Heterogeneity and relaxation dynamics of the photoexcited retinal schiff base cation in solution

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 13, 2009, Pages 4384-4393

  Zgrablić, Goran ^a,b,c   Haacke, Stefan ^a,b,c   Chergui, Majed ^a,b,c  

^a EPFL   (Switzerland)

^b SINCROTRONE TRIESTE   (Italy)

^c INSTITUT DE PHYSIQUE ET CHIMIE DES MATÉRIAUX DE STRASBOURG   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETONITRILE; CHROMATOGRAPHIC ANALYSIS; DECAY (ORGANIC); DYNAMICS; EMISSION SPECTROSCOPY; HIGH PRESSURE LIQUID CHROMATOGRAPHY; OPHTHALMOLOGY; ORGANIC SOLVENTS; QUENCHING; SOLVENTS;

APROTIC SOLVENTS; DECAY CHANNELS; DECAY COMPONENTS; EXCITATION WAVELENGTHS; EXCITED-STATE; FEMTOSECOND FLUORESCENCES; FLUORESCENCE DECAY CHANNELS; FLUORESCENCE DECAYS; HIGH-PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHIES; POTENTIAL SURFACES; PROTONATED SCHIFF BASE OF RETINALS; RELAXATION DYNAMICS; SCHIFF-BASE; SOLVENT EFFECTS; SOLVENT PROPERTIES; SPECTRAL COMPONENTS; SPECTRAL DECOMPOSITIONS; SPECTRAL EVOLUTIONS; STERIC EFFECTS; TIME-RESOLVED FLUORESCENCE SPECTRUM; TIME-SCALE;

FLUORESCENCE;

EID: 65249146173     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8077216     Document Type: Article

References (65)

1. Oesterhelt, D.; Stoecken, W. Nature sNew Biology 1971, 233, 149.
2. Dexheimer, S. L.; Wang, Q.; Peteanu, L. A.; Pollard, W. T.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Chem. Phys. Lett. 1992, 188, 61.
3. Dobler, J.; Zinth, W.; Kaiser, W.; Oesterhelt, D. Chem. Phys. Lett. 1988, 144, 215.
4. Du, M.; Fleming, G. R. Biophys. Chem. 1993, 48, 101.
5. Mathies, R. A.; Brito Cruz, C. H.; Pollard, W. T.; Shank, C. V. Science 1988, 240, 777.
6. Polland, H. J.; Franz, M. A.; Zinth, W.; Kaiser, W.; Kölling, E.; Oesterhelt, D. Biophys. J. 1986, 49, 651.
7. Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1991, 254, 412.
8. Sharkov, A. V.; Pakulev, A. V.; Chekalin, S. V.; Matveetz, Y. A. Biochim. Biophys. Acta 1985, 808, 94.
9. Wang, Q.; Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1994, 266, 422.
10. Becker, R. S.; Freedman, K. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1477.
11. Freedman, K. A.; Becker, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1245.
12. Koyama, Y.; Kubo, K.; Komori, M.; Yasuda, H.; Mukai, Y. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 433.
13. Huang, J. Y.; Chen, Z. P.; Lewis, A. J. Phys. Chem. 1989, 93, 3314.
14. Mathies, R. A.; Stryer, L. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1976, 73, 2169.
15. Ponder, M.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. 1983, 87, 5090.
16. Groma, G. I.; Colonna, A.; Lambry, J. C.; Petrich, J. W.; Varo, G.; Joffre, M.; Vos, M. H.; Martin, J. L. Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 7971.
17. Colonna, A.; Groma, G. I.; Martin, J. L.; Joffre, M.; Vos, M. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2707.
18. Xu, D.; Martin, C.; Schulten, K. Biophys. J. 1996, 70, 453.
19. Kennis, J. T. M.; Larsen, D. S.; Ohta, K.; Facciotti, M. T.; Glaeser, R. M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6067.
20. Schenkl, S.; van Mourik, F.; van der Zwan, G.; Haacke, S.; Chergui, M. Science 2005, 309, 917.
21. Heyne, K.; Herbst, J.; Dominguez-Herradon, B.; Alexiev, U.; Diller, R. J. Phys. Chem. 2000, 104, 6053.
22. Nonella, M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 677.
23. Nonella, M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11379.
24. Schenkl, S.; van Mourik, F.; Friedman, N.; Sheves, M.; Schlesinger, R.; Haacke, S.; Chergui, M. Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 4101.
25. Song, L.; El-Sayed, M. A.; Lanyi, J. K. Science 1993, 261, 891.
26. Hamm, P.; Zurek, M.; Röschinger, T.; Patzelt, H.; Oesterhelt, D.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1996, 263, 613.
27. Hou, B.; Friedman, N.; Ruhman, S.; Sheves, M.; Ottolenghi, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 7042.
28. Hamm, P.; Zurek, M.; Röschinger, T.; Patzelt, H.; Oesterhelt, D.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1997, 286, 180.
29. Zgrablić, G.; Voitchovsky, K.; Kindermann, M.; Haacke, S.; Chergui, M. Biophys. J. 2005, 88, 2779.
30. Zgrablić, G.; Haacke, S.; Chergui, M. Chem. Phys. 2007, 338, 168.
31. Hou, B. X.; Friedman, N.; Ottolenghi, M.; Sheves, M.; Ruhman, S. Chem. Phys. Lett. 2003, 381, 549.
32. Childs, R. F.; Shaw, G. S. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 3013.
33. Prokhorenko, V. I.; Nagy, A. M.; Waschuk, S. A.; Brown, L. S.; Birge, R. R.; Miller, R. J. D. Science 2006, 313, 1257.
34. Ruhman, S.; Hou, B. X.; Friedman, N.; Ottolenghi, M.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 8854.
35. Schmidt, B.; Sobotta, C.; Heinz, B.; Laimgruber, S.; Braun, M.; Gilch, P. Biochim. Biophys. Acta-Bioenerg. 2005, 1706, 165.
36. Vengris, M.; van der Horst, M. A.; Zgrablic, G.; van Stokkum, I. H. M.; Haacke, S.; Chergui, M.; Hellingwerf, K. J.; van Grondelle, R.; Larsen, D. S. Biophys. J. 2004, 87, 1848.
37. Zgrablić, G. Solvent effects on the ultrafast dynamics of the retinal chromophore of bacteriorhodopsin, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 2006.
38. Cannizzo, A.; Bram, O.; Zgrablic, G.; Tortschanoff, A.; Oskouei, A. A.; van Mourik, F.; Cherguil, M. Opt. Lett. 2007, 32, 3555.
39. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2 ed.; Klewer Academic/Plenum Publishers: New York, 1999.
40. Förster, T. Fluoreszenz Organischer Verbindungen; Vandenhoeck &Ruprecht: Göttingen, 1951.
41. Mataga, N.; Kubota, T. Molecular Interactions and Electronic Spectra; Marcel Dekker, Inc.: 1970.
42. Birge, R. B.; Zhang, C.-F. J. Chem. Phys. 1990, 92, 7178.
43. Chizhov, I.; Schmies, G.; Seidel, R.; Sydor, J. R.; Luttenberg, B.; Engelhard, M. Biophys. J. 1998, 75, 999.
44. Metzler, D. E. Vision Res. 1978, 18, 1417.
45. Scharnagl, C.; Fischer, S. F. Chem. Phys. 1996, 212, 231.
46. Bachilo, S. M.; Bondarev, S. L.; Gillbro, T. J. Photochem. Photobiol. B 1996, 34, 39.
47. Bachilo, S. M.; Gillbro, T. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 2481.
48. Baasov, T.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 7524.
49. Fee, R. S.; Maroncelli, M. Chem. Phys. 1994, 183, 235.
50. Schenkl, S.; Portuondo, E.; Zgrablic, G.; Chergui, M.; Haacke, S.; Friedman, N.; Sheves, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 5020.
51. Schenkl, S.; Zgrablic, G.; Portuondo-Campa, E.; Haacke, S.; Chergui, M. Chem. Phys. Lett. 2007, 441, 322.
52. Birge, R. R.; Murray, L. P.; Zidovetzki, R.; Knapp, H. M. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2090.
53. Lippert, E. Z. Naturforsch., A: Phys. Sci. 1955, 10, 541.
54. Lippert, E. Z. Elektrochem. 1957, 61, 962.
55. Mataga, N.; Kaifu, Y.; Koizumi, M. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1955, 28, 690.
56. Horng, M. L.; Gardecki, J. A.; Papazyan, A.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17311.
57. Lin, S. W.; Groesbeek, M.; van der Hoef, I.; Verdegem, P.; Lugtenburg, J.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2787.
58. Smith, S. O.; Myers, A. B.; Mathies, R. A.; Pardoen, J. A.; Winkel, C.; van den Berg, E. M. M.; Lugtenburg, J. Biophys. J. 1985, 47, 653.
59. Cembran, A.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16018.
60. Cembran, A.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 6255.
61. Kandori, H.; Sasabe, H. Chem. Phys. Lett. 1993, 216, 126.
62. Logunov, S. L.; Song, L.; El-Sayed, M. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18586.
63. Olivucci, M.; Lami, A.; Santoro, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 5118.
64. González-Luque, R.; Garavelli, M.; Bernardi, F.; Merchán, M.; Robb, M. A.; Olivucci, M. Proc. Nat. Acad. Sci. 2000, 97, 9379.
65. Kovalenko, S. A.; Schanz, R.; Hennig, H.; Ernsting, N. P. J. Chem. Phys. 2001, 115, 3256.