Atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics. II. A seven-site fluctuating charge and flexible body water potential function for liquid water

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 108, Issue 37, 2004, Pages 7563-7576

  Wu, Yang ^a   Yang, Zhong Zhi ^a  

^a LIAONING NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; DIAPHRAGMS; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR DYNAMICS; NEUTRON DIFFRACTION; PARAMETER ESTIMATION; PERMITTIVITY; SUBSTITUTION REACTIONS; THERMODYNAMIC PROPERTIES; VAPORIZATION;

ELECTRONEGATIVITY; FLUCTUATING CHARGE; LIQUID WATER; MOLECULAR MECHANICS;

WATER;

EID: 4644292544     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0493881     Document Type: Article

References (110)

1. Roentgen, W. C. Annu. Rev. Phys. Chem. 1892, 45, 91.
2. Bernal, J. D.; Fowler, R. H. J. Chem. Phys. 1933, 1, 515.
3. Narten, A. H.; Levy, H. A. J. Chem. Phys. 1971, 55, 2263.
4. Soper, A. K.; Philips, M. G. Chem. Phys. 1986, 107, 47.
5. Soper, A. K.; Turner, J. Int. J. Mod. Phys. B 1993, 7, 3049.
6. Soper, A. K.; Bruni, F.; Ricci, M. A. J. Chem. Phys. 1997, 106, 247.
7. Soper, A. K. Chem. Phys. 2000, 258, 121.
8. Postorine, P.; Tromp, R. H.; Riui, M.-A.; Soper, A. K.; Neilson, W. Nature 1993, 366, 668.
9. Mills, R. J. Phys. Chem. 1973, 77, 685.
10. Price, W. S.; Ide, H.; Arata, Y. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 448.
11. Laasonen K.; Sprik, M.; Parrinello, M.; Car, R. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9080.
12. Silvestrelli, P. L.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1999, 111, 3572.
13. Dell Site, L.; Alavi, A.; Lynden-Bell, R. M. Mol. Phys. 1999, 96, 1683.
14. Stillinger, F. H.; Rahman, A. J. Chem. Phys. 1974, 60, 1545.
15. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Interaction Models for Water in Relation to Protein Hydration. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981.
16. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
17. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269.
18. Dang, L. X.; Pettitt, B. M. J. Phys. Chem. 1987, 91, 3349.
19. Jorgensen, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 335.
20. Mahoney, M. W.; Jorgensen, W. J. J. Chem. Phys. 2000, 112, 8910.
21. Mahoney, M. W.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Phys. 2001, 114, 363.
22. Glättli, A.; Daura, X.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9811.
23. Levitt, M.; Hirshberg, M.; Sheron, R.; Laidig, K. E.; Daggett, V. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 5051.
24. Mark, P.; Nilsson, L. Structure and Dynamics of the TIP3P, SPC, and SPC/ E Water Models at 298 K. J. Phys. Chem. A 2001, 105 (43), 9954.
25. Glättli, A.; Daura, X.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1087.
26. Gregory, J. K.; Clary, D. C.; Liu, K.; Brown, M. G.; Saykally, R. J. Science 1997, 275, 814.
27. Coulson, C. A.; Eisenberg, D. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1966, 297, 445.
28. Sorenson, J. M.; Hura, G.; Glaeser, R. M.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9149.
29. Silvestrelli, P. L.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 3348.
30. Batista, E. R.; Xantheas, S. S.; Jónsson, H. J. Chem. Phys. 1998, 109, 4546.
31. Stillinger, F. H.; David, C. W. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1473.
32. Barnes, P.; Finney, J. L.; Nicholas, N. D.; Quinn, J. E. Nature 1979, 282, 459.
33. Rullman, J. A. C.; van Duijnen, P. T. Mol. Phys. 1998, 63, 451.
34. Sprik, M.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1988, 89, 7556.
35. Ahlström. P.; Wallqvist, A.; Engström, S.; Jönsson, B. Mol. Phys. 1989, 68, 563.
36. Cieplak, P.; Kollman, P.; Lybrand, J. J. Chem. Phys. 1990, 92, 6755.
37. Svishchev, I. M.; Kusalik, P. G.; Wang, J.; Boyd, R. J. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4742.
38. Dang, L. X. J. Chem. Phys. 1992, 87, 2659.
39. Wallqvist, A.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13841.
40. Bernardo, D. N.; Ding, Y. B.; Kroghjespersen, K.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4180.
41. Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 6208.
42. Chialvo, A. A.; Cummings, P. T. J. Chem. Phys. 1996, 105, 8274.
43. Chen, B.; Xing, J. H.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 2391.
44. Halgren, T. A.; Damm, W. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 236.
45. Stern, H. A.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7622.
46. Zhu, S. B.; Singh, S.; Robinson, G. W. J. Chem. Phys. 1991, 95, 2791.
47. Rick. S. W.; Stuart, S. J.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6146.
48. Rick, S. W.; Berne, B. J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 672.
49. Perng, B.-C.; Newton, M. D.; Raineri, F. O.; Friedman, H. L. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7153.
50. Field, M. J. Mol. Phys. 1997, 91, 835.
51. Liu, Y. P.; Kim, K.; Berne, B. J.; Friesner, R. A.; Rick, S. W. J. Chem. Phys. 1998, 108, 4739.
52. Banks, J. L.; Kaminski, G. A.; Zhou, R.; Maina, D. T.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 741.
53. Rick. S. W.; Cachau, R. E. J. Chem. Phys. 2000, 112, 5230.
54. Rick, S. W. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2276.
55. Yang, Z. Z.; Wu, Y.; Zhao, D. X. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2541.
56. Soetens, J.-C.; Millot, C. Chem. Phys. Lett. 1995, 235, 22.
57. Stern, H. A.; Kaminski, G. A.; Banks, J. L.; Zhou, R.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4730.
58. Stern, H. A.; Rittner, F.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2237.
59. Nalewajski, R. F. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 944.
60. Mortier, W. J.; Ghosh, S. K.; Shankar, S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4315.
61. Baekelandt, B. G.; Mortier, W. J.; Lievens, J. L.; Schoonheydt, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6730.
62. Baekelandt, B. G.; Mortier, W. J.; Schoonheydt, R. A. Struct. Bonding (Berlin) 1993, 80, 187.
63. Baekelandt, B. G.; Jassens, G. O. A.; Toufar, H.; Mortier, W. J.; Schoonheydt, R. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9784.
64. Janssens, G. O. A.; Toufar, H.; Baekelandt, B. G.; Mortier, W. J.; Schoonheydt, R. A. Stud. Surf. Sci. Catal. 1997, 105, 725.
65. Yang, Z. Z.; Wang, C. S. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 6315.
66. Wang. C. S.; Li. S. M.; Yang, Z. Z. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1998, 430, 191.
67. Wang, C. S.; Yang, Z. Z. J. Chem. Phys. 1999, 110, 6189.
68. Cong, Y.; Yang, Z. Z. Chem. Phys. Lett. 2000, 316, 324.
69. Yang, Z. Z.; Wang, C. S. J. Theor. Comput. Chem. 2003, 2, 273.
70. Parr, R. G.; Yang, W. Density Functional Theory of Atom and Molecules; Oxford University Press: New York, 1989.
71. Parr, R. G.; Donnelly, R. A.; Levy, R. A.; Palke, W. E. J. Chem. Phys. 1978, 68, 3801.
72. Donnelly, R. A.; Parr, R. G. J. Chem. Phys. 1978, 69, 4431.
73. Sanderson, R. T. Chemical Bond and Bond Energies; Academic Press: New York, 1976.
74. Sanderson, R. T. Polar Covalence; Academic Press: New York, 1983.
75. Stillinger, F. H.; Rahman, A. J. Chem. Phys. 1978, 68, 666.
76. Toukan, K.; Rahman, A. Phys. Rev. B.: Condens. Matter 1985, 31, 2643.
77. Teleman, O.; Ahlström, P. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4333.
78. Reimers, J. R.; Watts, R. O. Chem. Phys. 1984, 91, 201.
79. Barrat, J.-L.; McDonald, I. R. Mol. Phys. 1990, 20, 535.
80. Anderson, J.; Ullo, J.; Yip, S. J. Chem. Phys. 1987, 87, 1726.
81. Wallqvist, A.; Berne, B. J. Chem. Phys. Lett. 1985, 117, 214.
82. Zhu, S. B.; Yao, S.; Zhu, J. B.; Singh, S.; Robinson, G. W. J. Phys. Chem. 1991, 95, 6211.
83. Saint-Martin, H.; Henández-Cobos, J.; Bernal-Uruchurtu, M. I.; Ortega-Blake, I.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 2000, 13, 10899.
84. Burnham, C. J.; Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 2002, 116, 5115.
85. Ichikawa, K.; Kameda, Y.; Yamaguchi, T.; Wakita, H.; Misawa, M. Mol. Phys. 1991, 73, 79.
86. Thiessen, W. E.; Narten, A. M. J. Chem. Phys. 1982, 77, 2656.
87. Speedy, R. J.; Madura, J. D.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. 1987, 91, 909.
88. Liu, K.; Brown, M. G.; Carter, C.; Saykally, R. J.; Gregory, J. K.; Clary, D. C. Nature 1996, 381, 501.
89. Yang, Z. Z.; Zhao, D. X. Chem. Phys. Lett. 1998, 292, 387.
90. Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drumen, R. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 43.
91. Kell, G. S. J. Chem. Eng. Data 1967, 12, 66.
92. Kell, G. S. J. Chem. Eng. Data 1975, 20, 97.
93. Harr, L.; Gallagher, J. S.; Kell, G. S. NBS/NRC Steam Tables: Themodynamic and Transport Properties and Computer Programs for Vapor and Liquid States of Water in SI Units; Hemisphere Publishing Corp.: Washington, DC, 1984.
94. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarendon Press: Oxford, U.K., 1987.
95. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. J. Comput. Chem. 1994, 15, 667.
96. Prevost, M.; Van Belle, D.; Lippens, G.; Wodak, S. Mol. Phys. 1990, 19, 726.
97. Jorgensen, W. J.; Jenson, C. J. Comput. Chem. 1998, 19, 1179.
98. Badyal, Y. S.; Saboungi, M.-L.; Price, D. L.; Shastri, S. D.; Haeffner, D. R.; Soper, A. K. J. Chem. Phys. 2000, 112, 9206.
99. Batista, E. R.; Xantheas, S. S.; Jónsson, H. J. Chem. Phys. 2000, 112, 3285.
100. Silvestrelli, P. L.; Bernasconi, M.; Parrinello, M. Chem. Phys. Lett. 1997, 273, 360.
101. Silvestralli, P. L.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 3308.
102. Kaatze, U.; Uhlendorf, Z. V. Phys. Chem. Neue Folge 1981, 126, 151.
103. Weast, R. C., Ed. CRC Handbook of Chemistry and Physics; CRC Press, Boca Raton, FL, 1985-1986; Vol. 66.
104. Tyrell, H. J. V.; Harris, K. M. Diffusion in Liquids: A Theoretical and Experimental Study; Butterworths: London, 1984.
105. Krynicki, K.; Green, C. D.; Sawyer, D. W. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1978, 66, 199.
106. Wallqvist, A.; Astrand, P.-O. J. Chem. Phys. 1994, 102, 6559.
107. Jedlovszky, P.; Vallauri, R. Mol. Phys. 1999, 97, 1157.
108. Boodholt, J.; Sampoli, M.; Vallauri, R. Mol. Phys. 1995, 85, 81.
109. Malmberg, C. G.; Maryott, A. J. Res. Natl. Bur. Stand. 1956, 56, 1.
110. Dorsey, N. E. Properties of Ordinary Water-Substance in All Its Phases: Water Vapor, Water, and All the Ices; Reinhold: New York, 1940.