Time-resolved fluorescence anisotropy in assessing side-chain and segmental motions in polyamines entrapped in sol-gel derived silica

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 30, 2004, Pages 10692-10699

  Tleugabulova, Dina ^a   Czardybon, Wojciech ^a   Brennan, John D ^a  

^a MCMASTER UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADSORPTION; AMINES; AMINO ACIDS; ANISOTROPY; MAGNETIC RESONANCE; MATRIX ALGEBRA; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; OPTIMIZATION; REACTION KINETICS; ROTATION; SILICA; SOL-GELS; SOLUTIONS;

MOLECULAR MECHANICS; POLYAMINES; SEGMENTED MOTIONS; TIME-RESOLVED FLUORESCENCE ANISOTROPY;

FLUORESCENCE;

EID: 4043184291     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0491109     Document Type: Article

References (74)

1. Benkovic, S. J.; Hammes-Schiffer, S. Science 2003, 301, 1196.
2. Elofsson, A.; Rigler, R.; Nilsson, L.; Roslund, J.; Krause, G.; Holmgren, A. Biochemistry 1991, 30, 9648.
3. Lee, A. L.; Wand, A. J. Nature 2001, 411, 501.
4. Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520.
5. Ishima, R.; Torchia, D. A. Nature Struct. Biol. 2000, 7, 740.
6. Palmer, A. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001, 30, 129.
7. Columbus, L.; Hubbell, W. L. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 288.
8. Parak, F. G. Rep. Prog. Phys. 2003, 66, 103.
9. Orecchini, A.; Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. J. Phys. Chem B 2002, 106, 7348.
10. Jimenez, R.; Salazar, G.; Baldridge, K. K.; Romesberg, F. E. Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 92.
11. Yang, H.; Luo, G.; Kamchanaphanurach, P.; Louie, T. M.; Rech, I.; Cova, S.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 2003, 302, 262.
12. Bright, F. V.; Munson, C. A. Anal. Chim. Acta 2003, 500, 71.
13. Gangal, M.; Cox, S.; Lew, J.; Clifford, T.; Garrod, S. M.; Aschbaher, M. ; Taylor, S. S.; Johnson, D. A. Biochemistry 1998, 37, 13728.
14. Kemple, M. D.; Yuan, P.; Nollet, K. E.; Fuchs, J. A.; Silva, N.; Prendergast, F. G. Biophys. J. 1994, 66, 2111.
15. Moncrieffe, M. C.; Juranic, N.; Kemple, M. D.; Potter, J. D.; Macura, S. ; Prendergast, F. G. J. Mol. Biol. 2000, 297, 147.
16. Palmer, A. G.; Hochstrasser, R.; Millar, D. P.; Rance, M.; Wright, P. E. J. Am. Chem. Soc. 1992, 115, 6333.
17. Alexiev, U.; Rimke, I.; Pöhlmann, T. J. Mol. Biol 2003, 328, 705.
18. Tcherkasskaya, O.; Ptitsyn, O.; Knutson, J. R. Biochemistry 2000, 39, 1879.
19. Kemple, M. D.; Buckley, P.; Yuan, P.; Prendergast, F. G. Biochemistry 1997, 36, 1678.
20. Göttfried, D. S.; Kagan, A.; Hoffman, B. M.; Friedman, J. M. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2803.
21. Flora, K. K.; Brennan, J. D. Chem. Mater. 2001, 13, 4170.
22. Doody, M. A.; Baker, G. A.; Pandey, S.; Bright, F. V. Chem. Mater. 2000, 12, 1142.
23. Jordan, J. D.; Dunbar, R. A.; Bright, F. V. Anal Chem. 1995, 67, 2436.
24. Khan, I.; Shannon, C. F.; Dantsker, D.; Friedman, A. J.; de-Apodaca, J. P.; Friedman, J. M. Biochemistry 2000, 39, 16099.
25. Wang, R.; Narang, U.; Prasad, P. N.; Bright, F. V. Anal. Chem. 1993, 65, 2671.
26. Baker, G. A.; Jordan, J. D.; Bright, F. V. J. Sol-Gel Sci. Technol. 1998, 11, 43.
27. Bhatia, R. B.; Brinker, C. J.; Gupta, A. K.; Singh, A. K. Chem. Mater. 2000, 12, 2434.
28. Wittebort, R. J.; Szabo, A.; Gurd, F. R. N. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 5723.
29. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4559.
30. Fernandez, V.; Reimer, J. A.; Denn, M. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9634.
31. Gougeon, R. D.; Reinholdt, M.; Delmotte, L.; Miehé-Brendlé, J.; Chézeau, J. M.; Le Dred, R.; Marchai, R.; Jeandet, P. Langmuir 2002, 18, 3396.
32. Bordi, F.; Cametti, C.; Paradossi, G. Biopolymers 2000, 53, 129.
33. West, J. K.; Latour, R.; Hench, L. L. J. Biomed. Mater. Res. 1997, 37, 585.
34. Alaimo, M. H.; Kumosinski, T. F. Langmuir 1997, 13, 2007.
35. Coradin, T.; Durupthy, O.; Livage, J. Langmuir 2002, 18, 2332.
36. Cha, J. N.; Birkedal, H.; Euliss, L. E.; Bartl, M. H.; Wong, M. S.; Deming, T. J.; Stucky, G. D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8285.
37. Kobayashi, S.; Suh, K.; Shirokura, Y. Macromolecules 1989, 22, 2363.
38. Hirano, T.; Kikuchi, K.; Urano, Y.; Nagano, T. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6555.
39. Caruso, F.; Donath, E.; Mohwald, H.; Georgieva, R. Macromolecules 1998, 31, 7365.
40. Caruso, F.; Lichtenfeld, H.; Donath, E.; Mohwald, H. Macromolecules 1999, 32, 2317.
41. Haugland, R. P. Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals, 6th ed; Molecular Probes: Eugene, OR, 1996.
42. Zheng, L.; Reid, W. R.; Brennan, J. D. Anal. Chem. 1997, 69, 3940.
43. Demas, J. N. Excited-State Lifetime Measurements; Academic Press: New York, 1983.
44. (a) Bright, F. V.; Betts, T. A.; Litwiler, K. S. CRC Crit. Rev. Anal. Chem. 1990, 21, 389.
45. (b) Bright, F. V. Appl. Spectrosc. 1995, 49, 14A.
46. Geddes, C. D.; Karolin, J.; Birch, D. J. S. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3835.
47. Allinger, N. L. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 8127.
48. Weiner, S. J.; Kollman, P. A.; Nguyen, D. T.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 1986, 7, 230.
49. Patonay, G.; Salon, J.; Sowell, J.; Strekowski, L. Molecules 2004, 9, 40.
50. Welder, F.; Paul, B.; Nakazumi, H.; Yagi, S.; Colyer, C. L. J. Chromatogr. B 2003, 793, 93.
51. Colyer, C. Cell Stochem. Biophys. 2000, 33, 323.
52. Tleugabulova, D.; Zhang, Z.; Brennan, J. D. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 10127.
53. Costantino, U.; Coleti, N.; Nocchetti, M.; Aloisi, G. G.; Elisei, F.; Latterini, L. Langmuir 2000, 16, 10351.
54. Alvarez-Pez, J. M.; Ballesteros, L.; Talavera, E.; Yguerabide, J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 6320.
55. Riseman, J.; Kirkwood, J. G. J. Chem. Phys. 1949, 16, 442.
56. Kobayashi, S.; Tokunoh, M.; Saegusa, T.; Mashio, F. Macromolecules 1985, 18, 2357.
57. Spyros, A.; Dais, P.; Heatley, F. Macromolecules 1994, 27, 5845.
58. Go, N. Biophys. Chem. 1990, 35, 105.
59. Yun, S.; Jang, D. S.; Kim, D. H.; Choi, K. Y.; Lee, H. C. Biochemistry 2001, 40, 3967.
60. Lakowicz, J. R.; Gryczynski, I. Topics in Fluorescence Spectros copy; Plenum: New York, 1991; Vol. 1.
61. Duhamel, J.; Kanyo, J.; Dinter-Gottlieb, G.; Lu, P. Biochemistry 1996, 35, 16687.
62. Geddes, C. D. J. Fluoresc. 2002, 12, 343.
63. Levy, G. C.; Axelson, D. E.; Schwartz, R.; Hochmann, J. J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 410.
64. Mashimo, S.; Miura, N.; Shinyashiki, N.; Ota, T. Macromolecules 1993, 26, 6859.
65. Bordi, F.; Cametti, C.; Paradossi, G. Macromolecules 1992, 25, 4206.
66. Bicknese, S.; Rossi, M.; Thevenin, B.; Shohet, S. B.; Verkman, A. S. Biochemistry 1995, 34, 10645.
67. Soutar, I.; Swanson, L.; Imhof, R. E.; Rumbles, G. Macromolecules 1992, 25, 4399.
68. Soutar, I.; Swanson, L.; Thorpe, F. G.; Zhu, C. Macromolecules 1996, 29, 918.
69. Pascal, P.; Duhamel, J.; Wang, Y.; Winnik, M. A.; Zhu, X. X.; Macdonald, P. Polymer 1993, 34, 1134.
70. Soutar, I.; Swanson, L. Macromolecules 1994, 27, 4304.
71. Flora, K. K.; Brennan, J. D.; Baker, G. A.; Doody, M. A.; Bright, F. V. Biophys. J. 1998, 75, 1084.
72. Holowka, D.; Wensel. T.; Baird, B. Biochemistry 1990, 29, 4607.
73. Brennan, J. D.; Flora, K. K.; Bendiak, G.; Baker, G. A.; Kane, M.; Pandey, S.; Bright, F. V. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10100.
74. Sorensen, J. B.; Lewin, A. H.; Bowen, J. P. J. Org. Chem. 2001, 66, 4105.