Probing the heme-pocket structure of the paramagnetic forms of cytoglobin and a distal histidine mutant using electron paramagnetic resonance

Molecular Physics

Volumn 105, Issue 15-16, 2007, Pages 2073-2086

  Ioanitescu, Anda I ^a   Van Doorslaer, Sabine ^a   Dewilde, Sylvia ^a   Endeward, Burkhard ^b   Moens, Luc ^a  

^a UNIVERSITY OF ANTWERP   (Belgium)

^b GOETHE UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

Electron paramagnetic resonance; Globins; Heme proteins

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; AMINO ACIDS; OXIDATION; PARAMAGNETIC MATERIALS; PARAMAGNETIC RESONANCE; X RAY DIFFRACTION;

GLOBINS; HEME PROTEINS; HEME-POCKET STRUCTURE; HISTIDINE; LIGATION;

PROTEINS;

EID: 41149139468     PISSN: 00268976     EISSN: 13623028     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/00268970701616030     Document Type: Article

References (51)

1. J. T. Trent III and M. S. Hargrove, J. Biol. Chem. 277, 19538 (2002).
2. N. Kawada, D. B. Kristensen, K. Asahina, K. Nakatani, Y. Minamiyama, S. Seki, and K. Yoshizato, J. Biol. Chem. 276, 25318 (2001).
3. T. Burmester, B. Ebner, B. Weich, and T. Hankeln, Molec. Biol. Evol. 19, 416 (2002).
4. A. Pesce, M. Bolgnesi, A. Bocedi, P. Ascenzi, S. Dewilde, L. Moens, T. Hankeln, and T. Burmester, EMBO Rep. 3, 1146 (2002).
5. P. Ascenzi, A. Bocedi, D. de Sanctis, A. Pesce, M. Bolognesi, M. C. Marden, S. Dewilde, L. Moens, T. Hankeln, and T. Burmester., BAMBED 32, 305 (2004).
6. A. Pesce, D. de Sanctis, M. Nardini, S. Dewilde, L. Moens, T. Mankeln, T. Burmester, P. Ascenzi, and M. Bolognesi, IUBMB Life 56, 657 (2004).
7. D. Kugelstadt, M. Haberkamp, T. Hankeln, and T. Burmester, Biochem. Biophys. Res. Commun, 325, 719 (2004).
8. D. de Sanctis, S. Dewilde, A. Pesce, L. Moens, P. Ascenzi, T. Hankeln, T. Burmester, and M. Bolognesi, J. Molec. Biol. 336, 917 (2004).
9. D. de Sanctis, S. Dewilde, A. Pesce, L. Moens, P. Ascenzi, T. Hankeln, T. Burmester, and M. Bolognesi, Biochem. Biophys. Res. Commun. 316, 1217 (2004).
10. H. Sugimoto, M. Makino, H. Sawai, N. Kawada, K. Yoshizato, and Y. J. Shiro, Molec. Biol. 339, 873 (2004).
11. H. Sawai, N. Kawada, K. Yoshizato, H. Nakajima, S. Aono, and Y. Shiro, Biochemistry 42, 5133 (2003).
12. H. Sawai, M. Makino, Y. Mizutani, T. Ohta, H. Sugimoto, T. Uno, N. Kawada, K. Yoshizato, T. Kitagawa, and Y. Shiro, Biochemistry 44, 13257 (2005).
13. D. Hamdane, L. Kiger, S. Dewilde, B. N. Green, A. Pesce, J. Uzan, T. Burmester, T. Hankeln, M. Bolognesi, L. Moens, and M. C. Marden, J. Biol. Chem. 278, 51713 (2003).
14. A. Fago, C. Hundahl, S. Dewilde, K. Gilany, L. Moens, and R. E. Weber, J. Biol. Chem. 279, 44417 (2004).
15. E. Vinck, S. Van Doorslaer, S. Dewilde, and L. Moens, J. Am. Chem. Soc. 126, 4516 (2004).
16. V. Bondarenko, S. Dewilde, L. Moens, and G. N. La Mar, J. Am. Chem. Soc. 128, 12988 (2006).
17. A. Schweiger and G. Jeschke, Principles of Pulse Electron Paramagnetic Resonance (Oxford University Press, Oxford, 2001).
18. T. Prisner, M. Rohrer, and F. MacMillan, A. Rev. Phys. Chem. 52, 279 (2001).
19. E. Vinck and S. Van Doorslaer, Phys. Chem. Chem. Phys. 6, 5324 (2004).
20. A. I. Ioanitescu, S. Dewilde, L. Kiger, M. C. Marden, L. Moens, and S. Van Doorslaer, Biophys. J. 89, 2628 (2005).
21. E. Vinck, S. Van Doorslaer, S. Dewilde, G. Mitrikas, A. Schweiger, and L. Moens, J. Biol. Inorg. Chem. 11, 467 (2006).
22. F. Trandafir, P. Ter Heerdt, M. Fittipaldi, E. Vinck, S. Dewilde, L. Moens, and S. Van Doorslaer, Appl. Magn. Reson., Appl. Magn. Reson., 31, 553 (2007).
23. S. Van Doorslaer, S. Dewilde, L. Kiger, S. Nistor, E. Goovaerts, M.C. Marden, and L. Moens, J. Biol. Chem. 278, 4919 (2003).
24. F. Trandafir, S. Van Doorslaer, S. Dewilde, and L. Moens, Biochim. Biophys. Acta 1702, 153 (2004).
25. D. de Sanctis, S. Dewilde, A. Pesce, P. Ascenzi, T. Burmester, and T. Hankeln, Acta Crystallogr. D 59, 1285 (2003).
26. S. Stoll and A. Schweiger, J. Magn. Reson. 177, 390 (2005).
27. A. Weber, M. Rohrer, J. T. Törring, and T. F. Prisner, in Proceedings of the 29th Congress AMPERE/13th ISMAR, edited by D. Ziessow, W. Lubitz, and F. Lendzian, (Technical University, Berlin, 1998), p. 1128.
28. P. Höfer, A. Grupp, H. Nebenführ, and M. Mehring, Chem. Phys. Lett. 132, 279 (1986).
29. G. Jeschke, R. Rakhmatullin, and A. Schweiger, J. Magn. Reson. 131, 261 (1998).
30. A. V. Astashkin, A. M. Raitsimring, and F. A. Walker, Chem. Phys. Lett. 306, 9 (1999).
31. Z. L. Madi, S. Van Doorslaer, and A. Schweiger, J. Magn. Reson. 154, 181 (2002).
32. F. A. Walker, J. Biol. Inorg. Chem. 11, 391 (2006).
33. I. Garcia-Rubio, J. I. Martínez, R. Picorel, I. Yruela, and P. J. Alonso, J. Am. Chem. Soc. 125, 15846 (2003).
34. N. V. Shokhirev and A. Walker, JBIC 3, 581 (1998).
35. N. V. Shokhirev and A. Walker, J. Am. Chem. Soc. 120, 981 (1998).
36. A. Pöppl, M. Gutjahr, M. Hartmann, W. Bohlmann, and R. Böttcher, J. Phys. Chem. B 102, 7752 (1998).
37. C. P. Scholes, A. Lapidot, R. Mascarenhas, T. Inubushi, R. A. Isaacson, and G. Feher, J. Am. Chem. Soc. 104, 2724 (1982).
38. P. P. Schmidt, R. Kappl, and J. Hüttermann, Appl. Magn. Reson. 21, 423 (2001).
39. E. Wajnberg, M. P. Linhares, L. J. El-Jaick, and G. Bemski, Eur. Biophys. J. 21, 57 (1992).
40. M. Flores, E. Wajnberg, and G. Bemski, Biophys. J. 73, 3225 (1997).
41. M. Flores, E. Wajnberg, and G. Bemski, Biophys. J. 78, 217 (2000).
42. S. Patchkovskii and T. Ziegler, Inorg. Chem. 39, 5354 (2000).
43. B. Vallone, K. Nienhaus, M. Brunori, and G. U. Nienhaus, Proteins 56, 85 (2004).
44. B. Vallone, K. Nienhaus, A. Matthes, M. Brunori, and G. U. Nienhaus, Proc. Natn. Acad. Sci. U.S.A. 101, 17351 (2004).
45. T. Uno, D. Ryu, H. Tsutsumi, Y. Tomisugi, Y. Ishikawa, A. J. Wilkinson, H. Sato, and T. Hayashi, J. Biol. Chem. 279, 5886 (2004).
46. D. Hamdane, L. Kiger, S. Dewilde, B. N. Green, A. Pesce, J. Uzan, T. Burmester, T. Hankeln, M. Bolognesi, L. Moens, and M. C. Marden, J. Biol. Chem. 278, 51713 (2003).
47. M. Ikeda-Saito, H. Hori, L. A. Andersson, R. C. Prince, I. J. Pickering, G. N. George, C. R. Sanders, R. S. Lutz, E. J. McKelvey, and R. Mattera, J. Biol. Chem. 267, 22843 (1992).
48. K. Rajarthnam, G. N. La Mar, M. L. Chiu, S. G. Sligar, J. P. Singh, and K. M. Smith, J. Am. Chem. Soc. 113, 7886 (1991).
49. D. Leys, K. Backers, T. E. Meyer, W. R. Hagen, M. A. Cusanovich, and J. J. Van Beeumen, J. Biol. Chem. 275, 16050 (2000).
50. A. M. Gardner, R. A. Helmick, and P. R. Gardner, J. Biol. Chem. 277, 8172 (2002).
51. D. L. Rousseau and J. M. Friedmann, in Biological Application of Raman Spectroscopy, edited by T. G. Spiro (Wiley, New York, 1988), Vol. 3, p. 133.