-
1
-
-
0035937443
-
-
Volkman, B. F.; Lipson, D.; Wemmer, D. E.; Kern, D. Science 2001, 291, 2429-2433.
-
(2001)
Science
, vol.291
, pp. 2429-2433
-
-
Volkman, B.F.1
Lipson, D.2
Wemmer, D.E.3
Kern, D.4
-
2
-
-
0034720772
-
-
McCallum, S. A.; Hitchens, T. K.; Torborg, C.; Rule, G. S. Biochemistry 2000, 39, 7343-7356.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 7343-7356
-
-
McCallum, S.A.1
Hitchens, T.K.2
Torborg, C.3
Rule, G.S.4
-
3
-
-
0037154884
-
-
Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523.
-
(2002)
Science
, vol.295
, pp. 1520-1523
-
-
Eisenmesser, E.Z.1
Bosco, D.A.2
Akke, M.3
Kern, D.4
-
4
-
-
0028113846
-
-
Svoboda, K.; Mitra, P. P.; Block, S. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11782-11786.
-
(1994)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.91
, pp. 11782-11786
-
-
Svoboda, K.1
Mitra, P.P.2
Block, S.M.3
-
5
-
-
0038047431
-
-
Schotte, F.; Lim, M.; Jackson, T. A.; Smirnov, A. V.; Soman, J.; Olson, J. S.; Phillips, G. N., Jr.; Wulff, M.; Anfinrud, P. A. Science 2003, 300, 1944-1947.
-
(2003)
Science
, vol.300
, pp. 1944-1947
-
-
Schotte, F.1
Lim, M.2
Jackson, T.A.3
Smirnov, A.V.4
Soman, J.5
Olson, J.S.6
Phillips Jr., G.N.7
Wulff, M.8
Anfinrud, P.A.9
-
6
-
-
0346365084
-
-
Vendruscolo, M.; Paci, E.; Dobson, C. M.; Karplus, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 15686-15687.
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc
, vol.125
, pp. 15686-15687
-
-
Vendruscolo, M.1
Paci, E.2
Dobson, C.M.3
Karplus, M.4
-
7
-
-
14644424521
-
-
Kitahara, R.; Yokoyama, S.; Akasaka, K. J. Mol. Biol. 2005, 347, 277-285.
-
(2005)
J. Mol. Biol
, vol.347
, pp. 277-285
-
-
Kitahara, R.1
Yokoyama, S.2
Akasaka, K.3
-
8
-
-
12744263121
-
-
Lindorff-Larsen, K.; Best, R. B.; DePristo, M. A.; Dobson, C. M.; Vendruscolo, M. Nature 2005, 433, 128-132.
-
(2005)
Nature
, vol.433
, pp. 128-132
-
-
Lindorff-Larsen, K.1
Best, R.B.2
DePristo, M.A.3
Dobson, C.M.4
Vendruscolo, M.5
-
9
-
-
43849093505
-
-
Freddolino, P. L.; Liu, F.; Gruebele, M.; Schulten, K. Biophys. J. 2008, 94, L75-L77.
-
(2008)
Biophys. J
, vol.94
-
-
Freddolino, P.L.1
Liu, F.2
Gruebele, M.3
Schulten, K.4
-
14
-
-
0030819348
-
-
Nakajima, N.; Nakamura, H.; Kidera, A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 817-824.
-
(1997)
J. Phys. Chem. B
, vol.101
, pp. 817-824
-
-
Nakajima, N.1
Nakamura, H.2
Kidera, A.3
-
18
-
-
34247098754
-
-
Ayton, G. S.; Noid, W. G.; Voth, G. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 2007, 17, 192-198.
-
(2007)
Curr. Opin. Struct. Biol
, vol.17
, pp. 192-198
-
-
Ayton, G.S.1
Noid, W.G.2
Voth, G.A.3
-
21
-
-
32644458379
-
-
Lyman, E.; Ytreberg, F. M.; Zuckerman, D. M. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 028105.
-
(2006)
Phys. Rev. Lett
, vol.96
, pp. 028105
-
-
Lyman, E.1
Ytreberg, F.M.2
Zuckerman, D.M.3
-
23
-
-
36749060078
-
-
Zhang, B. W.; Jasnow, D.; Zuckerman, D. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 18043-18048.
-
(2007)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.104
, pp. 18043-18048
-
-
Zhang, B.W.1
Jasnow, D.2
Zuckerman, D.M.3
-
24
-
-
35948974358
-
-
Ytreberg, F. M.; Aroutiounian, S. K.; Zuckerman, D. M. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1860-1866.
-
(2007)
J. Chem. Theory Comput
, vol.3
, pp. 1860-1866
-
-
Ytreberg, F.M.1
Aroutiounian, S.K.2
Zuckerman, D.M.3
-
27
-
-
0002647323
-
-
Wall, F. T.; Rubin, R. J.; Isaacson, L. M. J. Chem. Phys. 1957, 27, 186-188.
-
(1957)
J. Chem. Phys
, vol.27
, pp. 186-188
-
-
Wall, F.T.1
Rubin, R.J.2
Isaacson, L.M.3
-
30
-
-
1642464839
-
-
Rohl, C. A.; Strauss, C. E. M.; Misura, K. M. S.; Baker, D. Methods Enzymol. 2004, 383, 66-93.
-
(2004)
Methods Enzymol
, vol.383
, pp. 66-93
-
-
Rohl, C.A.1
Strauss, C.E.M.2
Misura, K.M.S.3
Baker, D.4
-
31
-
-
36749055649
-
-
Das, R.; Qian, B.; Raman, S.; Vernon, R.; Thompson, J.; Bradley, P.; Khare, S.; Tyka, M. D.; Bhat, D.; Chivian, D.; Kim, D. E.; Sheffler, W. H.; Malmstrom, L.; Wollacott, A. M.; Wang, C.; Andre, I.; Baker, D. Proteins 2007, 69, 118-128.
-
(2007)
Proteins
, vol.69
, pp. 118-128
-
-
Das, R.1
Qian, B.2
Raman, S.3
Vernon, R.4
Thompson, J.5
Bradley, P.6
Khare, S.7
Tyka, M.D.8
Bhat, D.9
Chivian, D.10
Kim, D.E.11
Sheffler, W.H.12
Malmstrom, L.13
Wollacott, A.M.14
Wang, C.15
Andre, I.16
Baker, D.17
-
32
-
-
0029912748
-
-
Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236.
-
(1996)
J. Am. Chem. Soc
, vol.118
, pp. 11225-11236
-
-
Jorgensen, W.L.1
Maxwell, D.S.2
Tirado-Rives, J.3
-
33
-
-
67650469656
-
-
Zhang, X.; Mamonov, A. B.; Zuckerman, D. M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1680-1691.
-
(2009)
J. Comput. Chem
, vol.30
, pp. 1680-1691
-
-
Zhang, X.1
Mamonov, A.B.2
Zuckerman, D.M.3
-
37
-
-
0037441653
-
-
Lovell, S. C.; Davis, I. W.; Adrendall, W. B.; de Bakker, P. I. W.; Word, J. M.; Prisant, M. G.; Richardson, J. S.; Richardson, D. C. Proteins 2003, 50, 437-450.
-
(2003)
Proteins
, vol.50
, pp. 437-450
-
-
Lovell, S.C.1
Davis, I.W.2
Adrendall, W.B.3
de Bakker, P.I.W.4
Word, J.M.5
Prisant, M.G.6
Richardson, J.S.7
Richardson, D.C.8
-
38
-
-
0016696599
-
-
Ueda, Y.; Taketomi, H.; Go, N. Int. J. Pept. Protein Res. 1975, 7, 445-459.
-
(1975)
Int. J. Pept. Protein Res
, vol.7
, pp. 445-459
-
-
Ueda, Y.1
Taketomi, H.2
Go, N.3
-
39
-
-
0017842051
-
-
Ueda, Y.; Taketomi, H.; Go, N. Biopolymers 1978, 17, 1531-1548.
-
(1978)
Biopolymers
, vol.17
, pp. 1531-1548
-
-
Ueda, Y.1
Taketomi, H.2
Go, N.3
-
43
-
-
0029119560
-
-
Galaktionov, K.; Lee, A.; Eckstein, J.; Draetta, G.; Meckler, J.; Loda, M.; Beach, D. Science 1995, 269, 1575-1577.
-
(1995)
Science
, vol.269
, pp. 1575-1577
-
-
Galaktionov, K.1
Lee, A.2
Eckstein, J.3
Draetta, G.4
Meckler, J.5
Loda, M.6
Beach, D.7
-
44
-
-
18144432725
-
-
Fauman, E. B.; Cogswell, J. P.; Lovejoy, B.; Rocque, W. J.; Holmes, W.; Montana, V. G.; Piwnica-Worms, H.; Rink, M. J.; Saper, M. A. Cell 1998, 93, 617-625.
-
(1998)
Cell
, vol.93
, pp. 617-625
-
-
Fauman, E.B.1
Cogswell, J.P.2
Lovejoy, B.3
Rocque, W.J.4
Holmes, W.5
Montana, V.G.6
Piwnica-Worms, H.7
Rink, M.J.8
Saper, M.A.9
-
45
-
-
0032738102
-
-
Reynolds, R. A.; Yem, A. W.; Wolfe, C. L.; Deibel, M. R.; Chidester, C. G.; Watenpaugh, K. D. J. Mol. Biol. 1999, 293, 559-568.
-
(1999)
J. Mol. Biol
, vol.293
, pp. 559-568
-
-
Reynolds, R.A.1
Yem, A.W.2
Wolfe, C.L.3
Deibel, M.R.4
Chidester, C.G.5
Watenpaugh, K.D.6
-
47
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
48
-
-
27344436659
-
-
Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802.
-
(2005)
J. Comput. Chem
, vol.26
, pp. 1781-1802
-
-
Phillips, J.C.1
Braun, R.2
Wang, W.3
Gumbart, J.4
Tajkhorshid, E.5
Villa, E.6
Chipot, C.7
Skeel, R.D.8
Kale, L.9
Schulten, K.10
-
49
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
MacKerell, A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-McCarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
50
-
-
0042511005
-
-
Canutescu, A. A.; Shelenkov, A. A.; Dunbrack, R. L. Protein Sci. 2003, 12, 2001-2014.
-
(2003)
Protein Sci
, vol.12
, pp. 2001-2014
-
-
Canutescu, A.A.1
Shelenkov, A.A.2
Dunbrack, R.L.3
-
51
-
-
0025916872
-
-
Miranker, A.; Karplus, M. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1991, 11, 29-34.
-
(1991)
Proteins: Struct., Funct., Genet
, vol.11
, pp. 29-34
-
-
Miranker, A.1
Karplus, M.2
-
52
-
-
0037157153
-
-
Lin, J. H.; Perryman, A. L.; Schames, J. R.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5632-5633.
-
(2002)
J. Am. Chem. Soc
, vol.124
, pp. 5632-5633
-
-
Lin, J.H.1
Perryman, A.L.2
Schames, J.R.3
McCammon, J.A.4
-
53
-
-
0037231646
-
-
Lin, J. H.; Perryman, A. L.; Schames, J. R.; McCammon, J. A. Biopolymers 2003, 68, 47-62.
-
(2003)
Biopolymers
, vol.68
, pp. 47-62
-
-
Lin, J.H.1
Perryman, A.L.2
Schames, J.R.3
McCammon, J.A.4
-
55
-
-
45849129794
-
-
Mohanty, S.; Meinke, J. H.; Zimmermann, O.; Hansmann, U. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 8004-8007.
-
(2008)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.105
, pp. 8004-8007
-
-
Mohanty, S.1
Meinke, J.H.2
Zimmermann, O.3
Hansmann, U.H.4
-
56
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38.
-
(1996)
J. Mol. Graphics
, vol.14
, pp. 33-38
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
|