Structure-based drug development against malaria

Frontiers in Drug Design and Discovery

Volumn 3, Issue 1, 2007, Pages 225-255

  Buchholz, Kathrin ^a,b   Mailu, Boniface Mwongela ^a   Schirmer, R Heiner ^b   Becker, Katja ^a  

^a JUSTUS LIEBIG UNIVERSITY   (Germany)

^b UNIVERSITY OF HEIDELBERG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 62149129095     PISSN: 15740889     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: None     Document Type: Article

References (210)

1. Breman, J.G.; Alilio, M.S.; Mills, A. Am. J. Trop. Med. Hyg., 2004, 71, 1-15.
2. Sherman, I.W. Molecular Approaches to Malaria, American Society of Microbiology Press: Riverside, 2005.
3. White, N.J.; Ho, M. Adv. Parasitol., 1992, 31, 83-173.
4. Marsh, K.; Forster, D.; Waruiru, C.; Mwangi, I.; Winstanley, M.; Marsh, V. N. Engl. J. Med., 1995, 332, 1399-1404.
5. Taylor, W.R.J.; White, N.J. Clin. Chest Med., 2002, 30, 457-468.
6. Brewster, D.R.; Kwiatkowski, D.; White, N.J. Lancet, 1990, 336, 1039-1043.
7. Farooq, U.; Mahajan, R.C. J. Vector Borne Dis., 2004, 3-4, 45-53.
8. Maitland, K.; Makanga, M.; Williams, T.N. Curr. Opin. Infect. Dis., 2004, 5, 405-412.
9. Afonso, A.; Hunt, P.; Cheesman, S.; Alves, A.C.; Cunha, C.V.; do Rosario, V.; Cravo, P. Antimicrob. Agents Chemother., 2006, 50, 480-489.
10. Jambou, R.; Legrand, E.; Niang, M.; Khim, N.; Lim, P.; Volney, B.; Ekala, M.T.; Bouchier, C.; Esterre, P.; Fandeur, T.; Mercereau-Puijalon, O. Lancet, 2005, 366, 1960-1963.
11. Cooper, R.A.; Carucci, D.J. Curr. Drug Targets Infect. Disord., 2004, 4, 41-51.
12. Chiang, P.K.; Bujnicki, J.M.; Su, X.; Lanar, D.E. Curr. Mol. Med., 2006, 6, 309-326.
13. Vangapandu, S.; Jain, M.; Kaur, K.; Patil, P.; Patel, S.R.; Jain, R. Med. Res. Rev., 2007, 27, 65-107.
14. Brady, R.L.; Cameron, A. Curr. Drug Target, 2004, 2, 137-149.
15. Biot, C.; Chibale, K. Infect. Disord. Drug Target, 2006, 6, 173-204.
16. Yeh, I.; Altman, R.B. Med. Chem., 2006, 6, 177-202.
17. Cunha-Rodrigues, M.; Prudencio, M.; Mota, N.M.; Haas, W. Biotechnol. J., 2006, 1, 321-332.
18. Bentley, G.A. Curr. Opin. Microbiol., 2006, 9, 395-400.
19. Atamna, H.; Pascarmona, G.; Ginsburg, H. Mol. Biochem. Parasitol., 1994, 67, 79-89.
20. Becker, K.; Tilley, L.; Vennerstrom, J.L.; Roberts, D.; Rogerson, S.; Ginsburg, H. Int. J. Parasitol., 2004, 34, 163-189.
21. Becker, K.; Rahlfs, S.; Nickel, C.; Schirmer, R.H. Biol. Chem., 2003, 384, 551.
22. Becker, K.; Koncarevic, S.; Hunt, N.H. In Molecular Approaches to Malaria;Sherman, I., Ed.; Am. Soc. Microbiol. Press, 2005; pp. 365-383.
23. Muller, S. Mol. Microbiol., 2004, 53, 1291-1305.
24. Rahlfs, S.; Schirmer, R.H.; Becker, K. Cell. Mol. Life Sci., 2002, 59, 1024-1041.
25. Nickel, C.; Rahlfs, S.; Deponte, M.; Koncarevic, S.; Becker, K. Antioxid. Redox Signal., 2006, 8, 1227-1239.
26. Nickel, C.; Trujillo, M.; Rahlfs, S.; Deponte, M.; Radi, R.; Becker, K. Biol. Chem., 2005, 386, 1129-1136.
27. Sarma, G.N.; Nickel, C.; Rahlfs, S.; Fischer, M.; Becker, K.; Karplus, P.A. J. Mol. Biol., 2005, 346, 1021-1034.
28. Krnajski, Z.; Gilberger, T.W.; Walter, R.D.; Cowman, A.F.; Muller, S. J. Biol. Chem., 2002, 277, 25970-25975.
29. Le Roch, K.G.; Zhou, Y.; Blair, P.L.; Grainger, M.; Moch, J.K.; Haynes, J.D.; De la Vega, P.; Holder, A.A.; Batalov, S.; Carucci, D.J.; Winzeler, E.A. Science, 2003, 301, 1503-1508.
30. Bozdech, Z.; Llinás, M.; Pulliam, B.L.; Wong, E.D.; Zhu, J.; DeRisi, J.L. PLoS Biol., 2003, 1, E5.
31. Hall, N.; Karras, M.; Raine, J.D; Carlton, J.M.; Kooij, T.W.; Berriman, M.; Florens, L.; Janssen, C.S.; Pain, A.; Christophides, G.K.; James, K.; Rutherford, K.; Harris, B.; Harris, D.; Churcher, C.; Quail, M.A.; Ormond, D.; Doggett, J.; Trueman, H.E.; Mendoza, J.; Bidwell, S.L.; Rajandream, M.A.; Carucci, D.J.; Yates, J.R. 3rd; Kafatos, F.C.; Janse, C.J.; Barrell, B.; Turner, C.M.; Waters, A.P.; Sinden, R.E. Science, 2005, 307, 82-86.
32. Bozdech, Z.; Ginsburg, H. Malar. J., 2004, 3, 23.
33. Schirmer, R.H.; Bauer, H.; Becker, K. In Wiley Encyclopedia of Molecular Medicine; Creighton, D.J.; Ed.; John Wiley and Sons, Inc.: New York, 2002; pp. 1471-1476.
34. Krauth-Siegel, R.L.; Bauer, H.; Schirmer, R.H. Angew. Chem. Int. Ed., 2005, 44, 690-715.
35. Sarma, G.N.; Savvides, S.N.; Becker, K.; Schirmer, M.; Schirmer, R.H.; Karplus, P.A. J. Mol. Biol., 2003, 328, 893-907.
36. Nordhoff, A.; Tziatzios, C.; Van den Broek, J.A.; Schott, M.K.; Kalbitzer, H.-R.; Becker, K.; Schubert, D.; Schirmer, R.H. Eur. J. Biochem., 1997, 245, 273-282.
37. Färber, P.M.; Arscott, L.D.; Williams, C.H.; Becker, K.; Schirmer, R.H. FEBS Lett., 1998, 422, 311-314.
38. Irmler, A.; Bechthold, A.; Davioud-Charvet, E.; Hofmann, V.; Réau, R.; Gromer, S.; Schirmer, R.H.; Becker, K.; In Flavins and Flavoproteins; Chapman, S.; Perham, R.; Scrutton, N.; Eds.; Walter de Gruyter, Berlin New York, 2002; Vol. 14, pp. 803-815.
39. Becker, K.; Savvides, S.; Keese, M.; Schirmer, R.H.; Karplus, P.A. Nat. Struct. Biol., 1998, 5, 267-271.
40. Savvides, S.N.; Scheiwein, M.; Boehme, C.C.; Arteel, G.E.; Karplus, P.A.; Becker, K.; Schirmer, R.H. J. Biol. Chem., 2002, 277, 2779-2784.
41. Davioud-Charvet, E.; Delarue, S.; Biot, Ch.; Schwöbel, B.; Boehme, C.C.; Müssigbrodt, A.; Maes, L.; Sergheraert, Ch.; Grellier, P.; Schirmer, R.H.; Becker, K. J. Med. Chem., 2001, 44, 4268-4276.
42. Akoachere, M.; Buchholz, K.; Fischer, E.; Burhenne, J.; Haefeli, W.E.; Schirmer, R.H.; Becker, K. Antimicrob. Agents Chemother., 2005, 49, 4592-4597.
43. Williams, C.H.; Arscott, L.D.; Muller, S.; Lennon, B.W.; Ludwig, M.; Wang, P.F.; Veine, D.M.; Becker, K.; Schirmer, R.H. Eur. J. Biochem., 2000, 267, 6110-6117.
44. McMillan, J.; Arscott, L.D.; Ballou, D.P.; Becker, K.; Williams, C.H.Jr.; Müller, S. J. Biol. Chem., 2006, 281, 32967-32977.
45. Gromer, S.; Urig, S.; Becker, K. Med. Res. Rev., 2004, 24, 40-89.
46. Davioud-Charvet, E.; McLeish, M.J.; Veine, D.M.; Giegel, D.; Arscott, L.D.; Andricopulo, A.D.; Becker, K.; Muller, S.; Schirmer, R.H.; Williams, C.H.Jr.; Kenyon, G.L. Biochemistry, 2003, 42, 13319-13330.
47. Andricopulo, A.D.; Akoachere, M.; Krogh, R.; Nickel, C.; McLeish, M.J.; Kenyon, G.L.; Ascott, L.D.; Williams, Ch.H.Jr.; Davioud-Charvet, E.; Becker, K. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2006, 16, 2283-2292.
48. Salinas, A.E.; Wong, M.G. Curr. Med. Chem., 1999, 6, 279-309.
49. Dubois, V.L.; Platel, D.F.; Pauly, G.; Tribouley-Duret, J. Exp. Parasitol., 1995, 81, 117-124.
50. Srivastava, P.; Puri, S.K.; Kamboj, K.K.; Pandey, V.C. Trop. Med. Int. Health, 1999, 4, 251-254.
51. Harwaldt, P.; Rahlfs, S.; Becker, K. Biol. Chem., 2002, 383, 821-830.
52. Ferreira, I.D.; Nogueira, F.; Borges, S.T.; do Rosario, V.E.; Cravo, P. Mol. Biochem. Parasitol., 2004, 136, 43-50.
53. Fritz-Wolf, K.; Becker, A.; Rahlfs, S.; Harwaldt, P.; Schirmer, R.H.; Kabsch, W.; Becker, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2003, 100, 13821-13826.
54. Perbrandt, M.; Burmeister, C.; Walter, R.D.; Betze, C.; Liebau, E. J. Biol. Chem., 2004, 279, 1336-1342.
55. Liebau, E.; Bergmann, B.; Campbell, A.M.; Teesdale-Spittle, P.; Brophy, P.M.; Luersen, K.; Walter, R.D. Mol. Biochem. Parasitol., 2002, 124, 85-68.
56. Hiller, N.; Fritz-Wolf, K.; Deponte, M.; Wende, W.; Zimmermann, H.; Becker, K. Protein Sci., 2006, 15, 281-289.
57. Famin, O.; Krugliak, M.; Ginsburg, H. Biochem. Pharmacol., 1999, 58, 59-68.
58. Deponte, M.; Becker, K. Methods Enzymol., 2005, 401, 241-254.
59. Roth, E.F.Jr.; Schulman, S.; Vanderberg, J.; Olson, J. Blood, 1986, 67, 827-830.
60. Vander Jagt, D.L.; Hunsaker, L.A.; Kibirige, M.; Campos, N.M. Blood, 1989, 74, 471-474.
61. Wagner, J.T.; Ludemann, H.; Farber, P.M.; Lottspeich, F.; Krauth-Siegel, R.L. Eur. J. Biochem., 1998, 258, 813-819.
62. Werner, C.; Stubbs, M.T.; Krauth-Siegel, R.L.; Klebe, G. J. Mol. Biol., 2005, 349, 597-607.
63. Li, L.H.; Li, M.; Wu, Y.S.; Wang, P.; Tian, Z.W. Di Yi Jun Yi Da Xue Xue Bao, 2002, 22, 883-887.
64. Rodriguez-Acosta, A.; Dominguez, N.G.; Aguilar, I.; Giron, M.E. Braz. J. Med. Biol. Res., 1998, 31, 1149-1155.
65. Lung-Unnasch, N.; Murphy, A.D. Annu. Rev. Microbiol., 1998, 52, 561-590.
66. Jensen, M.D.; Conley, M.; Helsowski, L.D. J. Parasitol., 1983, 69, 1060-1067.
67. Homewood, C.A.; Neame, K.D. Annu. Trop. Med. Parasitol., 1983, 77, 127-129.
68. Roth, E.F.Jr. Blood Cells, 1990, 16, 453-460.
69. Roth, E.F.Jr.; Raventos-Suarez, C.; Perkins, M.; Nagel, R.L. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1982, 109, 355-362.
70. Gomez, M.S.; Piper, R.C.; Hunsaker, L.A.; Royer, R.E.; Deck, L.M.; Makler, M.T.; Vander Jagt, D.L. Mol. Biochem. Parasitol., 1997, 90, 235-246.
71. Menting, J.G.; Tilley, L.; Deady, L.W.; Ng, K.; Simpson, R.J.; Cowman, A.F.; Foley, M. Mol. Biochem. Parasitol., 1997, 88, 215-242.
72. Dunn, C.R.; Banfield, M.J.; Baker, J.J.; Higham, C.W.; Moreton, K.M.; Turgut-Balik, D.; Brady, R.L.; Holbrook, J.J. Nat. Struct. Biol., 1996, 3, 912-915.
73. Cameron, A.; Read, J.; Tranter, R.; Winter, J.V.; Sessions, R.B.; Brady, R.L.; Vivas, L.; Easton, A.; Kendrick, H.; Croft, S.L.; Barros, D.; Lavandera, J.L.; Martin, J.J.; Risco, F.; Garcia-Ochoa, S.; Gamo, J.F.; Sanz, L.; Leon, L.; Ruiz, J.R.; Gabarro, R.; Mallo, A.; Heras, G.F. J. Biol. Chem., 2004, 279, 31329-31439.
74. Makler, M.T.; Ries, J.M.; Williams, J.A.; Bankrof, J.E.; Piper, R.C.; Gibbins, B.L.; Hinrichs, D.J. Am. J. Trop. Med. Hyg., 1993, 48, 739-741.
75. Brown, M.W.; Yowell, C.A.; Hoard, A.; Vander Jagt, T.A.; Hunsaker, L.A.; Deck, L.M.; Royer, R.E.; Piper, R.C.; Dame, J.B.; Makler, M.T.; Van der Jagt, D.L. Biochemistry, 2004, 43, 6219-6229.
76. Royer, R.E.; Deck, L.M.; Campos, N.M.; Hunsaker, L.A.; Van der Jagt, D.L. J. Med. Chem., 1986, 29, 1799-1801.
77. Deck, L.M.; Royer, R.E.; Chamblee, B.B.; Hernandez, V.M.; Malone, R.R.; Torres, J.E.; Hunsaker, L.A.; Piper, R.C.; Makler, M.T.; Van der Jagt, D.L. J. Med. Chem., 1998, 41, 3879-3887.
78. Dando, C.; Schroeder, E.R.; Hunsaker, L.A.; Deck, L.M.; Royer, R.E.; Zhou, X.; Parmley, S.F.; Van der Jagt, D.L. Mol. Biochem. Parasitol., 2001, 118, 23-32.
79. Yu, Y.; Deck, J.A.; Hunsaker, L.A.; Deck, L.M.; Royer, R.E.; Goldberg, E.; Van der Jagt, D.L. Biochem. Pharmacol., 2001, 62, 81-89.
80. Wierenga, R.K.; Noble, M.E.M.; Nauche, G.; Hol, W.G.J. J. Mol. Biol., 1991, 220, 995-1015.
81. Lollis, E.; Albert, T.; Davenport, R.C.; Rose, D.; Hartman, F.C.; Petsko, G.A. Biochemistry, 1990, 29, 6609-6618.
82. Mainfroid, V.; Goraj, K. J. Mol. Biol., 1996, 257, 441-456.
83. Eaazhisai, K.; Balaram, H.; Balaram, P.; Murthy, M.R.N. J. Mol. Biol., 2004, 343, 671-684.
84. Velanker, S.S.; Ray, S.S.; Gokhale, R.S.; Suma, S.; Balaram, H.; Balaram, P.; Murthy, M.R.N. Structure, 1997, 5, 751-761.
85. Parthasarathy, S.; Eaazhisai, K.; Balaram, H.; Balaram, P.; Murthy, M.R.N. J. Biol. Chem., 2003, 278, 52461-52470.
86. Harn, D.A.; Gu, W.; Mitsuyana, M.; Gebremichael, A.; Ritcher, D. J. Immunol., 1992, 148, 562-571.
87. Foth, B.J.; Ralph, S.A.; Tonkin, C.J.; Struck, N.S.; Fraunholz, M.; Roos, D.S.; Cowman, A.F.; McFadden, G. I. Science, 2003, 299, 705-708.
88. Sirover, M.A. Biochim. Biophys. Acta, 1999, 1432, 159-184.
89. Robien, M.A.; Bosch, J.; Buckner, F.S.; Van Voohis, W.C.E.; Worthey, E.A.; Myler, P.; Mehlin, C.; Boni, E.E.M.; Kayluzhniy, O.; Anderson, L.; Lauricella, A.; Gulde, S.; Luft, J.R.; DeTitta, G.; Carothers, J.M.; Hodgson, K.O.; Soltis, M.; Zucker, F.; Verlinde, C.L.M.J.; Merritt, E.; Schoenfeld, L.W.; Hol, W.G.J. Proteins, 2006, 62, 570-577.
90. Kim, H.; Certa, U.; Döbeli, H.; Jakob, P.; Hol, W.G.J. Biochemistry, 1998, 37, 4388-4396.
91. Yeltman, D.R.; Harris, B.G. Biochim. Biophys. Acta, 1977, 484, 188-198.
92. Penhoet, E.E.; Kochman, M.; Rutter, W.J. Biochemistry, 1969, 8, 4396-4402.
93. McFadden, G.I.; Reith, M.E.; Munholland, J.; Lang-Unnasch, N. Nature, 1996, 381, 482.
94. Waller, R.F.; Keeling, P.J.; Donald, R.G.; Striepen, B.; Handman, E.; Lang-Unnasch, N.; Cowman, A.F.; Besra, G.S.; Roos, D.S.; McFadden, G.I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1998, 95, 12352-12357.
95. Surolia, N.; Surolia, A. Nat. Med., 2001, 7, 167-173.
96. Perozzo, R.; Kuo, M.; Sidhu, A.B.S.; Valiyaveettil, J.T.; Bittman, R.; Jacobs, W.R.; Fidock, D.A.; Sacchettini, J.C. J. Biol. Chem., 2002, 277, 13106-13114.
97. Rozwarski, D.A.; Vilcheze, C.; Sugantino, M.; Bittman, R.; Sacchetini, J.C. J. Biol. Chem., 1999, 274, 15582-15589.
98. van Aalten, D.M.; Milne, K.G.; Zou, J.Y.; Kleywegt, G.J.; Bergfors, T.; Ferguson, M.A.; Knudsen, J.; Jones, T.A. J. Mol. Biol., 2001, 309, 181-192.
99. Cassera, M.B.; Gozzo, F.C.; D'Alexandri, F.L.; Merino, E.F.; del Portillo, H.A.; Peres, V.J.; Almeida, I.C.; Eberlin, M.N.; Wunderlich, G.; Wiesner, J.; Jomaa, H.; Kimura, E.A.; Katzin, A.M. J. Biol. Chem., 2004, 279, 51749-51759.
100. Rodriguez-Concepcion, M. Curr. Pharm. Des., 2004, 10, 2391-2400.
101. Wiesner, J.; Ortmann, R.; Jomaa, H.; Schlitzer, M. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2003, 42, 5274-5293.
102. Steinbacher, S.; Kaiser, J.; Gerhardt, S.; Eisenreich, W.; Huber, R.; Bacher, A.; Rohdich, F. J. Mol. Biol., 2003, 329, 973-982.
103. Jomaa, H.; Wiesner, J.; Sanderbrand, S.; Altinciek, B.; Weidemeyer, C.; Hintz, M.; Turbachova, I.; Eberl, M.; Zeidler, J.; Lichtenthaler, H.K.; Soldati, D.; Beck, E. Science, 1999, 285, 1573-1576.
104. Missinou, M.A.; Borrmann, S.; Schindler, A.; Issifou, S.; Adegnika, A.A.; Matsiegui, P.B.; Binder, R.; Lell, B.; Wiesner, J.; Baranek, T; Jomaa, H.; Kremsner, P.G. Lancet, 2002, 360, 1941-1942.
105. Yaijma, S.; Nonaka, T.; Kuzuyama, T.; Seto, H.; Ohsawa, K. J. Biochem., 2002, 131, 313-317.
106. Reuter, K.; Sanderbrand, S.; Klebe, G.; Stubbs, M.T. J. Biol. Chem., 2002, 277, 5378-5384.
107. Ortmann, R.; Wiesner, J.; Reichenberg, A.; Henschker, D.; Beck, E.; Jomaa, H.; Schlitzer, M. Arch. Pharm., 2005, 338, 305-314.
108. Rodrigues Goulart, H.; Kimura, E.A.; Peres, V.J.; Couto, A.S.; Aquino Duarte, F.A.; Katzin, A.M. Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 2502-2509.
109. Borrmann, S.; Issifou, S.; Esser, G.; Adegnika, A.A.; Ramharter, M.; Matsiegui, P.B.; Oyakhirome, S.; Mawili-Mboumba, D.P.; Missinou, M.A.; Kun, J.F.; Jomaa, H.; Kremsner, P.G. J. Infect. Dis., 2004, 190, 1534-1540.
110. Borrmann, S.; Lundgren, I.; Oyakhirome, S.; Impouma, B.; Matsiegui, P.B.; Adegnika, A.A.; Issifou, S.; Kun, J.F.; Hutchinson, D.; Wiesner, J.; Jomaa, H.; Kremsner, P.G. Antimicrob. Agents Chemother., 2006, 50, 2713-2718.
111. Borrmann, S.; Adegnika, A.A.; Moussavou, F.; Oyakhirome, S.; Esser, G.; Matsiegui, P.B.; Ramharter, M.; Lundgren, I.; Kombila, M.; Issifou, S.; Hutchinson, D.; Wiesner, J.; Jomaa, H.; Kremsner, P.G. Antimicrob. Agents Chemother., 2005, 49, 3749-3754.
112. Silber, K.; Heidler, P.; Kurz, T.; Klebe, G. J. Med. Chem., 2005, 19, 3547-3563.
113. Gardner, M.J.; Hall, N.; Fung, E.; White, O.; Berriman, M.; Hyman, R.W.; Carlton, J.M.; Pain, A.; Nelson, K.E.; Bowman, S.; Paulsen, I.T.; James, K.; Eisen, J.A.; Rutherford, K. Nature, 2002, 419, 498-511.
114. Yeh, I.; Altman, R.B. Med. Chem., 2006, 6, 177-202.
115. Shi, W.; Ting, L.M.; Kicgka, G.; Lewandowicz, A.; Tyler, P.C.; Evans, G.B.; Furneaux, R.H.; Kim, K.; Almo, S.C.; Schramm, V.L. J. Biol. Chem., 2004, 279, 18103-18106.
116. Miles, R.W.; Tyler, P.C.; Furneaux, R.H.; Bagdassarian, C.K.; Schramm, V.L. Biochemistry, 1998, 37, 8615-8621.
117. Kicska, G.A.; Tyler, P.C.; Evans, G.B.; Furneaux, R.H.; Schramm, V.L.; Kim, K. J. Biol. Chem., 2002, 277, 3226-3231.
118. Shi, W.; Li, C.M.; Tyler, P.C.; Furneaux, R.H.; Cahill, S.M.; Girvin, M.E.; Grubmeyer, C.; Schramm, V.L.; Almo, S.C. Biochemistry, 1999, 38, 9872-9880.
119. Keough, D.T.; Ng, A.L.; Winzor, D.J.; Emmerson, B.T.; de Jersey, J. Mol. Biochem. Parasitol., 1999, 98, 29-41.
120. Queen, S.A.; Vander Jagt, D.L.; Reyes, P. Antimicrob. Agents Chemother., 1990, 34, 1393-1398.
121. Li, C.M.; Tyler, P.C.; Furneaux, R.H.; Kicska, G.; Xu, Y.; Grubmeyer, C.; Girvin, M.E.; Schramm, V.L. Nat. Struct. Biol., 1999, 6, 582-587.
122. Shi, W.; Li, C.M.; Tyler, P.C.; Furneaux, R.H.; Grubmeyer, C.; Schramm, V.L.; Almo, S.C. Nat. Struct. Biol., 1999, 6, 588-593.
123. Eaazhisai, K.; Jayalakshmi, R.; Gyyathri, P.; Anand, R.P.; Sumathy, K.; Malaram, H.; Murthy, M.RN. J. Mol. Biol., 2004, 335, 1251-1264.
124. Sumathy, K.; Jayalakshmi, R.; Shivayogi, M.S.; Balaram, H. Curr. Sci., 2000, 78, 610-615.
125. Jayalakshmi, R.; Mehrotra, S.; Anand, R.P.; Balaram, H. Mol. Biochem. Parasitol., 2004, 138, 1-8.
126. Krungkrai, S.R.; Prpapunwattana, P.; Horii, T.; Krunggkrai, J. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2004, 318, 1012-1018.
127. Scott, H.V.; Gero, A.M.; Osullivan, W. J. Mol. Biochem. Parasitol., 1986, 18, 3-15.
128. Rathod, P.K.; Reyes, P. J. Biol. Chem., 1983, 258, 2852-2855.
129. Suttle, D.P.; Bugg, B.Y.; Winkler, J.K.; Kanalas, J.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1988, 85, 1754-1758.
130. Krungkrai, S.R.; Tokuoka, K.; Kusakari, Y.; Inoue, T.; Adachi, H.; Matsumura, H.; Takano, K.; Murakami, S.; Mori, Y.; Kai, Y.; Krungkrai, J.; Horii, T. Acta Crystallograph. Sekt. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 2006, 62, 542-545.
131. Krungkrai, S.R.; DelFraino, B.J.; Smiley, J.A.; Prpapunwattana, P.; Mitamura, T.; Horii, T.; Krungkrai, J. Biochemistry, 2005, 44, 1643-1652.
132. Nguyen, C.; Kasinathan, G.; Leal-Cortijo, I.; Musso-Buendia, A.; Kaiser, M.; Brun, R.; Ruiz-Pérez, L.M.; Johansson, N.G.; Gonzaléz-Pacanowska, D.; Gilbert, I.H. J. Med. Chem., 2005, 48, 5942-5954.
133. Nguyen, C.; Ruda, G.F.; Schipani, A.; Kasinathan, G.; Leal, I.; Musso-Buendia, A.; Kaiser, M.; Brun, R.; Ruiz-Pérez, L.M.; Stahlberg, BL.; Johansson, N.G.; Gonzaléz-Pacanowska, D.; Gilbert, I.H. J. Med. Chem., 2006, 49, 4183-4195.
134. Whittingham, J.L.; Leal, I.; Nguyen, C.; Kasinathan, G.; Bell, E.; Jones, A.F.; Berry, C.; Benito, A.; Turkenburg, J.P.; Dodson, E.J.; Ruiz Perez, L.M.; Wilkinson, A.J.; Johansson, N.G.; Brun, R.; Gilbert, I.H.; Gonzales Pacanowska, D.; Wilson, K.S. Structure, 2005, 13, 329-338.
135. Mehling, C. Comb. Chem. High Throughput Screen., 2005, 8, 5-14.
136. Biagini, B.A.; Oneill, P.M.; Nzila, A.; Ward, S.A.; Bray, P.G. Trends Parasitol., 2003, 19, 479-487.
137. Hyde, J.E. Trends Parasitol., 2005, 21, 494-498.
138. White, N. J. Clin. Invest., 2004, 113, 1084-1092.
139. Sirawaraporn, W.; Sathitkul, T.; Sirawaraporn, R.; Yuthavong, Y.; Santi, D.V. Proc. Natl. Acad. Sci, U.S.A., 1997, 94, 1124-1129.
140. Yuvaniyama, J.; Chitnumsub, P.; Kamchonwongpaisan, S.; Vanichtanankul, J.; Sirawaraporn, W.; Taylor, P.; Walkinshaw, M.D.; Yuthavong, Y. Nat. Struct. Biol., 2003, 10, 357-365.
141. Lemcke, T.; Christensen, I.T.; Jørgensen, F.S. Bioorg. Med. Chem., 1999, 7, 1003-1011.
142. Wrenger, C.; Eschbach, M.L.; Müller, I.B.; Warnecke, D.; Walter, R.D. J. Biol. Chem., 2005, 280, 5242-5248.
143. Gengenbacher, M.; Fitzpatrick, T.B.; Raschle, T.; Flicker, K.; Sinning, I.; Müller, S.; Macheroux, P.; Tews, I.; Kappes, B. J. Biol. Chem., 2006, 281, 3633-3641.
144. Goldberg, D.E. Semin. Cell Biol., 1993, 4, 355-361.
145. Coombs, G.H.; Goldberg, D.E.; Klemba, M.; Berry, C.; Kay, J.; Mottram, J.C. Trends Parasitol., 2001, 17, 532-537.
146. Glutzmann, I.Y.; Francis, S.E.; Oksman, A.; Smith, C.E.; Duffin, K.L.; Goldberg, D.E. J. Clin. Invest., 1993, 4, 1602-1608.
147. Ersmark, K.; Samuelsson, B.; Hallberg, A. Med. Res. Rev., 2006, 26, 626-666.
148. Klemba, M.; Glutzman, I.; Goldberg, D.E. J. Biol. Chem., 2004, 279, 43000-43007.
149. Rosenthal, P.J. Exp. Parasitol., 1995, 80, 272-281.
150. Dash, C.; Kulkarni, A.; Dunn, G.B.; Rao, M. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol., 2003, 38, 89-119.
151. Silva, A.M.; Lee, A.Y.; Gulnik, S.V.; Majer, P.; Collins, J.; Bhat, T.N.; Collins, P.J.; Cachau, R.E.; Luker, K.E.; Gluzman, I.Y.; Francis, S.E.; Oksman, A.; Goldberg, D.E.; Erickson, J.W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1996, 93, 10034-10039.
152. Ersmark, K.; Feierberg, I.; Bjelic, S.; Hamelink, E.; Hackett, F.; Blackman, J.; Hultén, J.; Samuelsson, B.; Åqvist, J.; Hallberg, A. J. Med. Chem., 2004, 47, 110-122.
153. Omara-Opyene, L.; Moura, P.A.; Sulsona, C.R.; Bonilla, J.A.; Yowell, C.A.; Fujioka, H.; Fidock, D.A.; Dame, J.B. J. Biol. Chem., 2004, 279, 54088-54096.
154. Liu, J.; Gluzman, I.J.; Drew, M.E.; Goldberg, D.E. J. Biol. Chem., 2005, 280, 1432-1437.
155. Liu, J.; Istvan, E.S.; Gluzman, I.Y.; Gross, J.; Goldberg, D.E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2006, 103, 8840-8845.
156. Greenbaum, D.C.; Baruch, A.; Grainger, M.; Bozdech, Z.; Medzihradszky, K.F.; Engel, J.; DeRisi, J.; Holder, A.A.; Bogyo, M. Science, 2002, 6, 2002-2006.
157. Shenai, B.R.; Sijwali, P.S.; Singh, A.; Rosenthal, P.J. J. Biol. Chem., 2000, 275, 29000-29010.
158. Sijwali, P.S.; Shenai, B.R.; Gut, J.; Singh, A.; Rosenthal, P.J. Biochem. J., 2001, 360, 481-489.
159. Sijwali, P.S.; Rosenthal, P.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2004, 101, 4384-4389.
160. Sijwali, P.S.; Kato, K.; Seydel, K.B.; Gut, J.; Lehman, J.; Klemba, M.; Goldberg, D.E.; Miller, L.H.; Rosenthal, P.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2004, 101, 8721-8726.
161. Sijwali, P.S.; Koo, J.; Singh, N.; Rosenthal, P.J. Mol. Biochem. Parasitol., 2006, 150, 96-106.
162. Dominguez, J.N.; Lopez, S.; Charris, J.; Iarusso, L.; Lobo, G.; Semenov, A.; Olson, J.E.; Rosenthal, P.J. J. Med. Chem., 1997, 40, 2726-2732.
163. Scheidt, K.A.; Roush, W.R.; McKerrow, J.H.; Selzer, P.M.; Hansell, E.; Rosenthal, P.J. Bioorg. Med. Chem., 1998, 6, 2477-2494.
164. Lee, B.J.; Singh, A.; Chiang, P.; Kemp, S.J.; Goldman, E.A.; Weinhouse, M.I.; Vlasuk, G.P.; Rosenthal, P.J. Antimicron. Agents Chemother., 2003, 47, 3810-3814.
165. Batra, S.; Sabnis, Y.A.; Rosenthal, P.J.; Avery, M.A. Bioorg. Med. Chem., 2003, 11, 2293-2299.
166. Chiyanzu, I.; Clarkson, C.; Smith, P.J.; Lehman, J.; Gut, J.; Rosenthal, P.J.; Chibale, K. Bioorg. Med. Chem., 2005, 13, 3249-3261.
167. Singh, N.; Sijwali, P.S.; Pandey, K.C.; Rosenthal, P.J. Exp. Parasitol., 2006, 112, 187-192.
168. Desai, P.V.; Patny, A.; Gut, J.; Rosenthal, P.J.; Tekwani, B.; Srivastava, A.; Avery, M. J. Med. Chem., 2006, 49, 1576-1584.
169. Verhelst, S.H.; Witte, M.D.; Arastu-Kapur, S.; Fonovic, M.; Bogyo, M. Chembiochem, 2006, 7, 943-950.
170. Valente, C.; Guedes, R.C.; Moreira, R.; Iley, J.; Gut, J.; Rosenthal, P.J. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2006, 16, 4115-4119.
171. Micale, N.; Kozikowski, A.P.; Ettari, R.; Grasso, S.; Zappalà, M.; Jeong, J.J.; Kumar, A.; Hanspal, M.; Chishti, A.H. J. Med. Chem., 2006, 49, 3064-3067.
172. Wang, S.X.; Pandey, K.C.; Somoza, J.R.; Sijwali, P.S.; Kortemme, T.; Brinen, L.S.; Fletterick, R.J.; Rosenthal, P.J.; McKerrow, J.H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2006, 103, 11503-11508.
173. Hogg, T.; Nagarajan, K.; Herzberg, S.; Chen, L.; Shen, X.; Jiang, H.; Wecke, M.; Blohmke, C.; Hilgenfeld, R.; Schmidt, C.L. J. Biol. Chem., 2006, 281, 25425-25437.
174. Eggleson, K.K.; Duffin, K.L.; Goldberg, D.E. J. Biol. Chem., 1999, 274, 32411-32417.
175. Murata, C.E.; Goldberg, J. J. Biol. Chem., 2003, 278, 38022-38028.
176. Ross-MacDonald, P.B.; Graeser, R.; Kappes, B.; Franklin, R.; Williamson, D.H. J. Biochem., 1994, 220, 693-701.
177. Bracchi-Ricard, V.; Barik, S.; Delvecchio, C.; Doerig, C.; Chakrabarti, C.D. Biochem. J., 2000, 347, 255-263.
178. Doerig, C.; Horrocks, P.; Coyle, J.; Carlton, J.; Sultan, A.; Arnot, D.; Carter, R. Mol. Biochem. Parasitol., 1995, 70, 167-174.
179. Doerig, C.; Endicott, J.; Chakrabarti, D. Int. J. Parasitol., 2002, 32, 1575-1485.
180. Li, J.L.; Robson, K.J.; Chen, J.L.; Targett, G.A.; Baker, D.A. Eur. J. Biochem., 1996, 241, 805-813.
181. Ward, P.; Equinet, L.; Packer, J.; Doerig, C. BMC Genomics, 2004, 5, 79.
182. Geyer, J.A.; Prigge, S.T.; Waters, N.C. Biochim. Biophys. Acta, 2005, 1754, 160-170.
183. Cohen, P. Nat. Rev. Drug Discov., 2002, 1, 309.
184. Doerig, C.; Billker, O.; Pratt, D.; Endicott, J. Biochim. Biophys. Acta, 2005, 1754, 132-150.
185. Holton, S.; Merkx, A.; Burgess, D.; Doerig, C.; Noble, M.; Endicott, J. Structure, 2003, 11, 1329-1337.
186. Cantoni, G. L. Rev. Biochem., 1975, 44, 435-451.
187. Tanaka, N.; Nakanishi, M.; Kusakabe, Y.; Shiraiwa, K.; Yabe, S.; Ito, Y.; Kitade, Y.; Nakamura, K. T. J. Mol. Biol., 2004, 343, 1007-1017.
188. von Itzstein, M.; Dyason, J. C.; Oliver, S. W.; White, H. F.; Wu, W.Y.; Kok, G. B.; Pegg, M. S. J. Med. Chem., 1996, 39, 388-891.
189. Nakanishi, M.; Yabe, S.; Tanaka, N.; Ito, Y.; Nakamura, K.T.; Kitade, Y. Mol. Biochem. Parasitol., 2005, 143, 146-151.
190. Whaun, J. M.; Miura, G. A.; Brown, N. D.; Gordon, R. K.; Chiang, P. K. J. Pharmacol. Expt. Ther., 1986, 236, 277-283.
191. Takagi, C.; Sukeda, M.; Kim, H.S.; Wataya, Y.; Yabe, S.; Kitade, Y.; Matsuda, A.; Shuto, S. Org. Biomol. Chem., 2005, 3, 1245-1251.
192. Kitade, Y.; Kozaki, A.; Miwa, T.; Nakanishi, M. Tetrahedron, 2002, 58, 1271-1277.
193. Kitade, Y.; Kojima, H.; Zulfiqur, F.; Kim, H.-S.; Wataya, Y. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2003, 13, 3963-3965.
194. Bracchi-Richard, V.; Nguyen, K.; Zhou, Y.; Rajagopalan, P.T.R.; Chakrabarti, D.; Pei, D. Arch. Biochem. Biophys., 2001, 396, 162-170.
195. Kumar, A.; Nguyen, K.T.; Srivathsan, S.; Ornstein, B.; Turley, S.; Hirsh, I.; Pei, D.; Hol, W.G.J. Structure, 2002, 10, 357-367.
196. Robien, M.A.; Nguyen, K.T.; Kumar, A.; Hirsh, I.; Turley, S.; Pei, D.; Hol, W.G. Protein Sci., 2004, 13, 1155-1163.
197. Weisner, J.; Sanderbrand, S.; Altinicicek, B.; Beck, E.; Jomaa, H. Trends Parasitol., 2001, 17, 7-8.
198. Fischer, G. Angew. Chem. Int. Ed. Eng., 1994, 33, 1415-1436.
199. Galat, A.; Metcalfe, S. M. Prog. Biophys. Mol. Biol., 1995, 63, 67-118.
200. Gothel, S.F.; Marahiel, M.A. Cell. Mol. Life Sci., 1999, 55, 423-436.
201. Berriman, M.; Fairlamb, A.H. Biochem. J., 1998, 334, 437-445.
202. Hirtzlin, J.; Farber, P.M.; Franklin, R.M.; Bell, A. Eur. J. Biochem., 1995, 232, 765-772.
203. Reddy, G.R. Mol. Biochem. Parasitol., 1995, 73, 111-121.
204. Peterson, M.R.; Hall, D.R.; Berriman, M.; Nunes, J.A.; Leonard, G.A.; Fairlamb, A.H.; Hunter, W.N. J. Mol. Biol., 2000, 298, 123-133.
205. Bell, A.; Roberts, H.C.; Chappell, L.H. Gen. Pharmacol., 1996, 27, 963-971.
206. Huai, Q.; Kim, H.Y.; Liu, Y.; Zhao, Y.; Mondragon, A.; Lui, J.O.; Ke, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, 99, 12037-12042.
207. Jin, L.; Harrison, S.C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, 99, 13522-13526.
208. Dobson, S.; May, T.; Berriman, M.; Del Vecchio, C.; Fairlamb, A.H.; Chakrabarti, D.; Barik, S. Mol. Biochem. Parasitol., 1999, 99, 167-181.
209. Etzkorn, F.A.; Chang, Z.; Stolz, L.A.; Walsh, C.T. Biochemistry, 1994, 33, 2380-2388.
210. Mikol, V.; Kallen, J.; Walkinshaw, M.D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1994, 91, 5183-5186.