메뉴 건너뛰기




Volumn 130, Issue 7, 2009, Pages

An optimized replica exchange molecular dynamics method

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISTRIBUTION FUNCTIONS; MOLECULAR DYNAMICS; PROBABILITY DISTRIBUTIONS;

EID: 60749086217     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.3077857     Document Type: Article
Times cited : (15)

References (61)
  • 3
    • 33748253737 scopus 로고    scopus 로고
    • 1432-881X 10.1007/s00214-005-0004-1.
    • A. van der Vaart, Theor. Chem. Acc. 1432-881X 10.1007/s00214-005-0004-1 116, 183 (2006).
    • (2006) Theor. Chem. Acc. , vol.116 , pp. 183
    • Van Der Vaart, A.1
  • 4
    • 0342929614 scopus 로고
    • 0021-9991 10.1016/0021-9991(77)90121-8.
    • G. M. Torrie and J. P. Valleau, J. Comput. Phys. 0021-9991 10.1016/0021-9991(77)90121-8 23, 187 (1977).
    • (1977) J. Comput. Phys. , vol.23 , pp. 187
    • Torrie, G.M.1    Valleau, J.P.2
  • 6
    • 0031144465 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.78.3908.
    • A. F. Voter, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.78.3908 78, 3908 (1997).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.78 , pp. 3908
    • Voter, A.F.1
  • 7
    • 1442281293 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.473503.
    • A. F. Voter, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.473503 106, 4665 (1997).
    • (1997) J. Chem. Phys. , vol.106 , pp. 4665
    • Voter, A.F.1
  • 8
    • 0032607091 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.478948.
    • X. Wu and S. Wang, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.478948 110, 9401 (1999).
    • (1999) J. Chem. Phys. , vol.110 , pp. 9401
    • Wu, X.1    Wang, S.2
  • 9
    • 0001616080 scopus 로고    scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/S0009-2614(99)01123-9.
    • Y. Sugita and Y. Okamoto, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/S0009-2614(99)01123-9 314, 141 (1999).
    • (1999) Chem. Phys. Lett. , vol.314 , pp. 141
    • Sugita, Y.1    Okamoto, Y.2
  • 15
    • 39349109496 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2825614.
    • Y. Gao, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2825614 128, 064105 (2008).
    • (2008) J. Chem. Phys. , vol.128 , pp. 064105
    • Gao, Y.1
  • 16
    • 0033531973 scopus 로고    scopus 로고
    • 0022-2836 10.1006/jmbi.1999.2670.
    • E. Paci and M. Karplus, J. Mol. Biol. 0022-2836 10.1006/jmbi.1999.2670 288, 441 (1999).
    • (1999) J. Mol. Biol. , vol.288 , pp. 441
    • Paci, E.1    Karplus, M.2
  • 18
    • 40549112015 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2834500.
    • D. Min and W. Yang, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2834500 128, 094106 (2008).
    • (2008) J. Chem. Phys. , vol.128 , pp. 094106
    • Min, D.1    Yang, W.2
  • 19
    • 46749137495 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2949815.
    • L. Zheng and W. Yang, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2949815 129, 014105 (2008).
    • (2008) J. Chem. Phys. , vol.129 , pp. 014105
    • Zheng, L.1    Yang, W.2
  • 23
    • 0141704162 scopus 로고    scopus 로고
    • 0887-3585 10.1002/prot.10483.
    • R. Zhou, Proteins 0887-3585 10.1002/prot.10483 53, 148 (2003).
    • (2003) Proteins , vol.53 , pp. 148
    • Zhou, R.1
  • 28
    • 33846227108 scopus 로고    scopus 로고
    • 0887-3585 10.1002/prot.21258.
    • S. Kannan and M. Zacharias, Proteins 0887-3585 10.1002/prot.21258 66, 697 (2007).
    • (2007) Proteins , vol.66 , pp. 697
    • Kannan, S.1    Zacharias, M.2
  • 30
    • 33847717840 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2408415.
    • P. Liu and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2408415 126, 045106 (2007).
    • (2007) J. Chem. Phys. , vol.126 , pp. 045106
    • Liu, P.1    Voth, G.A.2
  • 35
    • 20844439932 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1917749.
    • A. Kone and D. A. Kofke, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1917749 122, 206101 (2005).
    • (2005) J. Chem. Phys. , vol.122 , pp. 206101
    • Kone, A.1    Kofke, D.A.2
  • 37
    • 0037109535 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1507776, ();, J. Chem. Phys. 120, 10852 (2004).
    • D. A. Kofke, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1507776 117, 6911 (2002); D. A. Kofke, J. Chem. Phys. 120, 10852 (2004).
    • (2002) J. Chem. Phys. , vol.117 , pp. 6911
    • Kofke, D.A.1    Kofke, D.A.2
  • 39
    • 33947603020 scopus 로고    scopus 로고
    • 0953-8984 10.1088/0953-8984/19/3/036225.
    • D. Gront and A. Kolinski, J. Phys.: Condens. Matter 0953-8984 10.1088/0953-8984/19/3/036225 19, 036225 (2007).
    • (2007) J. Phys.: Condens. Matter , vol.19 , pp. 036225
    • Gront, D.1    Kolinski, A.2
  • 40
    • 41349094233 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.046701.
    • S. Trebst, D. A. Huse, and M. Troyer, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.046701 70, 046701 (2004).
    • (2004) Phys. Rev. e , vol.70 , pp. 046701
    • Trebst, S.1    Huse, D.A.2    Troyer, M.3
  • 43
    • 33847341192 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.75.026109.
    • W. Nadler and U. Hansmann, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.75. 026109 75, 026109 (2007).
    • (2007) Phys. Rev. e , vol.75 , pp. 026109
    • Nadler, W.1    Hansmann, U.2
  • 48
    • 52949132972 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2982161.
    • L. Zheng and W. Yang, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2982161 129, 124107 (2008).
    • (2008) J. Chem. Phys. , vol.129 , pp. 124107
    • Zheng, L.1    Yang, W.2
  • 49
    • 6644221271 scopus 로고    scopus 로고
    • 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.86.2050.
    • F. Wang and D. P. Landau, Phys. Rev. Lett. 0031-9007 10.1103/PhysRevLett. 86.2050 86, 2050 (2001).
    • (2001) Phys. Rev. Lett. , vol.86 , pp. 2050
    • Wang, F.1    Landau, D.P.2
  • 50
    • 39749147672 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.64.056101.
    • F. Wang and D. P. Landau, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.64. 056101 64, 056101 (2001).
    • (2001) Phys. Rev. e , vol.64 , pp. 056101
    • Wang, F.1    Landau, D.P.2
  • 51
    • 34547809547 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.447334.
    • S. Noś, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.447334 81, 511 (1984).
    • (1984) J. Chem. Phys. , vol.81 , pp. 511
    • Noś, S.1
  • 52
    • 0001538909 scopus 로고
    • 1050-2947 10.1103/PhysRevA.31.1695.
    • W. Hoover, Phys. Rev. A 1050-2947 10.1103/PhysRevA.31.1695 31, 1695 (1985).
    • (1985) Phys. Rev. A , vol.31 , pp. 1695
    • Hoover, W.1
  • 56
  • 58
    • 0017842051 scopus 로고
    • 0006-3525 10.1002/bi1978.360170612.
    • Y. Ueda, H. Taketomi, and N. Go, Biopolymers 0006-3525 10.1002/bip.1978.360170612 17, 1531 (1978).
    • (1978) Biopolymers , vol.17 , pp. 1531
    • Ueda, Y.1    Taketomi, H.2    Go, N.3


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.