Dynamics of CO rebinding to protoheme in viscous solutions

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 30, Issue 1, 2009, Pages 177-182

  Lee, Taegon ^a   Park, Jaeheung ^a   Kim, Jooyoung ^a   Joo, Sangwoo ^b   Lim, Manho ^a  

^a Pusan National University   (South Korea)

^b Soongsil University   (South Korea)

Author keywords

CO Rebinding; Fs vibrational spectroscopy; Protoheme; Viscous solution

Indexed keywords

AMINO ACIDS; DIMERS; PHOTOLYSIS; SOLVENTS; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; VISCOSITY;

CO REBINDING; FS VIBRATIONAL SPECTROSCOPY; GAUSSIAN FUNCTIONS; GEMINATE REBINDING; PROTOHEME; PROTOPORPHYRIN IX; VIBRATIONAL BANDS; VISCOUS SOLUTION;

PORPHYRINS;

EID: 60149088229     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2009.30.1.177     Document Type: Article

References (39)

1. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalus, I. C. Biochemistry 1975, 14, 5355-5373.
2. Springer, B. A.; Sligar, S. G.; Olson, J. S.; Phillips, G. N., Jr. Chem. Rev. 1994, 94, 699-714.
3. Ye, X.; Yu, A.; Georgiev, G. Y.; Gruia, F.; Ionascu, D.; Cao, W.; Sage, J. T.; Champion, P. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5854-5861.
4. Ye, X.; Lonascu, D.; Gruia, F.; Yu, A.; Benabbas, A.; Champion, P. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 14682-14687.
5. Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Nature Struct. Biol. 1997, 4, 209-214.
6. Traylor, T. G.; Magde, D.; Taube, D. J.; Jongeward, K. A.; Bandyopadhyay, D.; Luo, J.; Walda, K. N. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 417-429.
7. White, D. K.; Cannon, J. B.; Traylor, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 2443-2454.
8. Cao, W.; Ye, X.; Georgiev, G. Y.; Berezhna, S.; Sjodin, T.; Demidov, A. A.; Wang, W.; Sage, J. T.; Champion, P. M. Biochemistry 2004, 43, 7017-7027.
9. Hasinoff, B. B. Arch. Biochem. Biophys. 1981, 211, 396-402.
10. Hill, J. R.; Cote, M. J.; Dlott, D. D.; Kauffman, J. F.; McDonald, J. D.; Steinbach, P. J.; Berendzen, J. R.; Frauenfelder, H. Springer Series Chemical Physics 1986, 46, 433-435.
11. Miers, J. B.; Postlewaite, J. C.; Zyung, T.; Chen, S.; Roemig, G. R.; Wen, X.; Dlott, D. D. J. Chem. Phys. 1990, 93, 8771-8776.
12. White, W. I. In The Porphyrins; Dolphin, D., Ed.; Academic: New York, 1979.
13. Medhi, O. K.; Mazumdar, S.; Mitra, S. Inorg. Chem. 1989, 28, 3243-3248.
14. Simplicio, J.; Schwenzer, K. Biochemistry 1973, 12, 1923-1929.
15. Beece, D.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Good, D.; Marden, M. C.; Reinisch, L.; Reynolds, A. H.; Sorensen, L. B.; Yue, K. T. Biochemistry 1980, 19, 5147-5157.
16. Moore, J. N.; Hansen, P. A.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 5062-5066.
17. Adachi, S.; Sunohara, N.; Ishimori, K.; Morishima, I. J. Biol. Chem. 1992, 267, 12614-12621.
18. Ansari, A.; Berendzen, J.; Braunstein, D. K.; Cowen, B. R.; Frauenfelder, H.; Hong, M. K.; Iben, I. E. T.; Johnson, J. B.; Ormos, P.; Sauke, T. B.; Scholl, R.; Schulte, A.; Steinbach, P. J.; Vittitow, J.; Young, R. D. Biophys. Chem. 1987, 26, 337-355.
19. Balasubramanian, S.; Lambright, D. G.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 4718-4722.
20. Muller, J. D.; McMahon, B. H.; Chien, E. Y.; Sligar, S. G.; Nienhaus, G. U. Biophy. J. 1999, 77, 1036-1051.
21. Li, T.; Quillin, M. L.; Phillips, G. N., Jr.; Olson, J. S. Biochemistry 1994, 33, 1433-1446.
22. Kim, S.; Jin, G.; Lim, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 20366- 20375.
23. Lim, M.; Wolford, M. F.; Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1998, 290, 355-362.
24. Hamm, P.; Kaindl, R. A.; Stenger, J. Opt. Lett. 2000, 25, 1798-1800.
25. Hamm, P.; Lim, M.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6123-6138.
26. Henry, E. R.; Sommer, J. H.; Hofrichter, J.; Eaton, W. A. J. Mol. Biol. 1983, 166, 443-451.
27. Jongeward, K. A.; Magde, D.; Taube, D. J.; Marsters, J. C.; Traylor, T. G.; Sharma, V. S. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 380-387.
28. Lide, D. R. CRC Hanbook of Chemistry and Physics, 76th ed.; CRC Press, Inc.: 1995.
29. Brault, D.; Rougee, M. Biochemistry 1974, 13, 4598-4602.
30. Brault, D.; Rougee, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1974, 57, 654-659.
31. Rougee, M.; Brault, D. Biochemistry 1975, 14, 4100-4106.
32. Vogel, K. M.; Kozlowski, P. M.; Zgierski, M. Z.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9915-9921.
33. Hamm, P. Chem. Phys. 1995, 200, 415-429.
34. Wynne, K.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1995, 193, 211-236.
35. Petrich, J. W.; Poyart, C.; Martin, J. L. Biochemistry 1988, 27, 4049-4060.
36. Anfinrud, P. A.; Han, C.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 8387-8391.
37. Lim, M.; Jackson, T.; Anfinrud, P. In Practical Spectroscopy; Marcel Dekker, Inc.: 2001; Vol. 26, pp 191-226.
38. Kleinert, T.; Doster, W.; Leyser, H.; Petry, W.; Schwarz, V.; Settles, M. Biochemistry 1998, 37, 717-733.
39. Kim, J.; Park, J.; Lee, T.; Lim, M. J. Phys. Chem. B (in press).