Chemical genetics

Chemical Reviews

Volumn 106, Issue 6, 2006, Pages 2476-2530

  Walsh, Daniel P ^a   Chang, Young Tae ^a  

^a NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHEMISTRY; OPTIMIZATION;

CHEMICAL GENETICS;

GENETIC ENGINEERING;

ANIMAL; CHEMICAL STRUCTURE; COMBINATORIAL CHEMISTRY; FUNGUS; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETIC DATABASE; GENETIC PROCEDURES; HUMAN; MUTAGENESIS; PLANT; REVIEW; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

ANIMALS; COMBINATORIAL CHEMISTRY TECHNIQUES; DATABASES, GENETIC; FUNGI; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETIC TECHNIQUES; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR PROBE TECHNIQUES; MUTAGENESIS; PLANTS; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 33745726644     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr0404141     Document Type: Review

References (549)

1. Schreiber, S. L. Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 1127.
2. Mitchison, T. J. Chem. Biol. 1994, 1, 3.
3. Darvas, F.; Dorman, G.; Krajcsi, P.; Puskas, L. G.; Kovari, Z.; Lorincz, Z.; Urge, L. Curr. Med. Chem. 2004, 11, 3119.
4. Thorpe, D. S. Comb. Chem. High Throughput Screening 2003, 6, 623.
5. Blackwell, H. E.; Zhao, Y. D. Plant Physiol. 2003, 133, 448.
6. Asami, T.; Nakano, T.; Nakashita, H.; Sekimata, K.; Shimada, Y.; Yoshida, S. J. Plant Growth Regul. 2003, 22, 336.
7. Stockwell, B. R. Trends Biotechnol. 2000, 18, 449.
8. Shuker, D. E. G. Annu. Rep. Prog. Chem. B: Org. Chem. 2004, 100, 191.
9. Lokey, R. S. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 91.
10. Crews, C. M.; Splittgerber, U. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 317.
11. Burdine, L.; Kodadek, T. Chem. Biol. 2004, 11, 593.
12. Specht, K. M.; Shokat, K. M. Curr. Opin. Cell Biol. 2002, 14, 155.
13. Flaumenhaft, R.; Sim, D. S. Chem. Biol. 2003, 10, 481.
14. Zheng, X. F.; Chan, T. F. Drug Discovery Today 2002, 7, 197.
15. Mayer, T. U. Trends Cell Biol. 2003, 13, 270.
16. Koh, B.; Crews, C. M. Neuron 2002, 36, 563.
17. Stockwell, B. R. Nat, Rev. Genet. 2000, 1, 116.
18. Branda, C. S.; Dymecki, S. M. Dev. Cell 2004, 6, 7.
19. Anderson, K. V.; Ingham, P. W. Nat. Genet. 2003, 33 (Suppl), 285.
20. Justice, M. J.; Noveroske, J. K.; Weber, J. S.; Zheng, B.; Bradley, A. Hum. Mol. Genet. 1999, 8, 1955.
21. Vitaterna, M. H.; King, D. P.; Chang, A. M.; Kornhauser, J. M.; Lowrey, P. L.; McDonald, J. D.; Dove, W. F.; Pinto, L. H.; Turek, F. W.; Takahashi, J. S. Science 1994, 264, 719.
22. Carroll, P. M.; Dougherty, B.; Ross-Macdonald, P.; Browman, K.; FitzGerald, K. Pharmacol. Ther. 2003, 99, 183.
23. Pichler, F. B.; Laurenson, S.; Williams, L. C.; Dodd, A.; Copp, B. R.; Love, D. R. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 879.
24. Alaimo, P. J.; Shogren-Knaak, M. A.; Shokat, K. M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 360.
25. Kim, T. K. J. Biochem. Mol. Biol. 2004, 37, 53.
26. Yeh, J. R. J.; Crews, C. M. Dev. Cell 2003, 5, 11.
27. MacBeath, G. Genome Biol. 2001, 2, COMMENT2005.
28. Shokat, K.; Velleca, M. Drug Discovery Today 2002, 7, 872.
29. Ward, G. E.; Carey, K. L.; Westwood, N. J. Cell. Microbiol. 2002, 4, 471.
30. Zheng, X. S.; Chan, T. F.; Zhou, H. H. Chem. Biol. 2004, 11, 609.
31. Strausberg, R. L.; Schreiber, S. L. Science 2003, 300, 294.
32. Stuckey, J.; Thomas, R. Modern Drug Discovery 2002, 5, 37.
33. Stockwell, B. R. Nature 2004, 4, 24.
34. Zanders, E. D.; Bailey, D. S.; Dean, P. M. Drug Discovery Today 2002, 7, 711.
35. Darvas, F., Guttman, A., Dorman, G., Eds. Chemical Genomics; Marcel Dekker: New York, 2004.
36. Bredel, M.; Jacoby, E. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 262.
37. Bleicher, K. H. Curr. Med. Chem. 2002, 9, 2077.
38. Browne, L. J.; Furness, L. M.; Natsoulis, G.; Pearson, C.; Jarnagin, K. Targets 2002, 1, 59.
39. Caron, P. R. Drug Discovery Today 2002, 7, 1121.
40. Falb, D.; Jindal, S. Curr. Opin. Drug Discovery Dev. 2002, 5, 532.
41. Sehgal, A. Curr. Opin. Drug Discovery Dev. 2002, 5, 526.
42. Huang, Y.; Sadee, W. Drug Discovery Today 2003, 8, 356.
43. Hacksell, U.; Nash, N.; Burstein, E. S.; Piu, F.; Croston, G.; Brann, M. R. Cytotechnology 2002, 38, 3.
44. Gagna, C. E.; Winokur, D.; Lambert, W. C. Cell Biol. Int. 2004, 28, 755.
45. Jung, M.; Kim, H.; Kim, M. Curr. Med. Chem. 2003, 10, 757.
46. Brenner, C. Genome Biol. 2004, 5.
47. Sehgal, A. Curr. Med. Chem. 2003, 10, 749.
48. Savchuk, N. P.; Balakin, K. V.; Tkachenko, S. E. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 412.
49. Willson, T. M.; Jones, S. A.; Moore, J. T.; Kliewer, S. A. Med. Res. Rev. 2001, 21, 513.
50. Giaever, G. Trends Pharmacol. Sci. 2003, 24, 444.
51. Wagner, B. K.; Haggarty, S. J.; Clemons, P. A. Am. J. Pharmaco-Genomics 2004, 4, 313.
52. Jacoby, E.; Schuffenhauer, A.; Floersheim, P. Drug News Perspect. 2003, 16, 93.
53. Dolle, R. E. Mol. Diversity 1998, 4, 233.
54. Dolle, R. E. Mol. Diversity 1998, 3, 199.
55. Dolle, R. E. J. Comb. Chem. 2000, 2, 383.
56. Dolle, R. E. J. Comb. Chem. 2001, 3, 477.
57. Dolle, R. E. J. Comb. Chem. 2002, 4, 369.
58. Dolle, R. E. J. Comb. Chem. 2003, 5, 693.
59. Dolle, R. E. J. Comb. Chem. 2004, 6, 623.
60. Dolle, R. E.; Nelson, K. H. J. Comb. Chem. 1999, 1, 235.
61. Darvas, F.; Dorman, G.; Urge, L.; Szabo, I.; Ronai, Z.; Sasvari-Szekely, M. Pure Appl. Chem. 2001, 73, 1487.
62. Breinbauer, R.; Vetter, I. R.; Waldmann, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 2879.
63. Abel, U.; Koch, C.; Speitling, M.; Hansske, F. G. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 453.
64. Khersonsky, S. M.; Chang, Y. T. ChemBioChem 2004, 5, 903.
65. Ortholand, J. Y.; Ganesan, A. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 271.
66. Rouhi, A. M. Chem. Eng. News 2003, 81, 77.
67. Rouhi, A. M. Chem. Eng. News 2003, 81, 93.
68. Rouhi, A. M. Chem. Eng. News 2003, 81, 104.
69. Knepper, K.; Gil, C.; Brase, S. Comb. Chem. High Throughput Screening 2003, 6, 673.
70. Eldridge, G. R.; Vervoort, H. C.; Lee, C. M.; Cremin, P. A.; Williams, C. T.; Hart, S. M.; Goering, M. G.; O'Neil-Johnson, M.; Zeng, L. Anal. Chem. 2002, 74, 3963.
71. Arya, P.; Joseph, R.; Chou, D. T. H. Chem. Biol. 2002, 9, 145.
72. Boldi, A. M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 281.
73. Brohm, D.; Metzger, S.; Bhargava, A.; Muller, O.; Lieb, F.; Waldmann, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 41, 307.
74. Lee, M. L.; Schneider, G. J. Comb. Chem. 2001, 3, 284.
75. Nicolaou, K. C.; Pfefferkorn J. A.; Roecker, A. J.; Cao, G. Q.; Barluenga, S.; Mitchell, H. J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9939.
76. Nicolaou, K. C.; Pfefferkorn, J. A.; Mitchell, H. J.; Roecker, A. J.; Barluenga, S.; Cao, G. Q.; Affleck, R. L.; Lillig, J. E. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9954.
77. Nicolaou, K. C.; Pfefferkorn, J. A.; Barluenga, S.; Mitchell, H. J.; Roecker, A. J.; Cao, G. Q. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9968.
78. Tan, D. S.; Foley, M. A.; Stockwell, B. R.; Shair, M. D.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9073.
79. Pelish, H. E.; Westwood, N. J.; Feng, Y.; Kirchhausen, T.; Shair, M. D. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6740.
80. Weber, L. Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 295.
81. Khersonsky, S. M.; Chang, Y. T. Comb. Chem. High Throughput Screening 2004, 7, 645.
82. Bagley, M. C.; Hughes, D. D.; Lubinu, M. C.; Merritt, E. A.; Taylor, P. H.; Tomkinson, N. C. O. QSAR Comb. Sci. 2004, 23, 859.
83. Ding, S.; Gray, N. S.; Ding, Q.; Wu, X.; Schultz, P. G. J. Comb. Chem, 2002, 4, 183.
84. Smukste, I.; Stockwell, B. R. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2005, 6, 261.
85. Lipinski, C. A.; Lombardo, F.; Dominy B. W.; Feeney, P. J. Adv. Drug Delivery Rev. 1997, 23, 3.
86. Druker, B. J.; Tamura, S.; Buchdunger, E.; Ohno, S.; Segal, G. M.; Fanning, S.; Zimmermann, J.; Lydon, N. B. Nat. Med. 1996, 2, 561.
87. Borman, S. Chem. Eng. News 2004, 82, 32.
88. Burke, M. D.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 46.
89. Schreiber, S. L. Science 2000, 287, 1964.
90. Blackwell, H. E.; Perez, L.; Stavenger, R. A.; Tallarico, J. A.; Cope Eatough, E.; Foley, M. A.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2001, 8, 1167.
91. Clemons, P. A.; Koehler, A. N.; Wagner, B. K.; Sprigings, T. G.; Spring, D. R.; King, R. W.; Schreiber, S. L.; Foley, M. A. Chem. Biol. 2001, 8, 1183.
92. Lo, M. M.-C.; Neumann, S.; Nagayama, S.; Perlstein, E. O.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem, Soc. 2004, 126, 16077.
93. Burke, M. D.; Berger, E. M.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14095.
94. Spring, D. R. Org. Biomol. Chem. 2003, 1, 3867.
95. Tan, D. S.; Foley, M. A.; Shair, M. D.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8565.
96. Burke, M. D.; Berger, E. M.; Schreiber, S. L. Science 2003, 302, 613.
97. Wu, C. Y.; Chang, C. F.; Chen, J. S. Y.; Wong, C. H.; Lin, C. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 4661.
98. Liu, J. J.; Numa, M. M. D.; Liu, H., T.; Huang, S. J.; Sears, P.; Shikhman, A. R.; Wong, C. H. J. Org. Chem. 2004, 69, 6273.
99. Best, M. D.; Brik, A.; Chapman, E.; Lee, L. V.; Cheng, W. C.; Wong, C. H. ChemBioChem 2004, 5, 811.
100. Brik, A.; Muldoon, J.; Lin, Y. C.; Elder, J. H.; Goodsell, D. S.; Olson, A. J.; Fokin, V. V.; Sharpless, K. B.; Wong, C. H. ChemBioChem 2003, 4, 1246.
101. Brik, A.; Lin, Y. C.; Elder, J.; Wong, C. H. Chem. Biol. 2002, 9, 891.
102. Stavenger, R. A.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 3417.
103. Wipf, P.; Stephenson, C. R. J.; Walczak, M. A. A. Org. Lett. 2004, 6, 3009.
104. Kwon, O.; Park, S. B.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 13402.
105. Micalizio, G. C.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 3272.
106. Micalizio, G. C.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 152.
107. Tallarico, J. A.; Depew, K. M.; Pelish, H. E.; Westwood, N. J.; Lindsley, C. W.; Shair, M. D.; Schreiber, S. L.; Foley, M. A. J. Comb. Chem. 2001, 3, 312.
108. Ding, S.; Gray, N. S.; Wu, X.; Ding, Q.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1594.
109. Schmidt, D. R.; Kwon, O.; Schreiber, S. L. J. Comb. Chem. 2004, 6, 286.
110. Kubota, H.; Lim, J.; Depew, K. M.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2002, 9, 265.
111. Sternson, S. M.; Louca, J. B.: Wong, J. C.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 1740.
112. Spring, D. R.; Krishnan, S.; Blackwell, H. E.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1354.
113. Wong, J. C.; Sternson, S. M.; Louca, J. B.; Hong, R.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2004, 11, 1279.
114. Mitsopoulos, G.; Walsh, D. P.; Chang, Y. T. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 26.
115. Nielsen, P. E.; Egholm, M.; Berg, R. H.; Buchardt, O. Science 1991, 254, 1497.
116. Winssinger, N.; Harris, J. L.; Backes, B. J.; Schultz, P. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 3152.
117. Winssinger, N.; Ficarro, S.; Schultz, P. G.; Harris, J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 11139.
118. Harris, J.; Mason, D. E.; Li, J.; Burdick, K. W.; Backes, B. J.; Chen, T.; Shipway, A.; Van Heeke, G.; Gough, L.; Ghaemmaghami, A.; Shakib, F.; Debaene, F.; Winssinger, N. Chem. Biol. 2004, 11, 1361.
119. Debaene, F.; Mejias, L.; Harris, J. L.; Winssinger, N. Tetrahedron 2004, 60, 8677.
120. Debaene, F.; Winssinger, N. Org. Lett. 2003, 5, 4445.
121. Winssinger, N.; Damoiseaux, R.; Tully, D. C.; Geierstanger, B. H.; Burdick, K.; Harris, J. L. Chem. Biol. 2004, 11, 1351.
122. Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 2004.
123. Kolb, H. C.; Sharpless, K. B. Drug Discovery Today 2003, 8, 1129.
124. Lee, L. V.; Mitchell, M. L.; Huang, S. J.; Fokin, V. V.; Sharpless, K. B.; Wong, C. H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9588.
125. Lober, S.; Gmeiner, P. Tetrahedron 2004, 60, 8699.
126. Lober, S.; Rodriguez-Loaiza, P.; Gmeiner, P. Org. Lett. 2003, 5, 1753.
127. Bettinetti, L.; Löber, S.; Hübner, H.; Gmeiner, P. J. Comb. Chem. 2005, 7, 309.
128. Lewis, W. G.; Green, L. G.; Grynszpan, F.; Radic, Z.; Carlier, P. R.; Taylor, P.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 1053.
129. Manetsch, R.; Krasinski, A.; Radic, Z.; Raushel, J.; Taylor, P.; Sharpless, K. B.; Kolb, H. C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 12809.
130. Mocharla, V. P.; Colasson, B.; Lee, L. V.; Roper, S.; Sharpless, K. B.; Wong, C. H.; Kolb, H. C. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 116.
131. Speers, A. E.; Cravatt, B. F. ChemBioChem 2004, 5, 41.
132. Speers, A. E.; Adam, G. C.; Cravatt, B. F. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4686.
133. Speers, A. E.; Cravatt, B. F. Chem. Biol. 2004, 11, 535.
134. Greenbaum, D. C.; Arnold, W. D.; Lu, F.; Hayrapetian, L.; Baruch, A.; Krumrine, J.; Toba, S.; Chehade, K.; Bromme, D.; Kuntz, I. D.; Bogyo, M. Chem. Biol. 2002, 9, 1085.
135. Greenbaum, D. C.; Baruch, A.; Grainger, M.; Bozdech, Z.; Medzihradszky, K. F.; Engel, J.; DeRisi, J.; Holder, A. A.; Bogyo, M. Science 2002, 298, 2002.
136. Greenbaum, D.; Baruch, A.; Hayrapetian, L.; Darula, Z.; Burlingame, A.; Medzihradszky, K. F.; Bogyo, M. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 60.
137. Jeffery, D. A.; Bogyo, M. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 87.
138. Melkko, S.; Scheuermann, J.; Dumelin, C. E.; Neri, D. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 568.
139. Khersonsky, S. M.; Jung, D. W.; Kang, T. W.; Walsh, D. P.; Moon, H. S.; Jo, H.; Jacobson, E. M.; Sherry, V.; Neubert, T. A.; Chang, Y. T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11804.
140. Uttamchandani, M.; Walsh, D. P.; Khersonsky, S. M.; Huang, X.; Yao, S. Q.; Chang, Y. T. J. Comb. Chem. 2004, 6, 862.
141. Lee, J. W.; Jung, M.; Rosania, G. R.; Chang, Y. T. Chem. Commun. 2003, 1852.
142. Rosania, G. R.; Lee, J. W.; Ding, L.; Yoon, H. S.; Chang, Y. T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1130.
143. Li, Q. A.; Lee, J. S.; Ha, C.; Park, C. B.; Yang, G.; Gan, W. B.; Chang, Y. T. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 6331.
144. Maly, D. J.; Choong, I. C.; Ellman, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 2419.
145. Kehoe, J. W.; Maly, D. J.; Verdugo, D. E.; Armstrong, J. I.; Cook, B. N.; Ouyang, Y. B.; Moore, K. L.; Ellman, J. A.; Bertozzi, C. R. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002, 12, 329.
146. Erlanson, D. A.; Braisted, A. C.; Raphael, D. R.; Randal, M.; Stroud, R. M.; Gordon, E. M.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 9367.
147. Erlanson, D. A.; Hansen, S. K. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 399.
148. Braisted, A. C.; Oslob, J. D.; Delano, W. L.; Hyde, J.; McDowell, R. S.; Waal, N.; Yu, C.; Arkin, M. R.; Raimundo, B. C. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3714.
149. Erlanson, D. A.; Lam, J. W.; Wiesmann, C.; Luong, T. N.; Simmons, R. L.; DeLano, W. L.; Choong, I. C.; Burdett, M. T.; Flanagan, W. M.; Lee, D.; Gordon, E. M.; O'Brien, T. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 308.
150. Erlanson, D. A.; Wells, J. A.; Braisted, A. C. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2004, 33, 199.
151. Ramstrom, O.; Lehn, J. M. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 26.
152. Ramstrom, O.; Bunyapaiboonsri, T.; Lohmann, S.; Lehn, J. M. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1572, 178.
153. Cousins, G. R. L.; Poulsen, S. A.; Sanders, J. K. M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 270.
154. Ahn, Y. H.; Chang, Y. T. J. Comb. Chem. 2004, 6, 293.
155. Reymond, J. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 5577.
156. Severin, K. Chem. - Eur. J. 2004, 10, 2565.
157. Ahn, Y. H.; Chang, Y. T. Chem. - Eur. J. 2004, 10, 3543.
158. Bunyapaiboonsri, T.; Ramstrom, O.; Lohmann, S.; Lehn, J. M.; Peng, L.; Goeldner, M. ChemBioChem 2001, 2, 438.
159. Gerber-Lemaire, S.; Popowycz, F.; Rodriguez-Garcia, E.; Asenjo. A. T. C.; Robina, I.; Vogel, P. ChemBioChem 2002, 3, 466.
160. Lins, R. J.; Flitsch, S. L.; Turner, N. J.; Irving, E.; Brown, S. A. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 3405.
161. Hochgurtel, M.; Kroth, H.; Piecha, D.; Hofmann, M. W.; Nicolau, C.; Krause, S.; Schaaf, O.; Sonnenmoser, G.; Eliseev, A. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 3382.
162. Ramstrom, O.; Lehn, J. M. ChemBioChem 2000, 1, 41.
163. Bunyapaiboonsri, T.; Ramstrom, H.; Ramstrom, O.; Haiech, J.; Lehn, J. M. J. Med. Chem. 2003, 46, 5803.
164. Root, D. E.; Flaherty, S. P.; Kelley, B. P.; Stockwell, B. R. Chem. Biol. 2003, 10, 881.
165. Schuffenhauer, A.; Zimmermann, J.; Stoop, R.; van der Vyver, J. J.; Lecchini, S.; Jacoby, E. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2002, 42, 947.
166. Kawazoe, Y.; Tanaka, S.; Uesugi, M. Chem. Biol. 2004, 11, 907.
167. Verkman, A. S. Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2004, 286, C465.
168. Marron, B. E.; Jayawickreme, C. K. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 395.
169. Hoever, M.; Zbinden, P. Drug Discovery Today 2004, 9, 358.
170. Anderson, S. N.; Cool, B. L.; Kifle, L.; Chiou, W.; Egan, D. A.; Barrett, L. W.; Richardson, P. L.; Frevert, E. U.; Warrior, U.; Kofron, J. L.; Burns, D. J. J. Biomol. Screening 2004, 9, 112.
171. Gopalakrishnan, S. M.; Moreland, R. B.; Kofron, J. L.; Helfrich, R. J.; Gubbins, E.; McGowen, J.; Masters, J. N.; Donnelly-Roberts, D.; Brioni, J. D.; Burns, D. J.; Warrior, U. Anal. Biochem. 2003, 321, 192.
172. King, R.; Elands, J. Modern Drug Discovery 2002, 5, 21.
173. Kelley, B. P.; Lunn, M. R.; Root, D. E.; Flaherty, S. P.; Martino, A. M.; Stockwell, B. R. Chem. Biol. 2004, 11, 1495.
174. Root, D. E.; Kelley, B. P.; Stockwell, B. R. J. Biomol. Screening 2003, 8, 393.
175. Leblanc, B.; Coulet, A.; Andre, E.; Molina, F.; Leonetti, J. P. Biotechniques 2004, 37, 223.
176. Agrafiotis, D. K.; Lobanov, V. S,; Salemme, F. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 337.
177. Bleicher, K. H.; Bohm, H. J.; Muller, K.; Alanine, A. I. Nat. Rev. Drug Discovery 2003, 2, 369.
178. Stein, R. L. J. Biomol. Screening 2003, 8, 615.
179. Landro, J. A.; Taylor, I. C. A.; Stirtan, W. G.; Osterman, D. G.; Kristie, J.; Hunnicutt, E. J.; Rae, P. M. M.; Sweetnam, P. M. J. Pharmacol. Toxicol. 2000, 44, 273.
180. Blundell, T. L.; Jhoti, H.; Abell, C. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 45.
181. Clemons, P. A. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 334.
182. Yarrow, J. C.; Perlman, Z. E.; Westwood, N. J.; Mitchison, T. J. BMC Biotechnol. 2004, 4.
183. Shen, J. H.; Xu, X. Y.; Cheng, F.; Liu, H.; Luo, X. M.; Shen, J. K.; Chen, K. X.; Zhao, W. M.; Shen, X.; Jiang, H. L. Curr. Med. Chem. 2003, 10, 2327.
184. Nordling, E.; Homan, E. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2004, 44, 2207.
185. Huang, J.; Zhu, H.; Haggarty, S. J.; Spring, D. R.; Hwang, H.; Jin, F.; Snyder, M.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16594.
186. Bedalov, A.; Gatbonton, T.; Irvine, W. P.; Gottschling, D. E.; Simon, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 15113.
187. Butcher, R. A.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2003, 10, 521.
188. Butcher, R. A.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7868.
189. Grozinger, C. M.; Chao, E. D.; Blackwell, H. E.; Moazed, D.; Schreiber, S. L. J. Biol. Chem. 2001, 276, 38837.
190. Zhao, Y. D.; Dai, X. H.; Blackwell, H. E.; Schreiber, S. L.; Chory, J. Science 2003, 301, 1107.
191. Asami, T.; Mizutani, M.; Fujioka, S.; Goda, H.; Min, Y. K.; Shimada, Y.; Nakano, T.; Takatsuto, S.; Matsuyama, T.; Nagata, N.; Sakata, K.; Yoshida, S. J. Biol. Chem. 2001, 276, 25687.
192. Chan, J.; Bayliss, P. E.; Wood, J. M.; Roberts, T. M. Cancer Cell 2002, 1, 257.
193. Moon, H. S.; Jacobson, E. M.; Khersonsky, S. M.; Luzung, M. R.; Walsh, D. P.; Xiong, W. N.; Lee, J. W.; Parikh, P. B.; Lam, J. C.; Kang, T. W.; Rosania, G. R.; Schier, A. F.; Chang, Y. T. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11608.
194. Kao, R. Y.; Tsui, W. H. W.; Lee, T. S. W.; Tanner, J. A.; Watt, R. M.; Huang, J. D.; Hu, L. H.; Chen, G. H.; Chen, Z. W.; Zhang, L. Q.; He, T.; Chan, K. H.; Tse, H.; To, A. P. C.; Ng, L. W. Y.; Wong, B. C. W.; Tsoi, H. W.; Yang, D.; Ho, D. D.; Yuen, K. Y. Chem. Biol. 2004, 11, 1293.
195. Rosania, G. R.; Chang, Y. T.; Perez, O.; Sutherlin, D.; Dong, H.; Lockhart, D. J.; Schultz, P. G. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 304.
196. Perez, O. D.; Chang, Y. T.; Rosania, G.; Sutherlin, D.: Schultz, P. G. Chem. Biol. 2002, 9, 475.
197. Williams, D.; Jung, D. W.; Khersonsky, S. M.; Heidary, N.; Chang, Y. T.; Orlow, S. J. Chem. Biol. 2004, 11, 1251.
198. Snyder, J. R.; Hall, A.; Ni-Komatsu, L.; Khersonsky, S. M.; Chang, Y. T.; Orlow, S. J. Chem. Biol. 2005, 12, 477.
199. Haggarty, S. J.; Mayer, T. U.; Miyamoto, D. T.; Fathi, R.; King, R. W.; Mitchison, T. J.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2000, 7, 275.
200. Haggarty, S. J.; Koeller, K. M.; Wong, J. C.; Grozinger, C. M.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 4389.
201. Mayer, T. U.; Kapoor, T. M.; Haggarty, S. J.; King, R. W.; Schreiber, S. L.; Mitchison, T. J. Science 1999, 286, 971.
202. Emami, K. H.; Nguyen, C.; Ma, H.; Kim, D. H.; Jeong, K. W.; Eguchi, M.; Moon, R. T.; Teo, J. L.; Oh, S. W.; Kim, H. Y.; Moon, S. H.; Ha, J. R.; Kahn, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 12682.
203. Ding, S.; Wu, T. Y. H.; Brinker, A.; Peters, E. C.; Hur, W.; Gray, N. S.; Schultz, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 7632.
204. Chong, T.; McMillan, M.; Teo, J. L.; Henderson, W. R., Jr.; Kahn, M. Lett. Drug Des. Discovery 2004, 1, 211.
205. Weitzman, J. B. J. Biol. 2002, 1, 7.
206. Peterson, J. R.; Lokey, R. S.; Mitchison, T. J.; Kirschner, M. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10624.
207. Peterson, J. R.; Bickford, L. C.; Morgan, D.; Kim, A. S.; Ouerfelli, O.; Kirschner, M. W.; Rosen, M. K. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 747.
208. Rosania, G. R.; Merlie, J., Jr.; Gray, N.; Chang, Y. T.; Schultz, P. G.; Heald, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 4797.
209. Wignall, S. M.; Gray, N. S.; Chang, Y. T.; Juarez, L.; Jacob, R.; Burlingame, A.; Schultz, P. G.; Heald, R. Chem. Biol. 2004, 11, 135.
210. Verma, R.; Peters, N. R.; D'Onofrio, M.; Tochtrop, G. P.; Sakamoto, K. M.; Varadan, R.; Zhang, M. S.; Coffino, P.; Fushman, D.; Deshaies, R. J.; King, R. W. Science 2004, 306, 117.
211. Zhu, H.; Snyder, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 55.
212. Zheng, X. F.; Florentino, D.; Chen, J.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Cell 1995, 82, 121.
213. Schmidt, A.; Bickle, M.; Beck, T.; Hall, M. N. Cell 1997, 88, 531.
214. Zouhar, J.; Hicks, G. R.; Raikhel, N. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9497.
215. Bernstein, B. E.; Tong, J. K.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13708.
216. Sharom, J. R.; Bellows, D. S.; Tyers, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 81.
217. Hartwell, L. H.; Szankasi, P.; Roberts, C. J.; Murray, A. W.; Friend, S. H. Science 1997, 278, 1064.
218. Simon, J. A.; Szankasi, P.; Nguyen, D. K.; Ludlow, C.; Dunstan, H. M.; Roberts, C. J.; Jensen, E. L.; Hartwell, L. H.; Friend, S. H. Cancer Res. 2000, 60, 328.
219. Tucker, C. L.; Fields, S. Comp. Funct. Genomics 2004, 5, 216.
220. Chan, T. F.; Carvalho, J.; Riles, L.; Zheng, X. F. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13227.
221. Schreiber, S. L. Science 1991, 251, 283.
222. Parsons, A. B.; Brost, R. L.; Ding, H. M.; Li, Z. J.; Zhang, C. Y.; Sheikh, B.; Brown, G. W.; Kane, P. M.; Hughes, T. R.; Boone, C. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 62.
223. Tong, A. H. Y.; Evangelista, M.; Parsons, A. B.; Xu, H.; Bader, G. D.; Page, N.; Robinson, M.; Raghibizadeh, S.; Hogue, C. W. V.; Bussey, H.; Andrews, B.; Tyers, M.; Boone, C. Science 2001, 294, 2364.
224. Zewail, A.; Xie, M. W.; Xing, Y.; Lin, L.; Zhang, P. F.; Zou, W.; Saxe, J. P.; Huang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 3345.
225. Cutler, N. S.; Heitman, J.; Cardenas, M. E. J. Biol. Chem. 1997, 272, 27671.
226. Giaever, G.; Shoemaker, D. D.; Jones, T. W.; Liang, H.; Winzeler, E. A.; Astromoff, A.; Davis, R. W. Nat. Genet. 1999, 21, 278.
227. Giaever, G.; Flaherty, P.; Kumm, J.; Proctor, M.; Nislow, C.; Jaramillo, D. F.; Chu, A. M.; Jordan, M. I.; Arkin, A. P.; Davis, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 793.
228. Lum, P. Y.; Armour, C. D.; Stepaniants, S. B.; Cavet, G.; Wolf, M. K.; Butler, J. S.; Hinshaw, J. C.; Ganier, P.; Prestwich, G. D.; Leonardson, A.; Garrett-Engele, P.; Rush, C. M.; Bard, M.; Schimmack, G.; Phillips, J. W.; Roberts, C. J.; Shoemaker, D. D. Cell 2004, 116, 121.
229. Baetz, K.; McHardy, L.; Gable, K.; Tarling, T.; Reberioux, D.; Bryan, J.; Andersen, R. J.; Dunn, T.; Hieter, P.; Roberge, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 4525.
230. Armstrong, J. I.; Yuan, S.; Dale, J. M.; Tanner, V. N.; Theologis, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 14978.
231. Cheng, Y. F.; Dai, X. H.; Zhao, Y. Plant Physiol. 2004, 135, 1020.
232. Hayashi, K.; Ogino, K.; Oono, Y.; Uchimiya, H.; Nozaki, H. J. Antibiot. 2001, 54, 573.
233. Sabatini, S.; Beis, D.; Wolkenfelt, H.; Murfett, J.; Guilfoyle, T.; Malamy, J.; Benfey, P.; Leyser, O.; Bechtold, N.; Weisbeek, P.; Scheres, B. Cell 1999, 99, 463.
234. Kirst, H. A.; Larsen, S. H.; Paschal, J. W.; Occolowitz, J. L.; Creemer, L. C.; Steiner, J. L.; Lobkovsky, E.; Clardy, J. J. Antibiot. 1995, 48, 990.
235. Hayashi, K.; Jones, A. M.; Ogino, K.; Yamazoe, A.; Oono, Y.; Inoguchi, M.; Kondo, H.; Nozaki, H. J. Biol. Chem. 2003, 278, 23797.
236. Bajguz, A.; Asami, T. Planta 2004, 218, 869.
237. Asami, T.; Yoshida, S. Trends Plant Sci. 1999, 4, 348.
238. Min, Y. K.; Asami, T.; Fujioka, S.; Murofushi, N.; Yamaguchi, I.; Yoshida, S. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 425.
239. Asami, T.; Min, Y. K.; Nagata, N.; Yamagishi, K.; Takatsuto, S.; Fujioka, S.; Murofushi, N.; Yamaguchi, I.; Yoshida, S. Plant Physiol. 2000, 123, 93.
240. Nagata, N.; Asami, T.; Yoshida, S. Plant Cell Physiol. 2001, 42, 1006.
241. Wang, J. M.; Asami, T.; Yoshida, S.; Murofushi, N. Biosci., Biotechnol., Biochem. 2001, 65, 817.
242. Sekimata, K.; Uzawa, J.; Han, S. Y.; Yoneyama, K.; Takeuchi, Y.; Yoshida, S.; Asami, T. Tetrahedron: Asymmetry 2002, 13, 1875.
243. Sekimata, K.; Han, S. Y.; Yoneyama, K.; Takeuchi, Y.; Yoshida, S.; Asami, T. J. Agric. Food Chem. 2002, 50, 3486.
244. Asami, T.; Mizutani, M.; Shimada, Y.; Goda, H.; Kitahata, N.; Sekimata, K.; Han, S. Y.; Fujioka, S.; Takatsuto, S.; Sakata, K.; Yoshida, S. Biochem. J. 2003, 369, 71.
245. MacRae, C. A.; Peterson, R. T. Chem. Biol. 2003, 10, 901.
246. Peterson, R. T.; Link, B. A.; Dowling, J. E.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 12965.
247. Kuruvilla, F. G.; Shamji, A. F.; Sternson, S. M.; Hergenrother, P. J.; Schreiber, S. L. Nature 2002, 416, 653.
248. Peterson, R. T.; Mably, J. D.; Chen, J. N.; Fishman, M. C. Curr. Biol. 2001, 11, 1481.
249. Peterson, R. T.; Shaw, S. Y.; Peterson, T. A.; Milan, D. J.; Zhong, T. P.; Schreiber, S. L.; MacRae, C. A.; Fishman, M. C. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 595.
250. Letsou, A.; Bohmann, D. Dev. Dyn. 2005, 232, 526.
251. St. Johnston, D. Nat. Rev. Genet. 2002, 3, 176.
252. Doan, T. N.; Eilertson, C. D.; Rubinstein, A. L. Drug Discovery Today: Targets 2004, 3, 191.
253. Eggert, U. S.; Kiger, A. A.; Richter, C.; Perlman, Z. E.; Perrimon, N.; Mitchison, T. J.; Field, C. M. PLoS Biol. 2004, 2, 2135.
254. Hara, M.; Han, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 3333.
255. Driscoll, M.; Dean, E.; Reilly, E.; Bergholz, E.; Chalfie, M. J. Cell Biol. 1989, 109, 2993.
256. Tissenbaum, H. A.; Hawdon, J.; Perregaux, M.; Hotez, P.; Guarente, L.; Ruvkun, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 460.
257. Choy, R. K. M.; Thomas, J. H. Mol. Cell 1999, 4, 143.
258. Hoshi, H.; Kamata, Y.; Uemara, T. J. Vet. Med. Sci. 2003, 65, 881.
259. Dengg, M.; van Meel, J. C. J. Pharmacol. Toxicol. 2004, 50, 209.
260. Ellerbrock, B. R.; Coscarelli, E. M.; Gurney, M. E.; Geary, T. G. J. Biomol. Screening 2004, 9, 147.
261. Aiken, C. T.; Tobin, A. J.; Schweitzer, E. S. Neurobiol. Dis. 2004, 16, 546.
262. Simons, A.; Dafni, N.; Dotan, I.; Oron, Y.; Canaani, D. Genome Res. 2001, 11, 266.
263. Torrance, C. J.; Agrawal, V.; Vogelstein, B.; Kinzler, K. W. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 940.
264. Dolma, S.; Lessnick, S. L.; Hahn, W. C.; Stockwell, B. R. Cancer Cell 2003, 3, 285.
265. Wu, X.; Ding, S.; Ding, Q.; Gray, N. S.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14520.
266. Stockwell, B. R.; Haggarty, S. J.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 1999, 6, 71.
267. Stockwell, B. R.; Hardwick, J. S.; Tong, J. K.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10662.
268. Haggarty, S. J.; Koeller, K. M.; Kau, T. R.; Silver, P. A.; Roberge, M.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2003, 10, 1267.
269. Wong, J. C.; Hong, R.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5586.
270. Koeller, K. M. H., Stephen J.; Perkins, Brian D.; Leykin, Igor; Wong, Jason C.; Kao, Ming-Chih J.; Schreiber, Stuart L. Chem. Biol. 2003, 10, 397.
271. Antos, C. L.; McKinsey, T. A.; Dreitz, M.; Hollingsworth, L. M.; Zhang, C. L.; Schreiber, K.; Rindt, H.; Gorczynski, R. J.; Olson, E. N. J. Biol. Chem. 2003, 278, 28930.
272. Kapoor, T. M.; Mayer, T. U.; Coughlin, M. L.; Mitchison, T. J. J. Cell Biol. 2000, 150, 975.
273. Hathaway, N. A.; King, R. W. Curr. Opin. Cell Biol. 2005, 17, 12.
274. Maliga, Z.; Kapoor, T. M.; Mitchison, T. J. Chem. Biol. 2002, 9, 989.
275. Blaskovich, M. A.; Sun, J.; Cantor, A.; Turkson, J.; Jove, R.; Sebti, S. M. Cancer Res. 2003, 63, 1270.
276. Fantin, V. R.; Berardi, M. J.; Scorrano, L.; Korsmeyer, S. J.; Leder, P. Cancer Cell 2002, 2, 29.
277. Tian, S. S.; Lamb, P.; King, A. G.; Miller, S. G.; Kessler, L.; Luengo, J. I.; Averill, L.; Johnson, R. K.; Gleason, J. G.; Pelus, L. M.; Dillon, S. B.; Rosen, J. Science 1998, 281, 257.
278. Komarov, P. G.; Komarova, E. A.; Kondratov, R. V.; Christov-Tselkov, K.; Coon, J. S.; Chernov, M. V.; Gudkov, A. V. Science 1999, 285, 1733.
279. Kim, T.; Kim, T. Y.; Lee, W. G.; Yim, J.; Kim, T. K. J. Biol. Chem. 2000, 275, 16910.
280. Subbaramaiah, K.; Bulic, P.; Lin, Y.; Dannenberg, A. J.; Pasco, D. S. J. Biomol. Screening 2001, 6, 101.
281. Lunn, M. R.; Root, D. E.; Martino, A. M.; Flaherty, S. P.; Kelley, B. P.; Coovert, D. D.; Burghes, A. H.; Man, N. T.; Morris, G. E.; Zhou, J. H.; Androphy, E. J.; Sumner, C. J.; Stockwell, B. R. Chem. Biol. 2004, 11, 1489.
282. Staleva, L.; Hall, A.; Orlow, S. J. Mol. Biol. Cell 2004, 15, 5574.
283. Nguyen, C.; Teo, J. L.; Matsuda, A.; Eguchi, M.; Chi, E. Y.; Henderson, W. R.; Kahn, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1169.
284. Misra-Press: A.; McMillan, M.; Cudaback, E.; Qabar, M.; Ruan, F.; Nguyen, M.; Vaiser, T.; Nakanishi, H.; Kahn, M. Curr. Med. Chem.: Anti-Inflammatory Anti-Allergy Agents 2002, 1, 23.
285. Frank-Kamenetsky, M.; Zhang, X. M.; Bottega, S.; Guicherit, O.; Wichterle, H.; Dudek, H.; Bumcrot, D.; Wang, F. Y.; Jones, S.; Shulok, J.; Rubin, L. L.; Porter, J. A. J. Biol. 2002, 1, 10.
286. Yarrow, J. C.; Feng, Y.; Perlman, Z. E.; Kirchhausen, T.; Mitchison, T. J. Comb. Chem. High Throughput Screening 2003, 6, 279.
287. Kau, T. R.; Schroeder, F.; Ramaswamy, S.; Wojciechowski, C. L.; Zhao, J. J.; Roberts, T. M.; Clardy, J.; Sellers, W. R.; Silver, P. A. Cancer Cell 2003, 4, 463.
288. Smukste, I.; Stockwell, B. R. Cancer Cell 2003, 4, 419.
289. Jackson, C. L. Subcell. Biochem. 2000, 34, 233.
290. Klausner, R. D.; Donaldson, J. G.; Lippincottschwartz, J. J. Cell Biol. 1992, 116, 1071.
291. Feng, Y.; Yu, S.; Lasell, T. K. R.; Jadhav, A. P.; Macia, E.; Chardin, P.; Melancon, P.; Roth, M.; Mitchison, T.; Kirchhausen, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 6469.
292. Feng, Y.; Jadhav, A. P.; Rodighiero, C.; Fujinaga, Y.; Kirchhausen, T.; Lencer, W. I. EMBO Rep. 2004, 5, 596.
293. Nieland, T. J. F.; Feng, Y.; Brown, J. X.; Chuang, T. D.; Buckett, P. D.; Wang, J.; Xie, X. S.; McGraw, T. E.; Kirchhausen, T.; Wessling-Resnick, M. Traffic 2004, 5, 478.
294. Brown, J. X.; Buckett, P. D.; Wessling-Resnick, M. Chem. Biol. 2004, 11, 407.
295. Venkatesh, N.; Feng, Y.; DeDecker, B.; Yacono, P.; Golan, D.; Mitchison, T.; McKeon, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8969.
296. Hotha, S.; Yarrow, J. C.; Yang, J. G.; Garrett, S.; Renduchintala, K. V.; Mayer, T. U.; Kapoor, T. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2379.
297. Mahal, L. K.; Charter, N. W.; Angata, K.; Fukuda, M.; Koshland, D. E.; Bertozzi, C. R. Science 2001, 294, 380.
298. Eguchi, M.; McMillan, M.; Nguyen, C.; Teo, J. L.; Chi, E. Y.; Henderson, W. R.; Kahn, M. Comb. Chem. High Throughput Screening 2003, 6, 611.
299. Haggarty, S. J.; Koeller, K. M.; Wong, J. C.; Butcher, R. A.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2003, 10, 383.
300. Haggarty, S. J.; Clemons, P. A.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10543.
301. Kim, Y.-k.; Arai, M. A.; Arai, T.; Lamenzo, J. O.; Dean, E. F., III.; Patterson, N.; Clemons, P. A.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14740.
302. Lesage, G.; Sdicu, A. M.; Menard, P.; Shapiro, J.; Hussein, S.; Bussey, H. Genetics 2004, 167, 35.
303. Borisy, A. A.; Elliott, P. J.; Hurst, N. W.; Lee, M. S.; Lehar, J.; Price, E. R.; Serbedzija, G.; Zimmermann, G. R.; Foley, M. A.; Stockwell, B. R.; Keith, C. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 7977.
304. Cheok, M. H.; Yang, W.; Pui, C. H.; Downing, J. R.; Cheng, C.; Naeve, C. W.; Relling, M. V.; Evans, W. E. Nat. Genet. 2003, 34, 85.
305. Knockaert, M.; Gray, N.; Damiens, E.; Chang, Y. T.; Grellier, P.; Grant, K.; Fergusson, D.; Mottram, J.; Soete, M.; Dubremetz, J. F.; Le Roch, K.; Doerig, C.; Schultz, P. G.; Meijer, L. Chem. Biol. 2000, 7, 411.
306. Knockaert, M.; Lenormand, P.; Gray, N.; Schultz, P.; Pouyssegur, J.; Meijer, L. Oncogene 2002, 21, 6413.
307. Ma, L.; Cantley, L. C.; Janmey, P. A.; Kirschner, M. W. J. Cell Biol. 1998, 140, 1125.
308. Ma, L.; Rohatgi, R.; Kirschner, M. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 15362.
309. Rohatgi, R.; Ma, L.; Miki, H.; Lopez, M.; Kirchhausen, T.; Takenawa, T.; Kirschner, M. W. Cell 1999, 97, 221.
310. Chang, Y. T.; Wignall, S. M.; Rosania, G. R.; Gray, N. S.; Hanson, S. R.; Su, A. I.; Merlie, J., Jr.; Moon, H. S.; Sangankar, S. B.; Perez, O.; Heald, R.; Schultz, P. G. J. Med. Chem. 2001, 44, 4497.
311. Pickart, C. M.; Eddins, M. J. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1695, 55.
312. Pickart, C. M. Cell 2004, 116, 181.
313. Jiang, X. J.; Kim, H. E.; Shu, H. J.; Zhao, Y. M.; Zhang, H. C.; Kofron, J.; Donnelly, J.; Burns, D.; Ng, S. C.; Rosenberg, S.; Wang, X. D. Science 2003, 299, 223.
314. Gray, N. S.; Wodicka, L.; Thunnissen, A. M. W. H.; Norman, T. C.; Kwon, S. J.; Espinoza, F. H.; Morgan, D. O.; Barnes, G.; LeClerc, S.; Meijer, L.; Kim, S. H.; Lockhart, D. J.; Schultz, P. G. Science 1998, 281, 533.
315. Chang, Y. T.; Gray, N. S.; Rosania, G. R.; Sutherlin, D. P.; Kwon, S.; Norman, T. C.; Sarohia, R.; Leost, M.; Meijer, L.; Schultz, P. G. Chem. Biol. 1999, 6, 361.
316. Norman, T. C.; Gray, N. S.; Koh, J. T.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7430.
317. Gray, N. S.; Kwon, S.; Schultz, P. G. Tetrahedron Lett. 1997, 38, 1161.
318. Sebolt-Leopold, J. S.; Dudley, D. T.; Herrera, R.; Van Becelaere, K.; Wiland, A.; Gowan, R. C.; Tecle, H.; Barrett, S. D.; Bridges, A.; Przybranowski, S.; Leopold, W. R.; Saltiel, A. R. Nat. Med. 1999, 5, 810.
319. Szardenings, A. K.; Antonenko, V.; Campbell, D. A.; DeFrancisco, N.; Ida, S.; Shi, L. H.; Sharkov, N.; Tien, D.; Wang, Y. W.; Navre, M. J. Med. Chem. 1999, 42, 1348.
320. Rohrer, S. P.; Birzin, E. T.; Mosley, R. T.; Berk, S. C.; Hutchins, S. M.; Shen, D. M.; Xiong, Y. S.; Hayes, E. C.; Parmar, R. M.; Foor, F.; Mitra, S. W.; Degrado, S. J.; Shu, M.; Klopp, J. M.; Cai, S. J.; Blake, A.; Chan, W. W. S.; Pasternak, A.; Yang, L. H.; Patchett, A. A.; Smith, R. G.; Chapman, K. T.; Schaeffer, J. M. Science 1998, 282, 737.
321. Cheung, A.; Dantzig, J. A.; Hollingworth, S.; Baylor, S. M.; Goldman, Y. E.; Mitchison, T. J.; Straight, A. F. Nat. Cell Biol. 2002, 4, 83.
322. Straight, A. F.: Cheung, A.; Limouze, J.; Chen, I.; Westwood, N. J.; Sellers, J. R.; Mitchison, T. J. Science 2003, 299, 1743.
323. Kovacs, M.; Toth, J.; Hetenyi, C.; Malnasi-Csizmadia, A.; Sellers, J. R. J. Biol. Chem. 2004, 279, 35557.
324. Ramamurthy, B.; Yengo, C. M.; Straight, A. F.; Mitchison, T. J.; Sweeney, H. L. Biochemistry 2004, 43, 14832.
325. Limouze, J.; Straight, A. F.; Mitchison, T.; Sellers, J. E. J. Muscle Res. Cell Motil. 2004, 25, 337.
326. Duxbury, M. S.; Ashley, S. W.; Whang, E. E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 313, 992.
327. Shu, S.; Liu, X.; Korn, E. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 1472.
328. Helm, J. S.; Hu, Y. N.; Chen, L.; Gross, B.; Walker, S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11168.
329. Hu, Y.; Heim, J. S.; Chen, L.; Ginsberg, C.; Gross, B.; Kraybill, B.; Tiyanont, K.; Fang, X.; Wu, T.; Walker, S. Chem. Biol. 2004, 11, 703.
330. Annis, D. A.; Nazef, N.; Chuang, C. C.; Scott, M. P.; Nash, H. M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15495.
331. Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Trends Biochem. Sci. 1996, 21, 418.
332. Pollock, R.; Clackson, T. Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 459.
333. Rivera, V. M. Methods 1998, 14, 421.
334. Clackson, T. Curr. Opin. Chem. Biol. 1997, 1, 210.
335. Neff, T.; Horn, P. A.; von Kalle, C.; Wood, B. L.; Richard, R. E.; Morris, J. C.; Peterson, L. J.; Kiem, H. P.; Blau, C. A. Blood 2001, 98, 817a.
336. Heck, S.; Qian, X.; Velleca, M. Curr. Drug Discovery Technol. 2004, 1, 1570.
337. Kley, N. Chem. Biol. 2004, 11, 599.
338. Athavankar, S.; Peterson, B. R. Chem. Biol. 2003, 10, 1245.
339. Spencer, D. M.; Wandless, T. J.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Science 1993, 262, 1019.
340. Klemm, J. D.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Annu. Rev. Immunol. 1998, 16, 569.
341. Austin, D. J.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 1994, 1, 131.
342. Diver, S. T.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5106.
343. Liberles, S. D.; Diver, S. T.; Austin, D. J.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci, U.S.A. 1997, 94, 7825.
344. Lin, H. N.; Cornish, V. W. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 871.
345. Amara, J. F.; Clackson, T.; Rivera, V. M.; Guo, T.; Keenan, T.; Natesan, S.; Pollock, R.; Yang, W.; Courage, N. L.; Holt, D. A.; Gilman, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 10618.
346. Jin, L. Q.; Zeng, H.; Chien, S.; Otto, K. G.; Richard, R. E.; Emery, D. W.; Blau, C. A. Nat. Genet. 2000, 26, 64.
347. Iwamoto, K.; Miyamoto, T.; Sawatani, Y.; Hosogane, N.; Hamaguchi, I.; Takami, M.; Nomiyama, K.; Takagi, K.; Suda, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 325, 229.
348. Abida, W. M.; Carter, B. T.; Althoff, E. A.; Lin, H.; Cornish, V. W. ChemBioChem 2002, 3, 887.
349. Ho, S. N.; Biggar, S. R.; Spencer, D. M.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Nature 1996, 382, 822.
350. Rivera, V. M.; Clackson, T.; Natesan, S.; Pollock, R.; Amara, J. F.; Keenan, T.; Magari, S. R.; Phillips, T.; Courage, N. L.; Cerasoli, F.; Holt, D. A.; Gilman, M. Nat. Med. 1996, 2, 1028.
351. Nyanguile, O.; Uesugi, M.; Austin, D. J.; Verdine, G. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 13402.
352. Spencer, D. M.; Belshaw, P. J.; Chen, L.; Ho, S. N.; Randazzo, F.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Curr. Biol. 1996, 6, 839.
353. Belshaw, P. J.; Spencer, D. M.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 1996, 3, 731.
354. Belshaw, P. J.; Ho, S. N.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 4604.
355. Berger, C.; Blau, C. A.; Huang, M. L.; Iuliucci, J. D.; Dalgarno, D. C.; Gaschet, J.; Heimfeld, S.; Clackson, T.; Riddell, S. R. Blood 2004, 103, 1261.
356. Yang, J. X.; Symes, K.; Mercola, M.; Schreiber, S. L. Curr. Biol. 1998, 8, 11.
357. Blau, C. A.; Peterson, K. R.; Drachman, J. G.; Spencer, D. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 3076.
358. Stockwell, B. R.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 1998, 5, 385.
359. Stockwell, B. R.; Schreiber, S. L. Curr. Biol. 1998, 8, 761.
360. Hatada, M. H.; Lu, X. D.; Laird, E. R.; Green, J.; Morgenstern, J. P.; Lou, M. Z.; Marr, C. S.; Phillips, T. B.; Ram, M. K.; Theriault, K.; Zoller, M. J.; Karas, J. L. Nature 1995, 377, 32.
361. Rivera, V. M.; Wang, X. R.; Wardwell, S.; Courage, N. L.; Volchuk, A.; Keenan, T.; Holt, D. A.; Gilman, M.; Orci, L.; Cerasoli, F.; Rothman, J. E.; Clackson, T. Science 2000, 287, 826.
362. Smith, K. M.; Van Etten, R. A. J. Biol. Chem. 2001, 276, 24372.
363. Mootz, H. D.; Muir, T. W. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9044.
364. Richard, R. E.; Wood, B.; Zeng, H.; Jin, L. Q.; Papayannopoulou, T.; Blau, C. A. Blood 2000, 95, 430.
365. Richard, R. E.; De Claro, R. A.; Yan, J.; Chien, S.; von Recum, H.; Morris, J.; Kiem, H. P.; Dalgarno, D. C.; Heimfeld, S.; Clackson, T.; Andrews, R.; Blau, C. A. Mol. Ther. 2004, 10, 730.
366. Neff, T.; Horn, P. A.; Valli, V. E.; Gown, A. M.; Wardwell, S.; Wood, B. L.; von Kalle, C.; Schmidt, M.; Peterson, L. J.; Morris, J. C.; Richard, R. E.; Clackson, T.; Kiem, H. P.; Blau, C. A. Blood 2002, 100, 2026.
367. Freeman, K. W.; Welm, B. E.; Gangula, R. D.; Rosen, J. M.; Ittmann, M.; Greenberg, N. M.; Spencer, D. M. Cancer Res. 2003, 63, 8256.
368. Zhao, S. M.; Weinreich, M. A.; Ihara, K.; Richard, R. E.; Blau, C. A. Mol. Ther. 2004, 10, 456.
369. Richard, R. E.; Weinreich, M.; Chang, K. H.; Ieremia, J.; Stevenson, M. M.; Blau, C. A. Blood 2004, 103, 4432.
370. Kobinger, G. P.; Deng, S. P.; Louboutin, J. P.; Vatamaniuk, M.; Rivera, V. M.; Matschinsky, F.; Markmann, J. F.; Clackson, T. P.; Raper, S. E.; Wilson, J. M. Mol. Ther. 2004, 9, S404.
371. Firestine, S. M.; Salinas, F.; Nixon, A. E.; Baker, S. J.; Benkovic, S. J. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 544.
372. Baker, K.; Bleczinski, C.; Lin, H. N.; Salazar-Jimenez, G.; Sengupta, D.; Krane, S.; Cornish, V. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 16537.
373. Holsinger, L. J.; Spencer, D. M.; Austin, D. J.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 9810.
374. Spencer, D. M.; Graef, I.; Austin, D. J.; Schreiber, S. L.; Crabtree, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 9805.
375. Licitra, E. J.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 12817.
376. Henthorn, D. C.; Jaxa-Chamiec, A. A.; Meldrum, E. Biochem. Pharmacol. 2002, 63, 1619.
377. Hussey, S. L.; Muddana, S. S.; Peterson, B. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3692.
378. Pruschy, M. N.; Spencer, D. M.; Kapoor, T. M.; Miyake, H.; Crabtree, G. R.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 1994, 1, 163.
379. Snyder, S. H.; Lai, M. M.; Burnett, P. E. Neuron 1998, 21, 283.
380. Belshaw, P. J.; Schoepfer, J. G.; Liu, K. Q.; Morrison, K. L.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1995, 34, 2129.
381. Belshaw, P. J.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 1805.
382. Brown, E. J.; Beal, P. A.; Keith, C. T.; Chen, J.; Shin, T. B.; Schreiber, S. L. Nature 1995, 377, 441.
383. Clemons, P. A.; Gladstone, B. G.; Seth, A.; Chao, E. D.; Foley, M. A.; Schreiber, S. L. Chem. Biol. 2002, 9, 49.
384. Clackson, T.; Yang, W.; Rozamus, L. W.; Hatada, M.; Amara, J. F.; Rollins, C. T.; Stevenson, L. F.; Magari, S. R.; Wood, S. A.; Courage, N. L.; Lu, X. D.; Cerasoli, F.; Gilman, M.; Holt, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 10437.
385. Mallet, V. O.; Mitchell, C.; Guidotti, J. E.; Jaffray, P.; Fabre, M.; Spencer, D.; Arnoult, D.; Kahn, A.; Gilgenkrantz, H. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 1234.
386. Stankunas, K.; Bayle, J. H.; Gestwicki, J. E.; Lin, Y. M.; Wandless, T. J.; Crabtree, G. R. Mol. Cell 2003, 12, 1615.
387. de Graffenried, C. L.; Laughlin, S. T.; Kohler, J. J.; Bertozzi, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16715.
388. Bishop, A.; Buzko, O.; Heyeck-Dumas, S.; Jung, I.; Kraybill, B.; Liu, Y.; Shah, K.; Ulrich, S.; Witucki, L.; Yang, F.; Zhang, C.; Shokat, K. M. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2000, 29, 577.
389. Hwang, Y. W.; Miller, D. L. J. Biol. Chem. 1987, 262, 13081.
390. Doerig, C.; Meijer, L.; Mottram, J. C. Trends Parasitol. 2002, 18, 366.
391. Whitney, J. A. Assay Drug Dev. Technol. 2004, 2, 417.
392. Bishop, A. C.; Buzko, O.; Shokat, K. M. Trends Cell Biol. 2001, 11, 167.
393. Bishop, A. C.; Ubersax, J. A.; Petsch, D. T.; Matheos, D. P.; Gray, N. S.; Blethrow, J.; Shimizu, E.; Tsien, J. Z.; Schultz, P. G.; Rose, M. D.; Wood, J. L.; Morgan, D. O.; Shokat, K. M. Nature 2000, 407, 395.
394. Witucki, L. A.; Huang, X.; Shah, K.; Liu, Y.; Kyin, S.; Eck, M. J.; Shokat, K. M. Chem. Biol. 2002, 9, 25.
395. Liu, Y.; Shah, K.; Yang, F.; Witucki, L.; Shokat, K. M. Chem. Biol. 1998, 5, 91.
396. Bishop, A. C.; Shah, K.; Liu, Y.; Witucki, L.; Kung, C. Y.; Shokat, K. M. Curr. Biol. 1998, 8, 257.
397. Weiss, E. L.; Bishop, A. C.; Shokat, K. M.; Drubin, D. G. Nat. Cell Biol. 2000, 2, 677.
398. Carroll, A. S.; Bishop, A. C.; DeRisi, J. L.; Shokat, K. M.; O'Shea, E. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 12578.
399. Fan, Q. W.; Zhang, C.; Shokat, K. M.; Weiss, W. A. Curr. Biol. 2002, 12, 1386.
400. Shah, K.; Shokat, K. M. Methods Mol. Biol. 2003, 233, 253.
401. Shah, K.; Liu, Y.; Deirmengian, C.; Shokat, K. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 3565.
402. Liu, Y.; Shah, K.; Yang, F.; Witucki, L.; Shokat, K. M. Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 1219.
403. Adams, J.; Huang, P.; Patrick, D. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 486.
404. Liu, Y.; Bishop, A.; Witucki, L.; Kraybill, B.; Shimizu, E.; Tsien, J.; Ubersax, J.; Blethrow, J.; Morgan, D. O.; Shokat, K. M. Chem. Biol. 1999, 6, 671.
405. Bishop, A. C.; Kung, C. Y.; Shah, K.; Witucki, L.; Shokat, K. M.; Liu, Y. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 627.
406. Shogren-Knaak, M. A.; Alaimo, P. J.; Shokat, K. M. Annu. Rev. Cell. Dev. Biol. 2001, 17, 405.
407. Kraybill, B. C.; Elkin, L. L.; Blethrow, J. D.; Morgan, D. O.; Shokat, K. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12118.
408. Sekiya-Kawasaki, M.; Groen, A. C.; Cope, M. J. T. V.; Kaksonen, M.; Watson, H. A.; Zhang, C.; Shokat, K. M.; Wendland, B.; McDonald, K. L.; McCaffery, J. M.; Drubin, D. G. J. Cell Biol. 2003, 162, 765.
409. Polson, A. G.; Huang, L.; Lukac, D. M.; Blethrow, J. D.; Morgan, D. O.; Burlingame, A. L.; Ganem, D. J. Virol. 2001, 75, 3175.
410. Shah, K.; Shokat, K. M. Chem. Biol. 2002, 9, 35.
411. Fan, Q. W.; Specht, K. M.; Zhang, C.; Goldenberg, D. D.; Shokat, K. M.; Weiss, W. A. Cancer Res. 2003, 63, 8930.
412. Wang, H.; Shimizu, E.; Tang, Y. P.; Cho, M.; Kyin, M.; Zuo, W. Q.; Robinson, D. A.; Alaimo, P. J.; Zhang, C.; Morimoto, H.; Zhuo, M.; Feng, R. B.; Shokat, K. M.; Tsien, J. Z. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 4287.
413. Denzel, A.; Hare, K. J.; Zhang, C.; Shokat, K.; Jenkinson, E. Y.; Anderson, G.; Hayday, A. J. Immunol. 2003, 171, 519.
414. Abeliovich, H.; Zhang, C.; Dunn, W. A., Jr.; Shokat, K. M.; Klionsky, D. J. Mol. Biol. Cell 2003, 14, 477.
415. Liu, Y.; Kung, C.; Fishburn, J.; Ansari, A. Z.; Shokat, K. M.; Hahn, S. Mol. Cell. Biol. 2004, 24, 1721.
416. Wan, L. H.; de los Santos, T.; Zhang, C.; Shokat, K.; Hollingsworth, N. M. Mol. Biol. Cell 2004, 15, 11.
417. Jones, M. H.; Huneycutt, B. J.; Pearson, C. G.; Zhang, C.; Morgan, G.; Shokat, K.; Bloom, K.; Winey, M. Curr. Biol. 2005, 15, 160.
418. Gillespie, P. G.; Gillespie, S. K. H.; Mercer, J. A.; Shah, K.; Shokat, K. M. J. Biol. Chem. 1999, 274, 31373.
419. Holt, J. R.; Gillespie, S. K. H.; Provance, D. W.; Shah, K.; Shokat, K. M.; Corey, D. P.; Mercer, J. A.; Gillespie, P. G. Cell 2002, 108, 371.
420. Provance, D. W.; Gourley, C. R.; Silan, C. M.; Cameron, L. C.; Shokat, K. M.; Goldenring, J. R.; Shah, K.; Gillespie, P. G.; Mercer, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 1868.
421. Kapoor. T. M.; Mitchison, T. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9106.
422. Coward, P.; Wada, H. G.; Falk, M. S.; Chan, S. D.; Meng, F.; Akil, H.; Conklin, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 352.
423. Scearce-Levie, K.; Coward, P.; Redfern, C. H.; Conklin, B. R. Trends Pharmacol. Sci. 2001, 22, 414.
424. Clackson, T. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 131.
425. Klabunde, T.; Hessler, G. ChemBioChem 2002, 3, 929.
426. Jacoby, E. Quant. Struct.-Act. Relat. 2001, 20, 115.
427. Pauwels, P. J. Trends Pharmacol. Sci. 2003, 24, 504.
428. Redfern, C. H.; Coward, P.; Degtyarev, M. Y.; Lee, E. K.; Kwa, A. T.; Hennighausen, L.; Bujard, H.; Fishman, G. I.; Conklin, B. R. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 165.
429. Redfern, C. H.; Degtyarev, M. Y.; Kwa, A. T.; Salomonis, N.; Cotte, N.; Nanevicz, T.; Fidelman, N.; Desai, K.; Vranizan, K.; Lee, E. K.; Coward, P.; Shah, N.; Warrington, J. A.; Fishman, G. L; Bernstein, D.; Baker, A. J.; Conklin, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 4826.
430. Pauwels, P. J.; Colpaert, F. C. Br. J. Pharmacol. 2000, 130, 1505.
431. Small, K. M.; Brown, K. M.; Forbes, S. L.; Liggett, S. B. J. Biol. Chem. 2001, 276, 31596.
432. Srinivasan, S.; Vaisse, C.; Conklin, B. R. Melanocortin Syst. 2003, 994, 225.
433. Claeysen, S.; Joubert, L.; Sebben, M.; Bockaert, J.; Dumuis, A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 699.
434. Zhao, G. Q.; Zhang, Y. F.; Hoon, M. A.; Chandrashekar, J.; Erlenbach, I.; Ryba, N. J. P.; Zuker, C. S. Cell 2003, 115, 255.
435. Jacobson, K. A.; Gao, Z. G.; Chen, A. S.; Barak, D.; Kim, S. A.; Lee, K.; Link, A.; Van Rompaey, P.; van Calenbergh, S.; Liang, B. T. J. Med. Chem. 2001, 44, 4125.
436. Jacobson, K. A.; Kim, H. S.; Ravi, G.; Kim, S. K. Y.; Lee, K.; Chen, A. S.; Chen, W. Z.; Kim, S. G.; Barak, D.; Liang, B. T.; Gao, Z. G. Drug Dev. Res. 2003, 58, 330.
437. Kim, S. K.; Gao, Z. G.; Van Rompaey, P.; Gross, A. S.; Chen, A.; Van Calenbergh, S.; Jacobson, K. A. J. Med. Chem. 2003, 46, 4847.
438. Jacobson, K. A.; Ohno, M.; Duong, H. T.; Kim, S. K.; Tchilibon, S.; Cesnek, M.; Holy, A.; Gao, Z. G. Chem. Biol. 2005, 12, 237.
439. Arkin, M. R.; Wells, J. A. Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 301.
440. Pagliaro, L.; Felding, J.; Audouze, K.; Nielsen, S. J.; Terry, R. B.; Krog-Jensen, C.; Butcher, S. Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 442.
441. Boger, D. L.; Desharnais, J.; Capps, K. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 4138.
442. Berg, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2462.
443. Toogood, P. L. J. Med. Chem. 2002, 45, 1543.
444. Vidal, M.; Endoh, H. Trends Biotechnol. 1999, 17, 374.
445. Luker, K. E.; Smith, M. C. P.; Luker, G. D.; Gammon, S. T.; Piwnica-Worms, H.; Piwnica-Worms, D. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 12288.
446. Huang, J.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 13396.
447. Park, S. H.; Raines, R. T. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 847.
448. Horswill, A. R.; Savinov, S. N.; Benkovic, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 15591.
449. Berg, T.; Cohen, S. B.; Desharnais, J.; Sonderegger, C.; Maslyar, D. J.; Goldberg, J.; Boger, D. L.; Vogt, P. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 3830.
450. Degterev, A.; Lugovskoy, A.; Cardone, M.; Mulley, B.; Wagner, G.; Mitchison, T.; Yuan, J. Nat. Cell Biol. 2001, 3, 173.
451. Lynch, B. A.; Loiacono, K. A.; Tiong, C. L.; Adams, S. E.; MacNeil, I. A. Anal. Biochem. 1997, 247, 77.
452. Schneekloth, J. S.; Fonseca, F. N.; Koldobskiy, M.; Mandal, A.; Deshaies, R.; Sakamoto, K.; Crews, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3748.
453. Schneekloth, J. S.; Crews, C. M. ChemBioChem 2005, 6, 40.
454. Sakamoto, K. M.; Kim, K. B.; Kumagai, A.; Mercurio, F.; Crews, C. M.; Deshaies, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 8554.
455. Sakamoto, K. M.; Kim, K. B.; Verma, R.; Ransick, A.; Stein, B.; Crews, C. M.; Deshaies, R. J. Mol. Cell. Proteomics 2003, 2, 1350.
456. Ostrem, J. A.; Al-Obeidi, F.; Safar, P.; Safarova, A.; Stringer, S. K.; Patek, M.; Cross, M. T.; Spoonamore, J.; LoCascio, J. C.; Kasireddy, P.; Thorpe, D. S.; Sepetov, N.; Lebl, M.; Wildgoose, P.; Strop, P. Biochemistry 1998, 37, 1053.
457. Alluri, P. G.; Reddy, M. M.; Bachhawat-Sikder, K.; Olivos, H. J.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13995.
458. Bachhawat-Sikder, K.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9550.
459. Naffin, J. L.; Han, Y.; Olivos, H. J.; Reddy, M. M.; Sun, T. W.; Kodadek, T. Chem. Biol. 2003, 10, 251.
460. Fischetti, R. F.; Rodi, D. J.; Gore, D. B.; Makowski, L. Chem. Biol. 2004, 11, 1431.
461. Fischetti, R. F.; Rodi, D. J.; Mirza, A.; Irving, T. C.; Kondrashkina, E.; Makowski, L. J. Synchrotron Radiat. 2003, 10, 398.
462. Choo, Y.; Klug, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11168.
463. Beerli, R. R.; Dreier, B.; Barbas, C. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 1495.
464. Reynolds, L.; Ullman, C.; Moore, M.; Isalan, M.; West, M. J.; Clapham, P.; Klug, A.; Choo, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1615.
465. Papworth, M.; Moore, M.; Isalan, M.; Minczuk, M.; Choo, Y.; Klug, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 1621.
466. Dasgupta, R.; Perrimon, N. Oncogene 2004, 23, 8359.
467. Braasch, D. A.; Corey, D. R. Biochemistry 2002, 41, 4503.
468. Opalinska, J. B.; Gewirtz, A. M. Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 503.
469. Stegmaier, K.; Ross, K. N.; Colavito, S. A.; O'Malley, S.; Stockwell, B. R.; Golub, T. R. Nat. Genet. 2004, 36, 257.
470. Dervan, P. B. Bioorg. Med. Chem. 2001, 9, 2215.
471. Denison, C.; Kodadek, T. Chem. Biol. 1998, 5, R129.
472. Fechter, E. J.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8476.
473. Olenyuk, B. Z.; Zhang, G. J.; Klco, J. M.; Nickols, N. G.; Kaelin, W. G.; Dervan, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16768.
474. Dickinson, L. A.; Burnett, R.; Melander, C.; Edelson, B. S.; Arora, P. S.; Dervan, P. B.; Gottesfeld, J. M. Chem. Biol. 2004, 11, 1583.
475. Gottesfeld, J. M.; Neely, L.; Trauger, J. W.; Baird, E. E.; Dervan, P. B. Nature 1997, 387, 202.
476. Dervan, P. B.; Burli, R. W. Curr. Opin. Chem. Biol. 1999, 3, 688.
477. Wang, Y. D.; Dziegielewski, J.; Chang, A. Y.; Dervan, P. B.; Beerman, T. A. J. Biol. Chem. 2002, 277, 42431.
478. Dickinson, L. A.; Gulizia, R. J.; Trauger, J. W.; Baird, E. E.; Mosier, D. E.; Gottesfeld, J. M.; Dervan, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12890.
479. Wurtz, N. R.; Pomerantz, J. L.; Baltimore, D.; Dervan, P. B. Biochemistry 2002, 41, 7604.
480. MacBeath, G.; Koehler, A. N.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7967.
481. Uttamchandani, M.; Walsh, D. P.; Yao, S. Q.; Chang, Y. T. Curr. Opin. Chem. Biol. 2005, 9, 4.
482. Walsh, D. P.; Chang, Y. T. Comb. Chem. High Throughput Screening 2004, 7, 557.
483. Bailey, S. N.; Sabatini, D. M.; Stockwell, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 16144.
484. Koehler, A. N.; Shamji, A. F.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8420.
485. Barnes-Seeman, D.; Park, S. B.; Koehler, A. N.; Schreiber, S. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 2376.
486. Salisbury, C. M.; Maly, D. J.; Ellman, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14868.
487. Zhu, Q.; Uttamchandani, M.; Li, D. B.; Lesaicherre, M. L.; Yao, S. Q. Org. Lett. 2003, 5, 1257.
488. Gosalia, D. N.; Diamond, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 8721.
489. Canman, J. C.; Cameron, L. A.; Maddox, P. S.; Straight, A.; Timauer, J. S.; Mitchison, T. J.; Fang, G. W.; Kapoor, T. M.; Salmon, E. D. Nature 2003, 424, 1074.
490. Hauf, S.; Cole, R. W.; LaTerra, S.; Zimmer, C.; Schnapp, G.; Walter, R.; Heckel, A.; van Meel, J.; Rieder, C. L.; Peters, J. M. J. Cell Biol. 2003, 161, 281.
491. Lampson, M. A.; Renduchitala, K.; Khodjakov, A.; Kapoor, T. M. Nat. Cell Biol. 2004, 6, 232.
492. Ditchfield, C.; Johnson, V. L.; Tighe, A.; Ellston, R.; Haworth, C.; Johnson, T.; Mortlock, A.; Keen, N.; Taylor, S. S. J. Cell Biol. 2003, 161, 267.
493. Harrington, E. A.; Bebbington, D.; Moore, J.; Rasmussen, R. K.; Ajose-Adeogun, A. O.; Nakayama, T.; Graham, J. A.; Demur, C.; Hercend, T.; Diu-Hercend, A.; Su, M.; Golec, J. M.; Miller, K. M. Nat. Med. 2004, 10, 262.
494. Tanaka, T. U.; Rachidi, N.; Janke, C.; Pereira, G.; Galova, M.; Schiebel, E.; Stark, M. J. R.; Nasmyth, K. Cell 2002, 108, 317.
495. Nguyen, A.; Rothman, D. M.; Stehn, J.; Imperiali, B.; Yaffe, M. B. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 993.
496. Yaffe, M. B.; Rittinger, K.; Volinia, S.; Caron, P. R.; Aitken, A.; Leffers, H.; Gamblin, S. J.; Smerdon, S. J.; Cantley, L. C. Cell 1997, 91, 961.
497. King, R. W. Chem. Biol. 1999, 6, R327.
498. Taunton, J.; Collins, J. L.; Schreiber, S. L. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 10412.
499. Taunton, J.; Hassig, C. A.; Schreiber, S. L. Science 1996, 272, 408.
500. Kwon, H. J.; Owa, T.; Hassig, C. A.; Shimada, J.; Schreiber, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 3356.
501. Whitesell, L.; Mimnaugh, E. G.; Decosta, B.; Myers, C. E.; Neckers, L. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 8324.
502. Neckers, L. Curr. Med. Chem. 2003, 10, 733.
503. Kamal, A.; Thao, L.; Sensintaffar, J.; Zhang, L.; Boehm, M. F.; Fritz, L. C.; Burrows, F. J. Clin. Cancer Res. 2003, 9, 6126s.
504. Schulte, T. W.; Akinaga, S.; Soga, S.; Sullivan, W.; Stensgard, B.; Toft, D.; Neckers, L. M. Cell Stress Chaperones 1998, 3, 100.
505. Sharma, S. V.; Agatsuma, T.; Nakano, H. Oncogene 1998, 16, 2639.
506. Marcu, M. G.; Chadli, A.; Bouhouche, I.; Catelli, M.; Neckers, L. M. J. Biol. Chem. 2000, 275, 37181.
507. Harding, M. W.; Galat, A.; Uehling, D. E.; Schreiber, S. L. Nature 1989, 341, 758.
508. Kino, T.; Hatanaka, H.; Hashimoto, M.; Nishiyama, M.; Goto, T.; Okuhara, M.; Kohsaka, M.; Aoki, H.; Imanaka, H. J. Antibiot. 1987, 40, 1249.
509. Standaert, R. F.; Galat, A.; Verdine, G. L.; Schreiber, S. L. Nature 1990, 346, 671.
510. Sin, N.; Meng, L.; Wang, M. Q.; Wen, J. J.; Bornmann, W. G.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6099.
511. Yamaoka, M.; Yamamoto, T.; Ikeyama, S.; Sudo, K.; Fujita, T. Cancer Res. 1993, 53, 5233.
512. Liu, S.; Widom, J.; Kemp, C. W.; Crews, C. M.; Clardy, J. Science 1998, 282, 1324.
513. Wan, Y. Q.; Hur, W. Y.; Cho, C. Y.; Liu, Y.; Adrian, F. J.; Lozach, O.; Bach, S.; Mayer, T.; Fabbro, D.; Meijer, L.; Gray, N. S. Chem. Biol. 2004, 11, 247.
514. Sin, N.; Kim, K. B.; Elofsson, M.; Meng, L.; Auth, H.; Kwok, B. H.; Crews, C. M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 2283.
515. Hatanaka, Y.; Sadakane, Y. Curr. Top. Med. Chem. 2002, 2, 271.
516. Ong, S. E.; Foster, L. J.; Mann, M. Methods 2003, 29, 124.
517. Ranish, J. A.; Yi, E. C.; Leslie, D. M.; Purvine, S. O.; Goodlett, D. R.; Eng, J.; Aebersold, R. Nat. Genet. 2003, 33, 349.
518. Oda, Y.; Owa, T.; Sato, T.; Boucher, B.; Daniels, S.; Yamanaka, H.; Shinohara, Y.; Yokoi, A.; Kuromitsu, J.; Nagasu, T. Anal. Chem. 2003, 75, 2159.
519. Lin, H. N.; Abida, W. M.; Sauer, R. T.; Cornish, V. W. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4247.
520. Althoff, E. A.; Cornish, V. W. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 2327.
521. Becker, F.; Murthi, K.; Smith, C.; Come, J.; Costa-Roldan, N.; Kaufmann, C.; Hanke, U.; Degenhart, C.; Baumann, S.; Wallner, W.; Huber, A.; Dedier, S.; Dill, S.; Kinsman, D.; Hediger, M.; Bockovich, N.; Meier-Ewert, S.; Kluge, A. F.; Kley, N. Chem. Biol. 2004, 11, 211.
522. Lefurgy, S.; Cornish, V. Chem. Biol. 2004, 11, 151.
523. Baker, K.; Sengupta, D.; Salazar-Jimenez, G.; Cornish, V. W. Anal. Biochem. 2003, 315, 134.
524. de Felipe, K. S.; Carter, B. T.; Althoff, E. A.; Cornish, V. W. Biochemistry 2004, 43, 10353.
525. Keppler, A.; Gendreizig, S.; Gronemeyer, T.; Pick, H.; Vogel, H.; Johnsson, K. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 86.
526. Gendreizig, S.; Kindermann, M.; Johnsson, K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14970.
527. Muddana, S. S.; Peterson, B. R. Org. Lett. 2004, 6, 1409.
528. Li, X. M.; Zolli-Juran, M.; Cechetto, J. D.; Daigle, D. M.; Wright, G. D.; Brown, E. D. Chem. Biol. 2004, 11, 1423.
529. Poole, K. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1528.
530. Marton, M. J.; DeRisi, J. L.; Bennett, H. A.; Iyer, V. R.; Meyer, M. R.; Roberts, C. J.; Stoughton, R.; Burchard, J.; Slade, D.; Dai, H. Y.; Bassett, D. E.; Hartwell, L. H.; Brown, P. O.; Friend, S. H. Nat. Med. 1998, 4, 1293.
531. Zlauddin, J.; Sabatini, D. M. Nature 2001, 411, 107.
532. Wu, R. Z.; Bailey, S. N.; Sabatini, D. M. Trends Cell Biol. 2002, 12, 485.
533. Tochtrop, G. P.; King, R. W. Biochemistry 2003, 42, 8642.
534. Tanaka, H.; Ohshima, N.; Hidaka, H. Mol. Pharmacol. 1999, 55, 356.
535. Sche, P. P.; McKenzie, K. M.; White, J. D.; Austin, D. J. Chem. Biol. 1999, 8, 399.
536. Christensen, D. J.; Gottlin, E. B.; Benson, R. E.; Hamilton, P. T. Drug Discovery Today 2001, 6, 721.
537. Jin, Y.; Yu, J.; Yu, Y. G. Chem. Biol. 2002, 9, 157.
538. McPherson, M.; Yang, Y.; Hammond, P. W.; Kreider, B. L. Chem. Biol. 2002, 9, 691.
539. Eggert, U. S.; Ruiz, N.; Falcone, B. V.; Branstrom, A. A.; Goldman, R. C.; Silhavy, T. J.; Kahne, D. Science 2001, 294, 361.
540. Towbin, H.; Bair, K. W.; DeCaprio, J. A.; Eck, M. J.; Kim, S.; Kinder, F. R.; Morollo, A.; Mueller, D. R.; Schindler, P.; Song, H. K.; van Oostrum, J.; Versace, R. W.; Voshol, H.; Wood, J.; Zabludoff, S.; Phillips, P. E. J. Biol. Chem. 2003, 278, 52964.
541. Kumble, K. D. Anal. Bioanal. Chem. 2003, 377, 812.
542. MacBeath, G.; Schreiber, S. L. Science 2000, 289, 1760.
543. Lueking, A.; Horn, M.; Eickhoff, H.; Bussow, K.; Lehrach, H.; Walter, G. Anal. Biochem. 1999, 270, 103.
544. Zheng, X. F.; Chan, T. F. Curr. Issues Mol. Biol. 2002, 4, 33.
545. Zhou, F. X.; Bonin, J.; Predki, P. F. Comb. Chem. High Throughput Screening 2004, 7, 539.
546. Ramachandran, N.; Hainsworth, E.; Bhullar, B.; Eisenstein, S.; Rosen, B.; Lau, A. Y.; Walter, J. C.; LaBaer, J. Science 2004, 305, 86.
547. Fang, Y.; Frutos, A. G.; Lahiri, J. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 2394.
548. Spalding, T. A.; Trotter, C.; Skjaerbaek, N.; Messier, T. L.; Currier, E. A.; Burstein, E. S.; Li, D.; Hacksell, U.; Brann, M. R. Mol. Pharmacol. 2002, 61, 1297.
549. Saitton, S.; Del Tredici, A. L.; Mohell, N.; Vollinga, R. C.; Bostrom, D.; Kihlberg, J.; Luthman, K. J. Med. Chem. 2004, 47, 6595.