Sensor array: Impedimetric label-free sensing of DNA hybridization in real time for rapid, PCR-based detection of microorganisms

Electroanalysis

Volumn 21, Issue 13, 2009, Pages 1459-1468

  Ghindilis, Andrei L ^a   Smith, Maria W ^b   Schwarzkopf, Kevin R ^a   Zhan, Changqing ^a   Evans, David R ^a   Baptista, António M ^b   Simon, Holly M ^b  

^a SHARP LABORATORIES OF AMERICA   (United States)

^b OREGON HEALTH AND SCIENCE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

DNA; Environmental chemistry; Impedance sensor array; Microorganism detection; Polymerase chain reaction

Indexed keywords

DNA; MICROORGANISMS; OLIGONUCLEOTIDES;

DNA HYBRIDIZATION; ELECTRONIC SENSORS; ENVIRONMENTAL CHEMISTRY; IMPEDANCE SENSOR ARRAYS; LABEL FREE; LABEL-FREE SENSING; MICROORGANISMS DETECTIONS; PCR-BASED DETECTION; REAL- TIME; SENSORS ARRAY;

POLYMERASE CHAIN REACTION;

EID: 69249230990     PISSN: 10400397     EISSN: 15214109     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elan.200904549     Document Type: Article

References (24)

1. U.S. Environmental Protection Agency, Ambient water quality criteria for bacteria, EPA A440/5-84-002, Washington, DC 1986.
2. E. A. Barlaan, M. Sugimori, S. Furukawa, K. Takeuchi, J. Biotechnol. 2005, 115, 11.
3. G. C. Baker, L. A. Tow, D. A. Cowan, Microbiol. Meth. 2003, 53, 157.
4. T. Zhang, H. H. Fang, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2006, 70, 281.
5. M. J. Lodes, D. Suciu, M. Elliott, A. G. Stover, M. Ross, M. Caraballo, K. Dix, J. Crye, R. J. Webby, W. J. Lyon, D. L. Danley, A. McShea, J. Clin. Microbiol. 2006, 44, 1209.
6. J. Wang, Biosens. Bioelectron. 2006, 21, 1887.
7. J. S. Daniels, N. Pourmand, Electroanalysis 2007, 19, 1239.
8. C. Fan, K. W. Plaxco, A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 9134.
9. J. Liu, S. Tian, L. Tiefenauer, P. E. Nielsen, W. Knoll, Anal. Chem. 2005, 77, 2756.
10. A. A. Lubin, R. Y. Lai, B. R. Baker, A. J. Heeger, K. W. Plaxco, Anal. Chem. 2006, 78, 5671.
11. R. Y. Lai, E. T. Lagally, S. H. Lee, H. T. Soh, K. W. Plaxco, A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 4017.
12. A. Kukol, P. Li, P. Estrela, P. Ko-Ferrigno, P. Migliorato. Anal. Biochem. 2008, 374, 143.
13. M. Y. Vagin, S. A. Trashin, A. A. Karyakin, M. Mascini, Anal. Chem. 2008, 80, 1336.
14. G. P. Brewood, Y. Rangineni, D. J. Fish, A. S. Bhandiwad, D. R. Evans, R. Solanki, A. S. Benight, Nucleic Acids Res. 2008, 36, e98.
15. F. Davis, M. A. Hughes, A. R. Cossins, S. P. Higson, Anal. Chem. 2007, 79, 1153.
16. J. Weng, J. Zhang, H. Li, L. Sun, C. Lin, Q. Zhang Q, Anal. Chem.2008, 80, 7075.
17. J. Zhang, S. Song, L. Wang, D. Pan, C. Fan, Nat. Protoc. 2007, 2, 2888.
18. H. M. Simon, C. E. Jahn, L. T. Bergerud, M. K. Sliwinski, P. J. Weimer, D. K. Willis, R. M. Goodman, Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 4751.
19. T. Wirth, D. Falush, R. Lan, F. Colles, P. Mensa, L. H. Wieler, H. Karch, P. R. Reeves, M. C. Maiden, H. Ochman, M. Achtman, Mol. Microbiol. 2006, 60, 1136.
20. J. C. Love, L. A. Estroff, J. K. Kriebel, R. G. Nuzzo, G. M. Whitesides, Chem. Rev. 2005, 105, 1103.
21. C. S. Barker, C. Griffin, G. M. Dolganov, K. Hanspers, J. Y. Yang, D. J. Erle, BMC Genomics 2005, 6, 57.
22. T. R. Hughes, M. Mao, A. R. Jones, J. Burchard, M. J. Marton, K. W. Shannon, S. M. Lefkowitz, M. Ziman, J. M. Schelter, M. R. Meyer, S. Kobayashi, C. Davis, H. Dai, Y. D. He, S. B. Stephaniants, G. Cavet, W. L. Walker, A. West, E. Coffey, D. D. Shoemaker, R. Stoughton, A. P. Blanchard, S. H. Friend, P. S. Linsley, Nature Biotech. 2001, 19, 342.
23. C. Guiducci, C. Stagni, G. Zuccheri, A. Bogliolo, L. Benini, B. Samorì, B. Riccò, Biosens. Bioelectron.2004, 19, 781.
24. C. Guiducci, C. Stagni, A. Fischetti, U. Mastromatteo, L. Benini, B. Riccò, IEEE Sensors J. 2006, 6, 1084.