Molecular dynamics simulations of bromine clathrate hydrates

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 113, Issue 26, 2009, Pages 7431-7438

  Schofield, Daniel P ^a   Jordan, Kenneth D ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHARGE PENETRATION; CLATHRATE HYDRATE; CRYSTAL TYPES; CUBIC STRUCTURE; FORCE FIELDS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MULTIPOLE; POLARIZABLE FORCE FIELD; TETRAGONAL STRUCTURE;

BROMINE; ELECTROMAGNETIC WAVE POLARIZATION; HYDRATES; HYDRATION; MOLECULAR DYNAMICS;

DYNAMICS;

EID: 67649589242     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp900237j     Document Type: Article

References (55)

1. Sloan, E. D., Jr. Nature 2003, 426, 353-359.
2. Rondinone, A. J.; Chakoumakos, B. C; Rawn, C. J.; Ishii, Y. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 6046-6050.
3. Hafemann, D. R.; Miller, S. L. J. Phys. Chem. 1969, 73, 1392-1397.
4. Allen, K. W.; Jeffrey, G. A. J. Chem. Phys. 1963, 38, 2304-2305.
5. Dyadin, Y. A.; Belosludov, V. R. Comprehensive Supramolecular Chemistry; Elsevier: Amsterdam, 1996; Vol. 6
6. Udachin, K. A.; Enright, G. D.; Ratcliffe, C. I.; Ripmeester, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 11481-11486.
7. Dyadin, Y. A.; Bondaryuk, I. V.; Zhurko, F. V. Inclusion Compounds: Vol. 5. Inorganic and Physical Aspects of Inclusion; Oxford University Press: Oxford, 1991.
8. Goldschleger, I. U.; Kerenskaya, G.; Janda, K. C.; Apkarian, V. A. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 787-789.
9. Janda, K. C.; Kerenskaya, G.; Goldscheleger, I. U.; Apkarian, V. A.; Fleischer, E. B. In Proceedings of the 6th International Conference on Gas Hydrates, 2008.
10. Weigend, F.; Häser, M. Theor. Chem. Acc. 1997, 97, 331-340.
11. Weigend, F.; Häser, M.; Patzelt, H.; Ahlrichs, R. Chem. Phys. Lett. 1998, 294, 143-152.
12. Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 479-483.
13. Hampel, C.; Peterson, K. A.; Werner, H.-J. Chem. Phys. Lett. 1992, 190, 1-12.
14. Stevens, W. J.; Fink, W. H. Chem. Phys. Lett. 1987, 139, 15-22.
15. Jiang, H.; Jordan, K. D.; Taylor, C. E. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6486-6492.
16. Jiang, H.; Myshakin, E. M.; Jordan, K. D.; Warzinski, R. P. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10207-10216.
17. Yu, H.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 2004, 121, 9549-9564.
18. Peterson, K. A.; Figgen, D.; Goll, E.; Stoll, H.; Dolg, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 11113-11123.
19. Barrow, R. F.; Clark, T. C.; Coxon, J. A.; Yee, K. K. J. Mol. Spectrosc. 1974, 57, 428-449.
20. Stone, A. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1128-1132.
21. Smith, W.; Forester, T.; Todorov, I.; Leslie, M. The DL-POLY-2.0 User Manual.
22. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery Jr., J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
23. Werner, H.-J.; Knowles, P. J.; Lindh, R.; Manby, F. R.; Schütz, M.; Celani, P.; Korona, T.; Rauhut, G.; Amos, R. D.; Bernhardsson, A.; Berning, A.; Cooper, D. L.; Deegan, M. J. O.; Dobbyn, A. J.; Eckert, F.; Hampel, C.; Hetzer, G.; Lloyd, A. W.; McNicholas, S. J.; Meyer, W.; Mura, M. E.; Nicklass, A.; Palmieri, P.; Pitzer, R.; Schumann, U.; Stoll, H.; Stone, A. J.; Tarroni, R.; Thorsteinsson, T. Molpro, version 2006.1, a package of ab initio programs, 2006.
24. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553-566.
25. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007-1023.
26. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A., Jr. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347-1363.
27. Buckingham, R. A. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1938, 168, 264-283.
28. Freitag, M. A.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Stevens, W. J. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7300-7306.
29. Stone, A. J. The theory of intermolecular forces; Oxford University Press: New York, 1996.
30. Tang, K. T.; Toennies, J. P. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3726-3741.
31. Melchionna, S.; Ciccotti, G.; Holian, B. L. Mol. Phys. 1993, 78, 533-544.
32. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697.
33. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 87, 3684-3690.
34. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
35. Miller, T. F., III.; Eleftheriou, M.; Pattnaik, P.; Ndirango, A.; Newns, D.; Martyna, G. J. J. Chem. Phys. 2002, 116, 8649-8659.
36. Andersen, H. C. J. Comput. Phys. 1983, 52, 24-34.
37. Buch, V.; Sandler, P.; Sadlej, J. J. Phys. Chem B 1998, 102, 8641-8653.
38. McMullan, R. K.; Jeffrey, G. A. J. Chem. Phys. 1965, 42, 2725-2732.
39. Alavi, S.; Ripmeester, J. A.; Klug, D. D. J. Chem. Phys. 2005, 123, 024507.
40. Torii, H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2192-2198.
41. Legon, A. C.; Thumwood, J. M. A.; Waclawik, E. R. Chem. Eur. J. 2002, 8, 940-950.
42. Rodger, P. M.; Stone, A. J.; Tildesley, D. J. Chem. Phys. Lett. 1988, 145, 365-370.
43. Price, S. L.; Stone, A. J. Mol. Phys. 1982, 47, 1457-1470.
44. Rodger, P. M.; Stone, A. J.; Tildesley, D. J. Mol. Phys. 1988, 63, 173-188
45. Stone, A. J.; Price, S. L. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3325-3335.
46. Kerenskaya, G.; Goldschleger, I. U.; Apkarian, V. A.; Fleischer, E.; Janda, K. C. J. Phys. Chem. A 2007, 777, 10969-10976.
47. Hampel, C.; Werner, H.-J. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6286-6297.
48. Schütz, M. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9986-10001.
49. Pauling, L.; Marsh, R. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1952, 38, 112-118.
50. Bondi, A. J. Phys. Chem. 1964, 68, 441-451.
51. Handa, Y. P.; Tse, J. S. J. Phys. Chem. 1986, 90, 5917-5921.
52. van der Waals, J. H.; Platteeuw, J. C. Adv. Chem. Phys. 1959, 2, 2-57.
53. Gale, J. D.; Rohl, A. L. Mol. Simul. 2003, 29, 291-341.
54. Tironi, I. G.; Brunne, R. M.; van Gunsteren, W. F. Chem. Phys. Lett. 1996, 250, 19-24.
55. Hildenbrand, D. L.; Kramer, W. R.; McDonald, R. A.; Stull, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1958, 80, 4129-4132.