Structure-activity relationships of αs1-casomorphin using AMI calculations and molecular dynamics simulations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 25, 2007, Pages 7377-7383

  Wu, Yng Ching ^a   Lin, Jenn Sen ^b   Hwang, Chi Chuan ^a  

^a NATIONAL CHENG KUNG UNIVERSITY   (Taiwan)

^b NATIONAL UNITED UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMIDES; CHEMICAL BONDS; COMPUTER SIMULATION; PEPTIDES;

CONFORMER SEARCH; HUMAN BREAST CANCER CELL LINE; TORSIONAL ANGLES;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 34547374979     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp070477y     Document Type: Article

References (42)

1. Aldrich, J. V.; Vigil-Cruz, S. C. Narcotic Analgesics. In Burger's Medicinal Chemistry and Drug Discovery; Abraham, D., Ed.; John Wiley & Sons: New York, 2003; Vol. 6, p 329.
2. Wollemann, M.; Benyhe, S. Life Sci. 2004, 75, 257.
3. Nyberg, F.; Sanderson, K.; Glamsta, E. L. Biopolymers 1997, 43, 147.
4. Zhao, Q.; Garreau, I.; Sannier, F.; Piot, J. M. Biopolymers 1997, 43, 75.
5. Zioudrou, C.; Streaty, R. A.; Klee, W. A. J. Biol. Chem. 1979, 254, 2446.
6. Brantl, V.; Teschemacher, H.; Henschen, A.; Lottspeich, F. Hoppe Seylers Z. Physiol. Chem. 1979, 360, 1211.
7. Kampa, M.; Loukas, S.; Hatzoglou, A.; Martin, P.; Martin, P. M.; Castanas, E. Biochem. J. 1996, 319, 903.
8. Kampa, M.; Bakogeorgou, E.; Hatzoglou, A.; Damianaki, A.; Martin, P. M.; Castanas, E. Eur. J. Pharmacol. 1997, 335, 255.
9. Meisel, H. Biopolymers 1997, 43, 119.
10. Zagon, I. S.; McLaughlin, P. J.; Goodman, S. R.; Rhodes, R. E. J. Natl. Cancer Inst. 1987, 79, 1059.
11. Hatzoglou, A.; Gravanis, A.; Margioris, A. N.; Zoumakis, E.; Castanas, E. J. Clin. Endocrinol. Metab. 1995, 80, 418.
12. Chatikhine, V. A.; Chevrier, A.; Chauzy, C.; Duval, C.; d'Anjou, J.; Girard, N.; Delpech, B. Cancer Lett. 1994, 77, 51.
13. Francois, A.; Chatikhine, V. A.; Chevallier, B.; Ren, G. S.; Berry, M.; Chevrier, A.; Delpech, B. Am. J. Clin. Oncol. 1995, 18, 133.
14. Maneckjee, R.; Biswas, R.; Vonderhaar, B. K. Cancer Res. 1990, 50, 2234.
15. Hatzoglou, A.; Bakogeorgou, E.; Castanas, E. Eur. J. Pharmacol. 1996, 296, 199.
16. Shahabi, N. A.; Sharp, B. M. J. Pharmacol. Exp. Ther. 1995, 273, 1105.
17. Zagon, I. S.; Hytrek, S. D.; McLaughlin, P. J. Am. J. Physiol. 1996, 271, R511.
18. McLaughlin, P. J.; Levin, R. J.; Zagon, I. S. Int. J. Oncol. 1999, 14, 991.
19. Zagon, I. S.; Smith, J. P.; Conter, R.; McLaughlin, P. J. Int. J. Mol Med. 2000, 5, 77.
20. Millan, M. J. Trends Pharmacol. Sci. 1990, 11, 70.
21. Soukara, S.; Maier, C. A.; Predoiu, U.; Ehret, A.; Jackisch, R.; Wünsch, B. J. Med. Chem. 2001, 44, 2814.
22. Holzgrabe, U.; Brand, W. J. Med. Chem. 2003, 46, 1383.
23. Giardina, G.; Clarke, G. D.; Grugni, M.; Sbacchi, M.; Vecchietti, V. Farmaco 1995, 50, 405.
24. Binder, W.; Walker, J. S. Br. J. Pharmacol. 1998, 124, 647.
25. Machelska, H.; Pfluger, M.; Weber, W.; Piranvisseh-Volk, M.; Daubert, J. D.; Dehaven, R.; Stein, C. J. Pharmacol. Exp. Ther. 1999, 290, 354.
26. Ko, M. C.; Butelman, E. R.; Woods, J. H. J. Pharmacol. Exp. Ther. 1999, 289, 378.
27. Ko, M. C.; Willmont, K. J.; Burritt, A.; Hruby, V. J.; Woods, J. H. Eur. J. Pharmacol. 2000, 402, 69.
28. DeHaven-Hudkins, D. L.; Dolle, R. E. Curr. Pharm. Des. 2004, 10, 743.
29. Johnsen, L. B.; Rasmussen, L. K.; Petersen, T. E. and Berglund, L. Biochem. J. 1995, 309, 237.
30. Shenderovich, M. D.; Liao, S.; Qian, X.; Hruby, V. J. Biopolymers 2000, 53, 565.
31. Loew, O. H. Mod. Drug Discovery 1999, 2, 24.
32. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
33. Scott, W. R. P.; Huenenberger, P.; Tironi, I.; Mark, A.; Billeter, S.; Fennen, J.; Torda, A.; Huber, T.; Krueger, P.; van Gunsteren, W. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596.
34. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; vanGunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
35. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
36. Zadina, J. E.; Hackler, L.; Ge, L. J.; Kastin, A. J. Nature 1997, 386, 499.
37. Chang, K. J.; Killian, A.; Hazum, E.; Cuatrecasas, P.; Chang, J. K. Science 1981, 212, 75.
38. Yamazaki, T.; Ro, S.; Goodman, M.; Chung, N. N.; Schiller, P. W. J. Med. Chem. 1993, 36, 708.
39. Keller, M.; Boissard, C.; Patiny, L.; Chung, N. N.; Lemieux, C.; Mutter, M.; Schiller, P. W. J. Med. Chem. 2001, 44, 3896.
40. Wang, Y.; Kuczera, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2555.
41. Mosberg, H. I.; Fowler, C. B. J. Pept. Res. 2002, 60, 329.
42. Przydzial, M. J.; Pogozheva, I. D.; Bosse, K. E.; Andrews, S. M.; Tharp, T. A.; Traynor, J. R.; Mosberg, H. I. J. Pept. Res. 2005, 65, 333.