An interface between the universal force field and the effective fragment potential method

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 40, 2008, Pages 12753-12760

  Zorn, Deborah ^a   Lin, Victor S Y ^a   Pruski, Marek ^a   Gordon, Mark S ^a  

^a IOWA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MECHANICS; METHOD OF MOMENTS; MOLECULAR MECHANICS; QUANTUM THEORY; SILICA; SOLVENTS; SURFACE REACTIONS; SURFACE TREATMENT;

BULK EFFECTS; EFFECTIVE FRAGMENT POTENTIAL METHODS; GAS-LIQUID; HETEROGENEOUS CATALYSTS; HETEROGENEOUS CATALYTIC SYSTEMS; HYBRID METHODS; INTERACTION POTENTIALS; QUANTUM MECHANICS; SMALL CLUSTERS; SOLVENT EFFECTS; SURFACE INTERFACES; UNIVERSAL FORCE FIELDS;

PHASE INTERFACES;

EID: 54549117947     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8049729     Document Type: Article

References (65)

1. Huh, S.; Chen, H.-T.; Wiench, J. W.; Pruski, M.; Lin, V.S.-Y. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1010.
2. Mbaraka, I. K.; Radu, D. R.; Lin, V.S.-Y.; Shanks, B. H. J. Catal. 2003, 219, 329.
3. Lin, V.S.-Y.; Radu, D. R.; Han, Mi.-K.; Deng, W.; Kuroki, S.; Shanks, B. H.; Pruski, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9040.
4. Chen, H.-T.; Huh, S.; Wiench, J. W.; Pruski, M.; Lin, VS.-Y. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13305.
5. Lin, VS.-Y.; Nieweg, J. A.; Kern, C.; Trewyn, B. G.; Wiench, J. W.; Pruski, M. Prepr. Symp. Am. Chem. Soc., Div. Fuel Chem. 2006, 51, 426.
6. Cai, Y.; Kumar, R.; Huang, W.; Trewyn, B. G.; Wiench, J. W.; Pruski, M.; Lin, V. S.-Y. J. Phys. Chem. C 2007, 111, 1480.
7. Zorn, D.; Lin, V. S.-Y.; Pruski, M.; Gordon, M. in preparation.
8. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347.
9. Schmidt, M. W.; Gordon, M. S. In Theory and Applications of Computational Chemistry: The First Forty Years; Dykstra, C. E.; Frenking, G.; Kirn, K. S.; Scuseria, G. E., Eds.; Elsevier: London, 2005.
10. Shoemaker, J. R.; Burggraf, L. W.; Gordon, M. S. J. Phys. Chem. A 1999, 105, 3245.
11. Gordon, M. S.; Freitag, M.; Bandyopadhyay, P.; Jensen, J. H.; Kairys, V.; Stevens, W. J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 293.
12. Day, P. N.; Jensen, J. H.; Gordon, M. S.; Webb, S. P.; Stevens, W. J.; Kraus, M.; Garmer, D.; Basch, H.; Cohen, D. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1968.
13. Freitag, M. A.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Stevens, W. A. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7300.
14. Slipchenko, L. V.; Gordon, M. S. J. Comput. Chem. 2007, 28, 276.
15. Adamovic, I; Freitag, M. A.; Gordon, M. S. J. Chem. Phys. 2003, 118, 6725.
16. Netzloff, H. M.; Gordon, M. S. J. Chem. Phys. 2004, 121, 2711. (Please note that the MP2 based EFP1 method for calculations with EFPs only is available in GAMESS, although it is not shown in the current GAMESS documentation).
17. Nemukhin, A. V.; Grigorenko, B. L.; Bochenkova, A. V.; Topol, I. A.; Burt, S. K. THEOCHEM 2002, 581, 167.
18. Kundrot, C. E.; Ponder, J. W.; Richards, F. M. J. Comput. Chem. 1991, 12, 402.
19. Ponder, J. W.; Richards, F. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 1016.
20. Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6474.
21. Aikens, C. M.; Gordon, M. S. J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 12835.
22. Mullin, J. M.; Gordon, M. G. In preparation.
23. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.
24. Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Rappe, A. K. J. Am. Chem. Soc 1992, 114, 10035.
25. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.
26. Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Rappe, A. K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10046.
27. (a) Badger, R. M. J. Chem. Phys. 1934, 2, 2128.
28. (b) Badger, R. M. J. Chem. Phys. 1935, 3, 710.
29. (c) Pearson, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 4869.
30. (d) Ohwada, K. J. Chem. Phys. 1980, 72, 1.
31. (e) Ohwada, K. J. Chem. Phys. 1980, 72, 3663.
32. (f) Ohwada, K. J. Chem. Phys. 1980, 72, 3663.
33. (g) Ohwada, K. J. Chem. Phys. 1981, 75, 1309.
34. (h) Chang, C.-A. J. Phys. Chem. 1983, 87, 1694.
35. (i) Barbiric, D. A.; Castro, E. A.; Fernandez, F. M. J. Chem. Phys. 1984, 80, 289.
36. (j) Ohwada, K. J. Chem. Phys. 1984, 50, 1556.
37. (k) Halgren, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4710.
38. Stone, A. J. The Theory of Intermolecular Forces; Oxford University Press: Oxford, 1996.
39. Stone, A. J. Chem. Phys. Lett. 1981, 83, 233.
40. Rappé, A. K.; Goddard, W. A., III. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3358.
41. Gundertofte, K.; Liljefors, T.; Norrby, P.-O.; Pettersson, I. J. Comput. Chem. 1996, 17, 4-429.
42. Spackman, M. A. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1.
43. luchi, S.; Izvekov, S.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2007, 126, 124505.
44. Rick, S. W.; Stuart, S. J.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6141.
45. Rasmussen, T. D.; Ren, P.; Ponder, J. W.; Jensen, F. Int. J. Quantum Chem. 2007, 107, 1390.
46. Culot, P.; Dive, G.; Nguyen, V. H.; Ghuysen, J. M. Theor.Chim. Acta 1992, 82, 189.
47. Møller, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 618.
48. Dunning, T. H., Jr.; Hay, P. J. In Methods of Electronic Structure Theory, Shaefer, H. F., III., Ed.; Plenum: New York, 1977; pp 1-27.
49. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A., III. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8897.
50. Gasteiger, J.; Marsili, M. Tetrahedron 1980, 36, 3219.
51. Trebosc, J.; Wiench, J. W.; Huh, S.; Lin, V. S.- Y.; Pruski, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3057.
52. Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.
53. Francl, M. M.; Pietro, W. J.; Hehre, W. J.; Binkley, J. S.; Gordon, M. S.; Defrees, D. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1982, 77, 3654.
54. Hariharan, P. C.; Pople, J. A. Theor. Chim. Acta 1973, 28, 213.
55. Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; Schleyer, P. v. R. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294.
56. Frisch, M. J.; Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.
57. Thompson, K. C.; Margey, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 2970.
58. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
59. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1998, 37. 785.
60. Vosko, S. H.; Wilk, L.; Nusair, M. Can. J. Phys. 1980, 58, 1200.
61. Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650.
62. McLean, A. D.; Chandler, G. S. J. Chem. Phys. 1980, 72, 5639.
63. Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Schleyer, P. v. R. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294.
64. Davidson, E. R.; Feller, D. Chem. Rev. 1986, 86, 661.
65. Liu, B.; McLean, A. D. J. Chem. Phys. 1973, 59, 4557.