Detection of nucleic acids in situ: Novel oligonucleotide analogues for target-assembled DNA-mounted exciplexes

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 5, Issue 7, 2007, Pages 1039-1051

  Bichenkova, Elena V ^a   Gbaj, Abdul ^a   Walsh, Lindsey ^a   Savage, Hannah E ^a   Rogert, Candelaria ^a,b   Sardarian, Ali R ^a,c   Etchells, Laura L ^a   Douglas, Kenneth T ^a  

^a UNIVERSITY OF MANCHESTER   (United Kingdom)

^b Solexa Ltd   (United Kingdom)

^c SHIRAZ UNIVERSITY   (Iran)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE; LIGHT EMISSION; MOLECULAR DYNAMICS; OLIGONUCLEOTIDES; ORGANIC SOLVENTS; PYRENE;

DUPLEX STRUCTURE; EXCIPLEX PARTNERS; FLUORESCENCE DETECTION; MOLECULAR LEVEL;

DNA;

EID: 33947545142     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b700293a     Document Type: Article

References (43)

1. E. V. Bichenkova A. Sardarian H. E. Savage C. Rogert K. T. Douglas Assay Drug Develop. Technol. 2005 3 39 46
2. K. Ebata M. Masuko H. Ohtani M. Jibu Nucleic Acids Symp. Ser. 1995 34 187 188
3. K. Ebata M. Masuko H. Ohtani M. Kashiwasake-Jibu Photochem. Photobiol. 1995 62 836 839
4. M. Masuko S. Ohuchi K. Sode H. Ohtani A. Shimadzu Nucleic Acids Symp. Ser. 1998 39 111 112
5. M. Masuko H. Ohtani K. Ebata A. Shimadzu Nucleic Acids Res. 1998 26 5409 5416
6. M. Masuko K. Ebata H. Ohtani Nucleic Acids Symp. Ser. 1996 35 165 166
7. A. Shimadzu H. Ohtani S. Ohuchi K. Sode M. Masuko Nucleic Acids Symp. Ser. 1998 39 45 46
8. P. L. Paris J. M. Langenhan E. T. Kool Nucleic Acids Res. 1998 26 3789 3793
9. J. B. Birks, Organic Molecular Photophysics, Wiley, London, 1973, vol. 1
10. J. B. Birks, Photophysics of Aromatic Molecules, Wiley, London, 1970
11. H. Kashida H. Asanuma M. Komiyama Chem. Commun. 2006 2768 2770
12. E. V. Bichenkova H. E. Savage A. R. Sardarian K. T. Douglas Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005 332 956 964
13. H. Kashida M. Komiyama H. Asanuma Chem. Lett. 2006 35 934 935
14. D. Rehm A. Weller Z. Phys. Chem. (Munich) 1970 69 183 200
15. S. Masaki T. Okada N. Mataga Y. Sakata S. Misumi Bull. Chem. Soc. Jpn. 1976 49 1277 1283
16. A. M. Swinnen M. Van der Auweraer F. C. De Schryver J. Photochem. 1985 28 315 327
17. Ph. Van Haver N. Helsen S. Depaemelaere M. Van der Auweraer F. C. De Schryver J. Am. Chem. Soc. 1991 113 6849 6857
18. A. M. Swinnen M. Van der Auweraer F. C. De Schryver K. Nakatami T. Okada N. Mataga J. Am. Chem. Soc. 1987 109 321 330
19. T. Okada T. Saito N. Mataga Y. Sakata S. Misumi Bull. Chem. Soc. Jpn. 1977 50 331 336
20. T. Okada T. Fujita M. Kubota S. Masaki N. Mataga Chem. Phys. Lett. 1972 14 563 568
21. N. Mataga Pure Appl. Chem. 1984 56 1255 1268
22. J. W. Verhoeven T. Scherer R. J. Willemse Pure Appl. Chem. 1993 65 1717 1722
23. J. W. Verhoeven Pure Appl. Chem. 1990 62 1585 1596
24. M. Van der Auweraer L. Viaene Ph. Van Haver F. C. De Schryver J. Phys. Chem. 1993 97 7178 7184
25. F. D. Lewis B. E. Cohen J. Phys. Chem. 1994 98 10591 10597
26. U. Werner H. Staerk J. Phys. Chem. 1995 99 248 254
27. E. V. Bichenkova A. R. Sardarian A. N. Wilton P. Bonnet R. A. Bryce K. T. Douglas Org. Biomol. Chem. 2006 4 367 378
28. F. Winnik Chem. Rev. 1993 93 587 614
29. M. Ramirez-Alvarado F. J. Blanco L. Serrano Nat. Struct. Biol. 1996 3 604 612
30. F. J. Blanco M. A. Jimenez A. Pineda M. Rico J. Santoro J. L. Nieto Biochemistry 1994 33 6004 6014
31. G. S. Beddard R. S. Davidson J. Photochem. 1973 1 491 495
32. T. Okada M. Migita N. Mataga Y. Sakata S. Misumi J. Am. Chem. Soc. 1981 103 4715 4720
33. E. V. Bichenkova D. Marks M. I. Dobrikov V. V. Vlassov G. A. Morris K. T. Douglas J. Biomol. Struct. Dyn. 1999 17 193 211
34. E. V. Bichenkova D. S. Marks S. G. Lokhov M. I. Dobrikov V. V. Vlassov K. T. Douglas J. Biomol. Struct. Dyn. 1997 15 307 320
35. J. M. L. Pieters R. W. W. Mans H. van den Elst G. A. van der Marel J. H. van Boom C. Altona Nucleic Acids Res. 1989 17 4551 4565
36. J. Kypr J. Chladkova M. Zimulova M. Vorlickova Nucleic Acids Res. 1999 27 3466 3473
37. H. Rau F. Totter J. Photochem. Photobiol., A 1992 63 337 347
38. H. Knibbe J. Chem. Phys. 1967 47 1184 1185
39. M. Gordon and W. R. Ware, The Exciplex, Academic Press, New York/San Francisco/London, 1975
40. O. B. Ptitsyn FEBS Lett. 1981 131 197 202
41. T. M. Davis L. McFail-Isom E. Keane L. D. Williams Biochemistry 1998 37 6975 6978
42. I. Kutyavin V. S. G. Lokhov I. A. Afonina R. Dempcy A. A. Gall V. Gorn V. E. Lukhtanov M. Metcalf A. Mills M. W. Reed S. Sanders I. Shishkina M. J. Vermeulen Nicolaas Nucleic Acids Res. 2002 30 4952 4959
43. T. Xia J. SantaLucia, Jr M. E. Burkard R. Kierzek S. J. Schroeder X. Jiao C. Cox D. H. Turner Biochemistry 1998 37 14719 14735