Photochemistry of a retinal protonated Schiff-base analogue mimicking the opsin shift of bacteriorhodopsin

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 9, 2007, Pages 2327-2334

  Bismuth, Oshrat ^a   Friedman, Noga ^b   Sheves, Mordechai ^b   Ruhman, Sanford ^a  

^a HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM   (Israel)

^b WEIZMANN INSTITUTE OF SCIENCE   (Israel)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTRA; CATALYSIS; CHEMICAL RELAXATION; LIGHT ABSORPTION; PROTEINS; PROTONATION;

BACTERIORHODOPSIN (BR); BIEXPONENTIAL KINETICS; EXCITATION WAVELENGTH;

PHOTOCHEMICAL REACTIONS;

EID: 33947433562     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0669308     Document Type: Article

References (50)

1. Spudich, J. L.; Yang, C. S.; Jung, K. H.; Spudich, E. N. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2000, 16, 365.
2. Beja, O.; Aravind, L.; Koonin, E. V.; Suzuki, M. T.; Hadd, A.; Nguyen, L. P.; Jovanovich, S.; Gates, C. M.; Feldman, R. A.; Spudich, J. L.; Spudich, E. N.; DeLong, E. F. Science 2000, 289, 1902.
3. Andersen, L. H.; Nielsen, I. B.; Kristensen, M. B.; El Ghazaly, M. O. A.; Haacke, S.; Nielsen, M. B.; Petersen, M. Å. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12347.
4. Biochim. Biophys. Acta. 2000, 1460, special issue.
5. Nakanishi, K.; Balogh-Nair, V.; Arnaboldi, M.; Tsujimoto, K.; Honig, B. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7945.
6. Tajkhorshid, E.; Suhai, S. Theor. Chem. Acc. 1999, 101, 180.
7. Houjou, H.; Inoue, Y.; Sakurai, M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4459.
8. Rajamani, R.; Gao, J. J. Comp. Chem. 2001, 23, 96.
9. Kloppmann, E.; Becker, T.; Ullmann, G. M. Proteins: Struct. Funct. Bioinf. 2005, 61, 953.
10. Hoffmann, M.; Wanko, M.; Strodel, P.; Konig, P. H.; Frauenheim, T.; Schulten, K.; Thiel, W.; Tajkhorshid, E.; Elstner, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10808.
11. Blatz, P. E.; Mohler, J. H.; Navangul, H. V. Biochemistry 1972, 11, 848.
12. Baasov, T.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 7524.
13. Albeck, A.; Livnah, N.; Gottlieb, H.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 2400.
14. Harbison, G. S.; Smith, S. O.; Pardoen, J. A.; Courtin, J. M. L.; Lugtenburg, J.; Herzfeld, J.; Mathies, R. A.; Griffin, R. G. Biochemistry 1985, 24, 6955.
15. Nakanishi, K.; Crouch, R. J. Isr. Chem. 1995, 35, 253.
16. Rohrig, U. F.; Guidoni, L.; Rothlisberger, U. Chem. Phys. Chem. 2005, 6, 1836.
17. Hamm, P.; Zurek, M.; Roschinger, T.; Patzelt, H.; Oesterhelt, D.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1996, 263, 613.
18. Hou, B.; Friedman, N.; Ruhman, S.; Sheves, M.; Ottolenghi, M. J. Phys. Chem. B 2001, 150, 7042.
19. Hamm, P.; Zurek, M.; Roschinger, T.; Patzelt, H.; Oesterhelt, D.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1997, 268, 180.
20. Zgrablic, G.; Voïtchovsky, K.; Kindermann, M.; Haacke, S.; Chergui, M. Biophys. J. 2005, 88, 2779.
21. Freedman, K. A.; Becker, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1245.
22. Koyama, Y.; Kubo, K.; Komori, M.; Yasuda, H.; Mukai, Y. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 433.
23. Doukas, A. G.; Aton, B.; Callender, R. H.; Ebrey, T. G. Biochemistry 1978, 17, 2430.
24. Del Zoppo, M.; Castiglioni, C.; Gerola, V.; Zuliani, P.; Zerbi, G. J. Opt. Soc. Am. B 1998, 308, 15.
25. Losa, A. M.; Galván, I. F.; Martín, M. E.; Aguilar, M. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 18064.
26. Lutz, I.; Sieg, A.; Wegener, A. A.; Engelhard, M.; Boche, I.; Otsuka, M.; Oesterhelt, D.; Wachtveitl, J.; Zinth, W. PNAS 2001, 98, 962.
27. Zadok, U.; Khatchatouriants, A.; Lewis, A.; Ottolenghi, M.; Sheves, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1184.
28. Olivucci, M.; Lami, A.; Santoro, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 5118.
29. Schmidt, B.; Sobotta, C.; Heinz, B.; Laimgruber, S.; Braun, M.; Gilch. P. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1706, 165.
30. Lenz, M. O.; Huber, R.; Schmidt, B.; Gilch, P.; Kalmbach, R.; Engelhard, M.; Wachtveitl, J. Biophys. J. 2006, 91, 255.
31. Sheves, M.; Albeck, A.; Friedman, N.; Ottolenghi, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 3262.
32. Shoshana, O.; Pérez, Lustres, J. L.; Ernsting, N. P.; Ruhman, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 2599.
33. Backus, S.; Peatross, J.; Huang, C. P.; Murnane, M.; Kapteyn, H. C. Opt. Lett. 1995, 20, 2000.
34. Kovalenko, S. A.; Dobryakov, A. L.; Ruthmann, J.; Ernsting, N. P. Phys. Rev. A 1999, 59, 2369.
35. van Stokkum, I. H. M.; Larsen, D. S.; van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1657, 82.
36. Mathies, R. A.; Brito Cruz, C. H.; Pollard, W. T.; Shank, C. V. Science 1988, 240, 777.
37. Schmidt, B.; Sobotta, C.; Heinz, B.; Laimgruber, S.; Braun, M.; Gilch, P. Biochim. Biophys. Acta. 2005, 1706, 165.
38. Cembran, A.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12509.
39. Kennis, J. T. M.; Larsen, D. S.; Ohta, K.; Facciotti, M. T.; Glaeser, R. M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6067.
40. Cembran, A.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Garavelli, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 6255.
41. Kohler, B. E. Chem. Rev. 1993, 93, 41.
42. Hudson, B. S.; Kohler, B. E.; Schulten, K. Excited States 1982, 6, 1.
43. Polívka, T.; Sundström, V. Chem. Rev. 2004, 104, 2021.
44. Sheves, M.; Baasov, T. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 6840.
45. Donahue, J.; Waddell, W. Photochem. Photobiol. 1984, 40, 399.
46. Becker, R. S.; Freedman, K. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 1477.
47. Feng, G.; Hasson, K. C.; McDonald, J. C.; Anfinrud, P. A. Science 1998, 279, 1886.
48. Peters, F.; Herbst, J.; Tittor, J.; Oesterhelt, D.; Diller, R. Chem. Phys. 2006, 323, 109.
49. McCamant, D. W.; Kukura, P.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10449.
50. Schenkl, S.; Mourik, F. V.; Friedman, N.; Sheves, M.; Schlesinger, R.; Haacke, S.; Chergui, M. PNAS 2006, 103, 4101.