Looking at long molecules in solution: What happens when they are subjected to Couette flow?

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 8, Issue 27, 2006, Pages 3161-3171

  Rodger, Alison ^a   Marrington, Rachel ^a   Geeves, Michael A ^b   Hicks, Matthew ^a,c   De Alwis, Lahari ^a   Halsall, David J ^d   Dafforn, Timothy R ^c  

^a UNIVERSITY OF WARWICK   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF KENT   (United Kingdom)

^c UNIVERSITY OF BIRMINGHAM   (United Kingdom)

^d ADDENBROOKE S HOSPITAL   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIN; AMYLOID; CARBON NANOTUBE; DNA; LIGAND; PROTEIN;

ABSORPTION; CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; CRYSTALLOGRAPHY; DNA SUPERCOILING; INSTRUMENTATION; KINETICS; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; REVIEW; SOLUTION AND SOLUBILITY; X RAY DIFFRACTION;

ABSORPTION; ACTINS; AMYLOID; CIRCULAR DICHROISM; CRYSTALLOGRAPHY; DNA; DNA, SUPERHELICAL; KINETICS; LIGANDS; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MICROCHEMISTRY; NANOTUBES, CARBON; PROTEINS; SOLUTIONS; X-RAY DIFFRACTION;

EID: 33746405155     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b604810m     Document Type: Review

References (78)

1. R. Marrington T. R. Dafforn D. J. Halsall A. Rodger Biophys. J. 2004 87 2002 2012
2. A. Rodger J. Rajendra R. Marrington M. Ardhammar B. Nordén J. D. Hirst A. T. B. Gilbert T. R. Dafforn D. J. Halsall C. A. Woolhead C. Robinson T. J. Pinheiro J. Kazlauskaite M. Seymour N. Perez M. J. Hannon Phys. Chem. Chem. Phys. 2002 4 4051 4057
3. A. Rodger, J. Rajendra, R. Marrington, R. Mortimer, T. Andrews, J. B. Hirst, A. T. B. Gilbert, D. Halsall, T. Dafforn, M. Ardhammar, B. Nordén, C. A. Woolhead, C. Robinson, T. Pinheiro, K. J. M. Seymour, N. Perez and M. J. Hannon, in Biophysical Chemistry: Membranes and Proteins, ed., R. H. Templer, and, R. Leatherbarrow,, The Royal Society of Chemistry, Cambridge, 2002, pp. 3-19
4. R. Marrington T. R. Dafforn D. J. Halsall M. Hicks A. Rodger Analyst 2005 130 1608 1616
5. R. Marrington M. Seymour A. Rodger Chirality 2006
6. B. Nordén M. Kubista T. Kuruscev Q. Rev. Biophys. 1992 25 51 170
7. B. Nordén Appl. Spectrosc. Rev. 1978 14 157 248
8. A. Rodger and B. Nordén, Circular Dichroism and Linear Dichroism, Oxford University Press, Oxford, 1997
9. B. Albinsson B. Nordén J. Phys. Chem. 1992 96 6204 6212
10. A. Holmen A. Broo B. Albinsson B. Norden J. Am. Chem. Soc. 1997 119 12240 12250
11. T. R. Dafforn J. Rajendra D. J. Halsall L. C. Serpell A. Rodger Biophys. J. 2004 86 404 410
12. A. Rodger, in Methods in Enzymology, ed., J. F. Riordan, and, B. L. Vallee,, Academic Press, San Diego, 1993, vol. 226, pp. 232-258
13. T. R. Dafforn J. Rajendra D. J. Halsall L. C. Serpell A. Rodger Biophys. J. 2004 86 404 410
14. L. B. A. Johansson A. Davidsson J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1 1985 81 1375 1388
15. A. Rodger J. Rajendra R. Marrington M. Ardhammar B. Norden J. D. Hirst A. T. B. Gilbert T. R. Dafforn D. J. Halsall C. A. Woolhead C. Robinson T. J. T. Pinheiro J. Kazlauskaite M. Seymour N. Perez M. J. Hannon Phys. Chem. Chem. Phys. 2002 4 4051 4057
16. M. Couette Ann. Chim. Phys 1890 6 433 510
17. A. Mallock Proc. R. Soc. London 1888 45 126
18. A. Mallock Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. A 1896 187 41
19. M. Kasai F. Oosawa Methods Enzymol. 1972 25 289 323
20. A. Wada S. Kozawa J. Polym. Sci., Part A 1964 2 853 864
21. S. Higashi M. Kasai F. Oosawa A. Wada J. Mol. Biol. 1963 7 421 430
22. J. Hofricheter W. Eaton Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 1976 5 511 560
23. B. Nordén Appl. Spectrosc. Rev. 1978 14 157 248
24. F. Oosawa Y. Maeda S. Fujime S. Ishiwata T. Yanagida M. Taniguchi J. Mechanochem. Cell Motil. 1977 4 63 78
25. B. Nordén M. Kubista T. Kurucsev Q. Rev. Biophys. 1992 25 51 170
26. R. J. Donnelly Phys. Today 1991 November 32 39
27. G. I. Taylor Proc. R. Soc. London, Ser. A 1923 223 289 343
28. G. I. Taylor Proc. R. Soc. London, Ser. A 1936 157 546 564
29. G. I. Taylor Proc. R. Soc. London, Ser. A 1936 157 565 578
30. A. Wada Biopolymers 1964 2 361 380
31. C. Lee N. Davidson Biopolymers 1968 6 531 550
32. P. Oriel J. Schellman Biopolymers 1966 4 469 494
33. J. O. Wilkes, Fluid Mechanics for Chemical Engineers, Prentice Hall PTR, Upper Saddle River, 1999
34. C. D. Anderick S. S. Liu H. L. Swinney J. Fluid Mech. 1986 164 155 183
35. O. Reynolds Philos. Trans. R. Soc. London 1883 174 935 982
36. O. Reynolds Proc. R. Soc. London 1883 35 84 99
37. M. C. Potter and D. C. Wiggert, Mechanics of Fluids, Brooks/Cole Thomson Learning, Pacific Grove, 3rd edn, 2002
38. M. Taniguchi R. Kuriyama Biochim. Biophys. Acta 1978 533 538 541
39. J. Nordh J. Deinum B. Norden Eur. Biophys. J. 1986 14 113 122
40. E. D. Korn M. F. Carlier D. Pantaloni Science 1987 238
41. S. L. Brenner E. D. Korn J. Biol. Chem. 1984 259 1441 1446
42. K. C. Holmes D. Popp W. Gebhard W. Kabsch Nature 1990 347 44 49
43. M. Miki K. Mihashi Biophys. Chem. 1977 6 101 106
44. M. Taniguchi Electro-Opt. Dielectr. Macromol. Colloids 1979 203 210
45. T. Yanagida M. Taniguchi F. Oosawa J. Mol. Biol. 1974 90 509 522
46. R. Marrington, PhD Thesis, University of Warwick (Coventry), 2004
47. M. J. Pandya G. M. Spooner M. Sunde J. R. Thorpe A. Rodger D. N. Woolfson Biochemistry 2000 39 8728 8734
48. F. G. Whitby G. N. Phillips, Jr Proteins: Struct., Funct., Genet. 2000 38 49 59
49. Molecular Probes, UK, 1993
50. L. C. Serpel, 2003, unpublished data
51. R. Marrington E. Small A. Rodger T. R. Dafforn S. Addinall J. Biol. Chem. 2004 47 48821 48829
52. F. J. Gueiros-Filho R. Losick Genes Dev. 2002 16 2544 2556
53. P.-J. Chou W. C. J. Johnson J. Am. Chem. Soc. 1993 115 1205 1214
54. B. Nordèn, S. Eriksson, S. K. Kim, M. Kubista, R. Lyng and B. Akerman, in The Jerusalem Symposia on Quantum Chemistry and Biochemistry, ed., B. Pullman, and, J. Jornter,, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht, 1990, vol. 23, pp. 23-41
55. A. Rodger I. S. Blagbrough G. Adlam M. L. Carpenter Biopolymers 1994 34 1583 1593
56. M. J. Hannon V. Moreno M. J. Prieto E. Molderheim E. Sletten I. Meistermann C. J. Isaac K. J. Sanders A. Rodger Angew. Chem., Int. Ed. 2001 40 879 884
57. D. Z. Coggan I. S. Haworth P. J. Bates A. Robinson A. Rodger Inorg. Chem. 1999 38 4486 4497
58. C. Houssier B. Hardy E. Fredercq Biopolymers 1974 13 1141 1160
59. M. Kubista B. Akerman B. Norden Biochemistry 1987 26 4545 4553
60. J. H. Moon S. K. Kim U. Sehlstedt A. Rodger B. Norden Biopolymers 1996 38 593 606
61. M. A. Ismail K. Sanders G. C. Fennell H. C. Latham P. Wormell A. Rodger Biopolymers 1998 46 127 143
62. B. Nordén F. Tjerneld FEBS Lett. 1976 67 368 370
63. K. K. Patel E. A. Plummer M. Darwish A. Rodger M. J. Hannon J. Inorg. Biochem. 2002 91 220 229
64. D. Z. M. Coggan I. S. Haworth P. J. Bates A. Robinson A. Rodger Inorg. Chem. 1999 38 4486 4497
65. A. Rodger A. Parkinson S. Best Eur. J. Inorg. Chem. 2001 9 2311 2316
66. F. Tjerneld B. Nordén H. Wallin Biopolymers 1982 21 343 358
67. B. Nordén K. Mortensen C. Elvingson M. Kubista B. Sjöberg M. Ryberg M. Takahashi J. Mol. Biol. 1991 226 1175 1191
68. T. Simonson M. Kubista Biopolymers 1993 33 1225 1235
69. T. R. Dafforn D. J. Halsall A. Rodger Chem. Commun. 2001 2410 2411
70. M. R. Hicks, A. Rodger, C. M. Thomas, S. Blatt and T. R. Dafforn, Biochemistry, 2006, submitted for publication
71. D. J. Halsall T. R. Dafforn R. Marrington E. Halligan A. Rodger IVD Technol. 2004 6 51 60
72. J. Rajendra M. Baxendale L. G. Dit Rap A. Rodger J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11182 11188
73. J. Rajendra A. Rodger Chem.-Eur. J. 2005 11 4841 4848
74. M. J. Pandya G. M. Spooner M. Sunde J. R. Thorpe A. Rodger D. N. Woolfson Biochemistry 2000 39 8728 8734
75. S. S. Lehrer G. Kerwar Biochemistry 1972 11 1211 1217
76. A. H. Criddle M. A. Geeves T. E. Jeffries Biochem. J. 1985 232 343 349
77. R. Maytum S. S. Lehrer M. A. Geeves Biochemistry 1999 38 1102 1110
78. E. Gasteiger A. Gattiker C. Hoogland I. Ivanyi R. D. Appel A. Bairoch Nucleic Acids Res. 2003 31 3784 3788