Electrostatically embedded many-body expansion for large systems, with applications to water clusters

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 3, Issue 1, 2007, Pages 46-53

  Dahlke, Erin E ^a   Truhlar, Donald G ^a  

^a University of Minnesota   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 34248152064     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct600253j     Document Type: Article

References (73)

1. Newton, M. D.; Boer, F. P.; Lipscomb, W. N. J. Am. Chem. Soc. 1966, 88, 2353.
2. Degand, P.; Leroy, G.; Peeters, D. Theor. Chim. Acta 1973, 30, 243.
3. Niessen, W. V. Theor. Chim. Acta 1973, 31, 111.
4. Stechel, E. B. In Domain-Based Parallelism and Problem Decomposition in Computational Science and Engineering; Keyes, D. R., Saad, Y., Truhlar, D. G., Eds.; SIAM: Philadelphia, PA, 1995; p 217.
5. Maseras, F.; Morokuma, K. J. Comput. Chem. 1995, 16, 1170.
6. Svensson, M.; Humbel, S.; Froese, R. D. J.; Matsubara, T.; Seiber, S.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 19357.
7. Humbel, S.; Sieber, S.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1959.
8. Lee, T.-S.; York, D. M.; Yang, W. J. Chem. Phys. 1996, 105, 2744.
9. Svensson, M.; Humbel, S.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 3654.
10. White, C. A.; Johnson, B. G.; Gill, P. M. W.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1996, 253, 268.
11. Challacombe, M.; Schwegler, E. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5526.
12. Sierka, J.; Sauer, J. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1997, 106, 41.
13. Combined Quantum Mechanical and Molecular Mechanical Methods; Gao, J., Thompson, M. A., Eds.; ACS Symp. Ser. 712; American Chemical Society: Washington, DC, 1998.
14. Galli, G. Comput. Mater. Sci. 1998, 12, 242.
15. Scuseria, G. E.; Ayala, P. Y. J. Chem. Phys. 1999, 111, 8330.
16. Kitaura, K.; Sawai, T.; Asada, T.; Nakano, T.; Uebayasi, M. Chem. Phys. Lett. 1999, 312, 319.
17. Kitaura, K.; Ikeo, E.; Asada, T.; Nakano, T.; Uebayasi, M. Chem. Phys. Lett. 1999, 313, 701.
18. Amara, P.; Field, M. J.; Alhambra, C.; Gao, J. Theor. Chem. Acc. 2000, 104, 336.
19. Papanicolaou, N. I.; Kallinteris, G. C.; Evangelakis, G. A.; Papaconstantopoulos, D. Comput. Mater. Sci. 2000, 17, 224.
20. Sherwood, P. In Modern Methods and Algorithms of Quantum Chemistry; Grotendurst, J., Ed.; NIC Ser. 3; Neumann Institute for Computing: Jülich, 2000; p 285.
21. Nakano, T.; Kaminuma, T.; Sato, T.; Akiyama, Y.; Uebayasi, M.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2000, 318, 614.
22. Gao, J.; Truhlar, D. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 2002, 53, 467.
23. Titmuss, S. J.; Cummins, P. L.; Rendall, A. P.; Bliznyuk, A. A.; Gready, J. E. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1314.
24. Nakano, T.; Kaminuma, T.; Sato, T.; Fukuzawa, K.; Akiyama, Y.; Uebayasi, M.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 351, 475.
25. Zhang, D. W.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2003, 119, 3599.
26. Zhang, D. W.; Chen, X. H.; Zhang, J. Z. H. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1846.
27. Assfeld, X.; Ferré, N.; Rivail, J.-L. Theor. Chem. Acc. 2004, 111, 328.
28. Federov, D. G.; Olson, R. M.; Kitaura, K.; Gordon, M. S.; Koseki, S. J. Comput. Chem. 2004, 25, 872.
29. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2004, 120, 6832.
30. Fedorov, D. G.; Kitaura, K. Chem. Phys. Lett. 2004, 389, 129.
31. Re, S.; Morokuma, K. Theor. Chem. Acc. 2004, 112, 59.
32. Miyazaki, T.; Bowler, D. R.; Choudhury, R.; Gillan, M. J. J. Chem. Phys. 2004, 121, 6186.
33. Staszewska, G.; Staszewski, P.; Schultz, N. E.; Truhlar, D. G. Phys. Rev. B 2005, 71, 45423.
34. Wada, M.; Sakurai, M. J. Comput. Chem. 2005, 26, 160.
35. He, X.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2005, 122, 31103.
36. Deev, V.; Collins, M. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 154102.
37. Monard, G.; Bernal-Uruchurtu, van der Vaart, A.; Merz, K. M., Jr.; Ruiz-López, M. F. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3425.
38. Federov, D. G.; Kitaura, K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 134103.
39. Lin, H.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3991.
40. Federov, D. G.; Kitaura, K.; Li, H.; Jensen, J. H.; Gordon, M. S. J. Comput. Chem. 2006, 27, 976.
41. Ishida, T.; Federov, D. G.; Kitaura, K. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1457.
42. Canfield, P.; Dahlborn, M. G.; Hush, N. S.; Reimers, J. R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 24301.
43. Jiang, N.; Ma, J.; Jiang, Y. J. Chem. Phys. 2006, 124, 114112.
44. He, X.; Zhang, J. Z. H. J. Chem. Phys. 2006, 124, 184703.
45. Vashista, P.; Kalia, R. K.; Nakano, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3727.
46. Pople, J. A. Rev. Mod. Phys. 1999, 71, 1267.
47. Kohn, W. Rev. Mod. Phys. 1999, 71, 1253.
48. Bowen, J. P.; Allinger, N. L. Rev. Comput. Chem. 1991, 2, 81.
49. Dinur, U.; Hagler, A. T. Rev. Comput. Chem. 1991, 2, 99.
50. Dahlke, E. E.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2006, 109, 15677.
51. Elrod, M. J.; Saykally, R. J. Chem. Rev. 1994, 94, 1975.
52. Xantheas, S. S. J. Chem. Phys. 1994, 100, 7523.
53. Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.
54. Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.
55. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
56. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
57. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623.
58. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. In Ab Intio Molecular Orbital Theory; Wiley: New York, 1986.
59. Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Theor. Chem. Acc. 2005, 113, 133.
60. Storer, J. W.; Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput.-Aided Mol. Des. 1995, 9, 87.
61. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
62. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennueci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Koinaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.01 ed.; Gaussian, Inc.: Wallingibrd, CT, 2004.
63. Chamberlin, A. C.; Kelly, C. P.; Thompson, J. D.; Xidos, J. D.; Li, J.; Hawkins, G. D.; Winget, P. D.; Zhu, T.; Rinaldi, D.; Liotard, D. A.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G.; Frisch, M. J. MN-GSM, version 6.0; University of Minnesota: Minneapolis, MN 55455-0431, 2006.
64. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865.
65. Møller, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 618.
66. Xantheas, S. S.; Burnham, C. J.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1493.
67. Xantheas, S. S.; Aprà, E. J. Chem. Phys. 2004, 120, 823.
68. Kendall, R. A.; Dunning, T. H., Jr.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796.
69. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.
70. Wales, D. J.; Doye, J. P. K.; Dullweber, A.; Hodges, M. P.; Naumkin, F. Y.; Calvo, F.; Hernández-Rojas, J.; Middleton, T. F. Cambridge Cluster Database. http:// www-wales.ch.cam.ac.uk/CCD.html (accessed March 8. 2006).
71. Mohoney, M. W.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Phys. 2000, 112, 8910.
72. James, T.; Wales, D. J.; Hernández-Rojas, J. Chem. Phys. Lett. 2005, 415, 302.
73. Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 479.