메뉴 건너뛰기




Volumn 75, Issue 2, 2007, Pages

Traffic of interacting ribosomes: Effects of single-machine mechanochemistry on protein synthesis

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOSYNTHESIS; CELLS; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR ORIENTATION; RNA; STATISTICAL MECHANICS;

EID: 33846838995     PISSN: 15393755     EISSN: 15502376     Source Type: Journal    
DOI: 10.1103/PhysRevE.75.021902     Document Type: Article
Times cited : (71)

References (72)
  • 2
    • 0037029091 scopus 로고    scopus 로고
    • FEBLAL 0014-5793
    • A. S. Spirin, FEBS Lett. FEBLAL 0014-5793 514, 2 (2002).
    • (2002) FEBS Lett. , vol.514 , pp. 2
    • Spirin, A.S.1
  • 4
    • 0031030137 scopus 로고    scopus 로고
    • NATUAS 0028-0836
    • R. A. Cross, Nature (London) NATUAS 0028-0836 385, 18 (1997).
    • (1997) Nature (London) , vol.385 , pp. 18
    • Cross, R.A.1
  • 6
    • 0001405969 scopus 로고    scopus 로고
    • PRPLCM 0370-1573 10.1016/S0370-1573(99)00117-9
    • D. Chowdhury, L. Santen, and A. Schadschneider, Phys. Rep. PRPLCM 0370-1573 10.1016/S0370-1573(99)00117-9 329, 199 (2000).
    • (2000) Phys. Rep. , vol.329 , pp. 199
    • Chowdhury, D.1    Santen, L.2    Schadschneider, A.3
  • 8
    • 33846834483 scopus 로고    scopus 로고
    • edited by A. Schadschneider, T. Pöschel, R. Kühne, Springer, Berlin, D. E. Wolf (M. Schreckenberg, and
    • Traffic and Granular Flow '05, Proceedings of the International Conference, edited by, A. Schadschneider, T. Pöschel, R. Kühne, M. Schreckenberg, and, D. E. Wolf, (Springer, Berlin, 2006).
    • (2006) Traffic and Granular Flow '05, Proceedings of the International Conference
  • 9
    • 33846810488 scopus 로고    scopus 로고
    • PHYADX 0378-4371
    • See Physica A PHYADX 0378-4371 372 (1) (2006), guest edited by D. Chowdhury, A. Dutta, and B.K. Chakrabarti, for the close similarities and crucial differences between biological traffic and vehicular traffic.
    • (2006) Physica A , vol.372 , Issue.1
  • 10
    • 0014245158 scopus 로고
    • BIPMAA 0006-3525 10.1002/bip.1968.360060102
    • C. MacDonald, J. Gibbs, and A. Pipkin, Biopolymers BIPMAA 0006-3525 10.1002/bip.1968.360060102 6, 1 (1968).
    • (1968) Biopolymers , vol.6 , pp. 1
    • MacDonald, C.1    Gibbs, J.2    Pipkin, A.3
  • 11
    • 84984085494 scopus 로고
    • BIPMAA 0006-3525 10.1002/bip.1969.360070508
    • C. MacDonald and J. Gibbs, Biopolymers BIPMAA 0006-3525 10.1002/bip.1969.360070508 7, 707 (1969).
    • (1969) Biopolymers , vol.7 , pp. 707
    • MacDonald, C.1    Gibbs, J.2
  • 12
    • 0037470280 scopus 로고    scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/36/8/302
    • G. Lakatos and T. Chou, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/36/ 8/302 36, 2027 (2003).
    • (2003) J. Phys. A , vol.36 , pp. 2027
    • Lakatos, G.1    Chou, T.2
  • 13
    • 42749107428 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.68.021910
    • L. B. Shaw, R. K. P. Zia, and K. H. Lee, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.68.021910 68, 021910 (2003).
    • (2003) Phys. Rev. e , vol.68 , pp. 021910
    • Shaw, L.B.1    Zia, R.K.P.2    Lee, K.H.3
  • 14
    • 42749107950 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.021901
    • L. B. Shaw, J. P. Sethna, and K. H. Lee, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.021901 70, 021901 (2004).
    • (2004) Phys. Rev. e , vol.70 , pp. 021901
    • Shaw, L.B.1    Sethna, J.P.2    Lee, K.H.3
  • 15
    • 1342347334 scopus 로고    scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/37/6/010
    • L. B. Shaw, A. B. Kolomeisky, and K. H. Lee, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/37/6/010 37, 2105 (2004).
    • (2004) J. Phys. A , vol.37 , pp. 2105
    • Shaw, L.B.1    Kolomeisky, A.B.2    Lee, K.H.3
  • 16
    • 0042845842 scopus 로고    scopus 로고
    • BIOJAU 0006-3495
    • T. Chou, Biophys. J. BIOJAU 0006-3495 85, 755 (2003).
    • (2003) Biophys. J. , vol.85 , pp. 755
    • Chou, T.1
  • 17
    • 18144385852 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.93.198101
    • T. Chou and G. Lakatos, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.93.198101 93, 198101 (2004).
    • (2004) Phys. Rev. Lett. , vol.93 , pp. 198101
    • Chou, T.1    Lakatos, G.2
  • 20
    • 2942685818 scopus 로고    scopus 로고
    • BIOJAU 0006-3495 10.1529/biophysj.103.036152
    • Y. Kafri, D. K. Lubensky, and D. R. Nelson, Biophys. J. BIOJAU 0006-3495 10.1529/biophysj.103.036152 86, 3373 (2004).
    • (2004) Biophys. J. , vol.86 , pp. 3373
    • Kafri, Y.1    Lubensky, D.K.2    Nelson, D.R.3
  • 21
    • 27744607689 scopus 로고    scopus 로고
    • JCOMEL 0953-8984 10.1088/0953-8984/17/47/016
    • Y. Kafri and D. R. Nelson, J. Phys.: Condens. Matter JCOMEL 0953-8984 10.1088/0953-8984/17/47/016 17, S3871 (2005).
    • (2005) J. Phys.: Condens. Matter , vol.17 , pp. 3871
    • Kafri, Y.1    Nelson, D.R.2
  • 22
    • 0031536149 scopus 로고    scopus 로고
    • RMPHAT. 0034-6861. 10.1103/RevModPhys.69.1269
    • F. Jülicher, A. Ajdari, and J. Prost, Rev. Mod. Phys. RMPHAT 0034-6861 10.1103/RevModPhys.69.1269 69, 1269 (1997).
    • (1997) Rev. Mod. Phys. , vol.69 , pp. 1269
    • Jülicher, F.1    Ajdari, A.2    Prost, J.3
  • 23
    • 0036179557 scopus 로고    scopus 로고
    • PRPLCM 0370-1573 10.1016/S0370-1573(01)00081-3
    • P. Reimann, Phys. Rep. PRPLCM 0370-1573 10.1016/S0370-1573(01)00081-3 361, 57 (2002).
    • (2002) Phys. Rep. , vol.361 , pp. 57
    • Reimann, P.1
  • 24
    • 33745972061 scopus 로고    scopus 로고
    • CUBLE2 0960-9822
    • J. Howard, Curr. Biol. CUBLE2 0960-9822 16, R517 (2006).
    • (2006) Curr. Biol. , vol.16 , pp. 517
    • Howard, J.1
  • 29
    • 0016230230 scopus 로고
    • BICIAZ 0301-4622
    • J. Hiernaux, Biophys. Chem. BICIAZ 0301-4622 2, 70 (1974).
    • (1974) Biophys. Chem. , vol.2 , pp. 70
    • Hiernaux, J.1
  • 30
    • 0014488536 scopus 로고
    • JTBIAP 0022-5193
    • R. Gordon, J. Theor. Biol. JTBIAP 0022-5193 22, 515 (1969).
    • (1969) J. Theor. Biol. , vol.22 , pp. 515
    • Gordon, R.1
  • 36
    • 0016180710 scopus 로고
    • NATUAS 0028-0836
    • H. F. Lodish, Nature (London) NATUAS 0028-0836 251, 385 (1974).
    • (1974) Nature (London) , vol.251 , pp. 385
    • Lodish, H.F.1
  • 37
    • 41349086343 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.052102
    • A. A. Ferreira and F. C. Alcaraz, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.65.052102 65, 052102 (2002).
    • (2002) Phys. Rev. e , vol.65 , pp. 052102
    • Ferreira, A.A.1    Alcaraz, F.C.2
  • 38
    • 4444383723 scopus 로고    scopus 로고
    • JPHAC5. 0305-4470. 10.1088/0305-4470/37/34/002
    • G. Schönherr and G. M. Schütz, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/37/34/002 37, 8215 (2004).
    • (2004) J. Phys. A , vol.37 , pp. 8215
    • Schönherr, G.1    Schütz, G.M.2
  • 39
    • 37649027860 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8. 1063-651X. 10.1103/PhysRevE.71.026122
    • G. Schönherr, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.71. 026122 71, 026122 (2005).
    • (2005) Phys. Rev. e , vol.71 , pp. 026122
    • Schönherr, G.1
  • 44
  • 45
    • 18844386816 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.45.618
    • S. A. Janowsky and J. L. Lebowitz, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.45.618 45, 618 (1992).
    • (1992) Phys. Rev. A , vol.45 , pp. 618
    • Janowsky, S.A.1    Lebowitz, J.L.2
  • 46
    • 0002038523 scopus 로고
    • JSTPBS. 0022-4715. 10.1007/BF01058433
    • G. Schütz, J. Stat. Phys. JSTPBS 0022-4715 10.1007/BF01058433 71, 471 (1993).
    • (1993) J. Stat. Phys. , vol.71 , pp. 471
    • Schütz, G.1
  • 47
    • 0002789119 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.78.3039
    • G. Tripathy and M. Barma, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.78.3039 78, 3039 (1997);
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.78 , pp. 3039
    • Tripathy, G.1    Barma, M.2
  • 48
    • 4243740606 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.58.1911
    • G. Tripathy and M. Barma, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.58.1911 58, 1911 (1998).
    • (1998) Phys. Rev. e , vol.58 , pp. 1911
    • Tripathy, G.1    Barma, M.2
  • 49
    • 0347297688 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.58.4226
    • S. Goldstein and E. R. Speer, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.58.4226 58, 4226 (1998).
    • (1998) Phys. Rev. e , vol.58 , pp. 4226
    • Goldstein, S.1    Speer, E.R.2
  • 50
    • 4243604629 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.61.2453
    • K. M. Kolwankar and A. Punnoose, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.61.2453 61, 2453 (2000).
    • (2000) Phys. Rev. e , vol.61 , pp. 2453
    • Kolwankar, K.M.1    Punnoose, A.2
  • 51
    • 42749104044 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.016108
    • R. J. Harris and R. B. Stinchcombe, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.70.016108 70, 016108 (2004).
    • (2004) Phys. Rev. e , vol.70 , pp. 016108
    • Harris, R.J.1    Stinchcombe, R.B.2
  • 52
    • 1842864957 scopus 로고    scopus 로고
    • EULEEJ 0295-5075 10.1209/epl/i2003-10153-8
    • C. Enaud and B. Derrida, Europhys. Lett. EULEEJ 0295-5075 10.1209/epl/i2003-10153-8 66, 83 (2004).
    • (2004) Europhys. Lett. , vol.66 , pp. 83
    • Enaud, C.1    Derrida, B.2
  • 53
    • 18244368724 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.94.010601
    • R. Juhasz, L. Santen, and F. Igloi, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.94.010601 94, 010601 (2005).
    • (2005) Phys. Rev. Lett. , vol.94 , pp. 010601
    • Juhasz, R.1    Santen, L.2    Igloi, F.3
  • 55
    • 0001576997 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.79.2895
    • T. Harms and R. Lipowsky, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.79.2895 79, 2895 (1997).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.79 , pp. 2895
    • Harms, T.1    Lipowsky, R.2
  • 56
    • 0001753863 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.56.2492
    • F. Marchesoni, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.56.2492 56, 2492 (1997).
    • (1997) Phys. Rev. e , vol.56 , pp. 2492
    • Marchesoni, F.1
  • 58
    • 0035334656 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.63.052101
    • Y. Jia, S. N. Yu, and J. R. Li, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.63.052101 63, 052101 (2001).
    • (2001) Phys. Rev. e , vol.63 , pp. 052101
    • Jia, Y.1    Yu, S.N.2    Li, J.R.3
  • 59
    • 7444253928 scopus 로고    scopus 로고
    • JMOBAK 0022-2836 10.1016/j.jmb.2004.08.107
    • L. Bai, A. Shundrovsky, and M. D. Wang, J. Mol. Biol. JMOBAK 0022-2836 10.1016/j.jmb.2004.08.107 344, 335 (2004).
    • (2004) J. Mol. Biol. , vol.344 , pp. 335
    • Bai, L.1    Shundrovsky, A.2    Wang, M.D.3
  • 61
    • 33846827670 scopus 로고    scopus 로고
    • See http://www.genome.wisc.edu/sequencing/k12.htm
  • 62
    • 12044250009 scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.67.1882
    • J. Krug, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.67.1882 67, 1882 (1991).
    • (1991) Phys. Rev. Lett. , vol.67 , pp. 1882
    • Krug, J.1
  • 63
    • 0033216540 scopus 로고    scopus 로고
    • EULEEJ. 0295-5075. 10.1209/epl/i1999-00474-0
    • V. Popkov and G. Schütz, Europhys. Lett. EULEEJ 0295-5075 10.1209/epl/i1999-00474-0 48, 257 (1999).
    • (1999) Europhys. Lett. , vol.48 , pp. 257
    • Popkov, V.1    Schütz, G.2
  • 64
  • 65
    • 0035362921 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.63.067103
    • J. S. Hager, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.63.067103 63, 067103 (2001).
    • (2001) Phys. Rev. e , vol.63 , pp. 067103
    • Hager, J.S.1
  • 68
    • 42749106314 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.68.026117
    • M. R. Evans, R. Juhasz, and L. Santen, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.68.026117 68, 026117 (2003).
    • (2003) Phys. Rev. e , vol.68 , pp. 026117
    • Evans, M.R.1    Juhasz, R.2    Santen, L.3
  • 70
    • 33746919953 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.97.050603
    • T. Reichenbach, T. Franosch, and E. Frey, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.97.050603 97, 050603 (2006).
    • (2006) Phys. Rev. Lett. , vol.97 , pp. 050603
    • Reichenbach, T.1    Franosch, T.2    Frey, E.3
  • 72
    • 41349084317 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.71.011103
    • G. Lakatos, T. Chou, and A. Kolomeisky, Phys. Rev. E PLEEE8 1063-651X 10.1103/PhysRevE.71.011103 71, 011103 (2005).
    • (2005) Phys. Rev. e , vol.71 , pp. 011103
    • Lakatos, G.1    Chou, T.2    Kolomeisky, A.3


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.