Reverse micelle encapsulation as a model for intracellular crowding

Journal of the American Chemical Society

Volumn 131, Issue 23, 2009, Pages 8030-8039

  Van Horn, Wade D ^a   Ogilvie, Mark E ^a   Flynn, Peter F ^a  

^a UNIVERSITY OF UTAH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AOT REVERSE MICELLES; BOVINE SERUM ALBUMINS; CHEMICAL SHIFT PERTURBATIONS; COLD DENATURATION; EXCLUDED VOLUME; HOST MOLECULES; IN-VITRO; IN-VIVO; LOW TEMPERATURES; MOLECULAR CROWDING; NANOSCALE PARTICLES; RECONSTITUTED SAMPLE; REVERSE MICELLES; SULFOSUCCINATE; UBIQUITIN; WATER LOADING; WATER SHEDDING;

AMIDES; BODY FLUIDS; PROTEINS; SODIUM; SURFACE ACTIVE AGENTS;

MICELLES;

AMIDE; BOVINE SERUM ALBUMIN; DOCUSATE SODIUM; HYDROGEN; NITROGEN; UBIQUITIN;

ARTICLE; CONTROLLED STUDY; IN VITRO STUDY; LOW TEMPERATURE; NANOENCAPSULATION; PARTICLE SIZE; PROTEIN DENATURATION; PROTON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; REVERSE MICELLE; WATER LOADING; WATER TEMPERATURE;

EID: 67650533799     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja901871n     Document Type: Article

References (63)

1. Flynn, P. F. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2004, 45, 31-51.
2. Wand, A. J.; Babu, C. R.; Flynn, P. F.; Milton, M. J. In Biological Magnetic Resonance; Krishna, N. R., Berliner, L. J., Eds.; Springer: New York, 2003; Vol.20, p 121-160.
3. Flynn, P. F.; Milton, M. J.; Babu, C. R.; Wand, A. J. J. Biomol. NMR 2002, 23, 311-316.
4. Van Horn, W. D.; Simorellis, A. K.; Flynn, P. F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13554-13560.
5. Simorellis, A. K.; Flynn, P. F. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9580-9581.
6. Simorellis, A. K.; Van Horn, W. D.; Flynn, P. F. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5082-5090.
7. Babu, C. R.; Hilser, V. J.; Wand, A. J. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 352-357.
8. Ellis, R. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 114-119.
9. Zimmerman, S. B.; Trach, S. O. J. Mol. Biol. 1991, 222, 599-620.
10. Flory, P. J. Principles of Polymer Chemistry; Cornell University Press: Ithaca, NY, 1953.
11. Snoussi, K.; Halle, B. Biophys. J. 2005, 88, 2855-2866.
12. Tokuriki, N.; Kinjo, M.; Negi, S.; Hoshino, M.; Goto, Y.; Urabe, I.; Yomo, T. Protein Sci. 2004, 13, 125-133.
13. van den Berg, B.; Ellis, R. J.; Dobson, C. M. EMBO J. 1999, 18, 6927-6933.
14. Munishkina, L. A.; Cooper, E. M.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. J. Mol. Recognit. 2004, 17, 456-464.
15. Konopka, M. C.; Shkel, I. A.; Cayley, S.; Record, M. T.; Weisshaar, J. C. J. Bacteriol. 2006, 188, 6115-6123.
16. Babu, C. R.; Flynn, P. F.; Wand, A. J. J. Biomol. NMR 2003, 25, 313-323.
17. Leser, M. E.; Luisi, P. L. Chimia 1990, 44, 270-282.
18. Pometun, M. S.; Peterson, R. W.; Babu, C. R.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10652-10653.
19. Lewis, K. E.; Keifer, P.; Saarinen, T. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10663-10665.
20. Pervushin, K.; Riek, R.; Wider, G.; Wuthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 12366-12371.
21. Van Geet, A. L. Anal. Chem. 1970, 42, 679-680.
22. Kuwajima, K.; Kim, P. S.; Baldwin, R. L. Biopolymers 1983, 22, 59-67.
23. Roder, H.; Wüthrich, K. Proteins 1986, 1, 34-42.
24. McIntosh, L. P.; Griffey, R. H.; Muchmore, D. C.; Nielson, C. P.; Redfield, A. G.; Dahlquist, F. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 1244-1248.
25. Klyachko, N. L.; Levashov, P. A.; Levashov, A. V.; Balny, C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 254, 685-688.
26. Rariy, R. V.; Bec, N.; Saldana, J.-L.; Nametkin, S. N.; Mozhaev, V. V.; Klyachko, N. L.; Levashov, A. V.; Balny, C. FEBS Lett. 1995, 364, 98-100.
27. Grzesiek, S.; Bax, A.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Hu, J. S.; Kaufman, J.; Palmer, I.; Stahl, S. J.; Wingfield, P. T. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 340-345.
28. Cheever, M. L.; Sato, T. K.; de Beer, T.; Kutateladze, T. G.; Emr, S. D.; Overduin, M. Nat. Cell Biol. 2001, 3, 613-618.
29. Fisher, R. D.; Wang, B.; Alam, S. L.; Higginson, D. S.; Robinson, H.; Sundquist, W. I.; Hill, C. P. J. Biol. Chem. 2003, 278, 28976-28984.
30. Ponting, C. P. Biochem. J. 2000, 351, 527-535.
31. Alam, S. L.; Sun, J.; Payne, M.; Welch, B. D.; Blake, B. K.; Davis, D. R.; Meyer, H. H.; Emr, S. D.; Sundquist, W. I. EMBO J. 2004, 23, 1411-1421.
32. Wang, Q.; Goh, A. M.; Howley, P. M.; Walters, K. J. Biochemistry 2003, 42, 13529-13535.
33. Wang, B.; Alam, S. L.; Meyer, H. H.; Payne, M.; Stemmler, T. L.; Davis, D. R.; Sundquist, W. I. J. Biol. Chem. 2003, 278, 20225-20234.
34. Beal, R.; Deveraux, Q.; Xia, G.; Rechsteiner, M.; Pickart, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 861-866.
35. Verma, R.; Peters, N. R.; D'Onofrio, M.; Tochtrop, G. P.; Sakamoto, K. M.; Varadan, R.; Zhang, M.; Coffino, P.; Fushman, D.; Deshaies, R. J.; King, R. W. Science 2004, 306, 117-120.
36. Rivas, G.; Fernandez, J. A.; Minton, A. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 3150-3155.
37. Sitkoff, D.; Case, D. A. Prog. NMR Spectrosc. 1998, 32, 165-190.
38. Massi, F.; Grey, M. J.; Palmer, A. G., III Protein Sci. 2005, 14, 735-742.
39. Tjandra, N.; Feller, S. E.; Richard, W.; Pastor, R. W.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12562-12566.
40. Tjandra, N.; Feller, S. E.; Richard, W.; Pastor, R. W. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12562-12566.
41. Melo, E. P.; Baptista, R. P.; Cabral, J. M. S. J. Mol. Catal. B-Enzym. 2003, 22, 299-306.
42. Melo, E. P.; Costa, S. M. B.; Joaquim, M. S.; Cabral, P. J.; Peterson, S. B. Phys. Lipids 2003, 124, 37-47.
43. Peterson, R. W.; Pomentum, M. S.; Shi, Z.; Wand, A. J. Protein Sci. 2005, 14, 2919-2921.
44. Shi, Z.; Peterson, R. W.; Wand, A. J. Langmuir 2005, 21, 10632-10637.
45. Shioi, A.; Harada, M.; Takahashi, H.; Adashi, M. Langmuir 1997, 13, 609-613.
46. Bryant, J. E.; Lecomte, J. T. J.; Lee, A. L.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Biochemistry 2005, 44, 9275-9279.
47. Bryant, J. E.; Lecomte, J. T. J.; Lee, A. L.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Biochemistry 2006, 45, 10085-10091.
48. Dedmon, M. M.; Patel, C. N.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 12681-12684.
49. Serber, Z.; Corsini, L.; Durst, F.; Doetsch, V. Method Enzymol. 2005, 394, 17-41.
50. Serber, Z.; Doetsch, V. Biochemistry 2001, 40, 14217-14323.
51. Serber, Z.; Keatinge-Clay, A. T.; Ledwidge, R.; Kelly, A. E.; Miller, S. M.; Doetsch, V. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2446-2447.
52. Serber, Z.; Ledwidge, R.; Miller, S. M.; Doetsch, V. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 8895-8901.
53. Serber, Z.; Straub, W.; Corsini, L.; Nomura, A.; Shimba, N.; Craik, C.; Ortiz de Montellano, P.; Dötsch, V. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7119-7125.
54. Sakai, T.; Tochio, H.; Tenno, T.; Ito, Y.; Kokubo, T.; Hiroaki, H.; Shirakawa, M. J. Biomol. NMR 2006, 36, 179-188.
55. Selenko, P.; Serber, Z.; Gadea, B.; Ruderman, J.; Wagner, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 11904-11909.
56. Selenko, P.; Wagner, G. Nat. Methods 2006, 3, 80-81.
57. Bryant, J. E.; Lecomte, J. T.; Lee, A. L.; Young, G. B.; Pielak, G. J. Biochemistry 2007, 46, 8206.
58. Kon-No, K.; Kitahara, A. J. Colloid Interface Sci. 1970, 33, 124-132.
59. Kon-No, K.; Kitahara, A. J. Colloid Interface Sci. 1971, 41, 47-51.
60. Makhatadze, G. I.; Lopez, M. M.; Richardson, J. M., III; Thomas, S. T. Protein Sci. 1998, 7, 689-697.
61. Ibarra-Molero, B.; Makhatadze, G. I.; Sanchez-Ruiz, J. M. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1429, 384-390.
62. Kitahara, R.; Okuno, A.; Kato, M.; Taniguchi, Y.; Yokoyama, S.; Akasaka, K. Magn. Reson. Chem. 2006, 44, S108-S113.
63. Pastor, A.; Martin, S. R.; Politou, A.; Kondapalli, K. C.; Stemmler, T.; Temussi, P. A. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 5374-5375.