Analysis of systemic sulfur metabolism in plants using integrated '-omics' strategies

Molecular BioSystems

Volumn 4, Issue 10, 2008, Pages 967-973

  Hirai, Masami Yokota ^a,b   Saito, Kazuki ^a,c  

^a RIKEN   (Japan)

^b JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

^c CHIBA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SULFUR;

ANIMAL; GENE EXPRESSION PROFILING; HUMAN; METABOLISM; METABOLOME; PLANT; PLANT SEED; REVIEW;

ANIMALS; GENE EXPRESSION PROFILING; HUMANS; METABOLOME; PLANTS; SEEDS; SULFUR;

ANIMALIA;

EID: 52749083003     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b802911n     Document Type: Review

References (34)

1. K. Saito Plant Physiol. 2004 136 2443 2450
2. V. Nikiforova B. Gakière S. Kempa M. Adamik L. Willmitzer H. Hesse R. Hoefgen J. Exp. Bot. 2004 55 1861 1870
3. L. M. Hicks R. E. Cahoon E. R. Bonner R. S. Rivard J. Sheffield J. M. Jez Plant Cell 2007 19 2653 2661
4. T. Rausch R. Gromes V. Liedschulte I. Müller J. Bogs V. Galovic A. Wachter Plant Biol. (Stuttgart, Ger.) 2007 9 565 572
5. H. Onouchi Y. Nagami Y. Haraguchi M. Nakamoto Y. Nishimura R. Sakurai N. Nagao D. Kawasaki Y. Kadokura S. Naito Genes Dev. 2005 19 1799 1810
6. The Arabidopsis Initiative Nature 2000 408 796 815
7. Q. Feng Y. Zhang P. Hao S. Wang G. Fu Y. Huang Y. Li J. Zhu Y. Liu X. Hu P. Jia Y. Zhang Q. Zhao K. Ying S. Yu Y. Tang Q. Weng L. Zhang Y. Lu J. Mu Y. Lu L. S. Zhang Z. Yu D. Fan X. Liu T. Lu C. Li Y. Wu T. Sun H. Lei T. Li H. Hu J. Guan M. Wu R. Zhang B. Zhou Z. Chen L. Chen Z. Jin R. Wang H. Yin Z. Cai S. Ren G. Lv W. Gu G. Zhu Y. Tu J. Jia Y. Zhang J. Chen H. Kang X. Chen C. Shao Y. Sun Q. Hu X. Zhang W. Zhang L. Wang C. Ding H. Sheng J. Gu S. Chen L. Ni F. Zhu W. Chen L. Lan Y. Lai Z. Cheng M. Gu J. Jiang J. Li G. Hong Y. Xue B. Han Nature 2002 420 316 320
8. T. Sasaki T. Matsumoto K. Yamamoto K. Sakata T. Baba Y. Katayose J. Wu Y. Niimura Z. Cheng Y. Nagamura B. A. Antonio H. Kanamori S. Hosokawa M. Masukawa K. Arikawa Y. Chiden M. Hayashi M. Okamoto T. Ando H. Aoki K. Arita M. Hamada C. Harada S. Hijishita M. Honda Y. Ichikawa A. Idonuma M. Iijima M. Ikeda M. Ikeno S. Ito T. Ito Y. Ito Y. Ito A. Iwabuchi K. Kamiya W. Karasawa S. Katagiri A. Kikuta N. Kobayashi I. Kono K. Machita T. Maehara H. Mizuno T. Mizubayashi Y. Mukai H. Nagasaki M. Nakashima Y. Nakama Y. Nakamichi M. Nakamura N. Namiki M. Negishi I. Ohta N. Ono S. Saji K. Sakai M. Shibata T. Shimokawa A. Shomura J. Song Y. Takazaki K. Terasawa K. Tsuji K. Waki H. Yamagata H. Yamane S. Yoshiki R. Yoshihara K. Yukawa H. Zhong H. Iwama T. Endo H. Ito J. H. Hahn H.-I. Kim M.-Y. Eun M. Yano J. Jiang T. Gojobori Nature 2002 420 312 316
9. S. A. Goff D. Ricke T.-H. Lan G. Presting R. Wang M. Dunn J. Glazebrook A. Sessions P. Oeller H. Varma D. Hadley D. Hutchison C. Martin F. Katagiri B. M. Lange T. Moughamer Y. Xia P. Budworth J. Zhong T. Miguel U. Paszkowski S. Zhang M. Colbert W.-l. Sun L. Chen B. Cooper S. Park T. C. Wood L. Mao P. Quail R. Wing R. Dean Y. Yu A. Zharkikh R. Shen S. Sahasrabudhe A. Thomas R. Cannings A. Gutin D. Pruss J. Reid S. Tavtigian J. Mitchell G. Eldredge T. Scholl R. M. Miller S. Bhatnagar N. Adey T. Rubano N. Tusneem R. Robinson J. Feldhaus T. Macalma A. Oliphant S. Briggs Science 2002 296 92 100
10. J. Yu S. Hu J. Wang G. K.-S. Wong S. Li B. Liu Y. Deng L. Dai Y. Zhou X. Zhang M. Cao J. Liu J. Sun J. Tang Y. Chen X. Huang W. Lin C. Ye W. Tong L. Cong J. Geng Y. Han L. Li W. Li G. Hu X. Huang W. Li J. Li Z. Liu L. Li J. Liu Q. Qi J. Liu L. Li T. Li X. Wang H. Lu T. Wu M. Zhu P. Ni H. Han W. Dong X. Ren X. Feng P. Cui X. Li H. Wang X. Xu W. Zhai Z. Xu J. Zhang S. He J. Zhang J. Xu K. Zhang X. Zheng J. Dong W. Zeng L. Tao J. Ye J. Tan X. Ren X. Chen J. He D. Liu W. Tian C. Tian H. Xia Q. Bao G. Li H. Gao T. Cao J. Wang W. Zhao P. Li W. Chen X. Wang Y. Zhang J. Hu J. Wang S. Liu J. Yang G. Zhang Y. Xiong Z. Li L. Mao C. Zhou Z. Zhu R. Chen B. Hao W. Zheng S. Chen W. Guo G. Li S. Liu M. Tao J. Wang L. Zhu L. Yuan H. Yang Science 2002 296 79 92
11. M. Y. Hirai T. Fujiwara M. Awazuhara T. Kimura M. Noji K. Saito Plant J. 2003 33 651 663
12. M. Y. Hirai M. Yano D. B. Goodenowe S. Kanaya T. Kimura M. Awazuhara M. Arita T. Fujiwara K. Saito Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 10205 10210
13. A. Maruyama-Nakashita E. Inoue A. Watanabe-Takahashi T. Yamaya H. Takahashi Plant Physiol. 2003 132 597 605
14. V. Nikiforova J. Freitag S. Kempa M. Adamik H. Hesse R. Hoefgen Plant J. 2003 33 633 650
15. M. Y. Hirai K. Saito J. Exp. Bot. 2004 55 1871 1879
16. Y. Sasaki-Sekimoto N. Taki T. Obayashi M. Aono F. Matsumoto N. Sakurai H. Suzuki M. Y. Hirai M. Noji K. Saito T. Masuda K. Takamiya D. Shibata H. Ohta Plant J. 2005 44 653 668
17. R. J. Bino R. D. Hall O. Fiehn J. Kopka K. Saito J. Draper B. J. Nikolau P. Mendes U. Roessner-Tunali M. H. Beale R. N. Trethewey B. M. Lange E. S. Wurtele L. W. Sumner Trends Plant Sci. 2004 9 418 425
18. K. M. Oksman-Caldentey K. Saito Curr. Opin. Biotechnol. 2005 16 174 179
19. K. Saito M. Y. Hirai K. Yonekura-Sakakibara Trends Plant Sci. 2008 13 36 43
20. V. J. Nikiforova J. Kopka V. Tolstikov O. Fiehn L. Hopkins M. J. Hawkesford H. Hesse R. Hoefgen Plant Physiol. 2005 138 304 318
21. M. Y. Hirai M. Klein Y. Fujikawa M. Yano D. B. Goodenowe Y. Yamazaki S. Kanaya Y. Nakamura M. Kitayama H. Suzuki N. Sakurai D. Shibata J. Tokuhisa M. Reichelt J. Gershenzon J. Papenbrock K. Saito J. Biol. Chem. 2005 280 25590 25595
22. V. J. Nikiforova C. O. Daub H. Hesse L. Willmitzer R. Hoefgen J. Exp. Bot. 2005 56 1887 1896
23. R. Morioka S. Kanaya M. Y. Hirai M. Yano N. Ogasawara K. Saito BMC Bioinf. 2007 8 343
24. T. Abe S. Kanaya M. Kinouchi Y. Ichiba T. Kozuki T. Ikemura Genome Res. 2003 13 693 702
25. S. Kanaya M. Kinouchi T. Abe Y. Kudo Y. Yamada T. Nishi H. Mori T. Ikemura Gene 2001 276 89 99
26. J. Szymanski M. Bielecka F. Carrari A. R. Fernie R. Hoefgen V. J. Nikiforova Phytochemistry 2007 68 2163 2175
27. M. Y. Hirai K. Sugiyama Y. Sawada T. Tohge T. Obayashi A. Suzuki R. Araki N. Sakurai H. Suzuki K. Aoki H. Goda O. I. Nishizawa D. Shibata K. Saito Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 6478 6483
28. T. Gigolashvili M. Engqvist R. Yatusevich C. Muller U. I. Flugge New Phytol. 2007 177 627 642
29. I. E. Sonderby B. G. Hansen N. Bjarnholt C. Ticconi B. A. Halkier D. J. Kliebenstein PLoS One 2007 2 e1322
30. Y. Higashi M. Y. Hirai T. Fujiwara S. Naito M. Noji K. Saito Plant J. 2006 48 557 571
31. L. M. Tabe M. Droux Plant Physiol. 2002 128 1137 1148
32. N. D. Hagan N. Upadhyaya L. M. Tabe T. J. V. Higgins Plant J. 2003 34 1 11
33. P. Chiaiese N. Ohkama-Ohtsu L. Molvig R. Godfree H. Dove C. Hocart T. Fujiwara T. J. V. Higgins L. M. Tabe J. Exp. Bot. 2004 55 1889 1901
34. N. Islam N. M. Upadhyaya P. M. Campbell R. Akhurst N. Hagan T. J. V. Higgins Phytochemistry 2005 66 2534 2539