Fluorescence intensity fluctuations of individual labeled DNA fragments and a DNA binding protein in solution at the single molecule level: A comparison of photobleaching, diffusion, and binding dynamics

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 6, 2000, Pages 1382-1390

  Daniel, Douglas C ^a   Thompson, Martin ^a   Woodbury, Neal W ^a  

^a ARIZONA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 6744254957     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9929465     Document Type: Review

References (34)

1. Weiss, S. Science 1999, 283, 1676.
2. Eggling, C.; Fries, J. R.; Brand, L.; Günther, R.; Seidel, C. A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 1556.
3. Funatsu, T.; Harada, Y.; Tokunaga, M.; Saito, K.; Yanagido, T. Nature 1995, 374, 555.
4. Kinjo, M.; Rigler, R. Nucl. Acids Res. 1995, 23, 1795.
5. Moerner, W. E.; Orrit, M. Science 1999, 283, 1670.
6. Edman, L.; Mets, Ü.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 6710.
7. Goodwin, P. M.; Cai, H.; Jett, J. H.; Ishaug-Riley, S. L.; Machara, N. P.; Semin, D. J.; Orden, A. V.; Keller, R. A. Nucleosides Nucleotides 1997, 16, 543.
8. Deniz, A. A.; Dahan, M.; Grunwell, J. R.; Ha, T.; Faulhaber, A. E.; Chemla, D. S.; Weiss, S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3670.
9. Ha, T.; Ting, A. Y.; Liang, J.; Caldwell, W. B.; Deniz, A. A.; Chemla, D. S.; Schultz, P. G.; Weiss, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 893.
10. Sauer, M.; Drexhage, K. H.; Lieberwirth, U.; Muller, R.; Nord, S.; Zander, C. Chem. Phys. Lett. 1998, 284, 153.
11. Lu, P. H.; Xie, X. S. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2753.
12. Pirotta, M.; Bach, H.; Donley, E.; Renn, A.; Wild, U. P. Spectrosc. Eur. 1997, 9, 16.
13. Bach, H.; Renn, A.; Wild, U. P. Chem. Phys. Lett. 1997, 266, 317.
14. Keller, R. A.; Ambrose, W. P.; Goodwin, P. M.; Jett, J. H.; Martin, J. C.; Wu, M. Appl. Spectrosc. 1996, 50, 12A.
15. Tan, W.; Wang, X. Thin Solid Films 1998, 331, 189.
16. Pawley, J. P., Ed. Handbook of Biological Confocal Microscopy; Plenum Press: New York, 1990.
17. Osbourne, M. A.; Balasubramanian, S.; Furey, W. S.; Klenerman, D. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 3160.
18. Nie, S.; Chiu, D. T.; Zare, R. N. Anal. Chem. 1995, 67, 2849.
19. Lee, L. G.; Chen, C. H.; Chiu, L. A. Cytometry 1986, 7, 508.
20. Rye, H. S.; Yue, S.; Wemmer, D. E.; Quesada, M. A.; Haugland, R. P.; Mathies, R. A.; Glazer, A. N. Nucl. Acids Res. 1992, 20, 2803.
21. Rye, H. S.; Quesada, M. A.; Peck, K.; Mathies, R. A.; Glazer, A. N. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 327.
22. Glazer, A. N.; Rye, H. S. Nature 1992, 359, 859.
23. Netzl, T. L.; Nafsi, K.; Zhao, M.; Lenhard, J. R.; Johnson, I. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17936.
24. Thompson, M.; Woodbury, N. W. Submmited to Biochemistry.
25. Luisi, B. F.; Xu, W. X.; Otwinowski, Z.; Freedman, L. P.; Yamamoto, K. R.; Sigler, P. B. Nature 1991, 352, 497.
26. Rigler, R.; Mets, Ü. SPIE Laser Spectrosc. Biomol. 1992, 1921, 239.
27. Widengren, J.; Mets, Ü.; Rigler, R. J. Phys. Chem. 1995, 99, 13368.
28. Zander, C.; Sauer, M.; Drexhage, K.; Ko, D. S.; Schultz, A.; Wolfram, J.;. Brand, L.; Eggeling, C.;. Seidel, C. A. M. Appl. Phys. B 1996, 63, 517.
29. Eigen, M.; Rigler, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5740.
30. Milanovich, N.; Suh, M.; Jankowiak, R.; Small, G. J.; Hayes, J. M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 9181.
31. Nissum, M.; Nielsen, O. F.; Jensen, F.; Jensen, P. W. J. Raman Spectrosc. 1995, 26, 1009.
32. Benson, S. C.; Mathies, R. A.; Glazer, A. N. Nucl. Acids Res. 1993, 21, 5720.
33. Carlsson, C.; Larsson, A.; Jonsson, M.; Albinsson, B.; Nordén, B. J. Phys. Chem. 1994, 98, 10312.
34. Milanovich, N.; Suh, M.; Hayes, J. M.; Small, G. J. Biospectroscopy 1996, 2, 125.