-
4
-
-
33745203038
-
-
Sauve, A. A.; Wolberger, C.; Schramm, V. L.; Boeke, J. D. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 435-465.
-
(2006)
Annu. Rev. Biochem
, vol.75
, pp. 435-465
-
-
Sauve, A.A.1
Wolberger, C.2
Schramm, V.L.3
Boeke, J.D.4
-
5
-
-
0027192267
-
-
Braunstein, M.; Rose, A. B.; Holmes, S. G.; Allis, C. D.; Broach, J. R. Genes Dev. 1993, 7, 592-604.
-
(1993)
Genes Dev
, vol.7
, pp. 592-604
-
-
Braunstein, M.1
Rose, A.B.2
Holmes, S.G.3
Allis, C.D.4
Broach, J.R.5
-
6
-
-
0028841317
-
-
Brachmann, C. B.; Sherman, J. M.; Devine, S. E.; Cameron, E. E.; Pillus, L.; Boeke, J. D. Genes Dev. 1995, 9, 2888-2902.
-
(1995)
Genes Dev
, vol.9
, pp. 2888-2902
-
-
Brachmann, C.B.1
Sherman, J.M.2
Devine, S.E.3
Cameron, E.E.4
Pillus, L.5
Boeke, J.D.6
-
7
-
-
0034677535
-
-
Imai, S.; Armstrong, C. M.; Kaeberlein, M.; Guarente, L. Nature 2000, 403, 795-800.
-
(2000)
Nature
, vol.403
, pp. 795-800
-
-
Imai, S.1
Armstrong, C.M.2
Kaeberlein, M.3
Guarente, L.4
-
8
-
-
0035913911
-
-
Luo, J. Y.; Nikolaev, A. Y.; Imai, S.; Chen, D. L.; Su, F.; Shiloh, A.; Guarente, L.; Gu, W. Cell 2001, 107, 137-148.
-
(2001)
Cell
, vol.107
, pp. 137-148
-
-
Luo, J.Y.1
Nikolaev, A.Y.2
Imai, S.3
Chen, D.L.4
Su, F.5
Shiloh, A.6
Guarente, L.7
Gu, W.8
-
9
-
-
0035913903
-
-
Vaziri, H.; Dessain, S. K.; Eagon, E. N.; Imai, S. I.; Frye, R. A.; Pandita, T. K.; Guarente, L.; Weinberg, R. A. Cell 2001, 107, 149-159.
-
(2001)
Cell
, vol.107
, pp. 149-159
-
-
Vaziri, H.1
Dessain, S.K.2
Eagon, E.N.3
Imai, S.I.4
Frye, R.A.5
Pandita, T.K.6
Guarente, L.7
Weinberg, R.A.8
-
10
-
-
12144290563
-
-
Brunet, A.; et al. Science 2004, 303, 2011-2015.
-
(2004)
Science
, vol.303
, pp. 2011-2015
-
-
Brunet, A.1
-
13
-
-
0033214237
-
-
Kaeberlein, M.; McVey, M.; Guarente, L. Genes Dev. 1999, 13, 2570-2580.
-
(1999)
Genes Dev
, vol.13
, pp. 2570-2580
-
-
Kaeberlein, M.1
McVey, M.2
Guarente, L.3
-
14
-
-
0034703217
-
-
Lin, S. J.; Defossez, P. A.; Guarente, L. Science 2000, 289, 2126-2128.
-
(2000)
Science
, vol.289
, pp. 2126-2128
-
-
Lin, S.J.1
Defossez, P.A.2
Guarente, L.3
-
16
-
-
3142740860
-
-
Cohen, H. Y.; Miller, C.; Bitterman, K. J.; Wall, N. R.; Hekking, B.; Kessler, B.; Howitz, K. T.; Gorospe, M.; de Cabo, R.; Sinclair, D. A. Science 2004, 305, 390-392.
-
(2004)
Science
, vol.305
, pp. 390-392
-
-
Cohen, H.Y.1
Miller, C.2
Bitterman, K.J.3
Wall, N.R.4
Hekking, B.5
Kessler, B.6
Howitz, K.T.7
Gorospe, M.8
de Cabo, R.9
Sinclair, D.A.10
-
17
-
-
33750869870
-
-
Kaeberlein, M.; Kirkland, K. T.; Fields, S.; Kennedy, B. K. PLoS. Biol. 2004, 2, 1381-1387.
-
(2004)
PLoS. Biol
, vol.2
, pp. 1381-1387
-
-
Kaeberlein, M.1
Kirkland, K.T.2
Fields, S.3
Kennedy, B.K.4
-
18
-
-
27744554550
-
-
Kennedy, B. K.; Smith, E. D.; Kaeberlein, M. Cell 2005, 123, 548-550.
-
(2005)
Cell
, vol.123
, pp. 548-550
-
-
Kennedy, B.K.1
Smith, E.D.2
Kaeberlein, M.3
-
20
-
-
31044445366
-
-
Mostoslavsky, R.; et al. Cell 2006, 124, 315-329.
-
(2006)
Cell
, vol.124
, pp. 315-329
-
-
Mostoslavsky, R.1
-
21
-
-
20344392202
-
-
Biel, M.; Wascholowski, V.; Giannis, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 3186-3216.
-
(2005)
Angew. Chem., Int. Ed
, vol.44
, pp. 3186-3216
-
-
Biel, M.1
Wascholowski, V.2
Giannis, A.3
-
23
-
-
33646021957
-
-
Corminboeuf, C.; Hu, P.; Tuckerman, M. E.; Zhang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4530-4531.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc
, vol.128
, pp. 4530-4531
-
-
Corminboeuf, C.1
Hu, P.2
Tuckerman, M.E.3
Zhang, Y.4
-
24
-
-
0035951072
-
-
Sauve, A. A.; Celic, I.; Avalos, J.; Deng, H. T.; Boeke, J. D.; Schramm, V. L. Biochemistry 2001, 40, 15456-15463.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 15456-15463
-
-
Sauve, A.A.1
Celic, I.2
Avalos, J.3
Deng, H.T.4
Boeke, J.D.5
Schramm, V.L.6
-
26
-
-
0346435109
-
-
Jackson, M. D.; Schmidt, M. T.; Oppenheimer, N. J.; Denu, J. M. J. Biol. Chem. 2003, 278, 50985-50998.
-
(2003)
J. Biol. Chem
, vol.278
, pp. 50985-50998
-
-
Jackson, M.D.1
Schmidt, M.T.2
Oppenheimer, N.J.3
Denu, J.M.4
-
27
-
-
3343024449
-
-
Borra, M. T.; Langer, M. R.; Slama, J. T.; Denu, J. M. Biochemistry 2004, 43, 9877-9887.
-
(2004)
Biochemistry
, vol.43
, pp. 9877-9887
-
-
Borra, M.T.1
Langer, M.R.2
Slama, J.T.3
Denu, J.M.4
-
33
-
-
0035917536
-
-
Min, J.; Landry, J.; Sternglanz, R.; Xu, R. M. Cell 2001, 105, 269-279.
-
(2001)
Cell
, vol.105
, pp. 269-279
-
-
Min, J.1
Landry, J.2
Sternglanz, R.3
Xu, R.M.4
-
34
-
-
0034956304
-
-
Finnin, M. S.; Donigian, J. R.; Pavletich, N. P. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 621-625.
-
(2001)
Nat. Struct. Biol
, vol.8
, pp. 621-625
-
-
Finnin, M.S.1
Donigian, J.R.2
Pavletich, N.P.3
-
35
-
-
0036753953
-
-
Avalos, J. L.; Celic, I.; Muhammad, S.; Cosgrove, M. S.; Boeke, J. D.; Wolberger, C. Mol. Cell 2002, 10, 523-535.
-
(2002)
Mol. Cell
, vol.10
, pp. 523-535
-
-
Avalos, J.L.1
Celic, I.2
Muhammad, S.3
Cosgrove, M.S.4
Boeke, J.D.5
Wolberger, C.6
-
36
-
-
0242626891
-
-
Zhao, K.; Chai, X.; Marmorstein, R. Structure 2003, 11, 1403-1411.
-
(2003)
Structure
, vol.11
, pp. 1403-1411
-
-
Zhao, K.1
Chai, X.2
Marmorstein, R.3
-
37
-
-
2942534101
-
-
Zhao, K.; Harshaw, R.; Chai, X.; Marmorstein, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8563-8568.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.101
, pp. 8563-8568
-
-
Zhao, K.1
Harshaw, R.2
Chai, X.3
Marmorstein, R.4
-
38
-
-
1642297558
-
-
Avalos, J. L.; Boeke, J. D.; Wolberger, C. Mol. Cell 2004, 13, 639-648.
-
(2004)
Mol. Cell
, vol.13
, pp. 639-648
-
-
Avalos, J.L.1
Boeke, J.D.2
Wolberger, C.3
-
39
-
-
15244355745
-
-
Avalos, J. L.; Bever, K. M.; Wolberger, C. Mol. Cell 2005, 17, 855-868.
-
(2005)
Mol. Cell
, vol.17
, pp. 855-868
-
-
Avalos, J.L.1
Bever, K.M.2
Wolberger, C.3
-
40
-
-
33745534953
-
-
Hoff, K. G.; Avalos, J. L.; Sens, K.; Wolberger, C. Structure 2006, 14, 1231-1240.
-
(2006)
Structure
, vol.14
, pp. 1231-1240
-
-
Hoff, K.G.1
Avalos, J.L.2
Sens, K.3
Wolberger, C.4
-
41
-
-
33846709501
-
-
Sanders, B. D.; Zhao, K.; Slama, J. T.; Marmorstein, R. Mol. Cell 2007, 25, 463-472.
-
(2007)
Mol. Cell
, vol.25
, pp. 463-472
-
-
Sanders, B.D.1
Zhao, K.2
Slama, J.T.3
Marmorstein, R.4
-
44
-
-
0034735990
-
-
Landry, J.; Slama, J. T.; Sternglanz, R. Biochem. BioPhys. Res. Commun. 2000, 278, 685-690.
-
(2000)
Biochem. BioPhys. Res. Commun
, vol.278
, pp. 685-690
-
-
Landry, J.1
Slama, J.T.2
Sternglanz, R.3
-
45
-
-
0034687694
-
-
Tanner, K. G.; Landry, J.; Sternglanz, R.; Denu, J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000, 97, 14178-14182.
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci
, vol.97
, pp. 14178-14182
-
-
Tanner, K.G.1
Landry, J.2
Sternglanz, R.3
Denu, J.M.4
-
48
-
-
84986513644
-
-
Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem
, vol.11
, pp. 700-733
-
-
Field, M.J.1
Bash, P.A.2
Karplus, M.3
-
60
-
-
0001582558
-
-
Zhang, Y.; Lee, T.; Yang, W. J. Chem. Phys. 1999, 110, 46-54.
-
(1999)
J. Chem. Phys
, vol.110
, pp. 46-54
-
-
Zhang, Y.1
Lee, T.2
Yang, W.3
-
61
-
-
0000145441
-
-
Zhang, Y.; Liu, H.; Yang, W. J. Chem. Phys. 2000, 112, 3483-3492.
-
(2000)
J. Chem. Phys
, vol.112
, pp. 3483-3492
-
-
Zhang, Y.1
Liu, H.2
Yang, W.3
-
64
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
66
-
-
57549117675
-
-
Shao, Y. et al. Q-Chem, Version 3.0; Q-Chem, Inc, Pittsburgh, PA, 2006
-
Shao, Y. et al. Q-Chem, Version 3.0; Q-Chem, Inc.: Pittsburgh, PA, 2006.
-
-
-
-
67
-
-
57549111521
-
-
Ponder, J. W. TINKER, Software Tools for Molecular Design, Version 4.2, June, 2004
-
Ponder, J. W. TINKER, Software Tools for Molecular Design, Version 4.2, June, 2004.
-
-
-
-
68
-
-
34248219463
-
-
Wang, S.; Hu, P.; Zhang, Y. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3758-3764.
-
(2007)
J. Phys. Chem. B
, vol.111
, pp. 3758-3764
-
-
Wang, S.1
Hu, P.2
Zhang, Y.3
-
69
-
-
41149125431
-
-
Hu, P.; Wang, S.; Zhang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 3806-3813.
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc
, vol.130
, pp. 3806-3813
-
-
Hu, P.1
Wang, S.2
Zhang, Y.3
-
70
-
-
3242886771
-
-
Dolinsky, T. J.; Nielsen, J. E.; McCammon, J. A.; Baker, N. A. Nucleic Acids Res. 2004, 32, W665-W667.
-
(2004)
Nucleic Acids Res
, vol.32
-
-
Dolinsky, T.J.1
Nielsen, J.E.2
McCammon, J.A.3
Baker, N.A.4
-
71
-
-
57549118584
-
-
Mount Sinai School of Medicine, New York
-
Mezei, M. Simulaid: Simulation Setup Utilites, 2008. Mount Sinai School of Medicine, New York. http://atlas.physbio.mssm.edu/mezei/simulaid.
-
(2008)
Simulation Setup Utilites
-
-
Mezei, M.S.1
-
72
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
73
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
-
(1995)
J. Chem. Phys
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, L.2
Berkowitz, M.L.3
Darden, T.4
Lee, H.5
Pedersen, L.G.6
-
74
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
75
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; Vangunsteren, W. F.; Dinola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
-
(1984)
J. Chem. Phys
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.P.M.2
Vangunsteren, W.F.3
Dinola, A.4
Haak, J.R.5
-
76
-
-
57549085234
-
-
Case, D. A.; Darden, T. A.; T. E. Cheatham, I.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Wu, X.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Mathews, D. H.; Schafmeister, C.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 9; University of California: San Francisco, 2006.
-
Case, D. A.; Darden, T. A.; T. E. Cheatham, I.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Wu, X.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Mathews, D. H.; Schafmeister, C.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 9; University of California: San Francisco, 2006.
-
-
-
-
77
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
-
(1995)
J. Am. Chem. Soc
, vol.117
, pp. 5179-5197
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould, I.R.4
Merz, K.M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Caldwell, J.W.9
Kollman, P.A.10
-
78
-
-
0001398008
-
-
Wang, J. M.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1049-1074.
-
(2000)
J. Comput. Chem
, vol.21
, pp. 1049-1074
-
-
Wang, J.M.1
Cieplak, P.2
Kollman, P.A.3
-
79
-
-
33748518255
-
-
Hornak, V.; Abel, R.; Okur, A.; Strockbine, B.; Roitberg, A.; Simmerling, C. Proteins 2006, 65, 712-725.
-
(2006)
Proteins
, vol.65
, pp. 712-725
-
-
Hornak, V.1
Abel, R.2
Okur, A.3
Strockbine, B.4
Roitberg, A.5
Simmerling, C.6
-
80
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
81
-
-
0029033663
-
-
Ryde, U. Protein Sci. 1995, 4, 1124-1132.
-
(1995)
Protein Sci
, vol.4
, pp. 1124-1132
-
-
Ryde, U.1
-
86
-
-
0034686678
-
-
Liu, H.; Zhang, Y.; Yang, W. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6560-6570.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc
, vol.122
, pp. 6560-6570
-
-
Liu, H.1
Zhang, Y.2
Yang, W.3
-
87
-
-
0038016725
-
-
Zhang, Y.; Kua, J.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 4459-4463.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 4459-4463
-
-
Zhang, Y.1
Kua, J.2
McCammon, J.A.3
-
88
-
-
0042431983
-
-
Cisneros, G. A.; Liu, H.; Zhang, Y.; Yang, W. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10384-10393.
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc
, vol.125
, pp. 10384-10393
-
-
Cisneros, G.A.1
Liu, H.2
Zhang, Y.3
Yang, W.4
-
89
-
-
33645523760
-
-
Cheng, Y.; Zhang, Y.; McCammon, J. A. Protein Sci. 2006, 15, 672-683.
-
(2006)
Protein Sci
, vol.15
, pp. 672-683
-
-
Cheng, Y.1
Zhang, Y.2
McCammon, J.A.3
-
91
-
-
34247549227
-
-
Wang, L.; Yu, X.; Hu, P.; Broyde, S.; Zhang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4731-4737.
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc
, vol.129
, pp. 4731-4737
-
-
Wang, L.1
Yu, X.2
Hu, P.3
Broyde, S.4
Zhang, Y.5
-
93
-
-
0037095621
-
-
Poyner, R. R.; Larsen, T. M.; Wong, S. W.; Reed, G. H. Arch. Biochem. Biophys. 2002, 401, 155-163.
-
(2002)
Arch. Biochem. Biophys
, vol.401
, pp. 155-163
-
-
Poyner, R.R.1
Larsen, T.M.2
Wong, S.W.3
Reed, G.H.4
-
94
-
-
5644246078
-
-
Metanis, N.; Brik, A.; Dawson, P. E.; Keinan, E. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 12726-12727.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 12726-12727
-
-
Metanis, N.1
Brik, A.2
Dawson, P.E.3
Keinan, E.4
-
95
-
-
0037291214
-
-
North, B. J.; Marshall, B. L.; Borra, M. T.; Denu, J. M.; Verdin, E. Mol. Cell 2003, 11, 437-444.
-
(2003)
Mol. Cell
, vol.11
, pp. 437-444
-
-
North, B.J.1
Marshall, B.L.2
Borra, M.T.3
Denu, J.M.4
Verdin, E.5
|