Direct-PCR detection and epidemiology of Ramularia collo-cygni associated with barley necrotic leaf spots

Journal of Phytopathology

Volumn 155, Issue 5, 2007, Pages 281-288

  Frei, P ^a   Gindro, K ^a   Richter, H ^a   Schurch S ^a  

^a AGROSCOPE   (Switzerland)

Author keywords

Aetiology; Direct polymerase chain reaction; Disease complex; Latent infections; Ramularia collo cygni

Indexed keywords

ASSAY; BARLEY; DETECTION METHOD; DISEASE; EPIDEMIOLOGY; ETIOLOGY; FUNGUS; LEAF; PATHOGEN; POLYMERASE CHAIN REACTION;

CENTRAL EUROPE; EURASIA; EUROPE; SWITZERLAND;

FUNGI; HORDEUM; RAMULARIA COLLO-CYGNI;

EID: 34247178501     PISSN: 09311785     EISSN: 14390434     Source Type: Journal    
DOI: 10.1111/j.1439-0434.2007.01228.x     Document Type: Article

References (28)

1. Brönimann A. (1988) Tätigkeitsbericht über die Jahre 1986 und 1987 aus der Eidg. Forschungsanstalt für Landw. Pflanzenbau Zürich-Reckenholz, p. 199.
2. Caron D. La ramulariose, nouvelle maladie de l'orge en France, Tours, France, AFPP septième conférence internationale sur les maladies des plantes, 3-5 December, 2003
3. Cromey MG, Harvey IC, Sheridan EJ, Grbavag N. Occurrence, importance and control of Ramularia collo-cygni in New Zealand. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 337-342.
4. Djurle A, Rasmussen M. Ramularia Leaf Spot in Barley. A New Disease in Sweden? In: von Tiedemann A, Schützendübel A, Koopman B (eds), Book of abstracts of the First European Ramularia Workshop, 12-14 March 2006, Georg-August University Göttingen, Germany, 2006, p. 16.
5. Frei P, Gindrat D. (2000) Le champignon Ramularia collo-cygni provoque une forme de grillures sur les feuilles d'orge d'automne et de graminées adventices. Rev Suisse Agric 32:229-233.
6. Gindrat D, Frei P. (1999) Les taches physiologiques ou grillures des feuilles des céréales. Revue suisse Agric 31:119-125.
7. Gindrat D, Frei P, Corbaz R, Do TD. (1991) Cas notables de maladies des plantes provoquées par des champignons en Suisse romande en 1988-1990. Revue suisse Agric 23:155-162.
8. Gindro K, Pezet R, Viret O, Richter H. (2005) Development of a rapid and highly sensitive direct-PCR assay to detect a single spore of Botrytis cinerea Pers.:Fr in vitro and quiescent forms in planta. Vitis 44:139-142.
9. Havis ND, Oxley SJ. Investigating the Life Cycle of Ramularia collo-cygni using a PCR based Diagnostic. In: von Tiedemann A, Schützendübel A, Koopman B (eds), Book of abstracts of the First European Ramularia Workshop, 12-14 March 2006, Georg-August University Göttingen, Germany, 2006, p. 15.
10. Havis ND, Piper SR, Oxley SJP, Langrell SRH. Development of a PCR-based identification and detection assay for Ramularia collo-cygni direct from barley leaf tissue. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 343-350.
11. Havis ND, Oxley SJ, Piper SR, Langrell SR. (2006) Rapid nested PCR-based detection of Ramularia collo-cygni direct from barley. FEMS Microbiol Lett 256:217-223.
12. Heiser I, Miethbauer S. Phytotoxins from Ramularia collo-cygni - Mode of Action and Contribution to Pathogenicy. In: von Tiedemann A, Schützendübel A, Koopman B (eds), Book of Abstracts of the First European Ramularia Workshop, 12-14 March 2006, Georg-August University Göttingen, Germany, 2006, p. 18.
13. Huss H, Mayerhofer H, Wetching W. (1987) Ophiocladium hordei CAV (Fungi imperfecti), ein für Österreich neuer parasitärer Pilz der Gerste. Pflanzenarzt 40:167-169.
14. Huss H, Formayer H, Staabentheiner E. (2003) Die Sprenkelkrankheit weiter auf dem Vormarsch! Pflanzenarzt 5:8-11.
15. Meier U. Growth Stages of Mono- and Dicotyledonous Plants, BBCH Monograph, Federal Biological Research Centre for Agriculture and Forestry, 2nd edn. Available at: http://www.bba.de/veroeff/bbch/bbcheng.pdf, 2001, (last access 18.12.2006).
16. Miethbauer S, Heiser I, Sachs E, Liebermann B. Anthraquinone derivatives biosynthesized by Ramularia collo-cygni caused the barley leaf spot disease. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 376-380.
17. Minaříková V, Mařik P, Stemberková L. Occurrence of a new fungal pathogen on barley, Ramularia collo-cygni, in the Czech Republic. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 360-364.
18. O'Sullivan E. Ramularia collo-cygni - a new pathogen associated with spotting of barley in Ireland. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 385-390.
19. Obst A, Baumer M, Huber G. (1995) Nichtparasitär bedingte Blattverbräunungen bei Gerste - Ein Problem mit zunehmender Bedeutung? Gesunde Pflanz 47:308-314.
20. Obst A, Baumer M, Schnitzler JP. (1996) Nichtparasitär bedingte Blattverbräunungen bei Gerste - Schadgeschehen und Ursachen. Mitt Biol Bundesanst 7/98:21-29.
21. Pinnschmitt HO, Christiansen AE, Sindberg SA. Expression of Resistance of Barley Varieties to Ramularia Leaf Spot and the Status of the Disease in Denmark. In: von Tiedemann A, Schützendübel A, Koopman B (eds), Book of Abstracts of the First European Ramularia Workshop, 12-14 March 2006, Georg-August University Göttingen, Germany, 2006, p. 22.
22. Sachs E. (2000) Das Auftreten der Ramularia-Blattfleckenkrankheit an Gerste in Bayern 1999, verursacht durch Ramularia collo-cygni Sutton & Waller. Nachrichtenbl Deut Pflanzenschutzd 52:160-163.
23. Sachs E. (2002) Monitoring zur Verbreitung der Ramularia- Blattfleckenkrankheit an Wintergerste in Deutschland im Jahr 2000. Nachrichtenbl Deut Pflanzenschutzd 54:31-35.
24. Sachs E, Amelung D, Klappach K. (1998) Die Symptome der Netzfleckenkrankheit der Gerste hervorgerufen durch Drechslera teres (Sacc.) Shoem. und deren Verwechslungsmöglichkeiten. Nachrichtenbl Deut Pflanzenschutzd 50:58-63.
25. Salamati S. Occurrence of Ramularia collo-cygni on spring barley in Norway. In: Yahyaoui AH, Brader L, Tekauz A, Wallwork H, Steffenson B (eds), Proceedings of the Second International Workshop on Barley Leaf Blights, 7-11 April 2002, Aleppo, Syria, ICARDA, 2004, pp. 355-359.
26. Sutton BC, Waller JM. (1988) Taxonomy of Ophiocladium hordei, causing leaf lesions on Triticale and other Gramineae. Trans Br Mycol Soc 90:55-61.
27. Tschöppe O, Sachs E. (2001) Die Farbstoffbildung von Ramularia collo-cygni Sutton & Waller als Grundlage für eine Schnelldiagnose. Nachrichtenbl Deut Pflanzenschutzd 53:162-165.
28. White TJ, Bruns T, Lee S, Taylor JL. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis MA, Gelfand DH, Sninsky JJ, White TJ (eds), PCR Protocols. A Guide to Methods and Applications, San Diego, CA, USA, Academic Press, 1990, pp. 315-322.