Binding of porphyrins to tubulin heterodimers

Biomacromolecules

Volumn 8, Issue 12, 2007, Pages 3767-3778

  Tian, Fang ^a   Johnson, Eric M ^a   Zamarripa, Miguel ^a   Sansone, Samuel ^a   Brancaleon, Lorenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS AT SAN ANTONIO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HYDROPHOBICITY; MONOMERS; PORPHYRINS; STOICHIOMETRY;

MICROTUBULES; MOLECULAR SIMULATIONS; PROTOPORPHYRIN; TUBULIN HETERODIMERS;

DIMERS;

ALPHA TUBULIN; BETA TUBULIN; HETERODIMER; HISTIDINE; LYSINE; MONOMER; PHOTOSENSITIZING AGENT; PROTOPORPHYRIN; TETRAKIS(4 SULFOPHENYL)PORPHINE; TRYPTOPHAN;

ABSORPTION SPECTROSCOPY; ARTICLE; BINDING AFFINITY; BINDING SITE; COMPARATIVE STUDY; CONTROLLED STUDY; DRUG PROTEIN BINDING; DRUG SOLUBILITY; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; ENERGY; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; HYDROPHOBICITY; MICROTUBULE ASSEMBLY; MOLECULAR INTERACTION; PHOTOCHEMICAL QUENCHING; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN TARGETING; SIMULATION; STOICHIOMETRY;

BINDING SITES; DIMERIZATION; PORPHYRINS; TUBULIN;

EID: 38049056208     PISSN: 15257797     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bm700687x     Document Type: Article

References (70)

1. Dutcher, S. K. Curr. Opin. Cell Biol. 2001, 13, 49.
2. Amos, L. A.; Lowe, J. Chem. Biol. 1999, 6, R65.
3. Avila, J. FASEB J. 1990, 4, 3284.
4. Lowe, J.; Li, H.; Downing, K. H.; Nogales, E. J. Mol. Biol. 2001, 313, 1045.
5. Bai, R.; Pei, X. F.; Boye, O.; Getahun, Z.; Grover, S.; Bekisz, J.; Nguyen, N. Y.; Brossi, A.; Hamel, E. J. Biol. Chem. 1996, 271, 12639.
6. He, L.; Orr, G. A,; Horwitz, S. B. Drug Discovery Today 2001, 6, 1153.
7. Richards, K. L.; Anders, K. R.; Nogales, E.; Schwartz, K.; Downing, K. H.; Botstein, D. Mol. Biol. Cell 2000, 11, 1887.
8. Downing, K. H.; Nogales, E. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 785.
9. Gabor Miklos, G. L.; Yamamoto, M. T.; Burns, R. G.; Maleszka, R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 5189.
10. Berg, C.; Moan, J. Photochem. Photobiol. 1997, 65, 403.
11. Chen, Y. L.; Lin, S. Z.; Chang, J. Y.; Cheng, Y. L.; Tsai, N. M.; Chen, S. P.; Chang, W. L.; Harn, H. J. Biochem. Pharmacol. 2006, 72, 308.
12. Rappl, C.; Barbier, P.; Bourgarel-Rey, V.; Gregoire, C.; Gilli, R.; Carre, M.; Combes, S.; Finet, J. P.; Peyrot, V. Biochemistry 2006, 45, 9210.
13. Giannakakou, P.; Gussio, R.; Nogales, E.; Downing, K. H.; Zaharevitz, D.; Bollbuck, B.; Poy, G.; Sackett, D.; Nicolaou, K. C.; Fojo, T. Proc. Natl. Acad. Sci. 2000, 97, 2904.
14. Geney, R.; Sun, L.; Pera, P.; Bernacki, R. J.; Xia, S.; Horwitz, S. B.; Simmerling, C. L.; Ojima, I. Chem. Biol. 2005, 12, 339.
15. Han, Y.; Malak, H.; Chaudhary, A. G.; Chordia, M. D.; Kingston, D. G. I.; Bane, S. Biochemistry 1998, 37, 6636.
16. Rao, S.; Orr, G. A.; Chaudahary, A. G.; Kingston, D. G. I.; Horwitz, S. B. J. Biol. Chem. 1995, 270, 20235.
17. Madiraju, C.; Edler, M. C.; Hamel, E.; Raccor, B. S.; Balachandran, R.; Zhu, G.; Giuliano, K. A.; Vogt, A.; Shin, Y.; Fournier, J. H.; Fukui, Y.; Bruckner, A. M.; Curran, D. P.; Day, B. W. Biochemistry 2005, 44, 15053.
18. Gigant, B.; Wang, C.; Ravelli, R. B. G.; Roussi, F.; Steinmetz, M. O.; Curmi, P. A.; Sobel, A.; Knossow, M. Nature 2005, 435, 519.
19. Berg, K.; Moan, J. Photochem. Photobiol. 1992, 56, 333.
20. Boekelheide, K.; Eveleth, J.; Tatum, A. H.; Winkelman, J. W. Photochem. Photobiol. 1987, 46, 657.
21. Fotinos, N.; Campo, M. A.; Popowycz, F.; Gurny, R.; Lange, N. Photochem. Photobiol. 2006, 82, 994.
22. Kennedy, J. C.; Marcus, S. L.; Pottier, R. H. J. Clin. Laser Med. Surg. 1996, 14, 289.
23. Brancaleon, L.; Moseley, H. Biophys. Chem. 2002, 96, 77.
24. Tian, F.; Johnson, K.; Lesar, A. E.; Moseley, H.; Ferguson, J.; Samuel, I. D. W.; Mazzini, A.; Brancaleon, L. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1760, 38.
25. Eftink, M. R.; Ghiron, C. A. Anal. Biochem. 1981, 114, 189.
26. Eftink, M. R. Biophys. J. 1994, 66, 482
27. Lakowicz, J. R. Photochem. Photobiol. 2000, 72, 421.
28. Beltramini, M.; Firey, P. A.; Ricchelli, F.; Rodgers, M. A. J.; Jori, G. Biochemistry 1987, 26, 6852.
29. Waterman-Storer, C. M.; Salmon, E. D. Biophys. J. 1998, 75, 2059.
30. Andrade, S. M.; Costa, S. M. B. Biophys. J. 2002, 82, 1607.
31. Hall, D.; Minton, A. P. Anal. Biochem. 2005, 345, 198.
32. Horowitz, P.; Prasad, V.; Luduena, R. F. J. Biol. Chem. 1984, 259, 14647.
33. Avdulov, N. A.; Chochina, S. V.; Daragan, V. A.; Schroeder, F.; Mayo, K. H.; Wood, W. G. Biochemistry 1996, 35, 340.
34. Bagdonas, S.; Ma, L. W.; Iani, V.; Rotomskis, R.; Juzenas, P.; Moan, J. Photochem. Photobiol. 2000, 72, 186.
35. Cantor, C. R.; Schimmel, P. R. Biophysical Chemistry part II: Techniques for the study of biological structure and function; W.H. Freeman and company: New York, 1980; p 846.
36. Davila, J.; Harriman, A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 2682.
37. Lakowicz, J. R. Principles of fluorescence spectroscopy; Plenum Press: New York, 1983.
38. Sackett, D. L. Biochemistry 1995, 34, 7010.
39. Lakowicz, J. R. Principles of Fluorescence Spectroscopy; Kluwer Academic/Plenum: New York, 1999.
40. Lehrer, S. S. Biochemistry 1971, 10, 3254.
41. Tatikolov, A. S.; Costa, S. M. Pholochem. Photobiol. 2004, 80, 250
42. London, E.; Feigenson, G. W. Biochemistry 1981, 20, 1932.
43. Lehrer, S. S.; Fasman, G. D. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1966, 23, 133.
44. Chipman, D. M.; Grisaro, V.; Sharon, N. J. Biol. Chem. 1967, 242, 4388.
45. Macaroff, P. P.; Oliveira, D. M.; Lacava, Z. G. M.; Azevedo, R. B.; Lima, E. C. D.; Morais, P. C.; Tedesco, A. C. IEEE Trans. Magn. 2004, 40, 3027.
46. Stryer, L. Annu. Rev. Biochem. 1978, 47, 819.
47. Ray, K.; Bhattacharyya, B.; Biswas, B. B. J. Biol. Chem. 1981, 256, 6241.
48. Ricchelli, F.; Stevanin, D.; Jori, G. Photochem. Photobiol. 1988, 48,
49. Brancaleon, L.; Magennis, S. W.; Samuel, I. D. W.; Namdas, E.; Lesar, A.; Moseley, H. Biophys. Chem. 2004, 109, 351.
50. Aveline, B. M.; Hasan, T.; Redmond, R. W. J. Photochem. Photobiol., B 1995, 30, 161.
51. Dahms, T. E. S.; Willis, K. J.; Szabo, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2321.
52. Samanta, U.; Pal, D.; Chakrabarti, P. Proteins 2000, 38, 288.
53. Tanaka, F.; Kaneda, N.; Mataga, N.; Tamai, N.; Yamazaki, I.; Hayashi, K. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6344.
54. Ross, J. B. A.; Schmidt, C. J.; Brand, L. Biochemistry 1981, 20, 4369.
55. Ricchelli, F.; Gobbo, S.; Moreno, G.; Salet, C.; Brancaleon, L.; Mazzini, A. Eur. J. Biochem. 1998, 253, 760.
56. Lang, K.; Mosinger, J.; Wagnerova, D. M. Coord. Chem. Rev. 2004, 248, 321.
57. Ricehelli, F.; Gobbo, S.; Jori, G.; Moreno, G.; Salet, C. Eur. J. Biochem. 1995, 233, 159.
58. Kelbauskas, L.; Bagdonas, S.; Dietel, W.; Rotomskis, R. J. Luminesc. 2003, 101, 253.
59. Raschke, T. M.; Tsai, J.; Levitt, M. Proc. Natl. Acad Sci. 2001, 98, 5965.
60. Rick, S. W.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10488.
61. Canadas, O.; Saenz, A.; Orellana, G.; Casals, C. Anal. Biochem. 2005, 340, 57.
62. Howard, W. D.; Timasheff, S. N. J. Biol. Chem. 1988, 263, 1342.
63. Kumar, N. J. Biol. Chem. 1981, 256, 10435.
64. Uppuluri, S.; Knipling, L.; Sackett, D. L.; Wolff, J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 11598.
65. Sharma, S.; Ganesh, T.; Kingston, D. G.; Bane, S. Anal. Biochem. 2007, 360, 56.
66. Harvey, B. J.; Bell, E.; Brancaleon, L. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2610.
67. Sharma, V. K.; Kalonia, D. S. J. Pharm. Sci. 2003, 92, 890.
68. DeFelippis, M. R.; Murthy, C. P.; Broitman, F.; Weinraub, D.; Faraggi, M.; Ylapper, M. H. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3416.
69. Worthington, P.; Hambright, P.; Williams, R. F. X.; Reid, J.; Burnham, C.; Shamim, A.; Turay, J.; Bell, D. M.; Kirkland, R.; Little, R. G.; Datta-Gupta, N.; Eisner, U. J. Inorg. Biochem. 1980, 12, 281.
70. Rehm, D.; Weller, A. Isr. J. Chem. 1970, 8, 259.