Quantifying archaeal community autotrophy in the mesopelagic ocean usinq natural radiocarbon

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 103, Issue 17, 2006, Pages 6442-6447

  Ingalls, Anitra E ^a,d   Shah, Sunita R ^a,d   Hansman, Roberta L ^b   Aluwihare, Lihini I ^b   Santos, Guaciara M ^b   Druffel, Ellen R M ^c   Pearson, Ann ^a  

^a HARVARD UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^d UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

Author keywords

Biomarkers; Carbon isotopes; Ecology nitrogen cycle; Microbial; Oceanography

Indexed keywords

CARBON 14; LIPID; NITROGEN; SURFACE WATER;

ARCHAEBACTERIUM; ARTICLE; AUTOTROPHY; BACTERIAL METABOLISM; BIOMASS; ECOLOGY; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; ISOTOPE LABELING; MARINE ENVIRONMENT; NONHUMAN; OCEANIC REGIONS; PRIORITY JOURNAL;

ARCHAEA; CARBON; CARBON RADIOISOTOPES; ECOSYSTEM; LIPID METABOLISM; LIPIDS; SEAWATER;

ARCHAEA; BACTERIA (MICROORGANISMS);

EID: 33646262107     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0510157103     Document Type: Article

References (46)

1. DeLong, E. F. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 5685-5689.
2. Fuhrman, J. A., McCallum, K. & Davis, A. A. (1992) Nature 356, 148-149.
3. DeLong, E. F., Wu, K. Y., Prézelin, B. B. & Jovine R. V. M. (1994) Nature 371, 695-697.
4. Fuhrman, J. A. & Davis, A. A. (1997) Mar. Ecol. Progr. Ser. 150, 275-285.
5. Massana, R., Murray, A. E., Preston, C. M. & DeLong, E. F. (1997) Appl. Environ. Mkrobiol. 63, 50-56.
6. Karner, M. B., DeLong, E. F. & Karl, D. M. (2001) Nature 409, 507-510.
7. Könneke, M., Bernhard, A. E., de la Torre, J. R., Walker, C. B., Waterbury, J. B. & Stahl, D. A. (2005) Nature 437, 543-546.
8. Francis, C. A., Roberts, K. J., Beman, J. M., Santoro, A. E. & Oakley, B. B. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 14683-14688.
9. Ouverney, C. C. & Fuhrman, J. A. (2000) Appl. Environ. Microbiol. 66, 4829-4833.
10. Wuchter, C., Schouten, S., Boschker, H. T. S. & Damsté, J. S. S. (2003) FEMS Microbiol. Lett. 219, 203-207.
11. Herndl, G. J., Reinthaler, T., Teira, E., van Aken, H., Veth, C., Pernthaler, A. & Pernthaler, J. (2005) Appl. Environ. Microbiol. 71, 2303-2309.
12. Schouten, S., Hopmans, E. C., Pancost, R. D. & Damsté, J. S. S. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 14421-14426.
13. Pearson, A., McNichol, A. P., Benitez-Nelson, B. C., Hayes, J. M. & Eglinton, T. I. (2001) Geochim. Cosmochim. Acta 65, 3123-3137.
14. Damsté, J. S. S., Rijpstra, W. I. C., Hopmans, E. C., Prahl, F. G., Wakeham, S. G. & Schouten, S. (2002) Appl. Environ. Microbiol. 68, 2997-3002.
15. Wuchter, C., Schouten, S., Wakeham, S. G. & Damsté, J. S. S. (2005) Paleoceanography 20, PA3013.
16. Schouten, S., Hopmans, E. C., Schefuß, E. & Damsté, J. S. S. (2002) Earth Planet. Sci. Lett. 204, 265-274.
17. Powers, L. A., Werne, J. P., Johnson, T. C., Hopmans, E. C., Damsté, J. S. S. & Schouten, S. (2004) Geology 31, 613-616.
18. Wuchter, C., Schouten, S., Coolen, M. J. L. & Damsté, J. S. S. (2004) Paleoceanography 19, PA4028.
19. Kuypers, M. M. M., Blokker, P., Erbacher, J., Kinkel, H., Pancost, R. D., Schouten, S. & Damsté, J. S. S. (2001) Science 293, 92-94.
20. Hoefs, M. J. L., Schouten, S., deLeeuw, J. W., King, L. L., Wakeham, S. G. & Damsté, J. S. S. (1997) Appl. Environ. Microbiol. 63, 3090-3095.
21. Schouten, S., Hoefs, M. J. L., Koopmans, M. P., Bosch, H. J. & Damsté, J. S. S. (1998) Org. Geochem. 29, 1305-1319.
22. Pearson, A., Eglinton, T. I. & McNichol, A. P. (2000) Paleoceanography 15, 541-550.
23. Volkman, J. K. (1986) Org. Geochem. 9, 83-99.
24. Druffel, E. R. M., Williams, P. M., Bauer, J. E. & Ertel, J. R. (1992) J. Geophys. Res. 97, 15639-15659.
25. Schouten, S., Hopmans, E. C. & Damsté, J. S. S. (2004) Org. Geochem. 35, 567-571.
26. Lichtfouse, E. & Eglinton, T. I. (1995) Org. Geochem. 23, 969-973.
27. Pearson, A. & Eglinton T. I. (2000) Org. Geochem. 31, 1103-1116.
28. Aluwihare L. I., Repeta D. J. & Chen R. F. (2002) Deep-Sea Res. II 49, 4421-4437.
29. Gliozzi, A., Paoli, G., DeRosa, M. & Gambacorta, A. (1983) Biochim. Biophys. Acta 735, 234-242.
30. Uda, I., Sugai, A., Itoh, Y. H. & Itoh, T. (2001) Lipids 36, 103-105.
31. Arístegui, J., Agustí, S. & Duarte, C. M. (2002) Geophys. Res. Lett. 30, 10.1029/2002GL016227.
32. Biddanda, B. & Benner, R. (1997) Deep-Sea Res. I 44, 2069-2085.
33. Sorokin D. Y. (1993) Microbiology 62, 488-493.
34. Hedges J. I. & Oades, J. M. (1997) Org. Geochem. 27, 319-361.
35. Lee, K. (2001) Limnol Oceanogr. 46, 1287-1297.
36. Blair, N., Leu, A., Munoz, E., Olson, J., Kwong, E. & DesMarais, D. (1985) Appl. Environ. Microbiol. 50, 996-1001.
37. Bligh, E. G. & Dyer, W. J. (1959) Can. J. Biochem. Physiol. 37, 911-917.
38. Hopmans, E. C., Schouten, S., Pancost, R. D., van der Meer, M. T. J. & Damsté, J. S. S. (2000) Rapid Commun. Mass Spectrom. 14, 585-589.
39. Smittenberg, R. H., Hopmans, E. C., Schouten, S., Hayes, J. M., Eglinton, T. I. & Damsté, J. S. S. (2004) Paleoceanography 19, PA2012.
40. von Reden, K. F., Schneider, R. J. McNichol, A. P. & Pearson, A. (1998) Radiocarbon 40, 247-253.
41. Pearson, A., McNichol, A. P., Schneider, R. J. & von Reden, K. F. (1998) Radiocarbon 40, 61-76.
42. Santos, G. M., Southon, J. R., Druffel E. R. M., Rodriguez, K. C., Griffin, S. & Mazon, M. (2004) Radiocarbon 46, 165-173.
43. McNichol, A. P. & Jones, G. A. (1991) in Requirements for WHP Data Reporting, WOCE Operations Manual, eds. Joyce, T., Corry, C. & Stalcup, M. World Ocean Circulation Experiment Hydrographic Program Office, University of California at San Diego, La Jolla, CA), WHPO Publication 90-1, Part 3.1.2, pp. 5-8.
44. McNichol, A. P., Jones, G. A., Button, D. L., Gagnon, A. R. & Key, R. M. (1994) Radiocarbon 36, 237-246.
45. Damsté, J. S. S., Hopmans, E. C., Schouten, S., van Duin, A. C. T. & Geenevasen, J. A. J. (2002) J. Lipid Res. 43, 1641-1651.
46. Kumamoto, Y., Murata, A., Saito, C., Hondo, M. & Kusakabe, M. (2002) Deep-Sea Res. II 49, 5339-5351.