Targeting DNA with "light-up" pyrimidine triple-helical forming oligonucleotides conjugated to stabilizing fluorophores (LU-TFOs)

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 6, Issue 23, 2008, Pages 4413-4425

  Renard, Brice Loïc ^a   Lartia, Rémy ^a,b   Asseline, Ulysse ^a  

^a UNIVERSITÉ D'ORLÉANS   (France)

^b UNIVERSITÉ JOSEPH FOURIER   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AROMATIC COMPOUNDS; BINDING ENERGY; CITRUS FRUITS; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; OLIGONUCLEOTIDES;

BALANCED PROPERTY; BINDING PROPERTIES; DOUBLE STRANDED DNA; FLUORESCENCE ENHANCEMENT; FLUORESCENCE INTENSITIES; FLUORESCENCE STUDIES; FLUORESCENT SIGNALS; STEADY STATE FLUORESCENCES;

FLUORESCENCE;

EID: 56349092915     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b813289e     Document Type: Article

References (43)

1. A. Okamoto Y. Saito I. Saito Photochem. Photobiol., C 2005 6 108
2. R. Ranasinghe T. Brown Chem. Commun. 2005 5487
3. U. Asseline Curr. Org. Chem. 2006 10 491
4. J. N. Wilson E. T. Kool Org. Biomol. Chem. 2006 4 4265
5. K. E. Sapsford L. Berti I. L. Medintz Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 4562
6. A. A. Marti S. Jockusch N. Stevens J. Ju N. J. Turro Acc. Chem. Res. 2007 40 402
7. J. L. Mergny T. Garestier M. Rougée A. V. Lebedev M. Chassignol N. T. Thuong C. Hélène Biochemistry 1994 33 15321
8. T. Inoue Y. Sugiura J. Saitoh T. Ishiguro M. Otsuka Bioorg. Med. Chem. 1999 7 1207
9. G. N. Grimm A. S. Boutorine P. Lincoln B. Norden C. Hélène ChemBioChem 2002 3 324
10. Y. Aubert U. Asseline Org. Biomol. Chem. 2004 2 3496
11. H. Kuhn Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 2001 11 265
12. J. S. Sun C. Hélène Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2003 22 489
13. E. Brunet M. Corgnali L. Perrouault V. Roig U. Asseline M. D. Sorensen B. R. Babu J. Wengel C. Giovannangeli Nucleic Acids Res. 2005 33 4223
14. R. Lartia U. Asseline Chem.-Eur. J. 2006 12 2270
15. L. G. Lee C.-H. Chen L. A. Liu Cytometry 1986 7 508
16. J. Nygren N. Svanvik M. Kubista Biopolymers 1998 46 39
17. S. Prodhomme J.-P. Demaret S. Vinogradov U. Asseline L. Morin-Allory P. Vigny J. Photochem. Photobiol., B 1999 53 60
18. A. Larsson C. Carlsson M. Jonsson B. Albinsson J. Am. Chem. Soc. 1994 117 8459
19. U. Asseline E. Cheng Tetrahedron Lett. 2001 42 9005
20. S. Vinogradov V. Roig Z. Sergueeva C.-H. Nguyen P. Arimondo J.-S. Sun N. T. Thuong E. Bisagni C. Hélène U. Asseline Bioconjugate Chem. 2003 76 14 120
21. D. A. Collier J.-L. Mergny N. T. Thuong C. Hélène Nucleic Acids Res. 1991 19 4219
22. U. Asseline N. T. Thuong C. Helene New J. Chem. 1997 21 5
23. J. S. Sun C. Giovannangeli J. C. Franois R. Kurfürst T. Montenay-Garestier U. Asseline N. T. Thuong C. Hélène Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 6023
24. U. Asseline E. Bonfils D. Dupret N. T. Thuong Bioconjugate Chem. 1996 7 369
25. U. Asseline M. Delarue G. Lancelot F. Toulme N. T. Thuong T. Montenay-Garestier C. Helene Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1984 81 3297
26. U. Asseline M. Chassignol Y. Aubert V. Roig Org. Biomol. Chem. 2006 4 1949
27. T. Montenay-Garestier, J. S. Sun, J. Chomilier, J. L. Mergny, M. Takasugi, U. Asseline, N. T. Thuong, M. Rougee and C. Helene, in " Molecular basis of specificity in nucleic acid-drug interactions " ed., B. Pullman, and, J. Jortner Kluwer Academic Publishers, The Netherlands, 1990, p. 275
28. N. T. Thuong and U. Asseline, in Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry. ed., S. Beaucage, D. E. Bergstrom, G. D. Glick, and, R. A. Jones,. John Wiley & Sons, New York, 2000, pp. 4.2.1-4.2.34
29. S. L. Beaucage M. H. Caruthers Tetrahedron Lett. 1981 22 1859
30. R. Lartia U. Asseline Tetrahedron Lett. 2004 45 949
31. U. Asseline E. Bonfils R. Kurfürst M. Chassignol V. Roig N. T. Thuong Tetrahedron 1992 48 1233
32. J. A. Burns J. C. Butler J. Moran G. M. Whitesides J. Org. Chem. 1991 56 2648
33. D. A. Gianolio J. M. Segismundo L. McLaughlin Nucleic Acids Res. 2000 28 2128
34. V. Metelev R. Weissleder A. Bogdanov Jr Bioconjugate Chem. 2004 15 1481
35. Q. Li G. Luan Q. Guo J. Liang Nucleic Acids Res. 2002 30 e5
36. J.-S. Sun J.-L. Mergny R. Lavery T. Montenay-Garestier C. Hélène J. Biomol. Struct. Dyn. 1991 9 411
37. J.-L. Mergny J.-S. Sun M. Rougée T. Montenay-Garestier F. Barcelo J. Chomilier C. Hélène Biochemistry 1991 30 9791
38. D. A. Rusling T. Brown K. R. Fox Biophys. J. 2006 123 134
39. N. Svanvik J. Nygren G. Westman M. Kubista J. Am. Chem. Soc. 2001 123 803
40. E. Privat T. Melvin U. Asseline P. Vigny Photochem. Photobiol. 2001 74 532
41. E. Privat T. Melvin F. Merola G. Schweizer S. Prodhomme U. Asseline P. Vigny Photochem. Photobiol. 2002 75 201
42. C. R. Cantor M. M. Warshaw H. Shapiro Biopolymers 1970 9 1059
43. Y. Aubert S. Bourgerie L. Meunier R. Mayer A.-C. Roche M. Monsigny N. T. Thuong U. Asseline Nucleic Acids Res. 2000 28 818