Calculation of vibrational spectra of linear tetrapyrroles. 4. Methine bridge C-H Out-of-plane modes

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 110, Issue 36, 2006, Pages 10564-10574

  Mroginski, Maria Andrea ^a   Murgida, Daniel Horacio ^a   Hildebrandt, Peter ^a  

^a TECHNISCHE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

RAMAN INTENSITIES; ROOT-MEAN-SQUARE DEVIATION; SCALING FACTOR;

CHROMOPHORES; MOLECULAR VIBRATIONS; OPTIMIZATION; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; PROTEINS; RAMAN SCATTERING;

POLYPYRROLES;

PROTEIN; TETRAPYRROLE DERIVATIVE;

ARTICLE; CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METHODOLOGY; RAMAN SPECTROMETRY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

MODELS, CHEMICAL; MOLECULAR STRUCTURE; PROTEINS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; TETRAPYRROLES;

EID: 33749600923     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp063128x     Document Type: Article

References (41)

1. Rauhut, G.; Pulay, P. J. Phys. Chem. 1995, 99, 3093.
2. Arenas, J. F.; Otero, J. C.; Sanchez Galvez, A.; Soto, J. J. Mol. Struct. 1996, 385, 49.
3. Magdo, I.; Nemeth, K.; Mark, F.; Hildebrandt, P.; Schaffner, K. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 289.
4. Mroginski, M. A.; Nemeth, K.; Bauschlicher, T.; Klotzbucher, W.; Goddard, R.; Heinemann, O.; Hildebrandt, P.; Mark, F. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2139.
5. Kneip, C.; Hildebrandt, P.; Schlamann, W.; Braslavsky, S. E.; Mark, F.; Schaffner, K. Biochemistry 1999, 38, 15185.
6. Mroginski, M. A.; Murgida, D. H.; von Stetten, D.; Kneip, C.; Mark, F.; Hildebrandt, P. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16734.
7. Borucki, B.; von Stetten, D.; Seibeck, S.; Lamparter, T.; Michael, N.; Mroginski, M. A.; Otto, H.; Murgida, D. H.; Heyn, M. P.; Hildebrandt, P. J. Biol. Chem. 2005, 280, 34358.
8. Kneip, C.; Mozley, D.; Hildebrandt, P.; Gartner, W.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. FEBS Lett. 1997, 414, 23.
9. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
10. Dilchfield, R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.
11. Baker, J.; Jarzecki, A. A.; Pulay, P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1412.
12. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Durant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
13. Kneip, C.; Parbel, A.; Foerstendorf, H.; Scheer, H.; Siebert, F.; Hildebrandt, P. J. Roman Spectrosc. 1998, 29, 939.
14. Mohamed, T. A.; Aly, M. M. A. J. Roman Spectrosc. 2004, 35, 869.
15. Duerring, M.; Huber, R.; Bode, W. J. Mol. Biol. 1990, 211, 633.
16. Takahashi, H.; Kuroyanagi, K.; Yamada, O.; Kaneko, N. Chem. Phys. Lett. 2003, 94, 38.
17. Compton, D. A. C.; George, W. O.; Maddams, W. F. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1976, 1666.
18. Traetteberg, M.; Paulen, G.; Cyvin, S. J.; Panchenko, Y. N.; Mochalov, V. I. J. Mol. Struct. 1984, 116, 141.
19. Kuchitsu, K.; Fukuyama, T.; Morino, Y. J. Mol. Struct. 1968, 1, 463.
20. Lide, D. R.; Christensen, D. J. Chem. Phys. 1961, 35, 1374.
21. Hsu, S. L.; Flygare, W. H. J. Chem. Phys. 1970, 52, 1053.
22. Traetteberg, M.; Frantsen, E. B. J. Mol. Struct. 1975, 26, 69.
23. Traetteberg, M.; Frantsen, E. B.; Mijlhoff, F. C.; Hoekstra, A. J. Mol. Struct. 1975, 26, 57.
24. Yasuda, N.; Uekusa, H.; Ohashi, Y. Acta Crystallogr., Sect. E 2001, 57, 01189-01190.
25. Knipp, B.; Müller, M.; Metzler-Nolte, N.; Balaban, T. S.; Braslavsky, S. E.; Schaffner, K. Helv. Chim. Acta 1998, 81, 881.
26. Kratky, C.; Falk, H.; Grubmayr, K. Monatsh. Chem. 1985, 116, 745.
27. Sheldrick, W. S. Isr. J. Chem. 1983, 23, 155.
28. Compton, D. A. C.; George, W. O.; Maddams, W. F. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1977, 1311.
29. Peng, J. P.; Minacamilde, N.; Manzanares, C. Vib. Spectrosc. 1995, 8, 319.
30. Schrader, B.; Meier, W. DM5 Raman/IR Atlas of Organic Compounds; Verlag Chemie GmbH: Weinheim, 1975.
31. Silvi, B.; Labarbe, P.; Perchard, J. P. Spectrochim. Acta, Part A 1973, A 29, 263.
32. Takada, T.; Dupuis, M. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 1713.
33. Arenas, J. F.; Tocon, I. L.; Otero, J. C.; Marcos, J. I. J. Phys. Chem. 1995, 99, 11392.
34. Watanabe, H.; Okamoto, Y.; Furuya, K.; Sakamoto, A.; Tasumi, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 3318.
35. Choi, C. H.; Kertesz, M. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3823.
36. Meic, Z.; Gusten, H. Spectrochim. Acta, Part A 1978, 34, 101.
37. Condirston, D. A.; Laposa, J. D. J. Mol. Spectrosc. 1976, 63, 466.
38. Stirling, A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 1254.
39. Aly, M. M. A.; Baron, M. H.; Romain, F.; Revault, M. Spectrochim. Acta 1984, 40, 1037.
40. Kneip, C.; Hildebrandt, P.; Nemeth, K.; Mark, F.; Schaffner, K. Chem. Phys. Lett. 1999, 311, 479.
41. Wagner, J. R.; Brunzelle, J. S.; Forest, K. T.; Vierstra, R. D. Nature (London) 2005, 438, 325.