Structural and functional properties of NAD kinase, a key enzyme in NADP biosynthesis

Mini-Reviews in Medicinal Chemistry

Volumn 6, Issue 7, 2006, Pages 739-746

  Magni, Giulio ^a   Orsomando, Giuseppe ^a   Raffaelli, Nadia ^a  

^a UNIVERSITÀ POLITECNICA DELLE MARCHE   (Italy)

Author keywords

Antimicrobial agents; Kinetic analysis; NADP biosynthesis; Pyridine dinucleotides; Recombinant protein

Indexed keywords

ANTIINFECTIVE AGENT; BACTERIAL ENZYME; ENZYME INHIBITOR; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE KINASE; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE; TUBERCULOSTATIC AGENT;

BACILLUS SUBTILIS; CRYSTAL STRUCTURE; DRUG DESIGN; ENZYME ACTIVITY; ENZYME ANALYSIS; ENZYME KINETICS; ENZYME STRUCTURE; ESCHERICHIA COLI; GENETIC CODE; HUMAN; MICROCOCCUS LUTEUS; MOLECULAR DYNAMICS; MUTAGENESIS; MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS; NONHUMAN; PYROCOCCUS HORIKOSHII; REVIEW; SIGNAL TRANSDUCTION;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMALS; HUMANS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NADP; PHOSPHOTRANSFERASES (ALCOHOL GROUP ACCEPTOR); SEQUENCE HOMOLOGY, AMINO ACID; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 33745854833     PISSN: 13895575     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138955706777698688     Document Type: Review

References (60)

1. Warburg, O.; Christian, W. Biochem. Z. 1931, 242, 206.
2. Kornberg, A.; Pricer, W.E. J. Biol. Chem. 1950, 186, 557.
3. Berger, F.; Ramirez-Hernandez, M.H.; Ziegler, M. Trends Biochem. Sci. 2004, 29, 111.
4. Jo, S.H.; Son, M.K.; Koh, H.J.; Lee, S.M.; Song, I.H.; Kim, Y.O.; Lee, Y.S.; Jeong, K.S.; Kim, W.B.; Park, J.W.; Song, B.J.; Huh, T.L.; Huhe, T.L. J. Biol. Chem. 2001, 276, 16168.
5. Outten, C.E.; Culotta, C. EMBO J. 2003, 22, 2015.
6. Kim, H.J.; Kangs, B.S.; Park, J.W. Free Radic. Res. 2005, 39, 441.
7. Wolin, M.S.; Ahmad, M.; Gupte, S.A. Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2005, 289, 159.
8. Yamasaki, M.; Churchill, G.C., Galione, A. FEBS J. 2005, 272, 4598.
9. Chini, E.N. Biol. Res. 2004, 37, 559.
10. Patel, S. Biol. Cell. 2004, 96, 19.
11. Rutter, G.A. Biochem. J. 2003, 373, 313.
12. Guse, A.H. Curr. Mol. Med. 2002, 2, 273.
13. Genazzani, A.A.; Billington, R.A. Trends Pharmacol. Sci. 2002, 23, 165.
14. McGuinness, E.T.; Butler, J.R. Int. J. Biochem. 1985, 17, 1.
15. Kawai, S.; Suzuki, S.; Mori, S.; Murata, K. FEMS Microbiol. Lett. 2001, 200, 181.
16. Lesuisse, E.; Casteras-Simon, M.; Labbe, P. J. Biol. Chem. 1996, 271, 13578.
17. Iwahashi, Y.; Hitoshio, A.; Tajima, N.; Nakamura, T. J. Biochem. 1989, 105, 588.
18. Iwahashi, Y.; Nakamura, T. J. Biochem. 1989, 105, 916.
19. Strand, M.K.; Stuart, G.R.; Longley, M.J.; Graziewicz, M.A.; Dominick, O.C.; Copeland, W.C. Eukaryot. Cell 2003, 2, 809.
20. Shi, F.; Kawai, S.; Mori, S.; Kono, E.; Murata, K. FEBS J. 2005, 272, 3337.
21. Kobayashi, K.; Ehrlich, S.D.; Albertini, A.; Amati, A.; Andersen, K.K.; Arnaud, M.; Asai, K.; Ashikaga, S.; Aymerich, S.; Bessieres, P.; Boland, F.; Brignell, S.C.; Bron, S.; Bunai, K.; Chapuis, J.; Christiansen, L.C.; Danchin, A.; Debarbouille, M.; Dervyn, E.; Deuerling, E.; Devine, K.; Devine, S.K.; Dreesen, O.; Errington, J.; Fillinger, S.; Foster, S.J.; Fujita, Y.; Galizzi, A.; Gardan, R.; Eschevins, C.; Fukushima, T.; Haga, K.; Harwood, C.R.; Hecker, M.; Hosoya, D.; Hullo, M.F.; Kakeshita, H.; Karamata, D.; Kasahara, Y.; Kawamura, F.; Koga, K.; Koski, P.; Kuwana, R.; Imamura, D.; Ishimaru, M.; Ihikawa, S.; Ishio, I.; Le Coq, D.; Mason, A.; Manuel, C.; Meima, R.; Mellado, R.P.; Moir, A.; Moriya, S.; Nagakawa, E.; Nanamiya, H.; Nakai, S.; Nygaard, P.; Ogura, M.; Ohanan, T.; O'Reilly, M.; O'Rourke, M.; Pragai, Z.; Pooley, H.M.; Rapoport, G.; Rawlins, J.P.; Rivas, L.A.; Rivolta, C.; Sadaie, A.; Sadaie, Y.; Sarvas, M.; Sato, T.; Saxild, H.H.; Scalan, E.; Schumann, W.; Seegers, J.F.; Sekiguchi, J.; Sekowska, A.; Seror, S.; Simon, M.; Stragier, P.; Studer, R.; Takamatsu, H.; Tanaka, T.; Takeuchi, M.; Thomaides, H.B.; Vagner, V.; van Dijl, J.M.; Watabe, K.; Wipat, A.; Yamamoto, H.; Yamamoto, M.; Yamamoto, Y.; Yamane, K.; Yata, K.; Yoshida, K.; Yoshikawa, H.; Zuber, U; Ogasawara, N. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 4678.
22. Sassetti, C.M.; Boyd, D.H.; Rubin, E. J. J. Mol. Microbiol. 2003, 48, 77.
23. Gerdes, S.Y.; Scholle, M.D.; D'Souza, M.; Bernal, A.; Baev, M.V.; Farrell, M.; Kurnasov, O.; Daugherty, M.D.; Mseeh, F.; Polanuyer, B.M.; Campbell, J.W.; Anantha, S.; Shatalin, K.Y.; Chowdhury, S.A.; Fonstein, M.Y.; Osterman, A.L. J. Bacteriol. 2002, 184, 4555.
24. Kawai, S.; Mori, S.; Mukai, T.; Suzuki, S.; Yamada, T.; Hashimoto, W.; Murata, K. Biochem. Biophys. Res. Comm. 2000, 276, 57.
25. Kawai, S.; Mori, S.; Mukai, T.; Hashimoto, W.; Murata, K. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 4359.
26. Kawai, S.; Mori, S.; Murata, K. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2003, 67, 1751.
27. Garavaglia, S.; Galizzi, A.; Rizzi, M. J. Bacteriol. 2003, 185, 4844.
28. Ochiai, A.; Mori, S.; Kawai, S.; Murata, K. Protein Expr. Purif. 2004, 36, 124.
29. Sakuraba, H.; Kawakami, R.; Ohshima, T. Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 4352.
30. Liu, J.; Lou, Y.; Yokota, H.; Adams, P.D.; Kim, R.; Kim, S.H. J. Mol. Biol. 2005, 354, 289.
31. Labesse, G.; Douguet, D.; Assairi, L.; Gilles, A.M. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 273.
32. Raffaelli, N.; Finaurini, L.; Mazzola, F.; Pucci, L.; Sorci, L.; Amici, A.; Magni, G. Biochemistry, 2004, 43, 7610.
33. Mori, S.; Yamasaki, M.; Maruyama, Y.; Momma, K.; Kawai, S.; Hashimoto, W.; Mikami, B.; Murata, K. Biochem. Biophys. Res. Comm. 2005, 327, 500.
34. Garavaglia, S.; Raffaelli, N.; Finaurini, L.; Magni, G.; Rizzi, M. J. Biol. Chem. 2004, 279, 40980.
35. Zerez, C.R.; Moul, D.E.; Gomez, E.G.; lopez, V.M.; Andreoli, A.J. J. Bacteriol. 1987, 169, 184.
36. Zerez, C.R.; Moul, D.E.; Andreoli, A.J. Arch. Microbiol. 1986, 144, 313.
37. Lopez, V.; Gomez, E.; Kwong, H.; Andreoli, A. J. Fed. Proc. 1985, 44, 2649.
38. Denicola-Seoane, A.; Anderson, B.M. J. Gen. Microbiol. 1990, 136, 425.
39. Wood, H.G.; Clark, J.E. Ann. Rev. Biochem. 1988, 57, 235.
40. Kornberg, A. J. Bacteriol. 1995, 177, 491.
41. Mori, S.; Kawai, S.; Feng, S.; Mikami, B.; Murata, K. J. Biol. Chem. 2005, 280, 24104.
42. Kawai, S.; Fukuda, C.; Mukai, T.; Murata, K. J. Biol. Chem. 2005, 280, 39200.
43. Villee, C.A.; Hagerman, D.D. J. Biol. Chem. 1958, 233, 42.
44. DeChatelet, L.R.; McCall, C.E.; Cooper, M.R.; Shirley, P.S. J. Reticuloendothel. Soc. 1972, 12, 387.
45. Pescarmona, G.P.; Bracone, A.; David, O.; Sartori, M.L.; Bosia, A. Acta Biol. Med. Ger. 1977, 36, 759.
46. Williams, M.B.; Jones, H.P. Arch. Biochem. Biophys. 1985, 237, 80.
47. Lerner, F.; Niere, M.; Ludwig, A.; Ziegler, M. Biochem. Biophys. Res. Comm. 2001, 288, 69.
48. Epel, D.; Patton, C.; Wallace, R.W.; Cheung, W.Y. Cell, 1981, 23, 543.
49. Iwasa, F.; Mohri, H. J. Biochem. 1983, 94, 575.
50. Muto, S.; Miyachi, S. Plant Physiol. 1977, 59, 55.
51. Dieter, P.; Marme, D. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1980, 356, 371.
52. Anderson, J.M.; Charbonneau, H.; Jones, H.P.; McCann, R.O.; Cormier, M.J. Biochemistry, 1980, 19, 3113.
53. Cormier, M.J.; Charbouneau, H.; Jarrett, H.W. Cell Calcium 1981, 2, 313.
54. Dieter, P.; Marme, D. J. Biol. Chem. 1984, 259, 184.
55. Liao, B.; Gawienowski, M.C.; Zielinski, R.E. Arch. Biochem. Biophys. 1996, 327, 53.
56. Zielinski, R.E. Annu. Rev. Plant Mol. Biol. 1998, 49, 697.
57. Pou De Crescenzo, M.A.; Gallais, S.; Leon, A.; Laval-Martin, D.L. J. Membr. Biol. 2001, 182, 135.
58. Turner, W.L.; Waller, J.C.; Vanderbeld, B.; Snedden, W.A. Plant Physiol. 2004, 135, 1243.
59. Shirakihara, Y.; Evans, P.R. J. Mol. Biol. 1988, 204, 973.
60. Pitson, S.M.; Moretti, P.A.; Zebol, J.R.; Zareie, R.; Derian, C.K.; Darrow, A.L. J. Biol. Chem. 2002, 277, 49545.