Distinguishing chromophore structures of photocycle intermediates of the photoreceptor PYP by transient fluorescence and energy transfer

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 30, 2008, Pages 9118-9125

  Hoersch, Daniel ^a   Otto, Harald ^a   Cusanovich, Michael A ^b   Heyn, Maarten P ^a  

^a FREIE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

^b UNIVERSITY OF ARIZONA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; ENERGY STORAGE; ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE; LIGHT EMISSION; LUMINESCENCE;

FLUORESCENCE DECAYS; FLUORESCENCE LIFE-TIME; PHOTOACTIVE YELLOW PROTEIN; PHOTOCYCLE; PHOTOCYCLE KINETICS; STRUCTURE AND ORIENTATION; TRANSITION-DIPOLE MOMENTS;

CHROMOPHORES;

EID: 49349114904     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp801174z     Document Type: Article

References (37)

1. Cusanovich, M. A.; Meyer, T. E. Biochemistry 2003, 42, 4759.
2. Groot, M. L.; van Wilderen, L. J. G. W.; Larsen, D. S.; van der Horst, M. A.; van Stokkum, I. H. M.; Heilingwerf, K. J.; van Grondelle, R. Biochemistry 2003, 42, 10054.
3. Heyne, K.; Mohammed, O. F.; Usman, A.; Dreyer, J.; Nibbering, E. T. J.; Cusanovich, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 18100.
4. Xie, A.; Hoff, W. D.; Kroon, A. R.; Hellingwerf, K. J. Biochemistry 1996, 35, 14671.
5. Otto, H.; Hoersch, D.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biochemistry 2005, 44, 16804.
6. Borucki, B.; Joshi, C. P.; Otto, H.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biophys. J. 2006, 91, 2991.
7. Shimizu, N.; Imamoto, Y.; Harigai, M.; Kamikubo, H.; Yamazaki, Y.; Kataoka, M. J. Biol. Chem. 2006, 281, 4318.
8. Rubinstenn, G.; Vuister, G. W.; Mulder, F. A.; Düx, P. E.; Boelens, R.; Hellingwerf, K. J.; Kaptein, R. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 568.
9. Bernard, C.; Houben, K.; Derix, N. M.; Marks, D.; van der Horst, M. A.; Hellingwerf, K. J.; Boelens, R.; Kaptein, R.; van Nuland. N. A. Structure 2005, 13, 953.
10. Harigai, M.; Imamoto, Y.; Kamikubo, H.; Yamazaki, Y.; Kataoka, M. Biochemistry 2003, 42, 13893.
11. Imamoto, Y.; Kamikubo, H.; Harigai, M.; Shimizu, N.; Kataoka, M. Biochemistry 2002, 41, 13595.
12. Xie, A.; Kelemen, L.; Hendriks, J.; White, B. J.; Hellingwerf, K. J.; Hoff, W. D. Biochemistry 2001, 40, 1510.
13. Brudler, R.; Rammelsberg, R.; Woo, T. T.; Getzoff, E. D.; Gerwert, K. Nat. Struct. Biol 2001, 8, 265.
14. Meyer, T. E.; Tollin, G.; Hazzard, J. H.; Cusanovich, M. A. Biophys. J. 1989, 56, 559.
15. Borucki, B.; Devanathan, S.; Otto, H.; Cusanovich, M. A.; Tollin, G.; Heyn, M. P. Biochemistry 2002, 41, 10026.
16. Joshi, C. P.; Borucki, B.; Otto, H.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biochemistry 2005, 44, 656.
17. Joshi, C. P.; Borucki, B.; Otto, H.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biochemistry 2006, 45, 7057.
18. Hoff, W. D.; van Stokkum, I. H. M.; van Ramesdonk, H. J.; van Brederode, M. E.; Brouwer, A. M.; Fitch, J. C.; Meyer, T. E.; van Grondelle, R.; Hellingwerf, K. J. Biophys. J. 1994, 67, 1691.
19. Hendriks, J.; van Stokkum, I. H. M.; Hellingwerf, K. J. Biophys. J. 2003, 84, 1180.
20. Borucki, B.; Kyndt, J. A.; Joshi, C. P.; Otto, H.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biochemistry 2005, 44, 13650.
21. Hoersch, D.; Otto, H.; Joshi, C. P.; Borucki, B.; Cusanovich, M. A.; Heyn, M. P. Biophys. J. 2007, 93, 1687.
22. Borucki, B.; Otto, H.; Heyn, M. P. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6371.
23. Pan, D. H.; Philip, A.; Hoff, W. D.; Mathies, R. A. Biophys. J. 2004, 86, 2374.
24. Genick, U. K.; Borgstahl, G. E.; Ng, K.; Ren, Z.; Pradervand, C.; Burke, P. M.; Srajer, V.; Teng, T. Y.; Schildkamp, W.; McRee, D. E.; Moffat, K.; Getzoff, E. D. Science 1997, 275, 1471.
25. Genick, U. K.; Soltis, S. M.; Kuhn, P.; Canestrelli, I. L.; Getzoff, E. D. Nature 1998, 392, 206.
26. Ihee, H.; Rajagopal, S.; Srajer, V.; Pahl, R.; Anderson, S.; Schmidt, M.; Schotte, F.; Anfinrud, P. A.; Wulff, M.; Moffat, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 7145.
27. Perman, B.; Srajer, V.; Ren, Z.; Teng, T.; Pradervand, C.; Ursby, T.; Bourgeois, D.; Schotte, F.; Wulff, M.; Kort, R.; Hellingwerf, K.; Moffat, K. Science 1998, 279, 1946.
28. Ren, Z.; Perman, B.; Srajer, V.; Teng, T. Y.; Pradervand, C.; Bourgeois, D.; Schotte, F.; Ursby, T.; Kort, R.; Wulff, M.; Moffat, K. Biochemistry 2001, 40, 13788.
29. Schmidt, M.; Pahl, R.; Srajer, V.; Anderson, S.; Ren, Z.; Ihee, H.; Rajagopal, S.; Moffat, K. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 4799.
30. Gensch, T.; Hendriks, J.; Hellingwerf, K. J. Photochem. Photobiol. Sci. 2004, 3, 531.
31. Kyndt, J. A.; Vanrobaeys, F.; Fitch, J. C.; Devreese, B. V.; Meyer, T. E.; Cusanovich, M. A.; Van Beeumen, J. J. Biochemistry 2003, 42, 965.
32. Otto, H.; Lamparter, T.; Borucki, B.; Hughes, J.; Heyn, M. P. Biochemistry 2003, 42, 5885.
33. Imamoto, Y.; Harigai, M.; Kataoka, M. FEBS Lett. 2004, 557, 75.
34. Heyn, M. P.; Borucki, B.; Otto, H. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1460, 60.
35. Hendriks, J.; Hoff, W. D.; Crielaard, W.; Hellingwerf, K. J. J. Biol. Chem. 1999, 274, 17655.
36. Unno, M.; Kumauchi, M.; Hamada, N.; Tokunaga, F.; Yamauchi, S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 23855.
37. Meyer, T. E.; Devanathan, S.; Woo, T.; Getzoff, E. D.; Tollin, G.; Cusanovich, M. A. Biochemistry 2003, 42, 3319.