메뉴 건너뛰기




Volumn 107, Issue 2, 2007, Pages 279-291

Solvating, manipulating, damaging, and repairing DNA in a computer

Author keywords

Computer simulations; DNA; Enzymatic reactions; Lesioned DNA; Quantum chemistry

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; ENZYME KINETICS; HYDRATION; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM THEORY;

EID: 33845999315     PISSN: 00207608     EISSN: 1097461X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.21191     Document Type: Conference Paper
Times cited : (2)

References (81)
  • 3
    • 33845971789 scopus 로고    scopus 로고
    • Atwood, J. L, Steed, J. W, Eds, Marcel Dekker: New York
    • Seeman, N. C. In Encyclopedia of Supramolecular Chemistry; Atwood, J. L.; Steed, J. W., Eds.; Marcel Dekker: New York, 2004; p 475.
    • (2004) Encyclopedia of Supramolecular Chemistry , pp. 475
    • Seeman, N.C.1
  • 5
    • 33845989372 scopus 로고    scopus 로고
    • http://ndbserver.rutgers.edu/.
  • 10
    • 33845983916 scopus 로고    scopus 로고
    • http://www.igc.ethz.ch/gromos/.
  • 11
    • 0010051764 scopus 로고
    • Computational Aspects for Large Chemical Systems
    • Springer-Verlag: Berlin
    • Clementi, E. Computational Aspects for Large Chemical Systems; Lecture Notes in Chemistry; Vol. 19; Springer-Verlag: Berlin, 1980.
    • (1980) Lecture Notes in Chemistry , vol.19
    • Clementi, E.1
  • 45
    • 0035333546 scopus 로고    scopus 로고
    • Sarkar, A.; Leger, J.-F.; Chatenay, D.; Marko, J. F. Phys Rev E 2001, 63, 0519031.
    • Sarkar, A.; Leger, J.-F.; Chatenay, D.; Marko, J. F. Phys Rev E 2001, 63, 0519031.
  • 65
    • 33845983541 scopus 로고    scopus 로고
    • Ph.D. thesis; Jyväskylä University, Jyväskylä, Finland
    • Lohikoski, R. Ph.D. thesis; Jyväskylä University, Jyväskylä, Finland, 2005.
    • (2005)
    • Lohikoski, R.1
  • 67
    • 0024058085 scopus 로고    scopus 로고
    • Lavery, R.; Sklenar, H. J Biol Struct Dyn 1989, 6, 63.
    • Lavery, R.; Sklenar, H. J Biol Struct Dyn 1989, 6, 63.
  • 68
    • 0024539180 scopus 로고    scopus 로고
    • Lavery, R.; Sklenar, H. J Biol Struct Dyn 1989, 6, 655.
    • Lavery, R.; Sklenar, H. J Biol Struct Dyn 1989, 6, 655.
  • 69
    • 33846018305 scopus 로고    scopus 로고
    • Lavery, R.; H. Sklenar, H. Curves 5.2 - Helical Analysis of Irregular Nucleic Acids; Laboratoire de Biochimie Théo rique, CNRS URA 77, Institut de Biologie Physico-Chimique: Paris, 1997.
    • Lavery, R.; H. Sklenar, H. Curves 5.2 - Helical Analysis of Irregular Nucleic Acids; Laboratoire de Biochimie Théo rique, CNRS URA 77, Institut de Biologie Physico-Chimique: Paris, 1997.
  • 74
    • 33846031362 scopus 로고    scopus 로고
    • Case, D. A.; Pearlman, D. A.; Caldwell, J. W.; Cheatham, T. E., III; Wang, J.; Ross, W. S.; Simmerling, C. L.; Darden, T. A.; Merz, K. M.; Stanton, R. V.; Cheng, A. L.; Vincent, J. J.; Crowley, M.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Radmer, R. J.; Duan, Y.; Pitera, J.; Massova, I.; Seibel, G. L.: Singh, U. C.; Weiner, P. K.; Kollman, P. A. AMBER 7; University of California: San Francisco, CA, 2002.
    • Case, D. A.; Pearlman, D. A.; Caldwell, J. W.; Cheatham, T. E., III; Wang, J.; Ross, W. S.; Simmerling, C. L.; Darden, T. A.; Merz, K. M.; Stanton, R. V.; Cheng, A. L.; Vincent, J. J.; Crowley, M.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Radmer, R. J.; Duan, Y.; Pitera, J.; Massova, I.; Seibel, G. L.: Singh, U. C.; Weiner, P. K.; Kollman, P. A. AMBER 7; University of California: San Francisco, CA, 2002.
  • 76
    • 33845972157 scopus 로고    scopus 로고
    • Frisch, M. J, Trucks, G. W, Schlegel, H. B, Scuseria, G. E, Robb, M. A, Cheeseman, J. R, Montgomery, J. A, Jr, Vreven, T, Kudin, K. N, Burant, J. C, Millam, J. M, Iyengar, S. S, Tomasi, J, Barone, V, Mennucci, B, Cossi, M, Scalmani, G, Rega, N, Petersson, G. A, Nakatsuji, H, Hada, M, Ehara, M, Toyota, K, Fukuda, R, Hasegawa, J, Ishida, M, Nakajima, T, Honda, Y, Kitao, O, Nakai, H, Klene, M, Li, X, Knox, J. E, Hratchian, H. P, Cross, J. B, Bakken, V, Adamo, C, Jaramillo, J, Gomperts, R, Stratmann, R. E, Yazyev, O, Austin, A. J, Cammi, R, Pomelli, C, Ochterski, J. W, Ayala, P. Y, Morokuma, K, Voth, G. A, Salvador, P, Dannenberg, J. J, Zakrzewski, V. G, Dapprich, S, Daniels, A. D, Strain, M. C, Farkas, O, Malick, D. K, Rabuck, A. D, Raghavachari, K, Foresman, J. B, Ortiz, J. V, Cui, Q, Baboul, A. G, Clifford, S, Cioslowski, J, Stefanov, B. B, Liu, G, Liashenko, A, Piskorz, P, Komaromi, I, Martin, R. L, Fox, D. J, Keit
    • Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Revision C.02; Gaussian: Wallingford, CT, 2004.
  • 80
    • 14844345843 scopus 로고    scopus 로고
    • Schyman, P; Danielsson, J; Pinak, M.; Laaksonen, A. J Phys Chem 2005, 109, 1713.
    • Schyman, P; Danielsson, J; Pinak, M.; Laaksonen, A. J Phys Chem 2005, 109, 1713.


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.