Automated Stereospecific 1H NMR Assignments and Their Impact on the Precision of Protein Structure Determinations in Solution

Journal of the American Chemical Society

Volumn 111, Issue 11, 1989, Pages 3997-4004

  Giintert, Peter ^a   Braun, Werner ^a   Billeter, Martin ^a   Wiithrich, Kurt ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33845183709     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja00193a036     Document Type: Article

References (44)

1. Wüthrich, K.; Wider, G.; Wagner, G.; Braun, W. J. Mol. Biol. 1982, 155, 311–319.
2. ; Wider, G.; Lee, K. H.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1983, 169, 921–948.
3. Williamson, M. P.; Havel, T. F.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1985, 182, 295–315.
4. Kline, A. D.; Braun, W.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1986, 189, 377–382.
5. Wüthrich, K. NMR of Proteins and Nucleic Acids; Wiley: New York, 1986.
6. Ernst, R. R.; Bodenhausen, G.; Wokaun, A. Principles of Nuclear Magnetic Resonance in One and Two Dimensions; Clarendon Press: Oxford, U.K., 1987.
7. Havel, T. F.; Wüthrich, K. Bull Math. Biol. 1984, 46, 673–698.
8. Kaptein, R.; Zuiderweg, E. R. P.; Scheek, R. M.; Boelens, R.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1985, 182, 179–182.
9. Braun, W.; and Gō, N. J. Mol. Biol. 1985, 186, 611–626.
10. Clore, G. M.; Gronenborn, A. M.; Brünger, A. T.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 1985, 186, 435–455.
11. Havel, T. F.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1985, 182, 281-294.
12. Braun, W. Q. Rev. Biophys. 1987, 19, 115–157.
13. (a) Solomon, I. Phys. Rev. 1955, 99, 559–565. (b) Noggle, J. H.; Schirmer, R. E. The Nuclear Overhauser Effect; Academic Press: New York, 1971.
14. Wagner, G.; Wüthrich, K. J. Magn. Reson. 1979, 33, 675–680.
15. Olejniczak, E. T.; Dobson, C. M.; Karplus, M.; Levy, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 1923–1930.
16. Billeter, M.; Kline, A. D.; Braun, W.; Huber, R.; Wiithrich, K. J. Mol. Biol., in press.
17. (a) Kline, A. D.; Braun, W.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1988, 204, 675–724. (b) press. Billeter, M.; Schaumann, Th.; Braun, W.; Wüthrich, K. Biopolymers
18. Wüthrich, K.; Billeter, M.; Braun, W. J. Mol. Biol. 1983, 169, 949–961.
19. Senn, H.; Billeter, M.; Wüthrich, K. Eur. Biophys. J. 1984, 11, 3–5.
20. Zuiderweg, E. R. P.; Boelens, R.; Kaptein, R. Biopolymers 1985, 24, 601–611.
21. Weber, P. L.; Morrison, R.; Hare, D. J. Mol. Biol. 1988, 204, 483–487.
22. Hyberts, S.; Marki, W.; Wagner G., Eur. J. Biochem. 1987, 164, 625–635.
23. (a) Arseniev, A.; Schultze, P.; Worgotter, E.; Braun, W.; Wagner, G.; Vašák, M.; Kagi, J. H. R.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1988, 201, 637–657. (b) Wagner, G.; Braun, W.; Havel, T. F.; Schaumann, T.; Gō, N.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1987, 196, 611–639.
24. (a) Ponder, J. W.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1987, 193, 755–791. (b) McGregor, M. J.; Islam, S. A.; Sternberg, M. J. E. J. Mol. Biol. 1987, 198, 295–310.
25. Marquart, M.; Walter, J.; Deisenhofer, J.; Bode, W.; Huber, R. Acta Crystallogr. B 1983, 39, 480–490.
26. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J. B.; Meyer, E. F., Jr.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimanouchi, T.; Tasumi, M. J. Mol. Biol. 1977, 112, 535–542.
27. (a) Nyburg, S. C. Acta Crystallogr. B 1974, 30, 251–253. (b) McLachlan, A. D. J. Mol. Biol. 1979, 128, 49–79.
28. Wlodawer, A.; Walter, J.; Huber, R.; Sjolin, L. J. Mol. Biol. 1984, 180, 301–329.
29. Pardi, A.; Billeter, M.; Wüthrich, K. J. Mol. Biol. 1984, 180, 741–751.
30. DeMarco, A.; Llinás, M.; Wüthrich, K. Biopolymers 1978, 17, 617–636.
31. Billeter, M.; Engeli, M.; Wüthrich, K. Mol. Graphics 1985, 3, 79–83, 97–98.
32. Momany, F. A.; McGuire, R. F.; Burgess, A. W.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1975, 79, 2361–2381.
33. Nemethy, G.; Pottle, M. S.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1983, 87, 1883–1887.
34. Teeter, M. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 6014–6018.
35. Leijonmarck, M.; Liljas, A. J. Mol. Biol. 1987, 195, 555–579.
36. Carter, C. W., Jr.; Kraut, J.; Freer, S. T.; Xuong, N.-H.; Alden, R. A.; Bartsch, R. G. J. Biol. Chem. 1974, 249, 4212–4225.
37. Blundell, T. L.; Pitts, J. E.; Tickle, I. J.; Wood, S. P.; Wu, C.-W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 4175–4179.
38. Almassy, R. J.; Fontecilla-Camps, J. C.; Suddath, F. L.; Bugg, C. E. J. Mol. Biol. 1983, 170, 497–527.
39. Mathews, F. S.; Argos, P.; Levine, M. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1972, 36, 387–395.
40. Bourne, P. E.; Sato, A.; Corfield, P. W. R.; Rosen, L. S.; Birken, S.; Low, B. W. Eur. J. Biochem. 1985, 153, 521–527.
41. Bode, W.; Epp, O.; Huber, R.; Laskowski, M., Jr.; Ardelt, W. Eur. J. Biochem. 1985, 147, 387–395.
42. Matsuura, Y.; Takano, T.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1982, 156, 389–395.
43. Watenpaugh, K. D.; Sieker, L. C.; Jensen, L. H. J. Mol. Biol. 1980, 138, 615–633.
44. Guss, J. M.; Harrowell, P. R.; Murata, M.; Norris, V. A.; Freeman, H. C. J. Mol. Biol. 1986, 192, 361–387.