
143. Li, K.; Xu, F; Erikssen, K. E. L.; Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 2654.
144. Wesenberg, D.; Kyriakides, I.; Agathos, S. N.; Biotechnol. Adv. 2003, 22, 161.
145. Camarero, S.; Ibarra, D.; Martinez, M. J.; Martinez, A. T; Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 1775.
146. Johannes, C.; Majcherczyk, A.; Hüttermann, A.; Appl. Microbiol. Biotechnol. 1996, 46, 313.
147. Amitai, G.; Adani, R.; Sod-Moriah, G.; Rabinovitz, I.; Vincze, A.; Leader, H.; Chefetz, B.; Leibovitz-Persky, L.; Friesem, D.; Hadar, Y.; FEBS Lett. 1998, 438, 195.
148. Kang, K. H.; Dec, J.; Park, H.; Bollag, J. M.; Water Res. 2002, 36, 4907.
149. Fritz-Langhals, E.; Kunath, B.; Tetrahedron Lett. 1998, 39, 5955.
150. Potthast, A.; Rosenau, T; Chen, C. L.; Gratzl, J. S.; J. Mol Catal. A 1996, 108, 5.