A coupled car-parrinello molecular dynamics and EXAFS data analysis investigation of aqueous Co2+

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 110, Issue 48, 2006, Pages 13081-13088

  Spezia, Riccardo ^a   Duvail, Magali ^a   Vitorge, Pierre ^a,b   Cartailler, Thierry ^a   Tortajada, Jeanine ^a   Chillemi, Giovanni ^c   D'Angelo, Paola ^d   Gaigeot, Marie Pierre ^a,e  

^a UNIVERSITÉ D EVRY VAL D ESSONNE   (France)

^b CEA SACLAY   (France)

^c CASPUR   (Italy)

^d SAPIENZA UNIVERSITY OF ROME   (Italy)

^e UNIVERSITÉ PIERRE ET MARIE CURIE   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; DATA REDUCTION; MICROSCOPIC EXAMINATION; MOLECULAR STRUCTURE; X RAY PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY;

EXTENDED X-RAY ABSORPTION FINE STRUCTURE (EXAFS); HYDRATION SHELLS; STRUCTURAL PARAMETERS;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 33846047076     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064688z     Document Type: Article

References (81)

1. Ohtaki, H.; Radnai, T. Chem. Rev. 1993, 93, 1157.
2. Marcus, Y. Chem. Rev. 1988, 88, 1475.
3. Johansson, G. Adv. Inorg. Chem. 1992, 187, 151.
4. Hofer, T. S.; Tran, H. T.; Schwenk, C. F.; Rode, B. M. J. Comput. Chem. 2003, 25, 211.
5. Rotzinger, F. P. Chem. Rev. 2005, 105, 2003.
6. D'Angelo, P.; Di Nola, A.; Filipponi, A.; Pavel, N. V.; Roccatano, D. J. Chem. Phys. 1994, 100, 985.
7. Roccatano, D.; Berendsen, H. J. C.; D'Angelo, P. J. Chem. Phys. 1998, 108, 9487.
8. Dubois, V.; Archirel, P.; Boulin, A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 9363.
9. Yagüe, J. I.; Mohammed, A. M.; Loeffler, H. H.; Rode, B. M. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 7646.
10. Rey, R.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5611.
11. Ferlat, G.; San Miguel, A.; Jal, J. F.; Soetsen, J. C.; Bopp, P. A.; Daniel, I.; Guillot, S.; Hazemann, J. L.; Argoud, R. Phys. Rev. B 2001, 63, 134202.
12. Spangberg, D.; Rey, R.; Hynes, J. T.; Hermansson, K. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 4470.
13. Chillemi, G.; D'Angelo, P.; Pavel, N. V.; Sanna, N.; Barone, V. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1968.
14. Chillemi, G.; Barone, V.; D'Angelo, P.; Mancini, G.; Persson, I.; Sanna, N. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 9186.
15. D'Angelo, P.; Roscioni, O. M.; Chillemi, G.; Della Longa, S.; M. Benfatto, M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1853.
16. Frank, I.; Parrinello, M.; Klamt, A. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 3614.
17. Spezia, R.; Tournois, G.; Tortajada, J.; Cartailler, T.; Gaigeot, M.-P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 2040.
18. Marinica, D. C.; Gregoire, G.; Desfrancois, C.; Schermann, J. P.; Borgis, D.; Gaigeot, M.-P. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8802.
19. Sprik, M.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1142.
20. Silvestrelli, P. L.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1999, 111, 3572.
21. Handgraaf, J. W.; Meijer, E. J.; Gaigeot, M.-P. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10111.
22. Rosso, L.; Tuckerman, M. E. Solid State Ionics 2003, 161, 219.
23. Meregalli, V.; Parrinello, M. Solid State Commun. 2001, 117, 441.
24. Lyubartsev, A. P.; Laasonen, K.; Laaksonen, A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3120.
25. Marx, D.; Sprik, M.; Parrinello, M. Chem. Phys. Lett. 1997, 273, 360.
26. Ramaniah, L.; Bernasconi, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1998, 109, 6839.
27. Vuilleumier, R.; Sprik, M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 3454.
28. White, J. A.; Schwegler, E.; Galli, G.; Gygi, F. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4668.
29. Lightstone, F. C.; Schwegler, E.; Hood, R. Q.; Gygi, F.; Galli, G. Chem. Phys. Lett. 2001, 343, 549.
30. Lubin, M. I.; Bylaska, E. J.; Weare, J. H. Chem. Phys. Lett. 2000, 322, 447.
31. Ramaniah, L.; Bernasconi, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1587.
32. Bakó, I.; Hutter, J.; Pálinkás, G. J. Chem. Phys. 2002, 117, 9838.
33. Ensing, B.; Baerends, E. J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 7902.
34. Ensing, B.; Buda, F.; Blöch, P. E.; Baerends, E. J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 3619.
35. Pasquarello, A.; Petri, I.; Salomon, P. S.; Parisel, O.; Car, R.; Toth, E.; Powell, D. H.; Fischer, H. E.; Helm, L.; Merbach, A. Science 2001, 297, 856.
36. Amira, S.; Spangberg, D.; Zelin, V.; Probst, M.; Hermansson, K. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 14235.
37. Yazyev, O. V.; Helm, L. Theor. Chem. Acc. 2006, 115, 190.
38. Buhl, M.; Grigoleit, S.; Kabrede, H.; Mauschick, F. T. Chem. Eur. J. 2006, 12, 477-488.
39. Raugei, S.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 2002, 116, 196.
40. Spezia, R.; Nicolas, C.; Boutin, A.; Vuilleumier, R. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 208304.
41. Ferlat, G.; Soetens, J.; San Miguel, A.; Bopp, P. A. J. Phys.: Condens. Matter 2005, 17, S145.
42. Filipponi, A.; D'Angelo, P.; Pavel, N. V.; Di Cicco, A. Chem. Phys. Lett. 1994, 225, 150.
43. D'Angelo, P.; Pavel, N. V. J. Chem. Phys. 1999, 111, 5107.
44. Campbell, L.; Rehr, J. J.; Schenter, G. K.; McCarthy, M. I.; Dixon, D. J. Synchrotron. Rad. 1999, 6, 310.
45. Benfatto, M.; Natoli, C. R.; Bianconi, A.; García, J.; Marcelli, A.; Fanfoni, M.; Davoli, I. Phys. Rev. B 1986, 34, 5774.
46. D'Angelo, P.; Barone, V.; Chillemi, G.; Sanna, N.; Meyer-Klaucke, W.; Pavel, N. V. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1958.
47. D'Angelo, P.; Chillemi, G.; Barone, V.; Mancini, G.; Sanna, N.; Persson, I. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 9178.
48. Ferlat, G.; San Miguel, A.; Xu, H.; Aouizerat, A.; Blase, X.; Zuniga, J.; Munoz-Sanjosé, V. Phys. Rev. B 2004, 69, 155202.
49. Spezia, R.; Tournois, G.; Cartailler, T.; Tortajada, J.; Jeanvoine, Y. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 9727.
50. Armunanto, R.; Schwenk, C. F.; Bambang Satiaji, A. H.; Rode, B. M. Chem. Phys. Lett. 2003, 295, 63.
51. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
52. Marx, D.; Hutter, J. Ab Initio Molecular Dynamics: Theory and Implementation. In Modern Methods and Algorithms of Quantum Chemistry, Vol. 1; Grotendorst, J. Ed.; NIC Series; John von Meumann Institute for Computing: Jülich, Germany: 2000.
53. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
54. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
55. Cotton, F. A.; Wilkinson, G. Advanced Inorganic Chemistry; Wiley: New York, 1980.
56. Trouillier, N.; Martins, J. L. Phys. Rev. B 1991, 43, 1993.
57. Rovira, C.; Kunc, K.; Hutter, J.; Parrinello, M. Inorg. Chem. 2001, 40, 11.
58. Kleinman, L.; Bylander, D. M. Phys. Rev. Lett. 1982, 48, 1425.
59. Louie, S. G.; Froyen, S.; Cohen, M. L. Phys. Rev. B 1982, 26, 1738.
60. Hutter, J.; Alavi, A.; Deutsch, T.; Bernasconi, M.; Goedecker, S.; Marx, D.; Tuckerman, M.; Parrinello, M. CPMD version 3.7.2; IBM Research Division, IBM Corp and Max Planck Institüt-Stuttgart.
61. Grossman, J. C.; Schwegler, E.; Draeger, E. W.; Gygi, F.; Galli, G. J. Chem. Phys. 2004, 120, 300.
62. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Oxford Science Publications: Oxford, U.K., 1989.
63. Souaille, M.; Borgis, D.; Gaigeot, M.-P. MDVRY; Molecular Dynamics Program Developed at the University of Evry: 2006.
64. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269.
65. Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comput. Chem. 2003, 24, 669.
66. Hermes, C.; Gilberg, E.; Koch, M. H. Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. 1984, 222, 207.
67. Pettifer, R.; Hermes, C. J. Phys. Colloq. 1986, C8, 127.
68. Pettifer, R. F.; Hermes, C. J. Appl. Crystallogr. 1985, 18, 404.
69. Filipponi, A.; Di Cicco, A.; Natoli, C. R. Phys. Rev. B 1995, 52, 15122.
70. Hedin, L.; Lundqvist, B. I. J. Phys. C 1971, 4, 2064.
71. Krause, M. O.; Oliver, J. H. J. Phys. Chem. Ref. Data 1979, 8, 329.
72. Miheliuc, A.; Gomilusek, J. P.; Kodre, A.; Arucon, I. HASYLAB Annual Report 2000, 209.
73. Sham, T. K. Acc. Chem. Res. 1986, 19, 99.
74. Miyanaga, T.; Sakane, H.; Watanabe, I. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1995, 68, 819.
75. Laage, D.; Hynes, J. T. Science 2006, 311, 832.
76. Musinu, A.; Peschina, G.; Piccaluga, G.; Magini, M. J. Chem. Phys. 1984, 80, 2772.
77. Magini, M. J. Chem. Phys. 1981, 74, 2523.
78. Corrias, A.; Musinu, A.; Pinna, G. Chem. Phys. Lett. 1985, 120, 295.
79. Caminiti, R.; Cucca, P.; Monduzzi, M.; Saba, G.; Crisponi, G. J. Chem. Phys. 1984, 81, 543.
80. Roscioni, O. M.; D'Angelo, P.; Chillemi, G.; Della Longa, S.; Benfatto, M. J. Synchrotron Rad. 2005, 12, 75.
81. Filipponi, A.; Di Cicco, A. Phys. Rev. B 1995, 52, 15135.