메뉴 건너뛰기




Volumn 129, Issue 2, 2008, Pages

A hierarchical transition state search algorithm

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BOOLEAN FUNCTIONS; CHEMICAL REACTIONS; CODES (SYMBOLS); CONSTRAINED OPTIMIZATION; CONSTRAINT THEORY; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; HYDROELECTRIC POWER; INTERPOLATION; LEARNING ALGORITHMS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

EID: 47349088900     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.2950083     Document Type: Article
Times cited : (51)

References (96)
  • 3
    • 33751044609 scopus 로고
    • 0001-4842 10.1021/ar00072a001.
    • K. Fukui, Acc. Chem. Res. 0001-4842 10.1021/ar00072a001 14, 363 (1981).
    • (1981) Acc. Chem. Res. , vol.14 , pp. 363
    • Fukui, K.1
  • 4
    • 38049108089 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2815812.
    • J. Kästner and P. Sherwood, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2815812 128, 014106 (2008).
    • (2008) J. Chem. Phys. , vol.128 , pp. 014106
    • Kästner, J.1    Sherwood, P.2
  • 5
  • 6
    • 34948825487 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2768533.
    • E. F. Koslover and D. J. Wales, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2768533 127, 134101 (2007).
    • (2007) J. Chem. Phys. , vol.127 , pp. 134101
    • Koslover, E.F.1    Wales, D.J.2
  • 7
    • 34547287571 scopus 로고    scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/jcc.20688.
    • W. Quapp, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/jcc.20688 28, 1834 (2007).
    • (2007) J. Comput. Chem. , vol.28 , pp. 1834
    • Quapp, W.1
  • 8
    • 34247881948 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.2720838.
    • W. E, W. Ren and E. Vanden-Eijnden, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.2720838 126, 164103 (2007).
    • (2007) J. Chem. Phys. , vol.126 , pp. 164103
    • Ren, W.1    Vanden-Eijnden, E.2
  • 11
    • 33744456749 scopus 로고    scopus 로고
    • 1066-5277 10.1089/cmb.2006.13.745.
    • C. K. Reddy and H. D. Chiang, J. Comput. Biol. 1066-5277 10.1089/cmb.2006.13.745 13, 745 (2006).
    • (2006) J. Comput. Biol. , vol.13 , pp. 745
    • Reddy, C.K.1    Chiang, H.D.2
  • 13
    • 14544268134 scopus 로고    scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/j.cplett.2005.01.068.
    • S. Maeda and K. Ohno, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/j.cplett.2005. 01.068 404, 95 (2005).
    • (2005) Chem. Phys. Lett. , vol.404 , pp. 95
    • Maeda, S.1    Ohno, K.2
  • 14
    • 22744435441 scopus 로고    scopus 로고
    • 1089-5639 10.1021/jp0513162.
    • S. Maeda and K. Ohno, J. Phys. Chem. A 1089-5639 10.1021/jp0513162 109, 5742 (2005).
    • (2005) J. Phys. Chem. A , vol.109 , pp. 5742
    • Maeda, S.1    Ohno, K.2
  • 18
    • 0347131010 scopus 로고    scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/j.cplett.2003.12.030.
    • K. Ohno and S. Maeda, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/j.cplett.2003. 12.030 384, 277 (2004).
    • (2004) Chem. Phys. Lett. , vol.384 , pp. 277
    • Ohno, K.1    Maeda, S.2
  • 22
    • 2442573648 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1691404.
    • L. Xie, H. Y. Liu, and W. T. Yang, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1691404 120, 8039 (2004).
    • (2004) J. Chem. Phys. , vol.120 , pp. 8039
    • Xie, L.1    Liu, H.Y.2    Yang, W.T.3
  • 25
    • 0038340986 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1571817.
    • R. Crehuet and M. J. Field, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1571817 118, 9563 (2003).
    • (2003) J. Chem. Phys. , vol.118 , pp. 9563
    • Crehuet, R.1    Field, M.J.2
  • 27
    • 37649032676 scopus 로고    scopus 로고
    • 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.042101.
    • L. Y. Chen, S. C. Ying, and T. Ala-Nissila, Phys. Rev. E 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.042101 65, 042101 (2002).
    • (2002) Phys. Rev. e , vol.65 , pp. 042101
    • Chen, L.Y.1    Ying, S.C.2    Ala-Nissila, T.3
  • 29
  • 32
    • 1242329035 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.1323224.
    • G. Henkelman and H. Jonsson, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.1323224 113, 9978 (2000).
    • (2000) J. Chem. Phys. , vol.113 , pp. 9978
    • Henkelman, G.1    Jonsson, H.2
  • 33
    • 0000327364 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.480097.
    • G. Henkelman and H. Jonsson, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.480097 111, 7010 (1999).
    • (1999) J. Chem. Phys. , vol.111 , pp. 7010
    • Henkelman, G.1    Jonsson, H.2
  • 34
    • 0037628561 scopus 로고    scopus 로고
    • 0020-7608 10.1002/(SICI)1097-461X(1999)75:4/5<563::AID-QUA21 3.0.CO;2-Z.
    • C. Cardenas-Lailhacar and M. C. Zerner, Int. J. Quantum Chem. 0020-7608 10.1002/(SICI)1097-461X(1999)75:4/5<563::AID-QUA21 3.0.CO;2-Z 75, 563 (1999).
    • (1999) Int. J. Quantum Chem. , vol.75 , pp. 563
    • Cardenas-Lailhacar, C.1    Zerner, M.C.2
  • 35
    • 0033459066 scopus 로고    scopus 로고
    • 0301-0104 10.1016/S0301-0104(98)00414-5
    • P. Chaudhury and S. P. Bhattacharyya, Chem. Phys. 241, 313 (1999). 0301-0104 10.1016/S0301-0104(98)00414-5
    • (1999) Chem. Phys. , vol.241 , pp. 313
    • Chaudhury, P.1    Bhattacharyya, S.P.2
  • 37
    • 0001407648 scopus 로고    scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/(SICI)1096-987X(19980715)19:9<1087::AID-JCC93.0. CO;2-M.
    • W. Quapp, M. Hirsch, O. Imig, and D. Heidrich, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/(SICI)1096-987X(19980715)19:9<1087::AID-JCC93.0.CO;2-M 19, 1087 (1998).
    • (1998) J. Comput. Chem. , vol.19 , pp. 1087
    • Quapp, W.1    Hirsch, M.2    Imig, O.3    Heidrich, D.4
  • 38
    • 0003121620 scopus 로고    scopus 로고
    • 0020-7608 10.1002/(SICI)1097-461X(1998)70:1<95::AID-QUA73.0.CO;2-0.
    • N. Okuyama-Yoshida, M. Nagaoka, and T. Yamabe, Int. J. Quantum Chem. 0020-7608 10.1002/(SICI)1097-461X(1998)70:1<95::AID-QUA73.0.CO;2-0 70, 95 (1998).
    • (1998) Int. J. Quantum Chem. , vol.70 , pp. 95
    • Okuyama-Yoshida, N.1    Nagaoka, M.2    Yamabe, T.3
  • 40
  • 41
    • 0000809763 scopus 로고    scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.474043.
    • A. Ulitsky and D. Shalloway, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.474043 106, 10099 (1997).
    • (1997) J. Chem. Phys. , vol.106 , pp. 10099
    • Ulitsky, A.1    Shalloway, D.2
  • 42
    • 2442481958 scopus 로고    scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/(SICI)1096-987X(19960115)17:1<49::AID-JCC53.0.CO;2- 0.
    • C. Y. Peng, P. Y. Ayala, H. B. Schlegel, and M. J. Frisch, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/(SICI)1096-987X(19960115)17:1<49::AID-JCC53.0.CO;2-0 17, 49 (1996).
    • (1996) J. Comput. Chem. , vol.17 , pp. 49
    • Peng, C.Y.1    Ayala, P.Y.2    Schlegel, H.B.3    Frisch, M.J.4
  • 43
    • 0030567410 scopus 로고    scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(96)00255-2.
    • W. Quapp, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(96)00255-2 253, 286 (1996).
    • (1996) Chem. Phys. Lett. , vol.253 , pp. 286
    • Quapp, W.1
  • 45
    • 0001047952 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.470579.
    • I. V. Ionova and E. A. Carter, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.470579 103, 5437 (1995).
    • (1995) J. Chem. Phys. , vol.103 , pp. 5437
    • Ionova, I.V.1    Carter, E.A.2
  • 46
    • 43949149445 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(94)00374-2.
    • O. S. Smart, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(94)00374-2 222, 503 (1994).
    • (1994) Chem. Phys. Lett. , vol.222 , pp. 503
    • Smart, O.S.1
  • 47
    • 0000829977 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.467721.
    • J. Q. Sun and K. Ruedenberg, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.467721 101, 2157 (1994).
    • (1994) J. Chem. Phys. , vol.101 , pp. 2157
    • Sun, J.Q.1    Ruedenberg, K.2
  • 48
    • 0001352517 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(94)00897-3.
    • P. L. A. Popelier, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(94) 00897-3 228, 160 (1994).
    • (1994) Chem. Phys. Lett. , vol.228 , pp. 160
    • Popelier, P.L.A.1
  • 50
    • 0000560755 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.465100.
    • I. V. Ionova and E. A. Carter, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.465100 98, 6377 (1993).
    • (1993) J. Chem. Phys. , vol.98 , pp. 6377
    • Ionova, I.V.1    Carter, E.A.2
  • 51
    • 0001717840 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(91)90115-P.
    • T. Helgaker, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(91)90115-P 182, 503 (1991).
    • (1991) Chem. Phys. Lett. , vol.182 , pp. 503
    • Helgaker, T.1
  • 53
    • 35248857016 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.458112.
    • A. Ulitsky and R. Elber, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.458112 92, 1510 (1990).
    • (1990) J. Chem. Phys. , vol.92 , pp. 1510
    • Ulitsky, A.1    Elber, R.2
  • 55
    • 0000603016 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(87)80576-6.
    • R. Elber and M. Karplus, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009- 2614(87)80576-6 139, 375 (1987).
    • (1987) Chem. Phys. Lett. , vol.139 , pp. 375
    • Elber, R.1    Karplus, M.2
  • 57
    • 84987142730 scopus 로고
    • 0020-7608 10.1002/qua.560250405
    • I. Balint and M. I. Ban, Int. J. Quantum Chem. 25, 667 (1984). 0020-7608 10.1002/qua.560250405
    • (1984) Int. J. Quantum Chem. , vol.25 , pp. 667
    • Balint, I.1    Ban, M.I.2
  • 58
    • 36549093328 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.446996.
    • S. Bell and J. S. Crighton, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.446996 80, 2464 (1984).
    • (1984) J. Chem. Phys. , vol.80 , pp. 2464
    • Bell, S.1    Crighton, J.S.2
  • 60
    • 84986478037 scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/jcc.540030302.
    • P. Scharfenberg, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/jcc.540030302 3, 277 (1982).
    • (1982) J. Comput. Chem. , vol.3 , pp. 277
    • Scharfenberg, P.1
  • 61
    • 84986439201 scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/jcc.540030212.
    • H. B. Schlegel, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/jcc.540030212 3, 214 (1982).
    • (1982) J. Comput. Chem. , vol.3 , pp. 214
    • Schlegel, H.B.1
  • 63
    • 36749114393 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.442352.
    • C. J. Cerjan and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.442352 75, 2800 (1981).
    • (1981) J. Chem. Phys. , vol.75 , pp. 2800
    • Cerjan, C.J.1    Miller, W.H.2
  • 64
    • 0001369898 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(80)85361-9.
    • M. J. Rothman and L. L. Lohr, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(80)85361-9 70, 405 (1980).
    • (1980) Chem. Phys. Lett. , vol.70 , pp. 405
    • Rothman, M.J.1    Lohr, L.L.2
  • 67
    • 0001149392 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(77)80574-5.
    • T. A. Halgren and W. N. Lipscomb, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(77)80574-5 49, 225 (1977).
    • (1977) Chem. Phys. Lett. , vol.49 , pp. 225
    • Halgren, T.A.1    Lipscomb, W.N.2
  • 68
    • 0010394929 scopus 로고
    • 0009-2614 10.1016/0009-2614(75)85665-X.
    • D. Poppinger, Chem. Phys. Lett. 0009-2614 10.1016/0009-2614(75)85665-X 35, 550 (1975).
    • (1975) Chem. Phys. Lett. , vol.35 , pp. 550
    • Poppinger, D.1
  • 69
    • 36449003859 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.469144.
    • F. Jensen, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.469144 102, 6706 (1995).
    • (1995) J. Chem. Phys. , vol.102 , pp. 6706
    • Jensen, F.1
  • 72
    • 84986513718 scopus 로고
    • 0192-8651 10.1002/jcc.540150102.
    • J. M. Bofill, J. Comput. Chem. 0192-8651 10.1002/jcc.540150102 15, 1 (1994).
    • (1994) J. Comput. Chem. , vol.15 , pp. 1
    • Bofill, J.M.1
  • 73
    • 36449004573 scopus 로고
    • 0021-9606 10.1063/1.466278.
    • Y. Abashkin and N. Russo, J. Chem. Phys. 0021-9606 10.1063/1.466278 100, 4477 (1994).
    • (1994) J. Chem. Phys. , vol.100 , pp. 4477
    • Abashkin, Y.1    Russo, N.2
  • 86
    • 33749419794 scopus 로고
    • 0022-3654 10.1021/j100203a036.
    • T. H. Fischer and J. Almlöf, J. Phys. Chem. 0022-3654 10.1021/j100203a036 96, 9768 (1992).
    • (1992) J. Phys. Chem. , vol.96 , pp. 9768
    • Fischer, T.H.1    Almlöf, J.2
  • 87
    • 77958398767 scopus 로고
    • 0020-2932 10.1093/imamat/6.1.76.
    • C. G. Broyden, J. Inst. Math. Appl. 0020-2932 10.1093/imamat/6.1.76 6, 76 (1970).
    • (1970) J. Inst. Math. Appl. , vol.6 , pp. 76
    • Broyden, C.G.1
  • 88
    • 0014825610 scopus 로고
    • 0010-4620 10.1093/comjnl/13.3.317.
    • R. Fletcher, Comput. J. 0010-4620 10.1093/comjnl/13.3.317 13, 317 (1970).
    • (1970) Comput. J. , vol.13 , pp. 317
    • Fletcher, R.1
  • 89
    • 84966251980 scopus 로고
    • 0025-5718 10.2307/2004873.
    • D. Goldfarb, Math. Comput. 0025-5718 10.2307/2004873 24, 23 (1970).
    • (1970) Math. Comput. , vol.24 , pp. 23
    • Goldfarb, D.1
  • 90
    • 84968497764 scopus 로고
    • 0025-5718 10.2307/2004840.
    • D. F. Shanno, Math. Comput. 0025-5718 10.2307/2004840 24, 647 (1970).
    • (1970) Math. Comput. , vol.24 , pp. 647
    • Shanno, D.F.1
  • 92
    • 0002008834 scopus 로고
    • 0025-5610 10.1007/BF01584071.
    • M. J. D. Powell, Math. Program. 0025-5610 10.1007/BF01584071 1, 26 (1971).
    • (1971) Math. Program. , vol.1 , pp. 26
    • Powell, M.J.D.1
  • 95


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.