Atomic force microscopic study of low temperature induced disassembly of RecA-dsDNA filaments

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 3, 2008, Pages 1022-1027

  Li, Zhuang ^a   Guo, Cunlan ^b   Song, Yonghai ^b   Wang, Li ^b   Sun, Lanlan ^b   Sun, Yujing ^b   Peng, Chongyang ^b   Liu, Zhelin ^b   Yang, Tao ^b  

^a CHANGCHUN INSTITUTE OF APPLIED CHEMISTRY   (China)

^b UNIVERSITY OF CHINESE ACADEMY OF SCIENCES   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; GLYCEROL; LOW TEMPERATURE EFFECTS; MORPHOLOGY; PROTEINS;

HOMOLOGOUS RECOMBINATION; NUCLEOPROTEIN FILAMENTS;

DNA;

EID: 38949184900     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp077233y     Document Type: Article

References (38)

1. McGrew, D. A.; Knight, K. L. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2003, 38, 385-432.
2. Schlacher, K.; Pham, P.; Cox, M. M.; Goodman, M. F. Chem. Rev. 2006, 106, 406-419.
3. West, S. C.; Cassuto, E.; Mursalim, J.; Howard-Flanders, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1980, 77, 2569-2573.
4. Kowalczykowski, S. C.; Eggleston, A. K. Annu. Rev. Biochem. 1994, 63, 991-1043.
5. Kowalczykowski, S. C.; Clow, J.; Krupp, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1987, 84, 3127-3131.
6. Soltis, D. A.; Lehman, I. R. J. Biol. Chem. 1983, 258, 6073-6077.
7. McEntee, K.; Weinstock, G. M.; Lehman, I. R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1979, 76, 2615-2619.
8. VanLoock, M. S.; Yu, X.; Yang, S. X.; Lai, A. L.; Low, C.; Campbell, M. J.; Egelman, E. H. Structure 2003, 11, 187-196.
9. Shivashankar, G. V.; Feingold, M.; Krichevsky, O.; Libchaber, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 7916-7921.
10. Kowalczykowski, S. C.; Krupp, R. A. J. Mol. Biol. 1987, 193, 97-113.
11. Muniyappa, K.; Williams, K.; Chase, J. W.; Radding, C. M. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 3967-3973.
12. Rajan, R.; Wisler, J. W.; Bell, C. E. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 2463-2471.
13. Zlotnick, A.; Mitchell, R. S.; Steed, R. K.; Brenner, S. L. J. Biol. Chem. 1993, 268, 22525-22530.
14. Di Capua, E.; Engel, A.; Stasiak, A.; Koller, T. J. Mol. Biol. 1982, 157, 87-103.
15. Cox, J. M.; Tsodikov, O. V.; Cox, M. M. PLoS Biol. 2005, 3, 231-243.
16. Masui, R.; Mikawa, T.; Kato, R.; Kuramitsu, S. Biochemistry 1998, 37, 14788-14797.
17. Benight, A. S.; Wilson, D. H.; Budzynski, D. M.; Goldstein, R. F. Biochimie 1991, 73, 143-155.
18. Galletto, R.; Amitani, I.; Baskin, R. J.; Kowalczykowski, S. C. Nature 2006, 443, 875-878.
19. Roca, A. I.; Singleton, S. F. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 15366-15375.
20. Ramreddy, T.; Sen, S.; Rao, B. J.; Krishnamoorthy, G. Biochemistry 2003, 42, 12085-12094.
21. Cazenave, C.; Toulmé, J. J.; Hélène, C. EMBO J. 1983, 2, 2247-2251.
22. Hegner, M.; Smith, S. B.; Bustamante, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 10109-10114.
23. van der Heijden, T.; van Noort, J.; van Leest, H.; Kanaar, R.; Wyman, C.; Dekker, N.; Dekker, C. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 2099-2105.
24. Fulconis, R.; Bancaud, A.; Allemand, J. F.; Croquette, V.; Dutreix, M.; Viovy, J. L. Biophys. J. 2004, 87, 2552-2563.
25. Pugh, B. F.; Cox, M. M. J. Biol. Chem. 1987, 262, 1326-1336.
26. Janicijćvić, A.; Ristic, D.; Wyman, C. J. Microsc. (Oxford) 2003, 212, 264-272.
27. Seong, G. H.; Niimi, T.; Yanagida, Y.; Kobatake, E.; Aizawa, M. Anal. Chem. 2000, 72, 1288-1293.
28. Umemura, K.; Komatsu, J.; Uchihashi, T.; Choi, N.; Ikawa, S.; Nishinaka, T.; Shibata, T.; Nakayama, Y.; Katsura, S.; Mizuno, A.; Tokumoto, H.; Ishikawa, M.; Kuroda, R. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001, 281, 390-395.
29. Sattin, B. D.; Goh, M. C. Biophys. J. 2004, 87, 3430-3436.
30. Shi, W. X.; Larson, R. G. Nano Lett. 2005, 5, 2476-2481.
31. Prévost, C.; Takahashi, M. Q. Rev. Biophys. 2003, 36, 429-453.
32. Li, B. S.; Sattin, B. D.; Goh, M. C. Nano Lett. 2006, 6, 1474-1478.
33. van der Heijden, T.; Moreno-Herrero, F.; Kanaar, R.; Wyman, C.; Dekker, C. Nano Lett. 2006, 6, 3000-3002.
34. Privalov, P. L. Grit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1990, 25, 281-305.
35. Tsai, C. J.; Maizel, J. V.; Nussinov, R. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2002, 37, 55-69.
36. Dyer, R. B.; Maness, S. J.; Franzen, S.; Fesinmeyer, R. M.; Olsen, K. A.; Andersen, N. H. Biochemistry 2005, 44, 10406-10415.
37. Sorel, I.; Piétrement, O.; Hamon, L.; Baconnais, S.; Le Cam, E.; Pastré, D. Biochemistry 2006, 45, 14675-14682.
38. Pastré, D.; Piétrement, O.; Zozime, A.; Le Cam, E. Biopolymers 2005, 77, 53-62.