Methods to probe protein transitions with ATR infrared spectroscopy

Molecular BioSystems

Volumn 3, Issue 6, 2007, Pages 398-407

  Rich, Peter R ^a   Iwaki, Masayo ^a  

^a UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 34249706283     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b702328f     Document Type: Article

References (81)

1. B. Stuart, Infrared Spectroscopy: Fundamentals and Applications, John Wiley & Sons, Chicester, 2004
2. H. Günzler and H.-U. Gremlich, IR Spectroscopy: An Introduction, Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2002
3. W. Mäntele Trends Biochem. Sci. 1993 18 197 202
4. C. Zscherp A. Barth Biochemistry 2001 40 1875 1883
5. K. Gerwert B. Hess J. Soppa D. Oesterhelt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989 86 4943 4947
6. M. S. Braiman O. Bousché K. J. Rothschild Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 2388 2392
7. K. Fahmy F. Jäger M. Beck T. A. Zvyaga T. P. Sakmar F. Siebert Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993 90 10206 10210
8. E. Nabedryk J. Breton R. Hienerwadel C. Fogel W. Mäntele M. L. Paddock M. Y. Okamura Biochemistry 1995 34 14722 14732
9. R. Hienerwadel A. Boussac J. Breton C. Berthomieu Biochemistry 1997 36 14712 14723
10. T. Noguchi M. Sugiura Biochemistry 2002 41 15706 15712
11. D. D. Lemon M. W. Calhoun R. B. Gennis W. H. Woodruff Biochemistry 1993 32 11953 11956
12. E. Nabedryk, B. A. Tavitian, W. Mäntele, and J. Breton, Spectroscopy of biological methods, ed., J. P. Alix,,, L. Bernard,, and, M. Manfait,, Wiley, New York, 1985, 367-369
13. P. R. Rich J. Breton Biochemistry 2001 40 6441 6449
14. R. Rammelsberg B. Hessling H. Chorongiewski K. Gerwert Appl. Spectrosc. 1998 51 558 562
15. T. Iwase C. Varotsis K. Shinzawa-Itoh S. Yoshikawa T. Kitagawa J. Am. Chem. Soc. 1999 121 1415 1416
16. H. Kandori Biochim. Biophys. Acta 2000 1460 177 191
17. T. Noguchi Photosynth. Res. 2007 91 59 69
18. D. Moss E. Nabedryk J. Breton W. Mäntele Eur. J. Biochem. 1990 187 565 572
19. C. Berthomieu A. Boussac W. Mäntele J. Breton E. Nabedryk Biochemistry 1992 31 11460 11471
20. D. D. Schlereth W. Mäntele Biochemistry 1992 31 7494 7502
21. M. Ritter O. Anderka B. Ludwig W. Mäntele P. Hellwig Biochemistry 2003 42 12391 12399
22. P. Hellwig J. Behr C. Ostermeier O.-M. H. Richter U. Pfitzner A. Odenwald B. Ludwig H. Michel W. Mäntele Biochemistry 1998 37 7390 7399
23. P. Hellwig D. Scheide S. Bungert W. Mäntele T. Friedrich Biochemistry 2000 39 10884 10891
24. P. Hellwig U. Pfitzner J. Behr B. Rost P. Pesavento W. v. Donk R. B. Gennis H. Michel B. Ludwig W. Mäntele Biochemistry 2002 41 9116 9125
25. S. A. Tatulian Biochemistry 2003 42 11898 11907
26. R. M. Nyquist K. Ataka J. Heberle ChemBioChem 2004 3 431 436
27. H. Marrero K. J. Rothschild FEBS Lett. 1987 223 289 293
28. E. Goormaghtigh V. Raussens J.-M. Ruysschaert Biochim. Biophys. Acta 1999 1422 105 185
29. J. E. Baenziger K. W. Miller K. J. Rothschild M. P. McCarthy Biophys. J. 1992 62 64 66
30. M. Iwaki S. Andrianambinintsoa P. R. Rich J. Breton Spectrochim. Acta, Part A 2002 58 1523 1533
31. M. Iwaki L. Giotta A. O. Akinsiku H. Schägger N. Fisher J. Breton P. R. Rich Biochemistry 2003 42 11109 11119
32. K. J. Rothschild M. Zagaeski W. A. Cantore Biochem. Biophys. Res. Commun. 1981 103 483 489
33. W. Mäntele E. Nabedryk B. A. Tavitian W. Kreutz J. Breton FEBS Lett. 1985 187 227 232
34. W. Uhmann A. Becker C. Taran F. Siebert Appl. Spectrosc. 1991 45 390 397
35. R. B. Dyer K. A. Peterson P. O. Stoutland W. H. Woodruff Biochemistry 1994 33 500 507
36. M. Lübben K. Gerwert FEBS Lett. 1996 397 303 307
37. J. Heberle C. Zscherp Appl. Spectrosc. 1996 50 588 596
38. P. R. Rich J. Breton Biochemistry 2002 41 967 973
39. T. Okubo T. Noguchi Spectrochim. Acta, Part A 2007 66 863 868
40. M. Iwaki P. R. Rich J. Am. Chem. Soc. 2007 129 2923 2929
41. A. Barth W. Kreutz W. Mäntele FEBS Lett. 1990 277 147 150
42. D. Marshall N. Fisher L. Grigic V. Zickermann U. Brandt R. J. Shannon J. Hirst R. Lawrence P. R. Rich Biochemistry 2006 45 5458 5467
43. A. Osyczka H. Zhang C. Mathé P. R. Rich C. C. Moser P. L. Dutton Biochemistry 2006 45 10492 10503
44. E. A. Gorbikova K. Vuorilehto M. Wikström M. I. Verkhovsky Biochemisry 2006 45 5641 5649
45. K. Ataka J. Heberle J. Am. Chem. Soc. 2004 126 9445 9457
46. K. Ataka F. Giess W. Knoll R. Naumann S. Haber-Pohlmeier B. Richter J. Heberle J. Am. Chem. Soc. 2004 126 16199 16206
47. J. E. Baenziger K. W. Miller K. J. Rothschild Biochemistry 1993 32 5448 5454
48. R. M. Nyquist D. Heitbrink C. Bolwien T. A. Wells R. Gennis J. Heberle FEBS Lett. 2001 505 63 67
49. R. M. Nyquist D. Heitbrink C. Bolwien R. B. Gennis J. Heberle Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 8715 8720
50. M. Iwaki A. Puustinen M. Wikström P. R. Rich Biochemistry 2006 45 10873 10885
51. M. Iwaki P. R. Rich J. Am. Chem. Soc. 2004 126 2386 2389
52. M. Iwaki N. P. J. Cotton P. G. Quirk P. R. Rich J. B. Jackson J. Am. Chem. Soc. 2006 128 2621 2629
53. J. Guijarro M. Engelhard F. Siebert Biochemistry 2006 45 11578 11588
54. M. Iwaki A. Puustinen M. Wikström P. R. Rich Biochemistry 2003 42 8809 8817
55. P. R. Rich Biochem. Soc. Trans. 2003 31 1095 1105
56. P. Nicholls G. A. Chanady Biochim. Biophys. Acta 1981 634 256 265
57. T. Tsukihara H. Aoyama E. Yamashita T. Tomizaki H. Yamaguchi K. Shinzawa-Itoh R. Nakashima R. Yaono S. Yoshikawa Science 1996 272 1136 1144
58. O. C. Mather A. Singh G. I. van Boxel S. A. White J. B. Jackson Biochemistry 2004 43 10952 10964
59. K. Fahmy Biophys. J. 1998 75 1306 1318
60. S. Gourion-Arsiquaud S. Chevance P. Bouyer L. Garnier J.-L. Montillet A. Bondon C. Berthomieu Biochemistry 2005 44 8652 8663
61. S. Y. Venyaminov N. N. Kalnin Biopolymers 1990 30 1243 1257
62. K. Rahmelow W. Hübner Th. Ackermann Anal. Biochem. 1998 257 1 11
63. A. Barth Prog. Biophys. Mol. Biol. 2000 74 141 173
64. A. Barth C. Zscherp Q. Rev. Biophys. 2002 35 369 430
65. P. R. Rich, and M. Iwaki, Biophysical and Structural Aspects of Bioenergetics, ed., M. Wikström,, The Royal Society of Chemistry, Cambridge, U.K., 2005, pp. 314-333
66. M. Wolpert P. Hellwig Spectrochim. Acta, Part A 2006 64 987 1001
67. S. Sonar X.-M. Liu C.-P. Lee M. Coleman Y.-W. He S. Pelletier J. Herzfeld U. L. RajBhandry K. J. Rothschild J. Am. Chem. Soc. 1995 117 11614 11615
68. S. Sonar C.-P. Lee M. Coleman N. Patel X. Liu T. Marti H. Gobind Khorana U. L. RajBhandry K. J. Rothschild Nat. Struct. Biol. 1994 1 512 517
69. J. B. Foresman and Æ. Frisch, Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, USA, 2nd edn, 1996
70. C. Kolano J. Helbing M. Kozinski W. Sander P. Hamm Nature 2006 444 469 472
71. W. Zhuang D. Abramavicius S. Mukamel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18934 18938
72. M. L. Groot L. J. G. W. van Wilderen D. S. Larsen M. A. van der Horst I. H. M. van Stokkum K. J. Hellingwerf R. van Grondelle Biochemistry 2003 42 10054 10059
73. K. J. Rothschild N. A. Clark Biophys. J. 1979 25 473 487
74. F. Garczarek K. Gerwert J. Am. Chem. Soc. 2006 128 28 29
75. K. L. A. Chan S. G. Kazarian J. Comb. Chem. 2005 7 185 189
76. S. G. Kazarian K. L. A. Chan Biochim. Biophys. Acta 2006 1758 858 867
77. E. J. Houser T. E. Mlsna V. K. Nguyen R. Chung R. L. Mowery R. A. McGill Talanta 2001 54 469 485
78. M. Jacoby Chem. Eng. News 2003, March 31 35 36
79. G. N. Hebert M. A. Odom S. C. Bowman S. H. Strauss Anal. Chem. 2004 76 781 787
80. T. Noguchi M. Sugiura Biochemistry 12-9-2000 39 10943 10949
81. F. Garczarek K. Gerwert Nature 2006 439 109 112