Tyrosyl rotamer interconversion rates and the fluorescence decays of n-acetyltyrosinamide and short tyrosyl peptides

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 19, 2007, Pages 5494-5502

  Unruh, Jay R ^a   Liyanage, Mangala Roshan ^a   Johnson, Carey K ^a  

^a UNIVERSITY OF KANSAS   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CONFORMATIONS; FLUORESCENCE; MOLECULAR DYNAMICS; PEPTIDES; STEREOCHEMISTRY;

PENTAPEPTIDES; ROTAMERS; TRYPTOPHAN; TYROSINE; TYROSYL PEPTIDES;

AMIDES;

EID: 34249779857     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0645059     Document Type: Article

References (40)

1. Cowgill, R. W. Biochim. Biophys. Acta 1970, 200, 18-25.
2. Cowgill, R. W. Biochim. Biophys. Acta 1967, 133, 6-18.
3. Gauduchon, P.; Wahl, P. Biophys. Chem. 1978, 8, 87-104.
4. Laws, W. R.; Ross, J. B. A.; Wyssbrod, H. R.; Beechem, J. M.; Brand, L.; Sutherland, J. C. Biochemistry 1986, 25, 599-607.
5. Contino, P. B.; Laws, W. R. J. Fluoresc. 1991, 1, 5-13.
6. Ross, J. B. A.; Laws, W. R.; Rousslang, K. W.; Wyssbrod, H. R. Tyrosine Fluorescence and Phosphorescence from Proteins and Polypeptides. In Topics in Fluorescence Spectroscopy;; Lakowicz, J. R., Ed.; Plenum Press: New York, 1992; Vol. 3, pp 1-63.
7. Seidel, C. A. M.; Orth, A.; Gruelich, K.-O. Photochem. Photobiol. 1993, 58, 178-184.
8. Chen, Y.; Barkley, M. D. Biochemistry 1998, 37, 9976-9982.
9. Wiczk, W.; Rzeska, A.; Lukomska, J.; Stachowiak, K.; Karolczak, J.; Malicka, J.; Lankiewicz, L. Chem. Phys. Lett. 2001, 341, 99-106.
10. Noronha, M.; Lima, J. C.; Lamosa, P.; Santos, H.; Maycock, C.; Ventura, R.; Maçanita, A. L. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2155-2166.
11. Guzow, K.; Ganzynkowicz, R.; Rzeska, A.; Mrozek, J.; Szabelski, M.; Karolczak, J.; Liwo, A.; Wiczk, W. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 3879-3889.
12. Petrich, J. W.; Chang, M. C.; McDonald, D. B.; Fleming, G. R. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 3824-3832.
13. Chen, R. F.; Knutson, J. R.; Ziffer, H.; Porter, D. Biochemistry 1991, 30, 5184-5195.
14. Ross, J. B.; Wyssbrod, H. R.; Porter, R. A.; Schwartz, G. P.; Michaels, C. A.; Laws, W. R. Biochemistry 1992, 31, 1585-1594.
15. McMahon, L. P.; Yu, H. T.; Vela, M. A.; Morales, G. A.; Shui, L.; Fronczek, F. R.; McLaughlin, M. L.; Barkley, M. D. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 3269-3280.
16. Ross, J. B. A.; Laws, W. R.; Buku, A.; Sutherland, J. C.; Wyssbrod, H. R. Biochemistry 1986, 25, 607-612.
17. Ross, J. B. A.; Laws, W. R.; Sutherland, J. C.; Buku, A.; Katsoyannis, P. G.; Schwartz, I. L.; Wyssbrod, H. R. Photochem. Photobiol. 1986, 44, 365-370.
18. Kungle, A. J. Biophys. Chem. 1992, 45, 41-50.
19. Guzow, K.; Rzeska, A.; Mrozek, J.; Karolczak, J.; Majewski, R.; Szabelski, M.; Ossowski, T.; Wiczk, W. Photochem. Photobiol 2005, 81, 697-704.
20. Shimizu, O.; Watanabe, J.; Imakubo, K. Photochem. Photobiol. 1979, 29, 915-919.
21. Pal, H.; Palit, D. K.; Mukherjee, T.; Mittal, J. P. J. Photochem. Photobiol, A 1990, 52, 391-409.
22. Harms, G. S.; Pauls, S. W.; Hedstrom, J. F.; Johnson, C. K. J. Fluoresc. 1997, 7, 273-281.
23. Livesey, A. K.; Brochon, J.-C. Biophys. J. 1987, 52, 693-706.
24. Skilling, J.; Bryan, R. K. Mon. Not. R. Astron. Soc. 1984, 211, 111-124.
25. Swaminathan, R.; Periasamy, N. Proc. Indian Acad. Sci. Chem. Sci. 1996, 108, 39-49.
26. Siemiarczuk, A.; Wagner, B. D.; Ware, W. R. J. Phys. Chem. 1990, 94, 1661-1666.
27. Johnson, M. L.; Faunt, L. M. Methods Emymol. 1992, 210, 1-37.
28. Beechem, J. M.; Ameloot, M.; Brand, L. Anal Instrum. 1985, 14, 379-402.
29. Pachler, K. G. R. Spectrochim. Acta 1964, 20, 581-587.
30. Abraham, R. J.; McLauchlan, K. A. Mol. Phys. 1962, 5, 513.
31. Kraszni, M.; Szakàcs, Z.; Noszál, B. Anal. Bioanal. Chem. 2004, 378, 1449-1463.
32. Altona, C.; Francke, R.; de Haan, R.; Ippel, J. H.; Daalmans, G. J.; Westra Hoekzema, A. J. A.; van Wijk, J. Magn. Reson. Chem. 1994, 32, 670-678.
33. Haasnoot, C. A. G.; de Leeuw, F. A. A. M.; Altona, C. Tetrahedron 1980, 36, 2783-2792.
34. Inamoto, N.; Masuda, S. Chem. Lett. 1982, 7, 1003-1006.
35. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R.; Olafson, B.; States, D.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217.
36. Houndonougbo, Y.; Kuczera, K.; Jas, G. S. Biochemistry 2005, 44, 1780-1792.
37. Harms, G. S.; Freund, W. L.; Johnson, C. K. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5004-5010.
38. Lakowicz, J. R.; Gryczynski, I.; Laczko, G.; Wiczk, W. Biophys. Chem. 1993, 47, 33-40.
39. Kobayashi, J.; Higashijima, T.; Nagai, U.; Miyazawa, T. Biochim. Biophys. Acta 1980, 621, 190-203.
40. Nielsen, B. G.; Jensen, M. Ø.; Bohr, H. G. Biopolymers 2003, 71, 577-592.