Vibrational spectroscopy and normal-mode analysis of Fe(II) octaethylporphyrin

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 26, 2006, Pages 13277-13282

  Starovoitova, Valeriia ^a   Budarz, Timo E ^a,d   Wyllie, Graeme R A ^b   Scheidt, W Robert ^b   Sturhahn, Wolfgang ^c   Alp, E Ercan ^c   Prohofsky, E W ^a   Durbin, Stephen M ^a  

^a PURDUE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF NOTRE DAME   (United States)

^c ARGONNE NATIONAL LABORATORY   (United States)

^d Santa Ana College   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

IRON; IRON COMPOUNDS; MOLECULAR STRUCTURE; MOLECULAR VIBRATIONS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

FORCE CONSTANTS; HEME COMPOUNDS; INTERMOLECULAR CONTACTS; NUCLEAR RESONANCE VIBRATIONAL SPECTROSCOPY (NRVS);

PORPHYRINS;

EID: 33746379875     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp060345p     Document Type: Article

References (46)

1. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
2. Brooks, B.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1985, 82, 4995.
3. MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D. ; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586.
4. Kaie, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Krawetz, N.; Phillips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J. Comput. Phys. 1999, 151, 283.
5. Scheidt, W. R.; Reed, C. A. Chem. Rev. 1981, 81, 543.
6. Resonance Roman Spectra of Heme and Metalloproteins; Spiro, T. G., Ed.; Wiley-Interscience: New York, 1988; Vol. 3.
7. Hoard, J. L.; Scheldt, W. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 1973, 70, 3919.
8. Rai, B. K.; Prohofsky, E. W.; Durbin, S. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 18983.
9. Melchers, B.; Knapp, E. W.; Parak, F.; Cordone, L.; Cupane, A.; Leone, M. Biophys. J. 1996, 70, 2092.
10. Kozlowski, P. M.; Spiro, T. G.; Berces, A.; Zgierski, M. Z. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2603.
11. Kozlowski, P. M.; Spiro, T. G.; Zgierski, M. Z. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10659.
12. Mouawad, L.; Perahia, D. J. Mol. Biol. 1996, 258, 393.
13. Parak, F. G. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 552.
14. Scheldt, W. R.; Durbin, S. M.; Sage, J. T. J. Inorg. Biochem. 2005, 99, 60.
15. Abe, M.; Kitagawa, T.; Kyogoku, Y. Chem. Lett. 1976, 249.
16. Hu, S. Z.; Morris, I. K.; Singh, J. P.; Smith, K. M.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12446.
17. Li, X. Y.; Czernuszewicz, R. S.; Kincaid, J. R.; Su, Y. O.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1990, 94, 31.
18. Li, X. Y.; Czernuszewicz, R. S.; Kincaid, J. R.; Stein, P.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1990, 94, 47.
19. Seto, M.; Yoda, Y.; Kikuta, S.; Zhang, X. W.; Ando, M. Phys. Rev. Lett. 1995, 74, 3828.
20. Sturhahn, W.; Toellner, T. S.; Alp, E. E.; Zhang, X.; Ando, M.; Yoda, Y. ; Kikuta, S.; Seto, M.; Kimball, C. W.; Dabrowski, B. Phys. Rev. Lett. 1995, 74, 3832.
21. Sturhahn, W.; Alp, E. E.; Toellner, T. S.; Hession, P.; Hu, M.; Sutler, J. Hyperfine Interact. 1998, 113, 47.
22. Chumakov, A. I.; Sturhahn, W. Hyperfine Interact. 1999, 123, 781.
23. Sturhahn, W. Hyperfine Interact. 2000, 125, 149.
24. Alp, E. E.; Sturhahn, W.; Toellner, T. S. Hyperfine Interact. 2001, 135, 295.
25. Alp, E. E.; Sturhahn, W.; Toellner, T. S.; Zhao, J.; Hu, M.; Brown, D. E. Hyperfine Interact. 2002, 144, 3.
26. Sturhahn, W. J. Phys.: Condens. Matter 2004, 16, S497.
27. Rai, B. K.; Durbin, S. M.; Prohofsky, E. W.; Sage, J. T.; Ellison, M. K. ; Scheidt, W. R.; Sturhahn, W.; Alp, E. E. Phys. Rev. E 2002, 66.
28. Rai, B. K.; Durbin, S. M.; Prohofsky, E. W.; Sage, J. T.; Wyllie, G. R. A.; Scheidt, W. R.; Sturhahn, W.; Alp, E. E. Biophys. J. 2002, 82, 2951.
29. Budarz, T. E.; Prohofsky, E. W.; Durbin, S. M.; Sjodin, T.; Sage, J. T.; Sturhahn, W.; Alp, E. E. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 11170.
30. Rai, B. K.; Durbin, S. M.; Prohofsky, E. W.; Sage, J. T.; Ellison, M. K. ; Roth, A.; Scheidt, W. R.; Sturhahn, W.; Alp, E. E. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6927.
31. Wilson, E. B.; Decius, J. C.; Cross, P. C. Molecular Vibrations; Dover: New York, 1980.
32. Landergren, M.; Baltzer, L. Inorg. Chem. 1990, 29, 556.
33. Stolzenberg, A. M.; Strauss, S. H.; Holm, R. H. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 4763.
34. Dolphin, D.; Sams, J. R.; Tsin, T. B.; Wong, K. L. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 6970.
35. Sturhahn, W.; Kohn, V. G. Hyperfine Interact. 1999, 123, 367.
36. Strauss, S. H.; Silver, M. E.; Long, K. M.; Thompson, R. G.; Hudgens, R. A.; Spartalian, K.; Ibers, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 4207.
37. Spiro, T. G.; Li, X. Y. Resonance Raman spectroscopy of metalloporphyrins. In Biological Applications of Raman Spectroscopy; Spiro, T. G., Ed.; Wiley-Interscience: New York, 1988; Vol. 3, p 1.
38. Procyk, A. D.; Bocian, D. F. Annu. Rev. Phys. Chem. 1992, 43, 465.
39. Kitagawa, T.; Teraoka, J. Chem. Phys. Lett. 1979, 63, 443.
40. Abe, M.; Kitagawa, T.; Kyogoku, Y. J. Chem. Phys. 1978, 69, 4526.
41. Kincaid, J. R.; Urban, M. W.; Watanabe, T.; Nakamoto, K. J. Phys. Chem. 1983, 87, 3096.
42. Ghosh, A.; Bocian, D. F. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6363.
43. Scott, A. P.; Radom, L. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16502.
44. Kozlowski, P. M.; Jarzecki, A. A.; Pulay, P. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7007.
45. Kozlowski, P. M.; Jarzecki, A. A.; Pulay, P.; Li, X. Y.; Zgierski, M. Z. J. Phys. Chem. 1996, 100, 13985.
46. Kozlowski, P. M.; Rush, T. S.; Jarzecki, A. A.; Zgierski, M. Z.; Chase, B.; Piffat, C.; Ye, B. H.; Li, X. Y.; Pulay, P.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 1357.