Cellular effect of high doses of silica-coated quantum dot profiled with high throughput gene expression analysis and high content cellomics measurements

Nano Letters

Volumn 6, Issue 4, 2006, Pages 800-808

  Zhang, Tingting ^a   Stilwell, Jackie L ^a,f   Gerion, Daniele ^b,f   Ding, Lianghao ^a   Elboudwarej, Omeed ^a   Cooke, Patrick A ^c   Gray, Joe W ^a,d   Alivisatos, A Paul ^d,e   Chen, Fanqing Frank ^a,d  

^a LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b LAWRENCE LIVERMORE NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c Thermo Fisher Scientific   (United States)

^d UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^e UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^f PHILIPS RESEARCH LABORATORIES   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GENE ARRAY; INFLAMMATORY RESPONSE; MERCAPTOACID; UNCOATED QDOTS;

BIOMEDICAL ENGINEERING; CELLS; GENES; POLYETHYLENE GLYCOLS; POLYMERS; SILICA; TOXICITY;

SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

BIOMATERIAL; PROTEOME; QUANTUM DOT; SILICON DIOXIDE;

ARTICLE; CELL LINE; DOSE RESPONSE; DRUG EFFECT; FIBROBLAST; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; HUMAN; METABOLISM;

CELL LINE; COATED MATERIALS, BIOCOMPATIBLE; DOSE-RESPONSE RELATIONSHIP, DRUG; FIBROBLASTS; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; HUMANS; PROTEOME; QUANTUM DOTS; SILICON DIOXIDE;

EID: 33646398886     PISSN: 15306984     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/nl0603350     Document Type: Article

References (59)

1. Colvin, V. L. Scientist 2004, 18, 26-27.
2. Colvin, V. L. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 760-760.
3. Service, R. F. Science 2004, 304, 1732-1734.
4. Maynard, A. D.; Baron, P. A.; Foley, M.; Shvedova, A. A.; Kisin, E. R.; Castranova, V. J. Toxicol. Environ. Health, Part A 2004, 67, 87-107.
5. Silva, V. M.; Corson, N.; Elder, A.; Oberdorster, G. Toxicol. Sci. 2005.
6. Frampton, M. W.; Utell, M. J.; Zareba, W.; Oberdorster, G.; Cox, C.; Huang, L. S.; Morrow, P. E.; Lee, F. E.; Chalupa, D.; Frasier, L. M.; Speers, D. M.; Stewart, J. Res. Rep. - Health Eff. Inst. 2004, 1-47; discussion 49-63.
7. Block, M. L.; Wu, X.; Pei, Z.; Li, G.; Wang, T.; Qin, L.; Wilson, B.; Yang, J.; Hong, J. S.; Veronesi, B. FASEB J. 2004, 18, 1618-1620.
8. Jia, G.; Wang, H.; Yan, L.; Wang, X.; Pei, R.; Yan, T.; Zhao, Y.; Guo, X. 2005, 39, 1378-1383.
9. Ali, S. S.; Hardt, J. I.; Quick, K. L.; Kim-Han, J. S.; Erlanger, B. F.; Huang, T. T.; Epstein, C. J.; Dugan, L. L. Free Radicals Biol. Med. 2004, 37, 1191-1202.
10. Burlaka, A. P.; Sidorik, Y. P.; Prylutska, S. V.; Matyshevska, O. P.; Golub, O. A.; Prylutskyy, Y. I.; Scharff, P. Exp. Oncol. 2004, 26, 326-327.
11. Nelson, M. A.; Domann, F. E.; Bowden, G. T.; Hooser, S. B.; Fernando, Q.; Carter, D. E. Toxicol. Ind. Health 1993, 9, 623-630.
12. Oberdorster, E. Environ. Health Perspect. 2004, 112, 1058-1062.
13. Rancan, F.; Rosan, S.; Boehm, F.; Cantrell, A.; Brellreich, M.; Schoenberger, H.; Hirsch, A.; Moussa, F. J. Photochem. Photobiol., B2002, 67, 157-162.
14. Sayes, C. M.; Fortner, J. D.; Guo, W.; Lyon, D.; Boyd, A. M.; Ausman, K. D.; Tao, Y. J.; Sitharaman, B.; Wilson, L. J.; Hughes, J. B.; West, J. L.; Colvin, V. L. Nano Lett. 2004, 4, 1881-1887.
15. Alivisatos, A. P.; Gu, W.; Larabell, C. Annu. Rev. Biomed. Eng. 2004.
16. Tang, Z.; Wang, Y.; Sun, K.; Kotov, N. A. Nano Lett. 2005, 17, 358-363.
17. Zaitseva, N.; Manna, L.; Gerion, D.; Saw, C. K. Adv. Mater. 2005, 17, 1321-1324.
18. Rikans, L. E.; Yamano, T. J. Biochem. Mol. Toxicol. 2000, 14, 110-117.
19. Tsien, R. Y. Nat. Cell Biol. 2003, SS16-SS21.
20. Sako, Y.; Yanagida, T. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003, 4, SS1-SS5.
21. Kim, S.; Lim, Y. T.; Soltesz, E. G.; De Grand, A. M.; Lee, J.; Nakayama, A.; Parker, J. A.; Mihaljevic, T.; Laurence, R. G.; Dor, D. M.; Cohn, L. H.; Bawendi, M. G.; Frangioni, J. V. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 93-97.
22. Gao, X.; Cui, Y.; Levenson, R.; Chung, L.; Nie, S. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 969-976.
23. Chen, F. Q.; Gerion, D. Nano Lett. 2004, 4, 1827-1832.
24. Derfus, A. M.; Chan, W. C. W.; Bhatia, S. N. Nano Lett. 2004, 4, 11-18.
25. Hoshino, A.; Fujioka, K.; Oku, T.; Suga, M.; Sasaki, Y. F.; Ohta, T.; Yasuhara, M.; Suzuki, K.; Yamamoto, K. Nano Lett. 2004, 4, 2163-2169.
26. Kirchner, C.; Liedl, T.; Kudera, S.; Pellegrino, T.; Munoz Javier. A.; Gaub, H. E.; Stölzle, S.; Fertig, N.; Parak, W. J. Nano Lett. 2005, 5, 331-338.
27. Ding, L.; Stilwell, J.; Zhang, T.; Elboudwarej, O.; Jiang, H.; Selegue, J. P.; Cooke, P. A.; Gray, J. W.; Chen, F. F. Nano Lett. 2005, 5, 2448-2464.
28. Parak, W. J.; Gerion, D.; Zanchet, D.; Woerz, A. S.; Pellegrino, T.; Micheel, C.; Williams, S. C.; Seitz, M.; Bruehl, R. E.; Bryant, Z.; Bustamante, C.; Bertozzi, C. R.; Alivisatos, A. P. Chem. Mater. 2002, 14, 2113-2119.
29. Gerion, D.; Pinaud, F.; Williams, S. C.; Parak, W. J.; Zanchet, D.; Weiss, S.; Alivisatos, A. P. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 8861-8871.
30. Jaiswal, J. K.; Mattoussi, H.; Mauro, J. M.; Simon, S. M. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 47-51.
31. Jaiswal, J. K.; Simon, S. M. Trend Cell Biol. 2004, 14, 497-504.
32. Zeeberg, B. R.; Feng, W.; Wang, G.; Wang, M. D.; Fojo, A. T.; Sunshine, M.; Narasimhan, S.; Kane, D. W.; Reinhold, W. C.; Lababidi, S.; Bussey, K. J.; Riss, J.; Barrett, J. C.; Weinstein, J. N. GenomeBiology 2003, 4, R28.
33. Engelman, J. A.; Berg, A. H.; Lewis, R. Y.; Lin, A.; Lisanti, M. P.; Scherer, P. E. J. Biol. Chem. 1999, 274, 35630-35638.
34. Luschen, S.; Scherer, G.; Ussat, S.; Ungefroren, H.; Adam-Klages, S. Exp. Cell Res. 2004, 293, 196-206.
35. Wang, W.; Chen, J. X.; Liao, R.; Deng, Q.; Zhou, J. J.; Huang, S.; Sun, P. Mol. Cell Biol. 2002, 22, 3389-3403.
36. Zhang, H.; Kim, J. K.; Edwards, C. A.; Xu, Z.; Taichman, R.; Wang, C. Y. Nat. Cell Biol. 2005, 7, 909-915.
37. Haq, R.; Brenton, J. D.; Takahashi, M.; Finan, D.; Finkielsztein, A.; Damaraju, S.; Rottapel, R.; Zanke, B. Cancer Res. 2002, 62, 5076-5082.
38. Petropoulou, C.; Trougakos, I. P.; Kolettas, E.; Toussaint, O.; Gonos, E. S. FEBS Lett. 2001, 509, 287-297.
39. Munakata, H.; Yosizawa, Z. Biochim. Biophys. Acta 1980, 623, 412-417.
40. Cowley, D. O.; Muse, G. W.; Van Dyke, T. Mol. Cell Biol. 2005, 25, 7796-7802.
41. Meraldi, P.; Sorger, P. K. EMBO J. 2005, 24, 1621-1633.
42. Vanoosthuyse, V.; Hardwick, K. G. Trends Cell Biol. 2005, 15, 231-233.
43. Tang, Z.; Shu, H.; Oncel, D.; Chen, S.; Yu, H. Mol. Cell 2004, 16, 387-397.
44. Margolis, R. L. Dev. Cell 2004, 7, 634-635.
45. Ouyang, B.; Lan, Z.; Meadows, J.; Pan, H.; Fukasawa, K.; Li, W.; Dai, W. Cell Growth Differ. 1998, 9, 877-885.
46. Hansen, D. V.; Loktev, A. V.; Ban, K. H.; Jackson, P. K. Mol. Biol. Cell 2004, 15, 5623-5634.
47. Letwin, K.; Mizzen, L.; Motro, B.; Ben-David, Y.; Bernstein, A.; Pawson, T. EMBO J. 1992, 11, 3521-3531.
48. Delaval, B.; Ferrand, A.; Conte, N.; Larroque, C.; Hernandez-Verdun, D.; Prigent, C.; Birnbaum, D. Oncogene 2004, 23, 4516-4522.
49. Lauffart, B.; Howell, S. J.; Tasch, J. E.; Cowell, J. K.; Still, I. H. Biochem. J. 2002, 363, 195-200.
50. Abaza, A.; Soleilhac, J. M.; Westendorf, J.; Piel, M.; Crevel, I.; Roux, A.; Pirollet, F. J. Biol. Chem. 2003, 278, 27844-27852.
51. Edsall, L. C.; Cuvillier, O.; Twitty, S.; Spiegel, S.; Milstien, S. J. Neurochem. 2001, 76, 1573-1584.
52. Kohama, T.; Olivera, A.; Edsall, L.; Nagiec, M. M.; Dickson, R.; Spiegel, S. J. Biol. Chem. 1998, 273, 23722-23728.
53. Matsusaki, M.; Larsson, K.; Akagi, T.; Lindstedt, M.; Akashi, M.; Borrebaeck, C. A. K. Nano Lett. 2005, 5, 2168-2173.
54. Laoukili, J.; Kooistra, M. R.; Bras, A.; Kauw, J.; Kerkhoven, R. M.; Morrison, A.; Clevers, H.; Medema, R. H. Nat. Cell Biol. 2005, 7, 126-136.
55. Hughes, M.; Dobric, N.; Scott, I. C.; Su, L.; Starovic, M.; St-Pierre, B.; Egan, S. E.; Kingdom, J. C.; Cross, J. C. Dev. Biol. 2004, 277, 26-37.
56. St-Pierre, B.; Flock, G.; Zacksenhaus, E.; Egan, S. E. J. Biol. Chem. 2002, 277, 46544-46551.
57. Turley, H.; Wykoff, C. C.; Troup, S.; Watson, P. H.; Gatter, K. C.; Harris, A. L. J. Pathol. 2004, 203, 808-813.
58. Boudjelal, M.; Taneja, R.; Matsubara, S.; Bouillet, P.; Dolle, P.; Chambon, P. Genes Dev. 1997, 77, 2052-2065.
59. Ding, L. H.; Shingyoji, M.; Chen, F.; Hwang, J. J.; Burma, S.; Lee, C.; Cheng, J. F.; Chen, D. J. Radiat. Res. 2005, 164, 17-26.