PyFrag-streamlining your reaction path analysis

Journal of Computational Chemistry

Volumn 29, Issue 2, 2008, Pages 312-315

  Van Zeist, Willem Jan ^a   Guerra, Célia Fonseca ^a   Bickelhaupt, F Matthias ^a  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

Author keywords

Activation strain model; ADF; Energy decomposition; Potential energy surfaces; PyFrag

Indexed keywords

ACTIVATION ENERGY; COMPUTER PROGRAMMING; REACTION KINETICS; STRAIN;

ACTIVATION STRAIN MODELS; ENERGY DECOMPOSITION; PYFRAG; REACTION PATH ANALYSIS;

POTENTIAL ENERGY SURFACES;

EID: 37649022903     PISSN: 01928651     EISSN: 1096987X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.20786     Document Type: Review

References (20)

1. de Jong, G. T.; Bickelhaupt, F. M. Chem Phys Chem 2007, 8, 1170-1181.
2. Diefenbach, A.; Bickelhaupt, F. M. J Chem Phys 2001, 115, 4030.
3. Diefenbach, A.; de Jong, G. T.; Bickelhaupt, F. M. Mol Phys 2005, 103, 995.
4. Bickelhaupt, F. M. J Comput Chem 1999, 20, 114.
5. Baerends, E. J.; Autschbach, J. A.; Berces, A.; Bo, C.; Boerrigter, P. M.; Cavallo, L.; Chong, D. P.; Deng, L.; Dickson, R. M.; Ellis, D. E.; Fan, L.; Fischer, T. H.; Fonseca Guerra, C.; van Gisbergen, S. J. A.; Groeneveld, J. A.; Gritsenko, O. V.; Grüning, M.; Harris, F. E.; van den Hoek, P.; Jacobsen, H.; Kessel, G. v.; Kootstra, F.; van Lenthe, E.; McCormack, D. A.; Osinga, V. P.; Patchkovskii, S.; Philipsen, P. H. T.; Post. D.; Pye, C. C.; Ravenek, W.; Ros, P.; Schipper, P. R. T.; Schreckenbach, G.; Snijders, J. G.; Sola, M.; Swan, M.; Swerhone, D.; te Velde, G.; Vernooijs, P.; Versluis, L.; Visser, O.; van Wezenbeek, E.; Wiesenekker, G.; Wolff, S. K.; Woo, T. K.; Ziegler, T.; ADF 2006.01, SCM: Amsterdam, 2006.
6. te Velde, G.; Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. J.; Fonseca Guerra, C.; Van Gisbergen, S. J. A.; Snijders, J. G.; Ziegler, T. J Comput Chem 2001, 22, 931.
7. Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. J.; Nibbering, N. M. M. Chem Eur J 1996, 2, 196.
8. de Jong, G. T.; Visser, R.; Bickelhaupt, F. M. J Organomet Chem 2006, 691, 4341.
9. Diefenbach, A.; de Jong, G. T.; Bickelhaupt, F. M. J Chem Theory Comput 2005, 1, 286.
10. Bickelhaupt, F. M.; Baerends, E. J. In Reviews in Computational Chemistry; Lipkowitz, K. B.; Boyd, D. B., Eds.; Wiley-VCH: New York, 2000, p. 1-86.
11. Baerends, E. J.; Gritsenko, O. V. J Phys Chem A 1997, 101, 5383.
12. Bickelhaupt, F. M.; Nibbering, N. M. M.; Van Wezenbeek, E. M.; Baerends, E. J. J Phys Chem 1992, 96, 4864.
13. Ziegler, T.; Rauk, A. Theor Chim Acta 1977, 46, 1.
14. Ziegler, T.; Rauk, A. Inorg Chem 1979, 18, 1558.
15. Ziegler, T.; Rauk, A. Inorg Chem 1979, 18, 1755.
16. Kitaura, K.; Morokuma, K. Int J Quantum Chem 1976, 10, 325.
17. Morokuma, K. J Chem Phys 1971, 55, 1236.
18. Fonseca Guerra, C.; Handgraaf, J.-W.; Baerends, E. J.; Bickelhaupt, F. M. J Comput Chem 2004, 25, 189.
19. van Bochove, M. A.; Swart, M.; Bickelhaupt, F. M. J Am Chem Soc 2006, 128, 10738.
20. Barone, G.; Fonseca Guerra, C.; Bickelhaupt, F. M. To be submitted 2007.