Entropic unfolding of DNA molecules in nanofluidic channels

Nano Letters

Volumn 8, Issue 11, 2008, Pages 3839-3844

  Levy, Stephen L ^a   Mannion, John T ^a   Cheng, Ji ^a   Reccius, Christian H ^a   Craighead, Harold G ^a  

^a Cornell University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHANNEL AXIS; CONFORMATIONAL FREE ENERGIES; CONTOUR LENGTHS; DNA MOLECULES; EXTERNAL ELECTRIC FIELDS; FLUIDIC CHANNELS; HYDRODYNAMIC FRICTIONS; NANO-CHANNELS; NANO-SCALE; NANOFLUIDIC CHANNELS; PER UNIT LENGTHS; SINGLE DNA MOLECULES;

DNA; ELECTRIC FIELDS; FLUID DYNAMICS; FLUIDIC DEVICES; FREE ENERGY; GENES; NANOFLUIDICS; NANOSTRUCTURED MATERIALS; NUCLEIC ACIDS;

MOLECULES;

DNA;

ARTICLE; CHEMISTRY; CONFORMATION; ENTROPY;

DNA; ENTROPY; NUCLEIC ACID CONFORMATION;

EID: 58149277694     PISSN: 15306984     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl802256s     Document Type: Article

References (25)

1. Foquet, M.; Korlach, J.; Zipfel, W.; Webb, W. W.; Craighead, H. G. Anal. Chem. 2002, 74, 1415.
2. Reccius, C. H.; Stavis, S. M.; Mannion, J. T.; Walker, L. P.; Craighead, H. G. Biophys. J. 2008, 95, 273.
3. Tegenfeldt, J. O.; Prinz, C.; Cao, H.; Chou, S.; Reisner, W. W.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Cox, E. C.; Sturm, J. C.; Silberzan, P.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 10979.
4. Riehn, R.; Lu, M. C.; Wang, Y. M.; Lim, S. F.; Cox, E. C.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 10012.
5. Chan, E. Y.; Goncalves, N. M.; Haeusler, R. A.; Hatch, A. J.; Larson, J. W.; Maletta, A. M.; Yantz, G. R.; Carstea, E. D.; Fuchs, M.; Wong, G. G.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Genome Res. 2004, 14, 1137.
6. Phillips, K. M.; Larson, J. W.; Yantz, G. R.; D'Antoni, C. M.; Gallo, M. V.; Gillis, K. A.; Goncalves, N. M.; Neely, L. A.; Gullans, S. R.; Gilmanshin, R. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 5829.
7. Chan, E. Y. Mutat. Res. 2005, 573, 13.
8. Zwolak, M.; Di Ventra, M. Rev. Modern Phys. 2008, 80, 141.
9. Reisner, W.; Morton, K. J.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Yu, Z. N.; Rosen, M.; Sturm, J. C.; Chou, S. Y.; Frey, E.; Austin, R. H. Phys. Rev. Lett. 2005, 94.
10. Reccius, C. H.; Mannion, J. T.; Cross, J. D.; Craighead, H. G. Phys. Rev. Lett. 2005, 95.
11. Mannion, J. T.; Reccius, C. H.; Cross, J. D.; Craighead, H. G. Biophys. J. 2006, 90, 4538.
12. Cabodi, M.; Turner, S. W. P.; Craighead, H. G. Anal. Chem. 2002, 74, 5169.
13. Turner, S. W. P.; Cabodi, M.; Craighead, H. G. Phys. Rev. Lett. 2002, 88.
14. Petrov, A. S.; Harvey, S. C. Biophys. J. 2008, 95, 497.
15. Jun, S.; Mulder, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12388.
16. Arnold, A.; Jun, S. Phys. Rev. E 2007, 76.
17. Brochard, F.; de Gennes, P. G. J. Chem. Phys. 1977, 67, 52.
18. Daoud, M.; de Gennes, P. G. J. Phys. 1977, 38, 85.
19. Reisner, W.; Beech, J. P.; Larsen, N. B.; Flyvbjerg, H.; Kristensen, A.; Tegenfeldt, J. O. Phys. Rev. Lett. 2007, 99.
20. Hsieh, C. C.; Balducci, A.; Doyle, P. S. Nano Lett. 2008, 8, 1683.
21. Zhang, C.; Zhang, F.; van Kan, J. A.; van der Maarel, J. R. C. J. Chem. Phys. 2008, 128.
22. Turban, L. J. Phys. 1984, 45, 347.
23. Bakajin, O. B.; Duke, T. A. J.; Chou, C. F.; Chan, S. S.; Austin, R. H.; Cox, E. C. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 2737.
24. Perkins, T. T.; Smith, D. E.; Larson, R. G.; Chu, S. Science 1995, 268, 83.
25. Morse, D. C. Macromolecules 1998, 31, 7044.