A Modified MSEVB force field for protonated water clusters

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 13, 2009, Pages 4111-4118

  Kumar, R ^a   Christie, R A ^a   Jordan, K D ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FORCE FIELDS; MULTI STATE; ORIGINAL MODELS; PROTONATED WATER CLUSTERS; VALENCE BONDS; WATER MODELS;

EID: 65249179591     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8066475     Document Type: Article

References (74)

1. Schwarz, H. A. J. Chem. Phys. 1977, 67, 5525.
2. Newton, M. D. J. Chem. Phys. 1977, 67, 5535.
3. Holland, P. M.; Castleman, A. W., Jr. J. Chem. Phys. 1980, 72, 5984.
4. Rahmouni, A.; Kochanski, E.; Wiest, R.; Wormer, P. E. S.; Langlet, J. J. Chem. Phys. 1990, 93, 6648.
5. Yang, X.; Zhang, X.; Castleman, A. W., Jr. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1991, 109, 339.
6. Wei, D.; Salahub, D. R. J. Chem. Phys. 1994, 101, 7633.
7. Corongiu, G.; Kelterbaum, R.; Kochanski, E. J. Phys. Chem. 1995, 99, 8038.
8. Ojamäe, L.; Shavitt, I.; Singer, S. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 5547.
9. Hodges, M. P.; Stone, A. J. J. Chem. Phys. 1999, 110, 6766.
10. Tuckerman, M.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1995, 103, 150.
11. Sagnella, D. E.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 1998, 108, 2073.
12. Jiang, J.-C.; Wang, Y.-S.; Chang, H.-C.; Lin, S.; Lee, Y.; Niedner- Schatteburg, G.; Chang, H.-C. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1398.
13. Lee, S.-W.; Cox, H.; Goddard, W.; Beauchamp, J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9201.
14. Achatz, U.; Fox, B.; Beyer, M.; Bondybey, V. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6151.
15. Christie, R.; Jordan, K. D. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 7551.
16. Christie, R.; Jordan, K. D. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 8376.
17. Shin, J.-W.; Hammer, N. I.; Diken, E. G.; Johnson, M. A.; Walters, R. S.; Jaeger, T. D.; Duncan, M. A.; Christie, R. A.; Jordan, K. D. Science 2004, 304, 1137.
18. Miyazaki, M.; Fujii, A.; Ebata, T.; Mikami, N. Science 2004, 304, 1134.
19. Singh, N. J.; Park, M.; Min, S. K.; Suh, S. B.; Kim, K. S. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 3795.
20. Park, M.; Shin, I.; Singh, N.; Kim, K. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10692.
21. Eigen, M.; Maeyer, L. Proc. R. Soc. London 1958, 247, 505.
22. Zundel, G.; Metzger, H. Z. Phys. Chem. 1968, 58, 225.
23. Schuster, P.; Zundel, G.; Sandorfy, C. The Hydrogen Bond: Recent Developments in Theory and Experiments; North-Holland: Amsterdam, 1976.
24. Jeffrey, G. A.; Saenger, W. Hydrogen Bonding in Biological Structures; Springer-Verlag: Berlin, 1991.
25. Nagle, J. F.; Morowitz, H. J. Proc. Natl. Acad. Sci. 1978, 75, 298.
26. Drukker, K.; de Leeuw, S. W.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 6799.
27. Lee, Y.; Krauss, M. J. Mol. Struct. 2004, 700, 243.
28. Kreuer, K.-D.; Paddison, S.; Spohr, E.; Schuster, M. Chem. Rev. 2004, 104, 4637.
29. Swanson, J.; Maupin, C.; Chen, H.; Petersen, M.; Xu, J.; Wu, Y.; Voth, G. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 4300.
30. Wayne, R. P. Chemistry of Atmospheres; Oxford University Press: New York, 1991.
31. Wei, S.; Shi, Z.; Castleman, A. W., Jr. J. Chem. Phys. 1991, 94, 3268.
32. Searcy, J. Q.; Fenn, J. B. J. Chem. Phys. 1974, 61, 5282.
33. Wu, C.-C.; Lin, C.-K.; Chang, H.-C.; Jiang, J.-C.; Kuo, J.-L.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 2005, 122, 074315.
34. Newton, M. D.; Ehrenson, S. J. Am. Chem. Soc. 1971, 93, 4971.
35. Luo, Y.; Maeda, S.; Ohno, K. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10732.
36. Iyengar, S. S. J. Chem. Phys. 2007, 126, 216101.
37. Stillinger, F. H.; David, C. W. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1473.
38. Vuilleumier, R.; Borgis, D. Chem. Phys. Lett. 1998, 284, 71.
39. Lobaugh, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2056.
40. Warshel, A. Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solution; Wiley: New York,1991.
41. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Mol. Struct. 1998, 553, 117.
42. Schmitt, U.; Voth, G. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5547.
43. Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1999, 111, 9361.
44. Day, T. J. F.; Soudackov, A. V.;Č uma, M.; Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2002, 117, 5839.
45. Brancato, G.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 2005, 122, 224507.
46. Chen, H.; Ilan, B.; Wu, Y.; Zhu, F.; Schulten, K.; Voth, G. A. Biophys. J. 2007, 92, 46.
47. Wu, Y.; Ilan, B.; Voth, G. A. Biophys. J. 2007, 92, 61.
48. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
49. Pedulla, J. M.; Jordan, K. D. Chem. Phys. 1998, 239, 593.
50. Burnham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1500.
51. Ren, P.; Ponder, J. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 5933.
52. Defusco, A.; Schofield, D. P.; Jordan, K. D. Mol. Phys. 2007, 105, 2681.
53. Bukowski, R.; Szalewicz, K.; Groenenboom, G. C.; van der Avoird, A. Science 2007, 315, 1249.
54. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Intermolecular Forces; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981.
55. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269.
56. Tsai, C. J.; Jordan, K. D. J. Phys. Chem. 1993, 97, 5208.
57. James, T.; Wales, D. J.; Hernández-Rojas, J. J. Chem. Phys. 2005, 415, 302.
58. Wu, Y.; Chen, H.; Wang, F.; Paesani, F.; Voth, G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 467.
59. Wu, Y.; Tepper, H. L.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2006, 124, 024503.
60. Weigend, F.; Häser, M.; Patzelt, H.; Alrichs, R. Chem. Phys. Lett. 1998, 294, 143.
61. http://www-wales.ch.cam.ac.uk/OPTIM/.
62. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
63. Werner, H.-J.; Knowles, P. J.; Lindh, R.; Manby, F. R.; Schütz, M.; Celani, P.; Korona, T.; Rauhut, G.; Amos, R. D.; Bernhardsson, A.; Berning, A.; Cooper, D. L.; Deegan, M. J. O.; Dobbyn, A. J.; Eckert, F.; Hampel, C.; Hetzer, G.; Lloyd, A. W.; McNicholas, S. J.; Meyer, W.; Mura, M. E.; Nicklass, A.; Palmieri, P.; Pitzer, R.; Schumann, U.; Stoll, H.; Stone, A. J.; Tarroni, R.; Thorsteinsson, T. Molpro, version 2006.1, a package of ab initio programs; 2006. See http://www.molpro.net.
64. Kendall, R. A.; Dunning, T. H., Jr.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796.
65. Duncan, M. A. Unpublished results.
66. Neirotti, J. P.; Calvo, F.; Freeman, D. L.; Doll, J. D. J. Chem. Phys. 2000, 112, 10340.
67. Iyengar, S. S.; Petersen, M. K.; Day, T. J. F.; Burnham, C. J.; Teige, V. E.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2005, 123, 084309.
68. Zwier, T. S. Science 2004, 304, 1119.
69. Hodges, M. P. Private communication.
70. Wales, D.; Doye, J. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 5111.
71. http://www-wales.ch.cam.ac.uk/wales/CCD/TIP4P-water.html.
72. Wales, D. J.; Hodges, M. P. Chem. Phys. Lett. 1998, 286, 65.
73. Franks, F. E. Water: A Comprehensive Treatise; Plenum: New York, 1972.
74. Dang, L. X.; Chang, T.-M. J. Chem. Phys. 1997, 106, 8149.