α-helix formation in melittin and β-lactoglobulin a induced by fluorinated dialcohols

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 22, 2006, Pages 10903-10909

  Schuh, Merlyn D ^a   Baldwin, Melinda C ^a  

^a DAVIDSON COLLEGE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHROMOPHORES; CONFORMATIONS; FLUORESCENCE; FLUORINE; PROTEINS;

CIRCULAR DICHROISM; HELIX FORMATION; LACTOGLOBULIN; RED-EDGE EXCITATION SHIFT;

ALCOHOLS;

EID: 33745478652     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp056124l     Document Type: Article

References (58)

1. Buck, M. Q. Rev. Biophys. 1998, 31, 297.
2. Hong, D.-P.; Hoshino, M.; Kuboi, R.; Goto, Y. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8427.
3. Jasanoff, A.; Fersht, A. Biochemistry 1994, 33, 2129.
4. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Curr. Opin. Struct. Biol. 1993, 3, 60.
5. Smith, L. J.; Alexandrescu, A. T.; Pitkeathly, M.; Dobson, C. M. Structure 1994, 2, 703.
6. Barrow, C. J.; Yasuda, A.; Kenny, P. T.; Zagorski M. G. J. Mol. Biol. 1992, 225, 1075.
7. Snyder, S. W.; Ladror, U. S.; Wade, W. S.; Wang, F. T.; Barrett, L. W.; Matayoshi, E. D.; Huffaker, H. J.; Krafft, G. A.; Holzman, T. F. Biophys. J. 1994, 67, 1216.
8. Wood, S. K.; Maleeff, B.; Hart, T.; Wetzel, R. J. Mol. Biol. 1996, 56, 870.
9. Zhang, H.; Kaneko, K.; Nguyen, J. T.; Livshits, T. L.; Baldwin, M. A.; Cohen, F. E.; James, T. L.; Prusiner, S. B. J. Mol. Biol. 1995, 250, 514.
10. Gassett, M.; Baldwin, M. A.; Lloyd, D. H.; Gabriel, J. M.; Holtzman, D. M.; Cohen, F.; Fletterick, R.; Prusiner, S. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 10940.
11. Masotti, L.; Spinsni, A.; Urry, D. W. Cell. Biophys. 1980, 2, 241.
12. MacPhee, C. E.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 2000, 297, 1203.
13. Lu, H.; Buck, M.; Radford, S. E.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 1997, 265, 112.
14. Hamada, D.; Chiti, F.; Guijarro, J. I.; Kataoka, M.; Taddei, N.; Dobson, C. M. Nat. Struct. Biol. 2000, 3, 868.
15. Pittz, E. P.; Timasheff, S. N. Biochemistry 1978, 17, 615.
16. Uversky, V. N.; Narizhneva., N. V.; Kirschstein, S. O.; Winter, S.; Löber, G. Folding Des. 1997, 2, 163.
17. Thomas, P. D.; Dill, K. A. Protein Sci. 1993, 2, 2050.
18. Luo, P.; Baldwin, R. L. Biochemistry 1997, 36, 8413.
19. Cammers-Goodwin, A.; Allen, T. J.; Oslick, S. L.; McClure, K. F.; Lee, J. H.; Kemp, D. S. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3082.
20. Conio, G.; Patrone, E.; Brighetti, S. J. Biol. Chem. 1970, 245, 3335.
21. Walgers, R.; Lee, T. C.; Cammers-Goodwin, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5073.
22. Fioroni, M.; Diaz, M. D.; Burger, K.; Berger, S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 7737.
23. Diaz, M. D.; Fioroni, M.; Burger, K.; Berer, S. Chem. Eur. J. 2002, 8, 1663.
24. Rajan, R.; Balaram, P. Int. J. Pept. Protein Res. 1996, 48, 328.
25. Kumar, S.; Modig, K.; Halle, B. Biochemistry 2003, 42, 13708.
26. Hirota, N.; Mizuno, K.; Goto, Y. Protein Sci. 1997, 6, 416.
27. Hirota, N.; Mizuno, K.; Goto, Y. J. Mol. Biol. 1998, 275, 365.
28. Roccatano, D.; Fioroni, M.; Zacharias, M.; Colombo, G. Protein Sci. 2005, 14, 2582.
29. Kuprin, S.; Gräslund, A.; Ehrenberg, A.; Koch, M. H. J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 217, 1151.
30. Gast, K.; Zirwer, D.; Müller-Frohne, M.; Damaschun, G. Protein Sci. 1999, 8, 625.
31. Reiersen, H.; Rees, A. R. Protein Eng. 2000, 13, 739.
32. Gast, K.; Siemer, A.; Zirwer, D. Eur. Biophys. J. 2001, 30, 273.
33. Kurpin, S.; Hamada, D.; Tanaka, T.; Goto, Y. Folding Des. 1996, 1, 255.
34. Mizutani, Y.; Kamogawa, T.; Kitigawa, T.; Shimizu, A.; Tanaguchi, Y.; Nakanishi, K. J. Phys. Chem. 1991, 95, 1790.
35. Koga, Y. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5172.
36. Kuwata, K.; Hoshino, M.; Forge, V.; Era, S.; Batt, C. A.; Goto, Y. Protein Sci. 1999, 8, 2541.
37. Chandani,. B.; Balasubramanian, D. Biopolymers 1986, 25, 1259.
38. Fersht, A. Structure and Mechanism in Protein Science; W. H. Freeman: New York. 1999; Chapter 17.
39. Chen, Y. H.; Yang, J. T.; Martinez, H. M. Biochemistry 1972, 11, 4120.
40. Kuwata, K.; Hoshino, M.; Era, S.; Batt, C. A.; Goto, Y. J. Mol. Biol. 1998, 285, 731.
41. Mendieta, J.; Folqué, H.; Tauler, R. Biophys. J. 1999, 76, 451.
42. Rohl, C. A.; Chakrabartty, A.; Baldwin, R. L. Protein Sci. 1996, 5, 2623.
43. Rohl, C. A.; Baldwin, R. L. Biochemistry 1994, 33, 7760.
44. Chakrabartty, A.; Baldwin, R. L. Adv. Protein Chem. 1995, 46, 141.
45. Kallenbach, N. R.; Lyu, P.; Zhou, H. In Circular Dichroism and the Conformational Analysis of Biomolecules; Fasman, G. D., Ed.; Plenum Press: New York, 1996; pp 201-259.
46. Lifson, R.; Roig, A. J. Chem. Phys. 1961, 34, 1963.
47. Griko, Y. V.; Kutyshenko, V. P. Biophys. J. 1994, 67, 356.
48. Raghuraman, H.; Chattopadhyay, A. Langmuir 2003, 19, 10,332.
49. Mukherjee, S.; Chattopadhyay, A. J. Fluoresc. 1995, 5, 237.
50. Chattopadhyay, A. Chem. Phys. Lipids 2003, 122, 3.
51. Raghuraman, H.; Kelkar, D. A.; Chattopadhyay, A. Proc. Ind. Natl. Acad. Sci. 2003, 69, 25.
52. Demchenko, A. P. Trends Biochem. Sci. 1988, 13, 374.
53. Demchenko, A. P. Biophys. Chem. 1982, 15, 101.
54. Galley, W. C.; Purkey, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1970, 67, 1116.
55. Lakowicz, J. R.; Keating-Hakamoto, S. Biochemistry 1984, 23, 3013.
56. Ghosh, A. K.; Rukmini, R.; Chattopadhyay, A. Biochemistry 1997, 36, 14, 291.
57. Chattopadhyay, A.; Rukmini, R. FEBS Lett. 1993, 335, 341.
58. Hristova, K.; Dempsey, C. E.; White, S. H. Biophys. J. 2001, 80, 801.