A tryptophan rotamer located in a polar environment probes pH-dependent conformational changes in bovine β-lactoglobulin A

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 10, 2007, Pages 2610-2620

  Harvey, Billie J ^a   Bell, Erin ^a   Brancaleon, Lorenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS AT SAN ANTONIO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CONFORMATIONS; DEPROTONATION; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; PH EFFECTS; X RAY ANALYSIS;

CONFORMATIONAL CHANGE; TERTIARY STRUCTURE; TRYPTOPHAN ROTAMER;

PROTEINS;

EID: 34047265288     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp065783a     Document Type: Article

References (54)

1. Katakura, Y.; Totsuka, M.; Ametani, A.; Kaminogawa, S. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1207, 58.
2. Renard, D.; Lefebvre, J.; Griffin, M. C. A.; Griffin, W. G. Int. J. Biol. Macromol. 1998, 22, 41.
3. Creamer, L. K. Biochemistry 1995, 34, 7170.
4. Qi, X. L.; Holt, C.; McNulty, D.; Clarke, D. T.; Brownlow, S.; Jones, G. R. Biochem. J. 1997, 324, 341.
5. Galani, D.; Apenten, R. K. O. Food Res. Int. 1999, 32, 93.
6. D'Alfonso, L.; Collini, M.; Baldini, G. Biochemistry 2002, 41, 326.
7. Blanch, E. W.; Hecht, L.; Barron, L. D. Protein Sci. 1999, 8, 1362.
8. Cho, Y.; Batt, C. A.; Sawyer, L. J. Biol. Chem. 1994, 269, 11102.
9. Collini, M.; D'Alfonso, L.; Baldini, G. Protein Sci. 2000, 9, 1968.
10. D'Alfonso, L.; Collini, M.; Baldini, G. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1432, 194.
11. Lange, D. C.; Kothari, R.; Patel, R. C.; Patel, S. C. Biophys. Chem. 1998, 74, 45.
12. Marden, M. C.; Dufour, E.; Christova, P.; Huang, Y.; Leclerc-L'Hostis, E.; Haertle, T. Arch. Biochem. Biophys. 1994, 311, 258.
13. Tian, F.; Johnson, K.; Lesar, A. E.; Moseley, H.; Ferguson, J.; Samuel, I. D. W.; Mazzini, A.; Brancaleon, L. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1760, 38.
14. Kontopidis, G.; Holt, C.; Sawyer, L. J. Mol. Biol. 2002, 318, 1043.
15. Qin, B. Y.; Bewley, M. C.; Creamer, L. K.; Baker, H. M.; Baker, E. N.; Jameson, G. B. Biochemistry 1998, 37, 14014.
16. Brownlow, S.; Morais Cabrai, J. H.; Cooper, R.; Flower, D. R.; Yewdall, S. J.; Polikarpov, I.; North, A. C. T.; Sawyer, L. Structure 1997, 5, 481.
17. Busti, P.; Scarped, S.; Gatti, C.; DeLorenzi, N. Food Res. Int. 2002, 35, 871.
18. Gasymov, O. K.; Abduragimov, A. R.; Yusifov, T. N.; Glasgow, B. J. Biochemistry 2002, 41, 8837.
19. Crougennec, T.; Molle, D.; Mehra, R.; Bouhallab, S. Protein Sci. 2004, 13, 1340.
20. Fessas, D.; Iametti, S.; Schiraldi, A.; Bonomi, F. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 5439.
21. Dong, A.; Matsuura, J.; Allison, S. D.; Chrisman, E.; Manning, M. C.; Carpenter, J. F. Biochemistry 1996, 35, 1450.
22. Vetri, V.; Militello, V. Biophys. Chem. 2005, 113, 83.
23. Hoffmann, M. A. M.; van Mil, P. J. J. M. J. Agric. Food Chem. 1997, 45, 2942.
24. Portugal, C. A. M.; Crespo, J. G.; Lima, J. C. J. Photochem. Photobiol, B 2006, 82, 117.
25. Kundu, S.; Melton, J. S.; Sorensen, D. C.; Phillips, G. N. Biophys. J. 2002, 83, 723.
26. Smith, D. K.; Radivojac, P.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K.; Zhu, G. Protein Sci. 2003, 12, 1060.
27. Radivojac, P.; Obradovic, Z.; Smith, D. K.; Zhu, G.; Vucetic, S.; Brown, C. J.; Lawson, J. D.; Dunker, A. K. Protein Sci. 2004, 13, 71.
28. Yuan, Z.; Bailey, T. L.; Teasdale, R. D. Proteins 2005, 58, 905.
29. Qin, B. Y.; Creamer, L. K.; Baker, E. N.; Jameson, G. B. FEBS Lett. 1998, 438, 272.
30. Qi, X. L.; Brownlow, S.; Holt, C.; Sellers, P. Biochim. Biophys. Acta 1995, 1248, 43.
31. Dufour, E.; Marden, M. C.; Haertle, T. FEBS Lett. 1990, 277, 223.
32. Gasymov, O. K.; Abduragimov, A. R.; Yusifov, T. N.; Glasgow, B. J. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1433, 307.
33. Weber, G. Biochem. J. 1960, 75, 335.
34. Samanta, U.; Pal, D.; Chakrabarti, P. Proteins 2000, 38, 288.
35. Nanda, V.; Brand, L. Proteins 2000, 40, 112.
36. Hennecke, J.; Sillen, A.; Huber-Wunderlich, M.; Engelborghs, Y.; Glockshuber, R. Biochemistry 1997, 36, 6391.
37. Vivian, J. T.; Callis, P. R. Biophys. J. 2001, 80, 2093.
38. Lakowicz, J. R. Photochem. Photobiol. 2000, 72, 421.
39. Dahms, T. E. S.; Willis, K. J.; Szabo, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2321.
40. Eftink, M. R.; Chiron, C. A. Anal. Biochem. 1981, 114, 189.
41. Eftink, M. R. Biophys. J. 1994, 66, 482.
42. Durbin, J.; Watson, G. S. Biometrika 1951, 38, 159.
43. Tanford, C.; Bunville, L. G.; Nozaki, Y. J. Am. Chem. Soc. 1959, 81, 4032.
44. Knutson, J. R.; Walbridge, D. G.; Brand, L. Biochemistry 1982, 21, 4671.
45. Ross, J. B. A.; Schmidt, C. J.; Brand, L. Biochemistry 1981, 20, 4369.
46. Merola, F.; Rigler, R.; Holmgren, A.; Brochon, J. C. Biochemistry 1989, 28, 3383.
47. Tanaka, F.; Kaneda, N.; Mataga, N.; Tamai, N.; Yamazaki, I.; Hayashi, K. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6344.
48. Szabo, A. G.; Rayner, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 554.
49. Kuwata, K.; Hoshino, M.; Forge, V.; Era, S.; Batt, C. A.; Goto, Y. Protein Sci. 1999, 5, 2541.
50. Koenig, S.; Muller, L.; Smith, D. K. Chem.-Eur. J. 2001, 7, 979.
51. Fukamizo, T.; Juffer, A. H.; Voge, H. J.; Honda, Y.; Tremblay, H.; Boucher, I.; Neugebauer, W. A.; Brzezinski, R. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25633-25640.
52. Berkovitch, F.; Nicolet, Y.; Wan, J. T.; Jarrett, J. T.; Drennan, C. L. Science 2004, 303, 76.
53. Kim, J.; Mao, J.; Gunner, M. R. J. Mol Biol. 2005, 348, 1283-1298.
54. Uhrinova, S.; Smith, M. H.; Jameson, G. B.; Uhrin, D.; Sawyer, L.; Barlow, P. N. Biochemistry 2000, 39, 3565.