The role of enzymes and mediators in white-rot fungal degradation of lignocellulose

ACS Symposium Series

Volumn 845, Issue , 2003, Pages 196-209

  Li, Kaichang ^a  

^a OREGON STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33645405658     PISSN: 00976156     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1021/bk-2003-0845.ch011     Document Type: Conference Paper

References (116)

1. Eriksson, K.-E.; Blanchette, R. A.; Ander, P. Microbial and enzymatic degradation of wood and wood components; Springer-Verlag: New York, 1990.
2. Ander, P.; Eriksson, K.-E. Arch. Microbiol. 1976, 109, 1-8.
3. Tien, M.; Kirk, T. K. Science 1983, 221, 661-663.
4. Tien, M.; Kirk, T. K. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 2280-2284.
5. Glenn, J. K.; Morgan, M. A.; Mayfield, M. B.; Kuwahara, M.; Gold, M. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1983, 114, 1077-1083.
6. Wariishi, H.; Huang, J.; Dunford, H. B.; Gold, M. H. J. Biol. Chem. 1991, 266, 20694-20699.
7. Wariishi, H.; Valli, K.; Gold, M. H. Biochemistry 1989, 28, 6017-6023.
8. Wariishi, H.; Valli, K.; Renganathan, V.; Gold, M. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 14185-14191.
9. Wariishi, H.; Valli, K.; Gold, M. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991, 176, 269-275.
10. Bao, W.; Fukushima, Y.; Jensen, K. A., Jr.; Moen, M. A.; Hammel, K. E. FEBS Lett. 1994, 354, 297-300.
11. Schmidt, H. W. H.; Haemmerli, S. D.; Shoemaker, H. E.; Leisola, M. S. A. Biochemistry 1989, 28, 1776-1783.
12. Banci, L.; Ciofi-Baffoni, S.; Tien, M. Biochemistry 1999, 38, 3205-3210.
13. Wariishi, H.; Dunford, H. B.; MacDonald, I. D.; Gold, M. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 3335-3340.
14. Wariishi, H.; Akileswaran, L.; Gold, M. H. Biochemistry 1988, 27, 5365-5370.
15. Tien, M.; Tu, C. P. Nature 1987, 326, 520-523.
16. Brown, A.; Sims, P. F.; Raeder, U.; Broda, P. Gene 1988, 73, 77-85.
17. Pribnow, D.; Mayfield, M. B.; Nipper, V. J.; Brown, J. A.; Gold, M. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 5036-5040.
18. Edwards, S. L.; Raag, R.; Wariishi, H.; Gold, M. H.; Poulos, T. L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 750-754.
19. Sundaramoorthy, M.; Kishi, K.; Gold, M. H.; Poulos, T. L. J. Biol. Chem. 1994, 269, 32759-32767.
20. Sundaramoorthy, M.; Kishi, K.; Gold, M. H.; Poulos, T. L. J. Biol. Chem. 1997, 272, 17574-17580.
21. Orth, A. B.; Royse, D. J.; Tien, M. Appl. Environ. Microbiol. 1993, 59, 4017-4023.
22. Camarero, S.; Sarkar, S.; Ruiz-Duenas, F. J.; Martinez, M. J.; Martinez, A. T. J. Biol. Chem. 1999, 274, 10324-10330.
23. Timofeevski, S. L.; Reading, N. S.; Aust, S. D. Arch. Biochem. Biophys. 1998, 356, 287-295.
24. de Jong, E.; Cazemier, A. E.; Field, J. A.; de Bont, J. A. Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 271-277.
25. Farmer, V. C.; Hendrerson, M. E. K.; Russell, J. D. Biochem. J. 1960, 74, 257-262.
26. Bourbonnais, R.; Paice, M. G. Biochem. J. 1988, 255, 445-450.
27. Sannia, P.; Limongi, P.; Cocea, E.; Buonocore, F.; Nitti, G.; Giardina, P. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1073, 114-119.
28. Guillén, F.; Martínez, A. T.; Martínez, M. J. Eur. J. Biochem. 1992, 209, 603-611.
29. Guillén, F.; Martínez, A. T.; Martínez, M. J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1990, 32, 465-469.
30. Muheim, A.; Waldner, R.; Sanglard, D.; Reiser, J.; Schoemaker, H. E.; Leisola, M. S. A. Eur. J. Biochem. 1991, 195, 369-375.
31. Muheim, A.; Waldner, R.; Leisola, M. S. A.; Fiechter, A. Enzyme Microb Technol 1990, 12, 204-209.
32. Kersten, P. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1990, 87, 2936-2940.
33. Kersten, P. J.; Kirk, T. K. J. Bacteriol. 1987, 169, 2195-2201.
34. Daniel, G.; Vole, J.; Kubatova, E. Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 2524-2532.
35. Ayers, A. R.; Ayers, S. B.; Eriksson, K. E. Eur. J. Biochem. 1978, 90, 171-181.
36. Henriksson, G.; Johansson, G.; Pettersson, G. J. Biotechnol. 2000, 78, 93-113.
37. Kelley, R. L.; Reddy, C. A. Methods Enzymol. 1988, 161B, 307-316.
38. Vole, J.; Eriksson, K.-E. L. Methods Enzymol. 1988, 161B, 316-322.
39. Vole, J.; Kubárocá, E.; Sedmera, P.; Daniel, G.; Gabriel, J. Arch. Microbiol. 1991, 156, 297-301.
40. Eriksson, K.-E. L.; Nishida, A. Methods Enzymol. 1988, 161B, 322-326.
41. Xu, F. In Encyclopedia of bioprocess technology: fermentation, biocatalysis, and bioseparation; Flickinger, M. C., Drew, S. W., Eds.; John Wiley & Sons, Inc.: 1999, p 1545-1554.
42. Xu, F.; Berka, R. M.; Wahleithner, J. A.; Nelson, B. A.; Shuster, J. R.; Brown, S. H.; Palmer, A. E.; Solomon, E. I. Biochem. J. 1998, 334, 63-70.
43. Xu, F.; Palmer, A. E.; Yaver, D. S.; Berka, R. M.; Gambetta, G. A.; Brown, S. H.; Solomon, E. I. J. Biol. Chem. 1999, 274, 12372-12375.
44. Ducros, V.; Brzozowski, A. M.; Wilson, K. S.; Brown, S. H.; Østergaard, P.; Schneider, P.; Yaver, D. S.; Pedersen, A. H.; Davies, G. J. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 310-316.
45. Ducros, V.; Brzozowski, A. M.; Wilson, K. S.; Østergaard, P.; Schneider, P.; Svendson, A.; Davies, G. J. Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 2001, 57, 333-336.
46. Adler, E. Wood Sci. Technol. 1977, 11, 169-218.
47. Perez, J.; Jeffries, T. W. Appl. Environ. Microbiol. 1990, 56, 1806-1812.
48. Schoemaker, H. E.; Leisola, M. S. A. J. Biotechnol. 1990, 13, 101-109.
49. Kersten, P. J.; Kalyanaraman, B.; Hammel, K. E.; Reinhammar, B.; Kirk, T. K. Biochem. J. 1990, 268, 475-480.
50. Kersten, P. J.; Tien, M.; Kalyanaraman, B.; Kirk, T. K. J. Biol. Chem. 1985, 260, 2609-2612.
51. Schoemaker, H. E.; Harvey, P. J.; Bowen, R. M.; Palmer, J. M. FEBS Lett. 1985, 183, 7-12.
52. Kirk, T. K.; Farrell, R. L. Annu. Rev. Microbiol. 1987, 41, 261-266.
53. Hammel, K. E.; Kalyanaraman, B.; Kirk, T. K. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1986, 83, 3708-3712.
54. Hammel, K. E.; Jensen, K. A.; Mozuch, M. D.; Landucci, L. L.; Tien, M.; Pease, E. A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 12274-12281.
55. Hammel, K. E.; Moen, M. A. Enzyme Microb. Technol. 1991, 13, 15-18.
56. Haemmerli, S. D.; Leisola, M. S.; Fiechter, A. FEMS Microbiol. Lett. 1986, 35, 33-36.
57. Odier, E.; Mozuch, M. D.; Kalyanaraman, B.; Kirk, T. K. Biochimie 1988, 70, 847-852.
58. Addleman, K.; Dumonceaux, T.; Paice, M. G.; Bourbonnais, R.; Archibald, F. S. Appl. Environ. Microbiol. 1995, 61, 3687-3694.
59. Périé, F. H.; Gold, M. H. Appl. Environ. Microbiol. 1991, 57, 2240-2245.
60. Périé, F. H.; Sheng, D.; Gold, M. H. Biochim. Biophys. Acta 1996, 1297, 139-148.
61. Jensen, K. A., Jr.; Bao, W.; Kawai, S.; Srebotnik, E.; Hammel, K. E. Appl. Environ. Microbiol. 1996, 62, 3679-3686.
62. Srebotnik, E.; Kenneth A. Jensen, J.; Hemmel, K. E. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 12794-12797.
63. Eggert, C.; Temp, U.; Eriksson, K.-E. L. In ACS Symposium Series 655, Enzymes for Pulp and Paper Processing; Jeffries, T. W., Viikari, L., Eds.; American Chemical Society: Washington, D. C., 1996, p 130-150.
64. Eggert, C.; Temp, U.; Eriksson, K.-E. L. FEBS Lett. 1997, 407, 89-92.
65. Bermek, H.; Li, K.; Eriksson, K.-E. L. J. Biotechnol. 1998, 66, 117-124.
66. Ayers, A. R.; Eriksson, K. E. Methods Enzymol. 1982, 89, 129-135.
67. Duarte, J. C.; Costa-Ferreira, M.; Sena-Martins, G. Bioresource Technol. 1999, 68, 43-48.
68. Kremer, S. M.; Wood, P. M. Eur. J. Biochem. 1992, 208, 807-814.
69. Ander, P.; Mishra, C.; Farrell, R. L.; Eriksson, K. E. L. J. Biotechnol. 1990, 13, 189-198.
70. Temp, U.; Eggert, C. Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 389-395.
71. Westermark, U.; Eriksson, K.-E. Acta Chem. Scand. B 1974, 28, 204-208.
72. Westermark, U.; Eriksson, K.-E. Acta Chem. Scand. 1974, B28, 209-214.
73. Roy, B. P.; Paice, M. G.; Archibald, F. S.; Misra, S. K.; Misiak, L. E. J. Biol. Chem. 1994, 169, 19745-19750.
74. Wood, P. M. FEMS Microbiol. Rev. 1994, 13, 313-320.
75. Ander, P. FEMS Microbiol. Rev. 1994, 13, 297-312.
76. Eriksson, K.-E. L.; Habu, N.; Samejima, M. Enzyme Microb. Technol. 1993, 15, 1001-1008.
77. Galliano, H.; Gas, G.; Seris, J. L.; Boudet, A. M. Enzyme Microb. Technol. 1991, 13, 478-482.
78. Scheel, T.; Hofer, M.; Ludwig, S.; Holker, U. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2000, 54, 686-691.
79. Sethuraman, A.; Akin, D. E.; Eriksson, K. E. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999, 52, 689-697.
80. Sethuraman, A.; Akin, D. E.; Eriksson, K. E. L. Biotechnol. Appl. Biochem. 1998, 27, 37-47.
81. Bermek, H.; Li, K.; Eriksson, K.-E. L. Tappi J. 2000, 83, 69.
82. Shoemaker, H. E.; Leisola, M. S. A. J. Biotechnol. 1990, 13, 101-109.
83. Harvey, P. J.; Schoemaker, H. E.; Palmer, J. M. FEBS Lett. 1986, 195, 242-246.
84. Goodwin, D. C.; Aust, S. D.; Grover, T. A. Biochemistry 1995, 34, 5060-5065.
85. Koduri, R. S.; Tien, M. J. Biol. Chem. 1995, 270, 22254-22258.
86. Zapanta, L. S.; Tien, M. J. Biotechnol. 1997, 53, 93-102.
87. Paice, M. G.; Reid, I. D.; Bourbonnais, R.; Archibald, F. S.; Jurasek, L. Appl. Environ. Microbiol. 1993, 59, 260-265.
88. Harazono, K.; Kondo, R.; Sakai, K. Appl. Environ. Microbiol. 1996, 62, 913-917.
89. Kondo, R.; Karazono, K.; Sakai, K. Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 4359-4363.
90. Bourbonnais, R.; Paice, M. G. FEBS Lett. 1990, 267, 99-102.
91. Li, K.; Eriksson, K.-E. L. Ind. J. Microbiol. 2000, 40, 149-261.
92. Call, H. P.; Mücke, I. J. Biotechnol. 1997, 53, 163-202.
93. Li, K.; Prabhu, N. G.; Cooper, D. A.; Xu, F.; Elder, T.; Eriksson, K.-E. L. In ACS symposium series 785, Oxidative Delignification Chemistry: Fundamentals and Catalysis; Argyropoulos, D. S., Ed.; American Chemical Society: Washington DC, 2001, p 400-412.
94. Amann, M. In 9th International Symposium on Wood and Pulping Chemistry Montreal, Canada, 1997, p F(4-1) - F(4-5).
95. Bourbonnais, R.; Rochefort, D.; Paice, M. G.; Renaud, S.; Leech, D. Tappi J. 2000, 83, 68.
96. Kulys, J.; Krikstopaitis, K.; Ziemys, A. J. Bio. Inorg. Chem. 2000, 5, 333-340.
97. Schneider, P.; Pedersen, A. H.; PCT world patent, 1995, p WO 95/01426.
98. Li, K.; Helm, R. F.; Eriksson, K.-E. L. Botechnol. Appl. Biochem. 1998, 27, 239-243.
99. Li, K.; Xu, F.; Eriksson, K. E. Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 2654-2660.
100. Majcherczyk, A.; Johannes, C.; Hüttermann, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1999, 51, 267-276.
101. Muheim, A.; Fiechter, A.; Harvey, P. J.; Schoemaker, H. E. Holzforschung 1992, 46, 121-126.
102. Bourbonnais, R.; Leech, D.; Paice, M. G. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1379, 381-390.
103. Xu, F.; Kulys, J. J.; Duke, K.; Li, K.; Krikstopaitis, K.; Deussen, H. J.; Abbate, E.; Galinyte, V.; Schneider, P. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 2052-2056.
104. Bourbonnais, R.; Paice, M. G.; Freiermuth, B.; Bodie, E.; Borneman, S. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 4627-4632.
105. Xu, F.; Deussen, H.-J. W.; Lopez, B.; Lam, L.; Li, K. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 4169-4176.
106. Xu, F.; Li, K.; Elder, T. Enzyme Microb. Technol. In press.
107. Archibald, F. S.; Bourbonnais, R.; Jurasek, L.; Paice, M. G.; Reid, I. D. J. Biotechnol. 1997, 53, 215-236.
108. Eggert, C.; LaFayette, P. R.; Temp, U.; Eriksson, K. E.; Dean, J. F. Appl. Environ. Microbiol. 1998, 64, 1766-1772.
109. Temp, U.; Zierold, U.; Eggert, C. Gene 1999, 236, 169-177.
110. Eggert, C.; Temp, U.; Eriksson, K.-E. L. Appl. Environ. Microbiol. 1996, 62, 1151-1158.
111. Eggert, C.; Temp, U.; Dean, J. F.; Eriksson, K.-E. L. FEBS Lett. 1996, 391, 144-148.
112. Li, K.; Horanyi, P.; Collins, R.; Phillips, R. S.; Eriksson, K.-E. L. Enzyme Microb. Technol. 2001, 28, 301-307.
113. Johannes, C.; Majcherczyk, A. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 524-528.
114. Archibald, F.; Roy, B. Appl. Environ. Microbiol. 1992, 58, 1496-1499.
115. Guillén, F.; Gomez-Toribio, V.; Martinez, M. J.; Martinez, A. T. Arch. Biochem. Biophys. 2000, 383, 142-147.
116. Guillén, F.; Muñoz, C.; Gómez-Toribio, V.; Martínez, A. T.; Jesus Martínez, M. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 170-175.