Theoretical insights into catalysis by phosphonoacetaldehyde hydrolase

Molecular Physics

Volumn 104, Issue 13-14, 2006, Pages 2203-2211

  Szefczyk, Borys ^a   Kedzierski, Paweł ^a   Sokalski, W Andrzej ^a   Leszczynski, Jerzy ^b  

^a WROCLAW UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Poland)

^b JACKSON STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Enzymatic catalysis; Phosphonatase; Reaction mechanism

Indexed keywords

CATALYSIS; DISCRETE FOURIER TRANSFORMS; MOLECULAR PHYSICS; PHOSPHORUS; REACTION KINETICS;

ENZYMATIC CATALYSIS; PHOSPHONATASE; PHOSPHONOACETALDEHYDE MOLECULES;

ENZYMES;

EID: 33745584365     PISSN: 00268976     EISSN: 13623028     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/00268970600654736     Document Type: Article

References (14)

1. N. G. Ternan, J. W. M. Grath, G. M. Mullan, and J. P. Quinn, World J. Microbiol. Biotech. 14, 635 (1998).
2. S. V. Kononova and M. A. Nesmeyanova, Biochemistry (Moscow) 67, 220 (2002).
3. D. B. Olsen, T. W. Hepburn, M. Moos, P. S. Mariano, and D. Dunaway-Mariano, Biochemistry 27, 2229 (1988).
4. S.-L. Lee, T. W. Hepburn, W. H. Swartz, H. L. Ammon, P. S. Mariano, and D. Dunaway-Mariano, J. Am. Chem. Soc. 114, 7346 (1992).
5. G. Zhang, K. N. Allen, and D. Dunaway-Mariano, Anal. Biochem. 322, 233 (2003).
6. M. C. Morais, W. Zhang, A. S. Baker, G. Zhang, D. Dunaway-Mariano, and K. N. Allen, Biochemistry 39, 10385 (2000).
7. M. C. Morais, G. Zhang, W. Zhang, D. B. Olsen, D. Dunaway-Mariano, and K. N. Allen, J. Biol. Chem. 279, 9353 (2004).
8. A. S. Baker, M. J. Ciocci, W. W. Metcalf, J. Kim, P. C. Babbitt, B. L. Wanner, B. M. Martin, and D. Dunaway-Mariano, Biochemistry 37, 9305 (1998).
9. G. Zhang, M. C. Morais, J. Dai, W. Zhang, D. Dunaway-Mariano, and K. N. Allen, Biochemistry 43, 4990 (2004).
10. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery Jr, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, Gaussian 03, Revision B.04 (Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003).
11. N. E. Hall and B. J. Smith, J. Phys. Chem. A 102, 4930 (1998).
12. F. Himo, J.-D. Guo, A. Rinaldo-Matthis, and P. Nordlund, J. Phys. Chem. B 109, 20004 (2005).
13. M. Garcia-Viloca, J. Gao, M. Karplus, and D. G. Truhlar, Science 303, 186 (2004).
14. K. N. Allen and D. Dunaway-Mariano, Trends Bioch. Sci. 29, 495 (2004).